MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	TTTTA	2	10	316	325	20 %	80 %	0 %	0 %	407702536
2	NC_018688	CTTTT	2	10	2188	2197	0 %	80 %	0 %	20 %	407702537
3	NC_018688	AAAAG	2	10	4051	4060	80 %	0 %	20 %	0 %	407702537
4	NC_018688	ATTGT	2	10	5461	5470	20 %	60 %	20 %	0 %	407702540
5	NC_018688	CTTCA	2	10	6090	6099	20 %	40 %	0 %	40 %	407702540
6	NC_018688	AAGAA	2	10	6600	6609	80 %	0 %	20 %	0 %	407702541
7	NC_018688	TTTTA	2	10	6842	6851	20 %	80 %	0 %	0 %	407702542
8	NC_018688	TTCAT	2	10	6909	6918	20 %	60 %	0 %	20 %	407702542
9	NC_018688	CTTTT	2	10	7946	7955	0 %	80 %	0 %	20 %	407702543
10	NC_018688	TTTTG	2	10	8088	8097	0 %	80 %	20 %	0 %	407702543
11	NC_018688	AAAAG	2	10	9309	9318	80 %	0 %	20 %	0 %	407702544
12	NC_018688	TGTCC	2	10	11104	11113	0 %	40 %	20 %	40 %	407702546
13	NC_018688	CGATC	2	10	13663	13672	20 %	20 %	20 %	40 %	407702547
14	NC_018688	CTTTT	2	10	14633	14642	0 %	80 %	0 %	20 %	407702548
15	NC_018688	AGTAA	2	10	16774	16783	60 %	20 %	20 %	0 %	407702550
16	NC_018688	TCCCA	2	10	16875	16884	20 %	20 %	0 %	60 %	407702550
17	NC_018688	ATAAA	2	10	18870	18879	80 %	20 %	0 %	0 %	407702552
18	NC_018688	AATTA	2	10	19922	19931	60 %	40 %	0 %	0 %	407702552
19	NC_018688	TTATC	2	10	20480	20489	20 %	60 %	0 %	20 %	407702553
20	NC_018688	GATAT	2	10	20512	20521	40 %	40 %	20 %	0 %	407702553
21	NC_018688	AATAA	2	10	23007	23016	80 %	20 %	0 %	0 %	407702555
22	NC_018688	TTTCC	2	10	23333	23342	0 %	60 %	0 %	40 %	407702555
23	NC_018688	TTTAG	2	10	25115	25124	20 %	60 %	20 %	0 %	407702558
24	NC_018688	TGTTT	2	10	31276	31285	0 %	80 %	20 %	0 %	407702570
25	NC_018688	TAAAA	2	10	32775	32784	80 %	20 %	0 %	0 %	407702571
26	NC_018688	ATTTA	2	10	42738	42747	40 %	60 %	0 %	0 %	407702575
27	NC_018688	GTTTT	2	10	42770	42779	0 %	80 %	20 %	0 %	407702575
28	NC_018688	TTTAT	2	10	43615	43624	20 %	80 %	0 %	0 %	407702575
29	NC_018688	CTACA	2	10	46436	46445	40 %	20 %	0 %	40 %	407702578
30	NC_018688	CAAAA	2	10	46691	46700	80 %	0 %	0 %	20 %	407702578
31	NC_018688	AAAAG	2	10	47022	47031	80 %	0 %	20 %	0 %	407702578
32	NC_018688	ATATT	2	10	48498	48507	40 %	60 %	0 %	0 %	407702579
33	NC_018688	ATTGA	2	10	48525	48534	40 %	40 %	20 %	0 %	407702579
34	NC_018688	GCATA	2	10	49090	49099	40 %	20 %	20 %	20 %	407702580
35	NC_018688	ATCAT	2	10	53366	53375	40 %	40 %	0 %	20 %	407702583
36	NC_018688	ATGAA	2	10	54072	54081	60 %	20 %	20 %	0 %	407702584
37	NC_018688	CCGTA	2	10	54917	54926	20 %	20 %	20 %	40 %	407702584
38	NC_018688	TTTAT	2	10	56664	56673	20 %	80 %	0 %	0 %	407702585
39	NC_018688	TGGAG	2	10	58813	58822	20 %	20 %	60 %	0 %	407702587
40	NC_018688	AATTA	2	10	59172	59181	60 %	40 %	0 %	0 %	407702588
41	NC_018688	ATTCT	2	10	59669	59678	20 %	60 %	0 %	20 %	407702588
42	NC_018688	ATCAA	2	10	59720	59729	60 %	20 %	0 %	20 %	407702588
43	NC_018688	ATTAA	2	10	59794	59803	60 %	40 %	0 %	0 %	407702588
44	NC_018688	TAGAG	2	10	62588	62597	40 %	20 %	40 %	0 %	407702591
45	NC_018688	CAATA	2	10	64425	64434	60 %	20 %	0 %	20 %	407702592
46	NC_018688	TGGTA	2	10	65089	65098	20 %	40 %	40 %	0 %	407702592
