MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 136985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018829	CAG	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417863
1003	NC_018829	GAT	2	6	44904	44909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417863
1004	NC_018829	CGTCTC	2	12	44928	44939	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410417863
1005	NC_018829	CCG	2	6	44990	44995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1006	NC_018829	GCA	2	6	44999	45004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417864
1007	NC_018829	CCG	2	6	45056	45061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1008	NC_018829	GGC	2	6	45094	45099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417864
1009	NC_018829	GGC	2	6	45121	45126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417864
1010	NC_018829	CGC	2	6	45167	45172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1011	NC_018829	GCGT	2	8	45278	45285	0 %	25 %	50 %	25 %	410417864
1012	NC_018829	TCA	2	6	45296	45301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417864
1013	NC_018829	GGT	2	6	45324	45329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417864
1014	NC_018829	CGGC	2	8	45350	45357	0 %	0 %	50 %	50 %	410417864
1015	NC_018829	CGC	2	6	45363	45368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417864
1016	NC_018829	GCTT	2	8	45390	45397	0 %	50 %	25 %	25 %	410417864
1017	NC_018829	CGC	2	6	45468	45473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417865
1018	NC_018829	TGG	2	6	45496	45501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1019	NC_018829	CATC	2	8	45670	45677	25 %	25 %	0 %	50 %	410417865
1020	NC_018829	GGT	3	9	45695	45703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1021	NC_018829	AAGA	2	8	45723	45730	75 %	0 %	25 %	0 %	410417865
1022	NC_018829	GGCC	2	8	45737	45744	0 %	0 %	50 %	50 %	410417865
1023	NC_018829	TGT	2	6	45859	45864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410417865
1024	NC_018829	TCG	2	6	45982	45987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1025	NC_018829	GCT	2	6	46013	46018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1026	NC_018829	GTG	2	6	46098	46103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1027	NC_018829	CAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417865
1028	NC_018829	CCG	2	6	46224	46229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417865
1029	NC_018829	CGT	2	6	46237	46242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1030	NC_018829	GCG	2	6	46285	46290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417865
1031	NC_018829	TGC	2	6	46316	46321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1032	NC_018829	TCT	2	6	46378	46383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417865
1033	NC_018829	GAA	2	6	46436	46441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417865
1034	NC_018829	GCG	2	6	46444	46449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417865
1035	NC_018829	TCCG	2	8	46465	46472	0 %	25 %	25 %	50 %	410417865
1036	NC_018829	CG	3	6	46484	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	410417865
1037	NC_018829	GCTG	2	8	46520	46527	0 %	25 %	50 %	25 %	410417865
1038	NC_018829	TGCT	2	8	46551	46558	0 %	50 %	25 %	25 %	410417865
1039	NC_018829	GGT	2	6	46602	46607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1040	NC_018829	ATT	2	6	46620	46625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410417865
1041	NC_018829	GTG	2	6	46629	46634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417865
1042	NC_018829	ATG	2	6	46668	46673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417865
1043	NC_018829	GCT	2	6	46691	46696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417865
1044	NC_018829	AAG	2	6	46698	46703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417865
1045	NC_018829	GAC	2	6	46758	46763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417866
1046	NC_018829	GTG	2	6	46839	46844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417866
1047	NC_018829	GTG	2	6	47065	47070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417867
1048	NC_018829	AGC	2	6	47099	47104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417867
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1050	NC_018829	CG	3	6	47239	47244	0 %	0 %	50 %	50 %	410417868
1051	NC_018829	GCT	2	6	47262	47267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417868
1052	NC_018829	CGT	2	6	47364	47369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417868
1053	NC_018829	CCCGCA	2	12	47473	47484	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410417868
1054	NC_018829	CGT	2	6	47493	47498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417868
1055	NC_018829	GCT	2	6	47499	47504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417868
