MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 136985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018829	CGC	2	6	21750	21755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
502	NC_018829	GGA	2	6	21777	21782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410417833
503	NC_018829	GCC	2	6	21814	21819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
504	NC_018829	GCG	2	6	21900	21905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417833
505	NC_018829	GCCC	2	8	21914	21921	0 %	0 %	25 %	75 %	410417833
506	NC_018829	GTC	2	6	21958	21963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417833
507	NC_018829	GCC	2	6	21981	21986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417833
508	NC_018829	CACG	2	8	22032	22039	25 %	0 %	25 %	50 %	410417833
509	NC_018829	GCA	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
510	NC_018829	CGG	2	6	22113	22118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
511	NC_018829	TGA	2	6	22140	22145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
512	NC_018829	CGGCC	2	10	22149	22158	0 %	0 %	40 %	60 %	410417834
513	NC_018829	GCC	2	6	22207	22212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
514	NC_018829	TTCG	2	8	22216	22223	0 %	50 %	25 %	25 %	410417834
515	NC_018829	CGG	2	6	22227	22232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
516	NC_018829	CG	3	6	22239	22244	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
517	NC_018829	CGT	2	6	22293	22298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
518	NC_018829	CACG	2	8	22329	22336	25 %	0 %	25 %	50 %	410417834
519	NC_018829	CGGA	2	8	22359	22366	25 %	0 %	50 %	25 %	410417834
520	NC_018829	CAG	2	6	22387	22392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
521	NC_018829	GCA	2	6	22410	22415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
522	NC_018829	GTC	2	6	22420	22425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
523	NC_018829	TCG	2	6	22454	22459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
524	NC_018829	CG	6	12	22476	22487	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
525	NC_018829	TCG	2	6	22502	22507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
526	NC_018829	GCA	2	6	22518	22523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
527	NC_018829	CG	3	6	22567	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
528	NC_018829	TCG	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
529	NC_018829	CTG	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
530	NC_018829	CCA	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417834
531	NC_018829	GCG	2	6	22707	22712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
532	NC_018829	CG	3	6	22711	22716	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
533	NC_018829	TCG	2	6	22820	22825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
534	NC_018829	GC	3	6	22836	22841	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
535	NC_018829	GCG	2	6	22917	22922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
536	NC_018829	TCG	2	6	22961	22966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
537	NC_018829	GC	3	6	22973	22978	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
538	NC_018829	CGG	2	6	22989	22994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
539	NC_018829	GGCGC	2	10	23007	23016	0 %	0 %	60 %	40 %	410417834
540	NC_018829	CGC	2	6	23047	23052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
541	NC_018829	GCCG	2	8	23070	23077	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
542	NC_018829	CG	3	6	23076	23081	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
543	NC_018829	GCGTC	2	10	23094	23103	0 %	20 %	40 %	40 %	410417834
544	NC_018829	CG	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
545	NC_018829	CAG	2	6	23206	23211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
546	NC_018829	CGG	2	6	23239	23244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
547	NC_018829	GCA	2	6	23286	23291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
548	NC_018829	CCAGCA	2	12	23334	23345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410417834
549	NC_018829	CGG	2	6	23356	23361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
550	NC_018829	GCC	2	6	23441	23446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
551	NC_018829	CAG	3	9	23476	23484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
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553	NC_018829	GC	3	6	23548	23553	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
554	NC_018829	GCA	2	6	23559	23564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
555	NC_018829	GAT	2	6	23572	23577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
556	NC_018829	CGCC	2	8	23583	23590	0 %	0 %	25 %	75 %	410417834
557	NC_018829	CCA	2	6	23655	23660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417834
558	NC_018829	GCA	2	6	23703	23708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
559	NC_018829	G	7	7	23740	23746	0 %	0 %	100 %	0 %	410417834
560	NC_018829	GGCC	2	8	23769	23776	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
561	NC_018829	CGC	2	6	23817	23822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
562	NC_018829	TCA	2	6	23829	23834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417834
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564	NC_018829	TGA	2	6	23925	23930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
565	NC_018829	GCG	3	9	23939	23947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
566	NC_018829	GCG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
567	NC_018829	CG	4	8	23986	23993	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
568	NC_018829	CAC	2	6	24007	24012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417834
569	NC_018829	GCA	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
570	NC_018829	GCG	2	6	24034	24039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
571	NC_018829	GAT	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
572	NC_018829	CG	3	6	24115	24120	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
573	NC_018829	CAG	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
574	NC_018829	GTC	3	9	24196	24204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417834
575	NC_018829	GCTG	2	8	24229	24236	0 %	25 %	50 %	25 %	410417834
576	NC_018829	GCCG	2	8	24237	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
577	NC_018829	GCC	2	6	24292	24297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417834
578	NC_018829	CAG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417834
579	NC_018829	ATG	2	6	24344	24349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417834
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581	NC_018829	GCCA	2	8	24362	24369	25 %	0 %	25 %	50 %	410417834
582	NC_018829	CGGG	2	8	24374	24381	0 %	0 %	75 %	25 %	410417834