47	NC_018688	ATGTC	2	10	66193	66202	20 %	40 %	20 %	20 %	407702593
48	NC_018688	AATAT	2	10	67887	67896	60 %	40 %	0 %	0 %	407702594
49	NC_018688	AACGT	2	10	69408	69417	40 %	20 %	20 %	20 %	407702595
50	NC_018688	TTTTA	2	10	76452	76461	20 %	80 %	0 %	0 %	407702599
51	NC_018688	TCAGA	2	10	78630	78639	40 %	20 %	20 %	20 %	407702600
52	NC_018688	TACCA	2	10	79163	79172	40 %	20 %	0 %	40 %	407702600
53	NC_018688	GAAAT	2	10	79216	79225	60 %	20 %	20 %	0 %	407702600
54	NC_018688	TTCAA	2	10	79904	79913	40 %	40 %	0 %	20 %	407702601
55	NC_018688	AACGA	2	10	80824	80833	60 %	0 %	20 %	20 %	407702601
56	NC_018688	TTACT	2	10	84944	84953	20 %	60 %	0 %	20 %	407702603
57	NC_018688	AAATT	2	10	84980	84989	60 %	40 %	0 %	0 %	407702603
58	NC_018688	AAAAT	2	10	85331	85340	80 %	20 %	0 %	0 %	407702603
59	NC_018688	TTCAC	2	10	85882	85891	20 %	40 %	0 %	40 %	407702603
60	NC_018688	AAAGA	2	10	86941	86950	80 %	0 %	20 %	0 %	407702606
61	NC_018688	ATGAA	2	10	87053	87062	60 %	20 %	20 %	0 %	407702606
62	NC_018688	AAAAT	2	10	88626	88635	80 %	20 %	0 %	0 %	407702608
63	NC_018688	TTGTT	2	10	91790	91799	0 %	80 %	20 %	0 %	407702612
64	NC_018688	AAATA	2	10	92397	92406	80 %	20 %	0 %	0 %	407702614
65	NC_018688	GATGC	2	10	93344	93353	20 %	20 %	40 %	20 %	407702616
66	NC_018688	GAAAA	2	10	94103	94112	80 %	0 %	20 %	0 %	407702616
67	NC_018688	GATTT	2	10	94307	94316	20 %	60 %	20 %	0 %	407702616
68	NC_018688	CCAAT	2	10	95080	95089	40 %	20 %	0 %	40 %	407702617
69	NC_018688	TAAAA	2	10	97540	97549	80 %	20 %	0 %	0 %	407702618
70	NC_018688	CAATC	2	10	97578	97587	40 %	20 %	0 %	40 %	407702618
71	NC_018688	TAAAT	2	10	105664	105673	60 %	40 %	0 %	0 %	407702621
72	NC_018688	AATAC	2	10	106910	106919	60 %	20 %	0 %	20 %	407702621
73	NC_018688	AAAAC	2	10	108284	108293	80 %	0 %	0 %	20 %	407702622
74	NC_018688	GAAAA	2	10	108482	108491	80 %	0 %	20 %	0 %	407702622
75	NC_018688	TCTTT	2	10	113205	113214	0 %	80 %	0 %	20 %	407702627
76	NC_018688	GAAAC	2	10	114918	114927	60 %	0 %	20 %	20 %	407702630
77	NC_018688	AATCC	2	10	117115	117124	40 %	20 %	0 %	40 %	407702633
78	NC_018688	TTTAA	2	10	119581	119590	40 %	60 %	0 %	0 %	407702635
79	NC_018688	TTTCC	2	10	119792	119801	0 %	60 %	0 %	40 %	407702635
80	NC_018688	CATTC	2	10	119946	119955	20 %	40 %	0 %	40 %	407702635
81	NC_018688	TTATC	2	10	124414	124423	20 %	60 %	0 %	20 %	407702638
82	NC_018688	TTCCA	2	10	124921	124930	20 %	40 %	0 %	40 %	407702639
83	NC_018688	AATGT	2	10	127377	127386	40 %	40 %	20 %	0 %	407702640
84	NC_018688	ACCTT	2	10	127850	127859	20 %	40 %	0 %	40 %	407702640
85	NC_018688	TGTTT	2	10	129345	129354	0 %	80 %	20 %	0 %	407702641
86	NC_018688	GCCAT	2	10	129497	129506	20 %	20 %	20 %	40 %	407702641
87	NC_018688	GGCAT	2	10	132005	132014	20 %	20 %	40 %	20 %	407702645
88	NC_018688	CTTAT	2	10	133506	133515	20 %	60 %	0 %	20 %	407702648
89	NC_018688	ATTAT	2	10	134128	134137	40 %	60 %	0 %	0 %	407702649
90	NC_018688	AAAAT	2	10	136988	136997	80 %	20 %	0 %	0 %	407702653
91	NC_018688	GAAGA	2	10	140763	140772	60 %	0 %	40 %	0 %	407702654
92	NC_018688	AAATG	2	10	140909	140918	60 %	20 %	20 %	0 %	407702655
