MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 5463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018688	TCTTTT	2	12	24148	24159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702556
502	NC_018688	T	7	7	24156	24162	0 %	100 %	0 %	0 %	407702556
503	NC_018688	CAC	2	6	24309	24314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702557
504	NC_018688	ATT	2	6	24547	24552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702558
505	NC_018688	T	6	6	24592	24597	0 %	100 %	0 %	0 %	407702558
506	NC_018688	A	7	7	24668	24674	100 %	0 %	0 %	0 %	407702558
507	NC_018688	ATC	2	6	24747	24752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702558
508	NC_018688	A	7	7	24839	24845	100 %	0 %	0 %	0 %	407702558
509	NC_018688	CGTT	2	8	24901	24908	0 %	50 %	25 %	25 %	407702558
510	NC_018688	AGA	2	6	24937	24942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702558
511	NC_018688	ACA	2	6	24958	24963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702558
512	NC_018688	GAAA	2	8	25003	25010	75 %	0 %	25 %	0 %	407702558
513	NC_018688	AAC	2	6	25011	25016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702558
514	NC_018688	TTC	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702558
515	NC_018688	ATG	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702558
516	NC_018688	ATT	2	6	25099	25104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702558
517	NC_018688	TTTAG	2	10	25115	25124	20 %	60 %	20 %	0 %	407702558
518	NC_018688	A	6	6	25180	25185	100 %	0 %	0 %	0 %	407702558
519	NC_018688	AGA	2	6	25201	25206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702558
520	NC_018688	ATCC	2	8	25216	25223	25 %	25 %	0 %	50 %	407702558
521	NC_018688	AGA	2	6	25264	25269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702558
522	NC_018688	CGA	2	6	25459	25464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702558
523	NC_018688	A	6	6	25499	25504	100 %	0 %	0 %	0 %	407702558
524	NC_018688	TTA	2	6	25570	25575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702558
525	NC_018688	GCC	2	6	25586	25591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702558
526	NC_018688	CTA	2	6	25721	25726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702558
527	NC_018688	GAT	2	6	25767	25772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702558
528	NC_018688	CTT	2	6	25977	25982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702559
529	NC_018688	T	6	6	26004	26009	0 %	100 %	0 %	0 %	407702559
530	NC_018688	TTC	2	6	26024	26029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702559
531	NC_018688	TAG	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702559
532	NC_018688	TCT	2	6	26111	26116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702559
533	NC_018688	AAT	2	6	26126	26131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702559
534	NC_018688	GTT	2	6	26146	26151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702559
535	NC_018688	TCT	2	6	26186	26191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702559
536	NC_018688	T	7	7	26196	26202	0 %	100 %	0 %	0 %	407702559
537	NC_018688	ATT	2	6	26206	26211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702559
538	NC_018688	CTCA	2	8	26236	26243	25 %	25 %	0 %	50 %	407702559
539	NC_018688	CTT	2	6	26248	26253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702559
540	NC_018688	ACCAAT	2	12	26314	26325	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407702559
541	NC_018688	CAA	2	6	26340	26345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702559
542	NC_018688	CATG	2	8	26374	26381	25 %	25 %	25 %	25 %	407702559
543	NC_018688	T	7	7	26927	26933	0 %	100 %	0 %	0 %	407702560
544	NC_018688	CTA	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702560
545	NC_018688	T	6	6	26975	26980	0 %	100 %	0 %	0 %	407702560
546	NC_018688	ATA	2	6	27028	27033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702560
547	NC_018688	T	6	6	27165	27170	0 %	100 %	0 %	0 %	407702560
548	NC_018688	TTG	2	6	27295	27300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702561
549	NC_018688	TGT	2	6	27301	27306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702561
550	NC_018688	TGC	2	6	27326	27331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702561
551	NC_018688	CTTT	2	8	27405	27412	0 %	75 %	0 %	25 %	407702561
552	NC_018688	TGA	2	6	27453	27458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702561
553	NC_018688	GAA	2	6	27505	27510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702561
554	NC_018688	TAA	2	6	27620	27625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702561
555	NC_018688	TGA	2	6	27634	27639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702561
556	NC_018688	ATG	2	6	27665	27670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702561
557	NC_018688	A	6	6	27680	27685	100 %	0 %	0 %	0 %	407702561
558	NC_018688	ATC	2	6	27716	27721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702561
559	NC_018688	GTT	2	6	27723	27728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702561
560	NC_018688	CTT	2	6	27839	27844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702561
561	NC_018688	TCCT	2	8	27869	27876	0 %	50 %	0 %	50 %	407702561
562	NC_018688	CT	4	8	27918	27925	0 %	50 %	0 %	50 %	407702562
563	NC_018688	TGC	2	6	27952	27957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702562
