MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 3107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018687	AAAAGG	2	12	27035	27046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
502	NC_018687	GAAAAA	2	12	27075	27086	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702378
503	NC_018687	GTT	2	6	27101	27106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702378
504	NC_018687	TAA	2	6	27158	27163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
505	NC_018687	TGAA	2	8	27193	27200	50 %	25 %	25 %	0 %	407702378
506	NC_018687	TTAA	2	8	27312	27319	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
507	NC_018687	TAA	2	6	27370	27375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
508	NC_018687	TAA	2	6	27383	27388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
509	NC_018687	TGAA	2	8	27418	27425	50 %	25 %	25 %	0 %	407702378
510	NC_018687	A	6	6	27444	27449	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
511	NC_018687	TAA	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
512	NC_018687	GAA	2	6	27546	27551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
513	NC_018687	AATAT	2	10	27562	27571	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
514	NC_018687	ACTA	2	8	27593	27600	50 %	25 %	0 %	25 %	407702378
515	NC_018687	TAA	2	6	27623	27628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
516	NC_018687	ATG	2	6	27646	27651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702378
517	NC_018687	TAA	2	6	27679	27684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
518	NC_018687	AGA	2	6	27773	27778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
519	NC_018687	AAG	2	6	27787	27792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
520	NC_018687	TTA	2	6	27821	27826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702378
521	NC_018687	A	6	6	27846	27851	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
522	NC_018687	AAG	2	6	27860	27865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
523	NC_018687	AGA	2	6	27908	27913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
524	NC_018687	A	7	7	27917	27923	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
525	NC_018687	TTA	2	6	27940	27945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702378
526	NC_018687	A	6	6	27945	27950	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
527	NC_018687	AGTTA	2	10	28042	28051	40 %	40 %	20 %	0 %	407702378
528	NC_018687	GAA	2	6	28110	28115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
529	NC_018687	A	6	6	28174	28179	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
530	NC_018687	GAAA	2	8	28298	28305	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
531	NC_018687	AGAA	2	8	28339	28346	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
532	NC_018687	A	8	8	28367	28374	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
533	NC_018687	A	6	6	28395	28400	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
534	NC_018687	AT	3	6	28445	28450	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
535	NC_018687	AGAA	2	8	28564	28571	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
536	NC_018687	TTA	2	6	28590	28595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702378
537	NC_018687	TAAA	2	8	28645	28652	75 %	25 %	0 %	0 %	407702378
538	NC_018687	GAAA	2	8	28745	28752	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
539	NC_018687	GAG	2	6	28782	28787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702378
540	NC_018687	TTA	2	6	28812	28817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702378
541	NC_018687	A	6	6	28842	28847	100 %	0 %	0 %	0 %	407702378
542	NC_018687	TAA	2	6	28919	28924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702378
543	NC_018687	AAG	2	6	28933	28938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
544	NC_018687	T	6	6	28980	28985	0 %	100 %	0 %	0 %	407702378
545	NC_018687	TA	3	6	29034	29039	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
546	NC_018687	GAA	2	6	29076	29081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
547	NC_018687	T	7	7	29091	29097	0 %	100 %	0 %	0 %	407702378
548	NC_018687	GAAGA	2	10	29149	29158	60 %	0 %	40 %	0 %	407702378
549	NC_018687	ATAA	2	8	29238	29245	75 %	25 %	0 %	0 %	407702378
550	NC_018687	ACC	2	6	29489	29494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702379
551	NC_018687	GAA	2	6	29520	29525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702379
552	NC_018687	GGT	2	6	29528	29533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702379
553	NC_018687	ATC	2	6	29598	29603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702379
554	NC_018687	C	6	6	29643	29648	0 %	0 %	0 %	100 %	407702379
555	NC_018687	A	6	6	29827	29832	100 %	0 %	0 %	0 %	407702380
556	NC_018687	TGT	2	6	29889	29894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702380
557	NC_018687	ACAA	2	8	29895	29902	75 %	0 %	0 %	25 %	407702380
558	NC_018687	A	6	6	29901	29906	100 %	0 %	0 %	0 %	407702380
559	NC_018687	TTA	2	6	29923	29928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702380
560	NC_018687	TAA	2	6	29933	29938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702380
561	NC_018687	T	6	6	29970	29975	0 %	100 %	0 %	0 %	407702380
562	NC_018687	TGC	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702380
563	NC_018687	A	6	6	30100	30105	100 %	0 %	0 %	0 %	407702380
564	NC_018687	A	7	7	30124	30130	100 %	0 %	0 %	0 %	407702380