93	NC_018688	TTTAC	2	10	142102	142111	20 %	60 %	0 %	20 %	407702656
94	NC_018688	CAAAA	2	10	146288	146297	80 %	0 %	0 %	20 %	407702658
95	NC_018688	TACCT	2	10	149936	149945	20 %	40 %	0 %	40 %	407702660
96	NC_018688	ATGAA	2	10	151965	151974	60 %	20 %	20 %	0 %	407702663
97	NC_018688	ATATA	2	10	155661	155670	60 %	40 %	0 %	0 %	407702665
98	NC_018688	TCATT	2	10	157267	157276	20 %	60 %	0 %	20 %	407702667
99	NC_018688	GACAA	2	10	158468	158477	60 %	0 %	20 %	20 %	407702667
100	NC_018688	ATTTA	2	10	165087	165096	40 %	60 %	0 %	0 %	407702673
101	NC_018688	ATTTA	2	10	165267	165276	40 %	60 %	0 %	0 %	407702673
102	NC_018688	CTTTT	2	10	166422	166431	0 %	80 %	0 %	20 %	407702674
103	NC_018688	ATTGG	2	10	167905	167914	20 %	40 %	40 %	0 %	407702676
104	NC_018688	GGAGG	2	10	168858	168867	20 %	0 %	80 %	0 %	407702677
105	NC_018688	TAGTA	2	10	169645	169654	40 %	40 %	20 %	0 %	407702678
106	NC_018688	AATTA	2	10	169846	169855	60 %	40 %	0 %	0 %	407702678
107	NC_018688	ATAAA	2	10	169989	169998	80 %	20 %	0 %	0 %	407702678
108	NC_018688	GTATT	2	10	172786	172795	20 %	60 %	20 %	0 %	407702681
109	NC_018688	TTAAA	2	10	174619	174628	60 %	40 %	0 %	0 %	407702684
110	NC_018688	TTTAC	2	10	176820	176829	20 %	60 %	0 %	20 %	407702686
111	NC_018688	AGAAA	2	10	177384	177393	80 %	0 %	20 %	0 %	407702686
112	NC_018688	ATCGT	2	10	180396	180405	20 %	40 %	20 %	20 %	407702690
113	NC_018688	CAAAA	2	10	184101	184110	80 %	0 %	0 %	20 %	407702693
114	NC_018688	ATGGT	2	10	184461	184470	20 %	40 %	40 %	0 %	407702694
115	NC_018688	GCAAA	2	10	185519	185528	60 %	0 %	20 %	20 %	407702695
116	NC_018688	AAATT	2	10	185853	185862	60 %	40 %	0 %	0 %	407702695
117	NC_018688	ACTAT	2	10	185986	185995	40 %	40 %	0 %	20 %	407702695
118	NC_018688	TAATA	2	10	192697	192706	60 %	40 %	0 %	0 %	407702702
119	NC_018688	TAAAT	2	10	193803	193812	60 %	40 %	0 %	0 %	407702703
120	NC_018688	TAGTA	2	10	196563	196572	40 %	40 %	20 %	0 %	407702705
121	NC_018688	ATGGG	2	10	196651	196660	20 %	20 %	60 %	0 %	407702705
122	NC_018688	CTATT	2	10	197741	197750	20 %	60 %	0 %	20 %	407702706
123	NC_018688	TGGTA	2	10	198207	198216	20 %	40 %	40 %	0 %	407702706
124	NC_018688	AAAGA	2	10	198442	198451	80 %	0 %	20 %	0 %	407702706
125	NC_018688	TCAAT	4	20	200133	200152	40 %	40 %	0 %	20 %	407702708
126	NC_018688	TTAAA	2	10	200854	200863	60 %	40 %	0 %	0 %	407702710
127	NC_018688	ATGGA	2	10	203123	203132	40 %	20 %	40 %	0 %	407702711
128	NC_018688	TGGGA	2	10	205363	205372	20 %	20 %	60 %	0 %	407702713
129	NC_018688	ATTTT	2	10	208137	208146	20 %	80 %	0 %	0 %	407702715
130	NC_018688	AAAGT	2	10	208444	208453	60 %	20 %	20 %	0 %	407702716
131	NC_018688	GATTT	2	10	208734	208743	20 %	60 %	20 %	0 %	407702717
132	NC_018688	TTTAC	2	10	209653	209662	20 %	60 %	0 %	20 %	407702718
133	NC_018688	CACAT	2	10	210456	210465	40 %	20 %	0 %	40 %	407702719
134	NC_018688	TTTCT	2	10	210703	210712	0 %	80 %	0 %	20 %	407702720
135	NC_018688	TATTG	2	10	212345	212354	20 %	60 %	20 %	0 %	407702721
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.