MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 10113

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018878	ATGA	2	8	497298	497305	50 %	25 %	25 %	0 %	410678632
10002	NC_018878	A	6	6	497334	497339	100 %	0 %	0 %	0 %	410678632
10003	NC_018878	GAT	2	6	497340	497345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678632
10004	NC_018878	GAC	2	6	497381	497386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678632
10005	NC_018878	GAT	2	6	497415	497420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678632
10006	NC_018878	AGA	2	6	497435	497440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678632
10007	NC_018878	AAT	2	6	497495	497500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678632
10008	NC_018878	TGA	2	6	497576	497581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678632
10009	NC_018878	AC	3	6	497587	497592	50 %	0 %	0 %	50 %	410678632
10010	NC_018878	CTGA	2	8	497679	497686	25 %	25 %	25 %	25 %	410678632
10011	NC_018878	TTA	2	6	497691	497696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678632
10012	NC_018878	TAC	2	6	497704	497709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678632
10013	NC_018878	AG	3	6	497719	497724	50 %	0 %	50 %	0 %	410678632
10014	NC_018878	ATA	2	6	497743	497748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678632
10015	NC_018878	TA	3	6	497747	497752	50 %	50 %	0 %	0 %	410678632
10016	NC_018878	ATAAAA	2	12	497824	497835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678632
10017	NC_018878	TGG	2	6	497849	497854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678632
10018	NC_018878	GAA	2	6	497918	497923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678632
10019	NC_018878	ATT	2	6	497966	497971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678632
10020	NC_018878	GAAA	2	8	497973	497980	75 %	0 %	25 %	0 %	410678632
10021	NC_018878	TTA	2	6	498013	498018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678633
10022	NC_018878	AAT	2	6	498038	498043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678633
10023	NC_018878	AAG	2	6	498053	498058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678633
10024	NC_018878	TTC	2	6	498063	498068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678633
10025	NC_018878	ATA	2	6	498076	498081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678633
10026	NC_018878	T	7	7	498113	498119	0 %	100 %	0 %	0 %	410678633
10027	NC_018878	TTC	2	6	498137	498142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678633
10028	NC_018878	T	7	7	498171	498177	0 %	100 %	0 %	0 %	410678633
10029	NC_018878	ATTA	2	8	498180	498187	50 %	50 %	0 %	0 %	410678633
10030	NC_018878	CTC	2	6	498237	498242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678633
10031	NC_018878	AAAGA	2	10	498253	498262	80 %	0 %	20 %	0 %	410678633
10032	NC_018878	ACT	2	6	498345	498350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10033	NC_018878	CTTT	2	8	498357	498364	0 %	75 %	0 %	25 %	410678634
10034	NC_018878	CTTT	2	8	498366	498373	0 %	75 %	0 %	25 %	410678634
10035	NC_018878	CTT	3	9	498379	498387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678634
10036	NC_018878	T	6	6	498386	498391	0 %	100 %	0 %	0 %	410678634
10037	NC_018878	TCT	2	6	498405	498410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678634
10038	NC_018878	TAA	2	6	498445	498450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678634
10039	NC_018878	GTTT	2	8	498460	498467	0 %	75 %	25 %	0 %	410678634
10040	NC_018878	TCA	2	6	498507	498512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10041	NC_018878	TCA	2	6	498549	498554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10042	NC_018878	TCT	2	6	498684	498689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678634
10043	NC_018878	TAC	2	6	498719	498724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10044	NC_018878	CTTT	2	8	498765	498772	0 %	75 %	0 %	25 %	410678634
10045	NC_018878	ATC	2	6	498785	498790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10046	NC_018878	TC	3	6	498789	498794	0 %	50 %	0 %	50 %	410678634
10047	NC_018878	AAC	2	6	498806	498811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678634
10048	NC_018878	T	7	7	498812	498818	0 %	100 %	0 %	0 %	410678634
10049	NC_018878	TAACT	2	10	498833	498842	40 %	40 %	0 %	20 %	410678634
10050	NC_018878	ATTC	2	8	498943	498950	25 %	50 %	0 %	25 %	410678634
10051	NC_018878	AAGA	2	8	498967	498974	75 %	0 %	25 %	0 %	410678634
10052	NC_018878	CAG	2	6	498985	498990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678634
10053	NC_018878	TCTT	2	8	499016	499023	0 %	75 %	0 %	25 %	410678634
10054	NC_018878	CTT	2	6	499033	499038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678634
10055	NC_018878	TTGA	2	8	499069	499076	25 %	50 %	25 %	0 %	410678634
10056	NC_018878	CAT	2	6	499088	499093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678634
10057	NC_018878	CAA	2	6	499096	499101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678634
