MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_9p

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018886	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
2	NC_018886	TGAG	2	8	192	199	25 %	25 %	50 %	0 %	410683890
3	NC_018886	AGA	3	9	264	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
4	NC_018886	GGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683890
5	NC_018886	GAT	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683890
6	NC_018886	AAAG	2	8	388	395	75 %	0 %	25 %	0 %	410683890
7	NC_018886	T	7	7	402	408	0 %	100 %	0 %	0 %	410683890
8	NC_018886	GAC	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683890
9	NC_018886	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683890
10	NC_018886	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683890
11	NC_018886	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
12	NC_018886	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683890
13	NC_018886	ATT	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
14	NC_018886	AAG	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
15	NC_018886	AAG	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
16	NC_018886	GTC	2	6	918	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683890
17	NC_018886	AATT	2	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	410683890
18	NC_018886	ATT	2	6	943	948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
19	NC_018886	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	410683890
20	NC_018886	GAAT	2	8	1009	1016	50 %	25 %	25 %	0 %	410683890
21	NC_018886	ATT	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
22	NC_018886	TAAT	2	8	1119	1126	50 %	50 %	0 %	0 %	410683890
23	NC_018886	TAT	3	9	1172	1180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
24	NC_018886	A	6	6	1212	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	410683891
25	NC_018886	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	410683891
26	NC_018886	ATT	2	6	1286	1291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
27	NC_018886	GTTG	2	8	1348	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	410683891
28	NC_018886	TTTA	2	8	2212	2219	25 %	75 %	0 %	0 %	410683892
29	NC_018886	TC	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	410683892
30	NC_018886	TTA	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683892
31	NC_018886	AATA	2	8	2375	2382	75 %	25 %	0 %	0 %	410683892
32	NC_018886	TTTG	2	8	2390	2397	0 %	75 %	25 %	0 %	410683892
33	NC_018886	T	6	6	2409	2414	0 %	100 %	0 %	0 %	410683892
34	NC_018886	GTA	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
35	NC_018886	ATA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
36	NC_018886	TAA	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
37	NC_018886	TCT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683893
38	NC_018886	AT	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	410683893
39	NC_018886	GAT	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
40	NC_018886	AAT	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
41	NC_018886	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
42	NC_018886	ATT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
43	NC_018886	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683894
44	NC_018886	AGA	3	9	3581	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
45	NC_018886	TAT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
46	NC_018886	A	6	6	3676	3681	100 %	0 %	0 %	0 %	410683894
47	NC_018886	AC	3	6	3698	3703	50 %	0 %	0 %	50 %	410683894
48	NC_018886	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	410683894
49	NC_018886	TAT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
50	NC_018886	GCAT	2	8	3742	3749	25 %	25 %	25 %	25 %	410683894
51	NC_018886	AGA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
52	NC_018886	TGA	2	6	3824	3829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
53	NC_018886	TAT	2	6	3870	3875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
54	NC_018886	TCA	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683894
55	NC_018886	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
56	NC_018886	T	7	7	3926	3932	0 %	100 %	0 %	0 %	410683894
57	NC_018886	AC	3	6	3976	3981	50 %	0 %	0 %	50 %	410683894
58	NC_018886	AGA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
59	NC_018886	TAA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683894
60	NC_018886	TCT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683894
61	NC_018886	AAG	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
62	NC_018886	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
63	NC_018886	ACAA	2	8	4229	4236	75 %	0 %	0 %	25 %	410683894
64	NC_018886	AT	3	6	4250	4255	50 %	50 %	0 %	0 %	410683894
65	NC_018886	ATAC	2	8	4400	4407	50 %	25 %	0 %	25 %	410683894
66	NC_018886	GAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
67	NC_018886	GAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
