MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_15p

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018880	ACT	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678729
2	NC_018880	ATG	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678729
3	NC_018880	GAG	2	6	173	178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678729
4	NC_018880	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
5	NC_018880	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
6	NC_018880	TAA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678729
7	NC_018880	AGA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
8	NC_018880	CTT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678729
9	NC_018880	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
10	NC_018880	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678729
11	NC_018880	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678729
12	NC_018880	TAA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678730
13	NC_018880	TGT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678730
14	NC_018880	TGT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678731
15	NC_018880	GCG	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678732
16	NC_018880	CAG	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678732
17	NC_018880	CGG	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678732
18	NC_018880	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678732
19	NC_018880	TAA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678732
20	NC_018880	TAG	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
21	NC_018880	AGA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
22	NC_018880	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678732
23	NC_018880	AGA	2	6	4167	4172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
24	NC_018880	CTT	2	6	4384	4389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678732
25	NC_018880	TGA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
26	NC_018880	AGA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
27	NC_018880	TGA	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
28	NC_018880	AGA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678733
29	NC_018880	GAA	2	6	4711	4716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678733
30	NC_018880	TGA	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
31	NC_018880	TTG	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
32	NC_018880	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
33	NC_018880	TTG	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
34	NC_018880	TTG	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
35	NC_018880	GAT	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
36	NC_018880	CTT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678733
37	NC_018880	GTT	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
38	NC_018880	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678733
39	NC_018880	TCT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678734
40	NC_018880	TAG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678734
41	NC_018880	CAA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678734
42	NC_018880	TTG	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678734
43	NC_018880	ATA	2	6	6231	6236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678734
44	NC_018880	TAT	2	6	6343	6348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
45	NC_018880	AGG	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678734
46	NC_018880	AAC	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678734
47	NC_018880	TTA	2	6	6471	6476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
48	NC_018880	GTC	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678734
49	NC_018880	TTA	2	6	6540	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
50	NC_018880	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678734
51	NC_018880	ACT	2	6	6649	6654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678734
52	NC_018880	GAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
53	NC_018880	TCT	2	6	7076	7081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
54	NC_018880	TTA	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
55	NC_018880	CAA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678735
56	NC_018880	AAT	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
57	NC_018880	TTC	2	6	7191	7196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
58	NC_018880	ATG	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
59	NC_018880	TTA	2	6	7710	7715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
60	NC_018880	GAA	2	6	7814	7819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
61	NC_018880	AAC	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678735
62	NC_018880	TTA	2	6	7907	7912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
63	NC_018880	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678735
64	NC_018880	ATG	3	9	8061	8069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
65	NC_018880	TAT	2	6	8090	8095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
66	NC_018880	CAT	2	6	8165	8170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
67	NC_018880	TGA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
68	NC_018880	ATG	2	6	8199	8204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
69	NC_018880	AGA	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
70	NC_018880	CTT	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
71	NC_018880	ATG	3	9	8661	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
72	NC_018880	ATC	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
73	NC_018880	CTT	3	9	8748	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
74	NC_018880	TAC	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
75	NC_018880	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
76	NC_018880	CAT	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
77	NC_018880	GAA	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
78	NC_018880	TTG	2	6	9017	9022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678735
79	NC_018880	CTC	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678735
80	NC_018880	TGG	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678735
81	NC_018880	AGA	2	6	9088	9093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
82	NC_018880	TAA	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
83	NC_018880	TAA	2	6	9319	9324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
84	NC_018880	ATT	2	6	9470	9475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
85	NC_018880	AGA	2	6	9520	9525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
86	NC_018880	AGA	2	6	9550	9555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
87	NC_018880	ACA	2	6	9925	9930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678736
88	NC_018880	ATA	2	6	9934	9939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678736
89	NC_018880	TCT	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678736
90	NC_018880	TTC	2	6	9982	9987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678736
91	NC_018880	AGG	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678736
92	NC_018880	ATC	2	6	10078	10083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678736
93	NC_018880	AGA	2	6	10155	10160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678736
94	NC_018880	ATG	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678736
95	NC_018880	CTT	2	6	10508	10513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678736
96	NC_018880	TCT	2	6	10702	10707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678736
97	NC_018880	ATT	2	6	10788	10793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678736
98	NC_018880	ACC	2	6	10881	10886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678736
99	NC_018880	TCG	2	6	10931	10936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678736
100	NC_018880	ATA	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678736
101	NC_018880	TTA	2	6	11068	11073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678736
102	NC_018880	TTC	2	6	11238	11243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678736
103	NC_018880	CGG	2	6	11720	11725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678737
104	NC_018880	CCA	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678737
105	NC_018880	AGA	2	6	12095	12100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678737
106	NC_018880	AGA	2	6	12380	12385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678738
107	NC_018880	AGG	2	6	12406	12411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678738
108	NC_018880	TAA	2	6	12479	12484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678738
109	NC_018880	ATT	2	6	12549	12554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678739
110	NC_018880	AAG	2	6	12564	12569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678739
111	NC_018880	CAG	2	6	12596	12601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678739
112	NC_018880	TAA	2	6	12645	12650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678739
113	NC_018880	GAC	2	6	12736	12741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678739
114	NC_018880	ACC	2	6	12753	12758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678739
115	NC_018880	TGA	2	6	12960	12965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678739
116	NC_018880	ACG	2	6	13282	13287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678740
117	NC_018880	TAT	2	6	13299	13304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678740
118	NC_018880	ACA	2	6	13347	13352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678741
119	NC_018880	TAA	2	6	13417	13422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678741
120	NC_018880	AGA	2	6	13437	13442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678741
121	NC_018880	AAG	2	6	13516	13521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678741
122	NC_018880	AGA	2	6	13583	13588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678741
123	NC_018880	AGA	3	9	13625	13633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678741
124	NC_018880	AGA	2	6	14344	14349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678742
125	NC_018880	ACA	2	6	14398	14403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678742
126	NC_018880	AGA	2	6	14480	14485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678742
127	NC_018880	AAT	2	6	14627	14632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678743
128	NC_018880	GAA	2	6	14696	14701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678743

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.