MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 23083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018887	AAC	2	6	18625	18630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678770
502	NC_018887	AAT	2	6	18654	18659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
503	NC_018887	T	7	7	18747	18753	0 %	100 %	0 %	0 %	410678770
504	NC_018887	TTGA	2	8	18768	18775	25 %	50 %	25 %	0 %	410678770
505	NC_018887	TCAA	2	8	18782	18789	50 %	25 %	0 %	25 %	410678770
506	NC_018887	CTTC	2	8	18897	18904	0 %	50 %	0 %	50 %	410678770
507	NC_018887	CAA	2	6	18924	18929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678770
508	NC_018887	CTT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678770
509	NC_018887	ACTC	2	8	18966	18973	25 %	25 %	0 %	50 %	410678770
510	NC_018887	AACTAT	2	12	19051	19062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678770
511	NC_018887	AACA	2	8	19099	19106	75 %	0 %	0 %	25 %	410678770
512	NC_018887	TCA	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
513	NC_018887	T	6	6	19252	19257	0 %	100 %	0 %	0 %	410678770
514	NC_018887	TC	3	6	19398	19403	0 %	50 %	0 %	50 %	410678770
515	NC_018887	CTTT	2	8	19404	19411	0 %	75 %	0 %	25 %	410678770
516	NC_018887	AGC	2	6	19432	19437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678770
517	NC_018887	ATC	2	6	19450	19455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
518	NC_018887	ACC	2	6	19456	19461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678770
519	NC_018887	AAT	4	12	19462	19473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
520	NC_018887	TAA	2	6	19501	19506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
521	NC_018887	TTC	2	6	19542	19547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678770
522	NC_018887	AGA	2	6	19549	19554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678770
523	NC_018887	C	6	6	19643	19648	0 %	0 %	0 %	100 %	410678770
524	NC_018887	T	7	7	19681	19687	0 %	100 %	0 %	0 %	410678770
525	NC_018887	TCC	2	6	19735	19740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678770
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527	NC_018887	A	6	6	19834	19839	100 %	0 %	0 %	0 %	410678770
528	NC_018887	TAAAC	2	10	19886	19895	60 %	20 %	0 %	20 %	410678770
529	NC_018887	T	7	7	19912	19918	0 %	100 %	0 %	0 %	410678770
530	NC_018887	TA	3	6	20061	20066	50 %	50 %	0 %	0 %	410678771
531	NC_018887	A	7	7	20098	20104	100 %	0 %	0 %	0 %	410678771
532	NC_018887	TTTA	2	8	20114	20121	25 %	75 %	0 %	0 %	410678771
533	NC_018887	CTT	2	6	20125	20130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
534	NC_018887	GT	3	6	20197	20202	0 %	50 %	50 %	0 %	410678771
535	NC_018887	ATAA	2	8	20255	20262	75 %	25 %	0 %	0 %	410678771
536	NC_018887	CTT	2	6	20294	20299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
537	NC_018887	TAT	2	6	20305	20310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678771
538	NC_018887	GTA	2	6	20340	20345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678771
539	NC_018887	T	6	6	20360	20365	0 %	100 %	0 %	0 %	410678771
540	NC_018887	CA	3	6	20399	20404	50 %	0 %	0 %	50 %	410678771
541	NC_018887	A	6	6	20415	20420	100 %	0 %	0 %	0 %	410678771
542	NC_018887	TTC	2	6	20441	20446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
543	NC_018887	T	6	6	20451	20456	0 %	100 %	0 %	0 %	410678771
544	NC_018887	GAA	2	6	20467	20472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678771
545	NC_018887	TAA	2	6	20497	20502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678771
546	NC_018887	CTA	2	6	20547	20552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678771
547	NC_018887	AATA	2	8	20599	20606	75 %	25 %	0 %	0 %	410678771
548	NC_018887	AGG	2	6	20654	20659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678771
549	NC_018887	AAT	2	6	20686	20691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678771
550	NC_018887	CAT	2	6	20701	20706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678771
551	NC_018887	ACT	2	6	20729	20734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678771
552	NC_018887	T	6	6	20736	20741	0 %	100 %	0 %	0 %	410678771
553	NC_018887	CAA	2	6	20788	20793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678771
554	NC_018887	TCTA	2	8	20843	20850	25 %	50 %	0 %	25 %	410678771
555	NC_018887	TAC	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678771
556	NC_018887	GTT	2	6	20918	20923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678771
557	NC_018887	TA	3	6	20948	20953	50 %	50 %	0 %	0 %	410678771
558	NC_018887	T	6	6	21034	21039	0 %	100 %	0 %	0 %	410678771
559	NC_018887	TAA	2	6	21179	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678772
560	NC_018887	CTG	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678772
561	NC_018887	CTT	2	6	21301	21306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678772
562	NC_018887	CAA	2	6	21371	21376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678772
563	NC_018887	AAC	2	6	21387	21392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678772
564	NC_018887	GAG	2	6	21452	21457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678772
565	NC_018887	CTT	2	6	21469	21474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678772
566	NC_018887	AAG	2	6	21477	21482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678772
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569	NC_018887	TAT	2	6	21534	21539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678772
570	NC_018887	CAA	2	6	21542	21547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678772
571	NC_018887	TAG	3	9	21626	21634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678772
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599	NC_018887	ACTA	2	8	22676	22683	50 %	25 %	0 %	25 %	410678773
600	NC_018887	T	8	8	22730	22737	0 %	100 %	0 %	0 %	410678773
601	NC_018887	TTAT	2	8	22758	22765	25 %	75 %	0 %	0 %	410678773
602	NC_018887	AATT	2	8	22869	22876	50 %	50 %	0 %	0 %	410678774
603	NC_018887	T	7	7	22884	22890	0 %	100 %	0 %	0 %	410678774
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610	NC_018887	TA	4	8	23139	23146	50 %	50 %	0 %	0 %	410678774
611	NC_018887	TCT	2	6	23147	23152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678774
612	NC_018887	AT	3	6	23162	23167	50 %	50 %	0 %	0 %	410678774
613	NC_018887	AGA	2	6	23185	23190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678774
614	NC_018887	TAA	2	6	23194	23199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678774
615	NC_018887	T	6	6	23241	23246	0 %	100 %	0 %	0 %	410678774
616	NC_018887	A	6	6	23257	23262	100 %	0 %	0 %	0 %	410678774
617	NC_018887	AAG	2	6	23367	23372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678774
618	NC_018887	A	7	7	23401	23407	100 %	0 %	0 %	0 %	410678774
619	NC_018887	ATA	2	6	23414	23419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678774
620	NC_018887	AT	3	6	23474	23479	50 %	50 %	0 %	0 %	410678774
621	NC_018887	ACA	2	6	23511	23516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678774
622	NC_018887	TCC	2	6	23518	23523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678774
623	NC_018887	TAA	3	9	23538	23546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678774
624	NC_018887	A	7	7	23592	23598	100 %	0 %	0 %	0 %	410678774
625	NC_018887	AT	3	6	23719	23724	50 %	50 %	0 %	0 %	410678774
626	NC_018887	AAAT	2	8	23725	23732	75 %	25 %	0 %	0 %	410678774
627	NC_018887	A	6	6	23824	23829	100 %	0 %	0 %	0 %	410678774
628	NC_018887	T	6	6	23839	23844	0 %	100 %	0 %	0 %	410678774
629	NC_018887	TAT	2	6	23903	23908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678774
630	NC_018887	T	6	6	23922	23927	0 %	100 %	0 %	0 %	410678774
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