10058	NC_018878	CAAA	2	8	499322	499329	75 %	0 %	0 %	25 %	410678635
10059	NC_018878	TCT	2	6	499377	499382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678635
10060	NC_018878	T	6	6	499406	499411	0 %	100 %	0 %	0 %	410678635
10061	NC_018878	TA	3	6	499497	499502	50 %	50 %	0 %	0 %	410678635
10062	NC_018878	ATT	2	6	499513	499518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678635
10063	NC_018878	AG	3	6	499561	499566	50 %	0 %	50 %	0 %	410678635
10064	NC_018878	ATG	2	6	499616	499621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678635
10065	NC_018878	AT	3	6	499631	499636	50 %	50 %	0 %	0 %	410678635
10066	NC_018878	TTG	2	6	499660	499665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678635
10067	NC_018878	CAA	2	6	499733	499738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678635
10068	NC_018878	AAT	2	6	499744	499749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678635
10069	NC_018878	TTA	2	6	499750	499755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678635
10070	NC_018878	AC	3	6	499900	499905	50 %	0 %	0 %	50 %	410678636
10071	NC_018878	ATT	2	6	499927	499932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678636
10072	NC_018878	TAT	2	6	499957	499962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678636
10073	NC_018878	GTA	2	6	499963	499968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678636
10074	NC_018878	GTGAA	2	10	500063	500072	40 %	20 %	40 %	0 %	410678636
10075	NC_018878	AAGAA	3	15	500124	500138	80 %	0 %	20 %	0 %	410678636
10076	NC_018878	AAT	2	6	500149	500154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678636
10077	NC_018878	AGA	2	6	500208	500213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678636
10078	NC_018878	TTG	2	6	500216	500221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678636
10079	NC_018878	AGA	2	6	500250	500255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678636
10080	NC_018878	AGT	2	6	500259	500264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678636
10081	NC_018878	AGA	2	6	500265	500270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678636
10082	NC_018878	AGA	2	6	500316	500321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678636
10083	NC_018878	AT	3	6	500325	500330	50 %	50 %	0 %	0 %	410678636
10084	NC_018878	ATTA	2	8	500460	500467	50 %	50 %	0 %	0 %	410678636
10085	NC_018878	AAG	2	6	500468	500473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678636
10086	NC_018878	TAA	2	6	500485	500490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678636
10087	NC_018878	ATG	2	6	500709	500714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678637
10088	NC_018878	AAT	2	6	500727	500732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678637
10089	NC_018878	TAG	2	6	500772	500777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678637
10090	NC_018878	AG	3	6	500787	500792	50 %	0 %	50 %	0 %	410678637
10091	NC_018878	GAA	2	6	500819	500824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678637
10092	NC_018878	CCA	4	12	500829	500840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678637
10093	NC_018878	AT	3	6	500880	500885	50 %	50 %	0 %	0 %	410678637
10094	NC_018878	GATTT	2	10	500904	500913	20 %	60 %	20 %	0 %	410678637
10095	NC_018878	A	6	6	500927	500932	100 %	0 %	0 %	0 %	410678637
10096	NC_018878	TCA	2	6	501022	501027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678637
10097	NC_018878	ATAA	2	8	501028	501035	75 %	25 %	0 %	0 %	410678637
10098	NC_018878	ATA	2	6	501043	501048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678637
10099	NC_018878	ATT	2	6	501056	501061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678637
10100	NC_018878	TTC	2	6	501071	501076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678637
10101	NC_018878	T	7	7	501203	501209	0 %	100 %	0 %	0 %	410678638
10102	NC_018878	TTTC	2	8	501214	501221	0 %	75 %	0 %	25 %	410678638
10103	NC_018878	T	6	6	501235	501240	0 %	100 %	0 %	0 %	410678638
10104	NC_018878	GTTC	2	8	501247	501254	0 %	50 %	25 %	25 %	410678638
10105	NC_018878	ACA	2	6	501294	501299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678638
10106	NC_018878	TCA	2	6	501318	501323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678638
10107	NC_018878	GTT	2	6	501346	501351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678638
10108	NC_018878	T	7	7	501393	501399	0 %	100 %	0 %	0 %	410678638
10109	NC_018878	GTT	2	6	501502	501507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678638
10110	NC_018878	CAG	2	6	501517	501522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678638
10111	NC_018878	ATC	2	6	501536	501541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678638
10112	NC_018878	T	6	6	501689	501694	0 %	100 %	0 %	0 %	410678638
10113	NC_018878	ATCGA	2	10	501779	501788	40 %	20 %	20 %	20 %	410678638

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.