68	NC_018886	TTA	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
69	NC_018886	ATG	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
70	NC_018886	A	6	6	4535	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	410683895
71	NC_018886	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
72	NC_018886	TTTTC	2	10	4581	4590	0 %	80 %	0 %	20 %	410683895
73	NC_018886	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683895
74	NC_018886	ATG	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683895
75	NC_018886	A	7	7	4629	4635	100 %	0 %	0 %	0 %	410683895
76	NC_018886	ATT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683895
77	NC_018886	CAA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
78	NC_018886	A	7	7	4798	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
79	NC_018886	GA	3	6	4813	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	410683896
80	NC_018886	A	7	7	4840	4846	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
81	NC_018886	GGA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683896
82	NC_018886	AAT	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
83	NC_018886	AAC	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
84	NC_018886	ATA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
85	NC_018886	TC	3	6	4957	4962	0 %	50 %	0 %	50 %	410683896
86	NC_018886	GAA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683896
87	NC_018886	TA	4	8	5034	5041	50 %	50 %	0 %	0 %	410683896
88	NC_018886	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683896
89	NC_018886	TAA	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
90	NC_018886	ATG	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683896
91	NC_018886	ACA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
92	NC_018886	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
93	NC_018886	T	6	6	5200	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	410683896
94	NC_018886	TGG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683896
95	NC_018886	A	6	6	5260	5265	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
96	NC_018886	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683896
97	NC_018886	GTAGC	2	10	5312	5321	20 %	20 %	40 %	20 %	410683896
98	NC_018886	TTA	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683896
99	NC_018886	TATTT	3	15	5399	5413	20 %	80 %	0 %	0 %	410683897
100	NC_018886	AT	3	6	5482	5487	50 %	50 %	0 %	0 %	410683897
101	NC_018886	ATT	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683897
102	NC_018886	TAG	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683897
103	NC_018886	A	8	8	5552	5559	100 %	0 %	0 %	0 %	410683897
104	NC_018886	TTG	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683898
105	NC_018886	TAG	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683898
106	NC_018886	A	7	7	6473	6479	100 %	0 %	0 %	0 %	410683898
107	NC_018886	GTG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683898
108	NC_018886	GA	3	6	6980	6985	50 %	0 %	50 %	0 %	410683899
109	NC_018886	AAAG	2	8	7020	7027	75 %	0 %	25 %	0 %	410683899
110	NC_018886	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683899
111	NC_018886	AATT	2	8	7111	7118	50 %	50 %	0 %	0 %	410683899
112	NC_018886	TGT	2	6	7172	7177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683899
113	NC_018886	TTG	2	6	7178	7183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683899
114	NC_018886	T	6	6	7268	7273	0 %	100 %	0 %	0 %	410683899
115	NC_018886	GAGAA	2	10	7288	7297	60 %	0 %	40 %	0 %	410683899
116	NC_018886	TGA	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683899
117	NC_018886	A	6	6	7327	7332	100 %	0 %	0 %	0 %	410683899
118	NC_018886	AAAAAC	2	12	7369	7380	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410683899
119	NC_018886	T	6	6	7395	7400	0 %	100 %	0 %	0 %	410683899
120	NC_018886	GAAA	2	8	7451	7458	75 %	0 %	25 %	0 %	410683899
121	NC_018886	GTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683899
122	NC_018886	ACA	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683899
123	NC_018886	AGA	2	6	7547	7552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
124	NC_018886	AAGAA	2	10	7561	7570	80 %	0 %	20 %	0 %	410683899
125	NC_018886	ATAG	2	8	7575	7582	50 %	25 %	25 %	0 %	410683899
126	NC_018886	GTC	2	6	7724	7729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683899
127	NC_018886	AGA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
128	NC_018886	AG	3	6	7806	7811	50 %	0 %	50 %	0 %	410683899
129	NC_018886	AG	3	6	7848	7853	50 %	0 %	50 %	0 %	410683899
130	NC_018886	GAAG	2	8	7865	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	410683899
131	NC_018886	TGA	3	9	8018	8026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683899
132	NC_018886	GAA	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
133	NC_018886	CAA	2	6	8076	8081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683899
134	NC_018886	GA	3	6	8136	8141	50 %	0 %	50 %	0 %	410683899

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.