583	NC_018829	GCG	4	12	24397	24408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417834
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585	NC_018829	GCCGGT	2	12	24440	24451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410417835
586	NC_018829	GTA	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417835
587	NC_018829	GC	3	6	24577	24582	0 %	0 %	50 %	50 %	410417835
588	NC_018829	CCA	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417835
589	NC_018829	CG	3	6	24643	24648	0 %	0 %	50 %	50 %	410417835
590	NC_018829	TA	3	6	24659	24664	50 %	50 %	0 %	0 %	410417835
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593	NC_018829	GC	4	8	24717	24724	0 %	0 %	50 %	50 %	410417835
594	NC_018829	G	6	6	24739	24744	0 %	0 %	100 %	0 %	410417835
595	NC_018829	GCA	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417835
596	NC_018829	CGGCG	2	10	24830	24839	0 %	0 %	60 %	40 %	410417835
597	NC_018829	GCT	2	6	24884	24889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417835
598	NC_018829	GCT	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417835
599	NC_018829	GCC	2	6	24983	24988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417835
600	NC_018829	CG	3	6	24997	25002	0 %	0 %	50 %	50 %	410417835
601	NC_018829	GGC	2	6	25076	25081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417835
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608	NC_018829	GACC	2	8	25343	25350	25 %	0 %	25 %	50 %	410417835
609	NC_018829	TGCT	2	8	25375	25382	0 %	50 %	25 %	25 %	410417835
610	NC_018829	TC	3	6	25426	25431	0 %	50 %	0 %	50 %	410417835
611	NC_018829	GGGCT	2	10	25445	25454	0 %	20 %	60 %	20 %	410417835
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616	NC_018829	CG	3	6	25737	25742	0 %	0 %	50 %	50 %	410417836
617	NC_018829	A	6	6	25765	25770	100 %	0 %	0 %	0 %	410417836
618	NC_018829	GGC	2	6	25796	25801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417836
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621	NC_018829	CG	3	6	25923	25928	0 %	0 %	50 %	50 %	410417836
622	NC_018829	CGG	2	6	25938	25943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417836
623	NC_018829	GTC	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417836
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625	NC_018829	TCG	2	6	26078	26083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417836
626	NC_018829	GCC	2	6	26144	26149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417836
627	NC_018829	AG	3	6	26197	26202	50 %	0 %	50 %	0 %	410417836
628	NC_018829	CTG	2	6	26206	26211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417836
629	NC_018829	TGC	2	6	26216	26221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417836
630	NC_018829	GC	4	8	26568	26575	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
631	NC_018829	GCCG	2	8	26598	26605	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
632	NC_018829	CGA	2	6	26666	26671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417837
633	NC_018829	CAT	2	6	26687	26692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417837
634	NC_018829	GCA	2	6	26694	26699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417837
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636	NC_018829	TGAG	2	8	26761	26768	25 %	25 %	50 %	0 %	410417837
637	NC_018829	ACG	2	6	26776	26781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417837
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639	NC_018829	CAT	2	6	26861	26866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417837
640	NC_018829	GGC	2	6	26874	26879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417837
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642	NC_018829	CTGC	2	8	26906	26913	0 %	25 %	25 %	50 %	410417837
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644	NC_018829	GCCG	2	8	26942	26949	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
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649	NC_018829	GCTGTC	2	12	27104	27115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417837
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651	NC_018829	CGGC	2	8	27154	27161	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
652	NC_018829	GCTG	2	8	27194	27201	0 %	25 %	50 %	25 %	410417837
653	NC_018829	CGG	2	6	27211	27216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417837
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660	NC_018829	CGG	2	6	28200	28205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417838
661	NC_018829	GGT	2	6	28233	28238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417838
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739	NC_018829	CTG	2	6	31568	31573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
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745	NC_018829	GGT	2	6	31891	31896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417841
746	NC_018829	GCG	2	6	31914	31919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417841
747	NC_018829	GAAATC	2	12	31937	31948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410417841
748	NC_018829	GAC	2	6	31972	31977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417841
749	NC_018829	GCT	2	6	32005	32010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
750	NC_018829	GGCG	2	8	32023	32030	0 %	0 %	75 %	25 %	410417841
751	NC_018829	CTG	2	6	32045	32050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
752	NC_018829	TTC	2	6	32180	32185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417841
753	NC_018829	ACG	2	6	32216	32221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417841
754	NC_018829	CGG	2	6	32247	32252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417841
755	NC_018829	TGC	2	6	32265	32270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
756	NC_018829	GCT	2	6	32299	32304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
757	NC_018829	GAA	2	6	32321	32326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417841
758	NC_018829	CGT	2	6	32374	32379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417841
759	NC_018829	ATC	2	6	32387	32392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417841
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761	NC_018829	CGT	2	6	32600	32605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417842
762	NC_018829	ACG	2	6	32607	32612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417842
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766	NC_018829	CGTCGA	2	12	32746	32757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410417842
767	NC_018829	ACGCCC	2	12	33143	33154	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410417843
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784	NC_018829	GTG	2	6	33927	33932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417844
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