MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 3934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	CAAAT	2	10	1014	1023	60 %	20 %	0 %	20 %	410672378
2	NC_018877	TACAA	2	10	1628	1637	60 %	20 %	0 %	20 %	410672379
3	NC_018877	AAAAT	2	10	1932	1941	80 %	20 %	0 %	0 %	410672379
4	NC_018877	ATTAA	2	10	4900	4909	60 %	40 %	0 %	0 %	410672382
5	NC_018877	CCAGC	2	10	5977	5986	20 %	0 %	20 %	60 %	410672382
6	NC_018877	AAAAC	2	10	7339	7348	80 %	0 %	0 %	20 %	410672383
7	NC_018877	TAGGT	2	10	14070	14079	20 %	40 %	40 %	0 %	410672384
8	NC_018877	TAAAG	2	10	15429	15438	60 %	20 %	20 %	0 %	410672385
9	NC_018877	ATGCT	2	10	15866	15875	20 %	40 %	20 %	20 %	410672385
10	NC_018877	AAATT	2	10	23182	23191	60 %	40 %	0 %	0 %	410672392
11	NC_018877	ATTTT	2	10	23598	23607	20 %	80 %	0 %	0 %	410672393
12	NC_018877	AAGCG	2	10	26501	26510	40 %	0 %	40 %	20 %	410672395
13	NC_018877	TGAAG	2	10	27091	27100	40 %	20 %	40 %	0 %	410672396
14	NC_018877	TTGGC	2	10	36048	36057	0 %	40 %	40 %	20 %	410672402
15	NC_018877	GTATT	2	10	36171	36180	20 %	60 %	20 %	0 %	410672402
16	NC_018877	ATTGT	2	10	40112	40121	20 %	60 %	20 %	0 %	410672408
17	NC_018877	TGGAT	2	10	42190	42199	20 %	40 %	40 %	0 %	410672410
18	NC_018877	TGACA	2	10	43559	43568	40 %	20 %	20 %	20 %	410672411
19	NC_018877	GAAAC	2	10	47488	47497	60 %	0 %	20 %	20 %	410672416
20	NC_018877	AAGAC	2	10	47759	47768	60 %	0 %	20 %	20 %	410672417
21	NC_018877	GATTT	2	10	59086	59095	20 %	60 %	20 %	0 %	410672427
22	NC_018877	TATTT	2	10	59645	59654	20 %	80 %	0 %	0 %	410672427
23	NC_018877	TTGGA	2	10	62326	62335	20 %	40 %	40 %	0 %	410672431
24	NC_018877	TTATG	2	10	64648	64657	20 %	60 %	20 %	0 %	410672434
25	NC_018877	GGAAA	3	15	64972	64986	60 %	0 %	40 %	0 %	410672434
26	NC_018877	TCAAT	2	10	66426	66435	40 %	40 %	0 %	20 %	410672434
27	NC_018877	AATGA	2	10	68556	68565	60 %	20 %	20 %	0 %	410672435
28	NC_018877	GATTA	2	10	69031	69040	40 %	40 %	20 %	0 %	410672436
29	NC_018877	GGAAC	2	10	72425	72434	40 %	0 %	40 %	20 %	410672439
30	NC_018877	AAGGG	2	10	74417	74426	40 %	0 %	60 %	0 %	410672441
31	NC_018877	AAAAG	2	10	74682	74691	80 %	0 %	20 %	0 %	410672441
32	NC_018877	AGAGC	2	10	75172	75181	40 %	0 %	40 %	20 %	410672441
33	NC_018877	ATTTA	2	10	75695	75704	40 %	60 %	0 %	0 %	410672442
34	NC_018877	TGATG	2	10	76441	76450	20 %	40 %	40 %	0 %	410672443
35	NC_018877	GGTAA	2	10	77939	77948	40 %	20 %	40 %	0 %	410672444
36	NC_018877	AAAAC	2	10	78715	78724	80 %	0 %	0 %	20 %	410672446
37	NC_018877	AAATA	2	10	79361	79370	80 %	20 %	0 %	0 %	410672448
38	NC_018877	GTTAT	2	10	81587	81596	20 %	60 %	20 %	0 %	410672449
39	NC_018877	TCAAA	2	10	94591	94600	60 %	20 %	0 %	20 %	410672452
40	NC_018877	GAACA	2	10	95097	95106	60 %	0 %	20 %	20 %	410672453
41	NC_018877	GAACA	2	10	95319	95328	60 %	0 %	20 %	20 %	410672453
42	NC_018877	TGAAG	2	10	96259	96268	40 %	20 %	40 %	0 %	410672453
43	NC_018877	GAAAA	2	10	96282	96291	80 %	0 %	20 %	0 %	410672453
44	NC_018877	GAAAA	2	10	96405	96414	80 %	0 %	20 %	0 %	410672453
45	NC_018877	CGTAT	2	10	98279	98288	20 %	40 %	20 %	20 %	410672454