1056	NC_018829	GAA	2	6	47513	47518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417868
1057	NC_018829	CCA	2	6	47551	47556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417869
1058	NC_018829	GCG	2	6	47557	47562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417869
1059	NC_018829	CG	3	6	47566	47571	0 %	0 %	50 %	50 %	410417869
1060	NC_018829	AAG	2	6	47586	47591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417869
1061	NC_018829	CAA	2	6	47630	47635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417869
1062	NC_018829	CAT	2	6	47639	47644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417869
1063	NC_018829	ACCG	2	8	47652	47659	25 %	0 %	25 %	50 %	410417869
1064	NC_018829	GCG	2	6	47692	47697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417869
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1067	NC_018829	GCCCCG	2	12	47812	47823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417869
1068	NC_018829	TCG	2	6	47832	47837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417869
1069	NC_018829	GC	4	8	47840	47847	0 %	0 %	50 %	50 %	410417869
1070	NC_018829	CCG	2	6	47916	47921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417869
1071	NC_018829	CGT	3	9	47925	47933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417869
1072	NC_018829	CGC	2	6	47987	47992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417870
1073	NC_018829	GC	4	8	48018	48025	0 %	0 %	50 %	50 %	410417870
1074	NC_018829	CGCT	2	8	48026	48033	0 %	25 %	25 %	50 %	410417870
1075	NC_018829	CGT	2	6	48197	48202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417870
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1084	NC_018829	TCG	2	6	48928	48933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417871
1085	NC_018829	CCGA	2	8	48949	48956	25 %	0 %	25 %	50 %	410417871
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1089	NC_018829	GTG	2	6	49045	49050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417871
1090	NC_018829	TGC	2	6	49085	49090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417871
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1095	NC_018829	AGC	2	6	49358	49363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417871
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1097	NC_018829	CGC	2	6	49523	49528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417871
1098	NC_018829	GATC	2	8	49530	49537	25 %	25 %	25 %	25 %	410417871
1099	NC_018829	TGC	3	9	49541	49549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417871
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1102	NC_018829	GAAC	2	8	49644	49651	50 %	0 %	25 %	25 %	410417871
1103	NC_018829	CAG	2	6	49973	49978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417872
1104	NC_018829	CACG	2	8	50021	50028	25 %	0 %	25 %	50 %	410417872
1105	NC_018829	GGT	2	6	50159	50164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417872
1106	NC_018829	CGG	2	6	50207	50212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417872
1107	NC_018829	GGC	2	6	50474	50479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417873
1108	NC_018829	GC	3	6	50478	50483	0 %	0 %	50 %	50 %	410417873
1109	NC_018829	GCG	2	6	50515	50520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417873
1110	NC_018829	GCG	2	6	50524	50529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417873
1111	NC_018829	AGGTC	2	10	50539	50548	20 %	20 %	40 %	20 %	410417873
1112	NC_018829	GACGT	2	10	50571	50580	20 %	20 %	40 %	20 %	410417873
1113	NC_018829	TGGGCA	2	12	50607	50618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410417873
1114	NC_018829	GGCA	2	8	50729	50736	25 %	0 %	50 %	25 %	410417873
1115	NC_018829	GATG	2	8	50797	50804	25 %	25 %	50 %	0 %	410417873
1116	NC_018829	GGC	2	6	50821	50826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417873
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1118	NC_018829	GAC	2	6	51015	51020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417874
1119	NC_018829	TGC	2	6	51052	51057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417874
1120	NC_018829	GCC	2	6	51099	51104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417874
1121	NC_018829	TG	3	6	51105	51110	0 %	50 %	50 %	0 %	410417874
1122	NC_018829	CTGT	2	8	51129	51136	0 %	50 %	25 %	25 %	410417874
1123	NC_018829	CGA	2	6	51167	51172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417874
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1125	NC_018829	ATC	2	6	51261	51266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417874
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1372	NC_018829	GCG	2	6	60123	60128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417881
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