564	NC_018688	ATTG	2	8	27981	27988	25 %	50 %	25 %	0 %	407702562
565	NC_018688	TGC	2	6	28008	28013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702562
566	NC_018688	GAT	2	6	28046	28051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702562
567	NC_018688	TTC	2	6	28054	28059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702562
568	NC_018688	AAT	2	6	28189	28194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702563
569	NC_018688	CTTT	2	8	28225	28232	0 %	75 %	0 %	25 %	407702563
570	NC_018688	TTGC	2	8	28262	28269	0 %	50 %	25 %	25 %	407702563
571	NC_018688	TTC	2	6	28275	28280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702563
572	NC_018688	CAA	2	6	28284	28289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702563
573	NC_018688	A	7	7	28409	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	407702564
574	NC_018688	T	6	6	28535	28540	0 %	100 %	0 %	0 %	407702565
575	NC_018688	TATG	2	8	28607	28614	25 %	50 %	25 %	0 %	407702565
576	NC_018688	CCT	2	6	28629	28634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702565
577	NC_018688	GTT	2	6	28635	28640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702565
578	NC_018688	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702565
579	NC_018688	TGT	2	6	28698	28703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702565
580	NC_018688	TGGT	2	8	28745	28752	0 %	50 %	50 %	0 %	407702565
581	NC_018688	TGCT	2	8	28778	28785	0 %	50 %	25 %	25 %	407702565
582	NC_018688	GTT	2	6	28798	28803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702565
583	NC_018688	ATTC	2	8	28966	28973	25 %	50 %	0 %	25 %	407702566
584	NC_018688	ATA	2	6	28986	28991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702566
585	NC_018688	A	7	7	28999	29005	100 %	0 %	0 %	0 %	407702566
586	NC_018688	A	6	6	29026	29031	100 %	0 %	0 %	0 %	407702566
587	NC_018688	CAT	2	6	29084	29089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702566
588	NC_018688	TACT	2	8	29096	29103	25 %	50 %	0 %	25 %	407702566
589	NC_018688	TA	3	6	29298	29303	50 %	50 %	0 %	0 %	407702567
590	NC_018688	ATAA	2	8	29313	29320	75 %	25 %	0 %	0 %	407702567
591	NC_018688	TTG	2	6	29341	29346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702567
592	NC_018688	A	7	7	29357	29363	100 %	0 %	0 %	0 %	407702567
593	NC_018688	TAC	2	6	29414	29419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702567
594	NC_018688	A	6	6	29452	29457	100 %	0 %	0 %	0 %	407702567
595	NC_018688	CAC	2	6	29458	29463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702567
596	NC_018688	TAAA	2	8	29467	29474	75 %	25 %	0 %	0 %	407702567
597	NC_018688	TCT	2	6	29511	29516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702567
598	NC_018688	TTA	2	6	29517	29522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702567
599	NC_018688	A	7	7	29522	29528	100 %	0 %	0 %	0 %	407702567
600	NC_018688	ATAAAC	2	12	29626	29637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407702567
601	NC_018688	GAA	3	9	29646	29654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702567
602	NC_018688	TTA	2	6	29655	29660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702567
603	NC_018688	AAT	2	6	29793	29798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702568
604	NC_018688	TTG	2	6	29827	29832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702568
605	NC_018688	CCA	2	6	29993	29998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702569
606	NC_018688	CCG	2	6	29999	30004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702569
607	NC_018688	CAT	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702569
608	NC_018688	TGT	2	6	30068	30073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702569
609	NC_018688	TAA	2	6	30109	30114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702569
610	NC_018688	CTA	2	6	30126	30131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702569
611	NC_018688	T	6	6	30156	30161	0 %	100 %	0 %	0 %	407702569
612	NC_018688	TCA	2	6	30200	30205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702570
613	NC_018688	TACA	2	8	30226	30233	50 %	25 %	0 %	25 %	407702570
614	NC_018688	ATT	2	6	30241	30246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702570
615	NC_018688	TTAA	2	8	30272	30279	50 %	50 %	0 %	0 %	407702570
616	NC_018688	GTG	2	6	30321	30326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702570
617	NC_018688	TTC	2	6	30352	30357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702570
618	NC_018688	TATT	2	8	30363	30370	25 %	75 %	0 %	0 %	407702570
619	NC_018688	TTG	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702570
620	NC_018688	TTAA	2	8	30392	30399	50 %	50 %	0 %	0 %	407702570
621	NC_018688	TTTA	2	8	30442	30449	25 %	75 %	0 %	0 %	407702570
622	NC_018688	CCA	2	6	30457	30462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702570
623	NC_018688	GAAA	2	8	30549	30556	75 %	0 %	25 %	0 %	407702570
624	NC_018688	T	6	6	30565	30570	0 %	100 %	0 %	0 %	407702570
625	NC_018688	CAA	2	6	30610	30615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702570
626	NC_018688	GAA	2	6	30631	30636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702570
627	NC_018688	AG	3	6	30686	30691	50 %	0 %	50 %	0 %	407702570
628	NC_018688	T	6	6	30695	30700	0 %	100 %	0 %	0 %	407702570
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