MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	GAT	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708682
2	NC_018694	TGC	2	6	227	232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708682
3	NC_018694	TGC	2	6	242	247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708682
4	NC_018694	ACT	2	6	282	287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708682
5	NC_018694	ATG	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708682
6	NC_018694	ACA	2	6	420	425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708682
7	NC_018694	TGG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708682
8	NC_018694	TGA	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708682
9	NC_018694	AGA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708682
10	NC_018694	TAA	2	6	630	635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708682
11	NC_018694	GTC	2	6	810	815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708683
12	NC_018694	AGA	3	9	886	894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
13	NC_018694	AGC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708683
14	NC_018694	AGA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
15	NC_018694	AGA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
16	NC_018694	GCT	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708683
17	NC_018694	ATG	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708683
18	NC_018694	GTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708683
19	NC_018694	AAG	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
20	NC_018694	TGA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708683
21	NC_018694	GAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
22	NC_018694	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708683
23	NC_018694	TGA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708683
24	NC_018694	GCT	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708683
25	NC_018694	TGA	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708683
26	NC_018694	TCT	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708683
27	NC_018694	TAT	2	6	1551	1556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708683
28	NC_018694	CAC	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708683
29	NC_018694	AGG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407708683
30	NC_018694	AGA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
31	NC_018694	CTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708683
32	NC_018694	GAA	2	6	1733	1738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
33	NC_018694	AGA	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
34	NC_018694	TGC	2	6	1840	1845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708683
35	NC_018694	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708683
36	NC_018694	CAA	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708683
37	NC_018694	TAT	3	9	1947	1955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708684
38	NC_018694	GCA	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708684
39	NC_018694	ACA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708684
40	NC_018694	ATT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708684
41	NC_018694	TTC	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708684
42	NC_018694	ACA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708684
43	NC_018694	TGG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708684
44	NC_018694	GAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708684
45	NC_018694	ATA	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708684
46	NC_018694	GAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708684
47	NC_018694	TTC	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708684
48	NC_018694	ATG	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708684
49	NC_018694	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708684
50	NC_018694	TAA	2	6	2691	2696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708684
51	NC_018694	GAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708684
52	NC_018694	TTC	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708684
53	NC_018694	ACA	2	6	2809	2814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708684
54	NC_018694	TGA	3	9	2865	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708684
55	NC_018694	AGT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708685
56	NC_018694	AAG	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708685
57	NC_018694	AAG	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708685
58	NC_018694	AAG	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708685
59	NC_018694	CAA	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708686
60	NC_018694	AAG	2	6	3374	3379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708686
61	NC_018694	CTG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708686
62	NC_018694	ATG	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708686
63	NC_018694	GAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708686
64	NC_018694	TAT	2	6	3619	3624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708686
65	NC_018694	GTT	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708686
66	NC_018694	AGT	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708686
67	NC_018694	ATT	2	6	3699	3704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708686
68	NC_018694	GAT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708687
69	NC_018694	GAT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708687
70	NC_018694	AGA	3	9	3918	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708687
71	NC_018694	ACT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708687
72	NC_018694	CTG	3	9	3965	3973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708687
73	NC_018694	CTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708687
74	NC_018694	GAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708687
75	NC_018694	CAC	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708687
76	NC_018694	CAG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708688
77	NC_018694	AAG	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708688
78	NC_018694	CTG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708688
79	NC_018694	ATG	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708688
80	NC_018694	ATA	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708689
81	NC_018694	GAT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708689
82	NC_018694	CAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708689
83	NC_018694	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708689
84	NC_018694	ATA	2	6	4777	4782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708689
85	NC_018694	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708689
86	NC_018694	GTA	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708689
87	NC_018694	ACT	2	6	5062	5067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708690
88	NC_018694	ATG	2	6	5186	5191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708690
89	NC_018694	TAG	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708690
90	NC_018694	AGA	2	6	5334	5339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708690
91	NC_018694	ATT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708690
92	NC_018694	GTA	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708690
93	NC_018694	ACC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708690
94	NC_018694	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708690
95	NC_018694	TGA	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708691
96	NC_018694	CGA	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708691
97	NC_018694	ATT	2	6	5797	5802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708691
98	NC_018694	AGA	3	9	5898	5906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708691
99	NC_018694	AGC	2	6	5939	5944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708691
100	NC_018694	GAT	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708691
101	NC_018694	GAT	2	6	6001	6006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708691
102	NC_018694	TTA	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708691
103	NC_018694	GAA	2	6	6046	6051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708691
104	NC_018694	CAG	3	9	6179	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708691
105	NC_018694	GAT	2	6	6291	6296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708692
106	NC_018694	AGC	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708692
107	NC_018694	AAG	2	6	6364	6369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
108	NC_018694	GAA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
109	NC_018694	GAA	2	6	6423	6428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
110	NC_018694	TAC	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708692
111	NC_018694	ATC	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708692
112	NC_018694	AGA	2	6	6524	6529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
113	NC_018694	AAG	2	6	6568	6573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
114	NC_018694	GAA	2	6	6579	6584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708692
115	NC_018694	ACA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708693
116	NC_018694	GCT	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708693
117	NC_018694	AAG	2	6	6917	6922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708693
118	NC_018694	AAG	2	6	6986	6991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708693
119	NC_018694	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708693
120	NC_018694	TGG	2	6	7185	7190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708693
121	NC_018694	AGA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708693
122	NC_018694	AAT	2	6	7597	7602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708693
123	NC_018694	GCA	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708693
124	NC_018694	AAG	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708693
125	NC_018694	CAT	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708693
126	NC_018694	TCC	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407708693
127	NC_018694	TGC	2	6	7788	7793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708693
128	NC_018694	ATG	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708693
129	NC_018694	TTG	2	6	7916	7921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708693
130	NC_018694	TGG	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708693
131	NC_018694	ATG	2	6	8053	8058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708693
132	NC_018694	TGA	2	6	8066	8071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708693
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156	NC_018694	ATT	2	6	10104	10109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708694
157	NC_018694	TAT	2	6	10136	10141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708694
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160	NC_018694	CTT	3	9	10341	10349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708695
161	NC_018694	ACA	2	6	10360	10365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708695
162	NC_018694	TCT	2	6	10481	10486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708695
163	NC_018694	TAC	2	6	10654	10659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708695
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247	NC_018694	AGA	2	6	17155	17160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708701
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253	NC_018694	TAT	2	6	17520	17525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708701
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255	NC_018694	ATT	2	6	17649	17654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708701
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378	NC_018694	CCA	2	6	26752	26757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708712
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