46	NC_018877	TGAAA	2	10	98340	98349	60 %	20 %	20 %	0 %	410672454
47	NC_018877	GTAAT	2	10	99305	99314	40 %	40 %	20 %	0 %	410672455
48	NC_018877	CATTC	2	10	103163	103172	20 %	40 %	0 %	40 %	410672459
49	NC_018877	GAAAA	2	10	104051	104060	80 %	0 %	20 %	0 %	410672459
50	NC_018877	GAAAA	2	10	109740	109749	80 %	0 %	20 %	0 %	410672467
51	NC_018877	GAAAA	2	10	109756	109765	80 %	0 %	20 %	0 %	410672467
52	NC_018877	AGAAA	2	10	113375	113384	80 %	0 %	20 %	0 %	410672472
53	NC_018877	TAACG	2	10	118917	118926	40 %	20 %	20 %	20 %	410672474
54	NC_018877	CAATC	2	10	119451	119460	40 %	20 %	0 %	40 %	410672474
55	NC_018877	AACAT	2	10	121159	121168	60 %	20 %	0 %	20 %	410672475
56	NC_018877	ACGTG	2	10	121849	121858	20 %	20 %	40 %	20 %	410672477
57	NC_018877	TCGTA	2	10	122885	122894	20 %	40 %	20 %	20 %	410672478
58	NC_018877	TGGTA	2	10	129973	129982	20 %	40 %	40 %	0 %	410672487
59	NC_018877	GTGCG	2	10	137213	137222	0 %	20 %	60 %	20 %	410672502
60	NC_018877	GAAAT	2	10	141838	141847	60 %	20 %	20 %	0 %	410672510
61	NC_018877	GAGCA	2	10	144852	144861	40 %	0 %	40 %	20 %	410672514
62	NC_018877	AAAAG	2	10	145516	145525	80 %	0 %	20 %	0 %	410672516
63	NC_018877	GATAA	2	10	147335	147344	60 %	20 %	20 %	0 %	410672518
64	NC_018877	CTTGG	2	10	148170	148179	0 %	40 %	40 %	20 %	410672519
65	NC_018877	GTTTT	2	10	148889	148898	0 %	80 %	20 %	0 %	410672520
66	NC_018877	ATGTG	2	10	157259	157268	20 %	40 %	40 %	0 %	410672523
67	NC_018877	CAAAA	2	10	161218	161227	80 %	0 %	0 %	20 %	410672526
68	NC_018877	ATTAC	2	10	162479	162488	40 %	40 %	0 %	20 %	410672527
69	NC_018877	AAGTA	2	10	163549	163558	60 %	20 %	20 %	0 %	410672528
70	NC_018877	ACAGC	2	10	164519	164528	40 %	0 %	20 %	40 %	410672528
71	NC_018877	CGTAG	2	10	164714	164723	20 %	20 %	40 %	20 %	410672528
72	NC_018877	AGAAT	2	10	172465	172474	60 %	20 %	20 %	0 %	410672534
73	NC_018877	TTCAC	2	10	173242	173251	20 %	40 %	0 %	40 %	410672535
74	NC_018877	TGCTT	2	10	177676	177685	0 %	60 %	20 %	20 %	410672539
75	NC_018877	TCTAT	2	10	177921	177930	20 %	60 %	0 %	20 %	410672539
76	NC_018877	AAAGG	2	10	178956	178965	60 %	0 %	40 %	0 %	410672540
77	NC_018877	AAAAG	2	10	182109	182118	80 %	0 %	20 %	0 %	410672543
78	NC_018877	TTTTA	2	10	183472	183481	20 %	80 %	0 %	0 %	410672545
79	NC_018877	ATCTT	2	10	184952	184961	20 %	60 %	0 %	20 %	410672546
80	NC_018877	AACGT	2	10	184967	184976	40 %	20 %	20 %	20 %	410672546
81	NC_018877	ATGGG	2	10	188039	188048	20 %	20 %	60 %	0 %	410672549
82	NC_018877	TATTT	2	10	188373	188382	20 %	80 %	0 %	0 %	410672550
83	NC_018877	AGTTT	2	10	188692	188701	20 %	60 %	20 %	0 %	410672550
84	NC_018877	TATTG	2	10	189134	189143	20 %	60 %	20 %	0 %	410672551
85	NC_018877	TAAAT	2	10	190272	190281	60 %	40 %	0 %	0 %	410672552
86	NC_018877	TTTGT	2	10	192043	192052	0 %	80 %	20 %	0 %	410672553
87	NC_018877	AAACC	2	10	194116	194125	60 %	0 %	0 %	40 %	410672554
88	NC_018877	TTGAT	2	10	194710	194719	20 %	60 %	20 %	0 %	410672555
89	NC_018877	TTTTA	2	10	195519	195528	20 %	80 %	0 %	0 %	410672556
90	NC_018877	GTTTT	2	10	195969	195978	0 %	80 %	20 %	0 %	410672557