565	NC_018687	TGG	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702380
566	NC_018687	TA	3	6	30146	30151	50 %	50 %	0 %	0 %	407702380
567	NC_018687	TAA	2	6	30161	30166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702380
568	NC_018687	TGTT	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	407702380
569	NC_018687	CAT	2	6	30197	30202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702380
570	NC_018687	AATTT	2	10	30292	30301	40 %	60 %	0 %	0 %	407702380
571	NC_018687	TTA	2	6	30310	30315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702380
572	NC_018687	GTT	2	6	30320	30325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702380
573	NC_018687	AATTAT	2	12	30363	30374	50 %	50 %	0 %	0 %	407702380
574	NC_018687	T	6	6	30378	30383	0 %	100 %	0 %	0 %	407702380
575	NC_018687	T	8	8	30449	30456	0 %	100 %	0 %	0 %	407702380
576	NC_018687	TTA	2	6	30550	30555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702380
577	NC_018687	TA	3	6	30745	30750	50 %	50 %	0 %	0 %	407702381
578	NC_018687	GAA	2	6	30810	30815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702381
579	NC_018687	ATG	2	6	30850	30855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702381
580	NC_018687	TTTA	2	8	30856	30863	25 %	75 %	0 %	0 %	407702381
581	NC_018687	TAT	2	6	30882	30887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702381
582	NC_018687	A	6	6	30898	30903	100 %	0 %	0 %	0 %	407702381
583	NC_018687	GAA	2	6	30906	30911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702381
584	NC_018687	TGA	2	6	30923	30928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702381
585	NC_018687	AAAG	2	8	31098	31105	75 %	0 %	25 %	0 %	407702382
586	NC_018687	GGTT	2	8	31120	31127	0 %	50 %	50 %	0 %	407702382
587	NC_018687	CTA	2	6	31150	31155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702382
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589	NC_018687	TTA	2	6	31321	31326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702383
590	NC_018687	A	7	7	31387	31393	100 %	0 %	0 %	0 %	407702383
591	NC_018687	T	6	6	31402	31407	0 %	100 %	0 %	0 %	407702383
592	NC_018687	TA	3	6	31459	31464	50 %	50 %	0 %	0 %	407702383
593	NC_018687	GAT	2	6	31477	31482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702383
594	NC_018687	G	6	6	31560	31565	0 %	0 %	100 %	0 %	407702383
595	NC_018687	TA	3	6	31568	31573	50 %	50 %	0 %	0 %	407702383
596	NC_018687	TCA	2	6	31593	31598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702383
597	NC_018687	ATG	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702383
598	NC_018687	CGC	2	6	31739	31744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702383
599	NC_018687	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	407702383
600	NC_018687	TGA	2	6	31799	31804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702383
601	NC_018687	CAA	2	6	31819	31824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702383
602	NC_018687	GGA	2	6	32301	32306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702384
603	NC_018687	CTA	2	6	32317	32322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702384
604	NC_018687	TAT	2	6	32330	32335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702384
605	NC_018687	AGA	2	6	32352	32357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702384
606	NC_018687	T	6	6	32370	32375	0 %	100 %	0 %	0 %	407702384
607	NC_018687	GGT	2	6	32415	32420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702384
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609	NC_018687	AAT	2	6	33237	33242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702385
610	NC_018687	CAA	2	6	33289	33294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702385
611	NC_018687	GTA	2	6	33361	33366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702386
612	NC_018687	TGC	2	6	33387	33392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702386
613	NC_018687	T	6	6	33440	33445	0 %	100 %	0 %	0 %	407702386
614	NC_018687	TAA	2	6	33549	33554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
615	NC_018687	AT	3	6	33602	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
616	NC_018687	AAT	3	9	33610	33618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
617	NC_018687	AAG	2	6	33648	33653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702386
618	NC_018687	ATA	2	6	33676	33681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
619	NC_018687	TAT	2	6	33709	33714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702386
620	NC_018687	TTA	2	6	33783	33788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702386
621	NC_018687	TA	3	6	33828	33833	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
622	NC_018687	TAA	2	6	33894	33899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
623	NC_018687	TCT	2	6	33904	33909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702386
624	NC_018687	AT	3	6	33948	33953	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
625	NC_018687	ATT	2	6	33956	33961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702386
626	NC_018687	GAAT	2	8	34020	34027	50 %	25 %	25 %	0 %	407702386
627	NC_018687	ATA	2	6	34028	34033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
628	NC_018687	TAA	2	6	34109	34114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702386
629	NC_018687	CCT	2	6	34219	34224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702386
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