91	NC_018877	GATAT	2	10	199565	199574	40 %	40 %	20 %	0 %	410672560
92	NC_018877	TACCT	2	10	200166	200175	20 %	40 %	0 %	40 %	410672563
93	NC_018877	TAATT	2	10	200818	200827	40 %	60 %	0 %	0 %	410672563
94	NC_018877	ATTTT	2	10	201132	201141	20 %	80 %	0 %	0 %	410672564
95	NC_018877	ATTGT	2	10	201178	201187	20 %	60 %	20 %	0 %	410672564
96	NC_018877	AGCTG	2	10	202107	202116	20 %	20 %	40 %	20 %	410672565
97	NC_018877	AATCA	2	10	203238	203247	60 %	20 %	0 %	20 %	410672567
98	NC_018877	AAAAG	2	10	203821	203830	80 %	0 %	20 %	0 %	410672569
99	NC_018877	AAAAC	2	10	204061	204070	80 %	0 %	0 %	20 %	410672569
100	NC_018877	GTTAA	2	10	206053	206062	40 %	40 %	20 %	0 %	410672571
101	NC_018877	GAAGA	2	10	207428	207437	60 %	0 %	40 %	0 %	410672574
102	NC_018877	GTTTC	2	10	209634	209643	0 %	60 %	20 %	20 %	410672575
103	NC_018877	TTTTA	2	10	213742	213751	20 %	80 %	0 %	0 %	410672579
104	NC_018877	AAAAG	2	10	215387	215396	80 %	0 %	20 %	0 %	410672581
105	NC_018877	TGGAT	2	10	215709	215718	20 %	40 %	40 %	0 %	410672581
106	NC_018877	TTATT	2	10	216833	216842	20 %	80 %	0 %	0 %	410672581
107	NC_018877	AATTA	2	10	217506	217515	60 %	40 %	0 %	0 %	410672582
108	NC_018877	ATTAC	2	10	217789	217798	40 %	40 %	0 %	20 %	410672582
109	NC_018877	TATTC	2	10	219770	219779	20 %	60 %	0 %	20 %	410672584
110	NC_018877	GAAGT	2	10	220153	220162	40 %	20 %	40 %	0 %	410672585
111	NC_018877	TATTC	2	10	222637	222646	20 %	60 %	0 %	20 %	410672589
112	NC_018877	GAAAG	2	10	224832	224841	60 %	0 %	40 %	0 %	410672591
113	NC_018877	GACGT	2	10	225019	225028	20 %	20 %	40 %	20 %	410672591
114	NC_018877	GGATG	2	10	225905	225914	20 %	20 %	60 %	0 %	410672592
115	NC_018877	AAATT	2	10	229646	229655	60 %	40 %	0 %	0 %	410672595
116	NC_018877	CTGCA	2	10	231059	231068	20 %	20 %	20 %	40 %	410672596
117	NC_018877	AAGAA	2	10	233137	233146	80 %	0 %	20 %	0 %	410672597
118	NC_018877	GACAT	2	10	234334	234343	40 %	20 %	20 %	20 %	410672598
119	NC_018877	CTTTA	2	10	237021	237030	20 %	60 %	0 %	20 %	410672601
120	NC_018877	ACGTT	2	10	237991	238000	20 %	40 %	20 %	20 %	410672602
121	NC_018877	GATAT	2	10	250204	250213	40 %	40 %	20 %	0 %	410672609
122	NC_018877	TAATT	2	10	252377	252386	40 %	60 %	0 %	0 %	410672611
123	NC_018877	CATTT	2	10	252463	252472	20 %	60 %	0 %	20 %	410672611
124	NC_018877	AACTC	2	10	257771	257780	40 %	20 %	0 %	40 %	410672616
125	NC_018877	AAGAG	2	10	259760	259769	60 %	0 %	40 %	0 %	410672618
126	NC_018877	AACTT	2	10	260343	260352	40 %	40 %	0 %	20 %	410672619
127	NC_018877	GCGTA	2	10	262471	262480	20 %	20 %	40 %	20 %	410672620
128	NC_018877	GGCGT	2	10	263781	263790	0 %	20 %	60 %	20 %	410672621
129	NC_018877	TTATT	2	10	273750	273759	20 %	80 %	0 %	0 %	410672625
130	NC_018877	TCCAT	2	10	279954	279963	20 %	40 %	0 %	40 %	410672626
131	NC_018877	GAACA	2	10	289049	289058	60 %	0 %	20 %	20 %	410672629
132	NC_018877	TTATT	2	10	290056	290065	20 %	80 %	0 %	0 %	410672630
133	NC_018877	ACTTT	2	10	291854	291863	20 %	60 %	0 %	20 %	410672632
134	NC_018877	GATAA	2	10	295010	295019	60 %	20 %	20 %	0 %	410672635
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