MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	AACTT	2	10	3988	3997	40 %	40 %	0 %	20 %	407702037
2	NC_018685	GGATC	2	10	6228	6237	20 %	20 %	40 %	20 %	407702040
3	NC_018685	ATGGA	2	10	7131	7140	40 %	20 %	40 %	0 %	407702042
4	NC_018685	AAAAG	2	10	7478	7487	80 %	0 %	20 %	0 %	407702043
5	NC_018685	CTTTT	2	10	12989	12998	0 %	80 %	0 %	20 %	407702048
6	NC_018685	ATTTT	2	10	13222	13231	20 %	80 %	0 %	0 %	407702048
7	NC_018685	ATGTG	2	10	13483	13492	20 %	40 %	40 %	0 %	407702048
8	NC_018685	TAATT	2	10	13812	13821	40 %	60 %	0 %	0 %	407702049
9	NC_018685	TCATA	2	10	14458	14467	40 %	40 %	0 %	20 %	407702050
10	NC_018685	ATTTT	2	10	15036	15045	20 %	80 %	0 %	0 %	407702051
11	NC_018685	ATGAA	2	10	15661	15670	60 %	20 %	20 %	0 %	407702052
12	NC_018685	TTTGA	2	10	18165	18174	20 %	60 %	20 %	0 %	407702054
13	NC_018685	TGATT	2	10	18248	18257	20 %	60 %	20 %	0 %	407702054
14	NC_018685	TGTAA	2	10	19285	19294	40 %	40 %	20 %	0 %	407702055
15	NC_018685	ACGCA	2	10	21849	21858	40 %	0 %	20 %	40 %	407702060
16	NC_018685	TGAAA	2	10	22603	22612	60 %	20 %	20 %	0 %	407702060
17	NC_018685	TCTCT	2	10	25017	25026	0 %	60 %	0 %	40 %	407702063
18	NC_018685	AGAAA	2	10	27938	27947	80 %	0 %	20 %	0 %	407702065
19	NC_018685	TTTAT	2	10	29067	29076	20 %	80 %	0 %	0 %	407702067
20	NC_018685	TGGAA	2	10	29733	29742	40 %	20 %	40 %	0 %	407702068
21	NC_018685	AAAGG	2	10	30181	30190	60 %	0 %	40 %	0 %	407702069
22	NC_018685	AAAAC	2	10	30237	30246	80 %	0 %	0 %	20 %	407702069
23	NC_018685	TACTT	2	10	30298	30307	20 %	60 %	0 %	20 %	407702069
24	NC_018685	AGGAA	2	10	30462	30471	60 %	0 %	40 %	0 %	407702069
25	NC_018685	AATTG	2	10	33010	33019	40 %	40 %	20 %	0 %	407702072
26	NC_018685	CACAA	2	10	33142	33151	60 %	0 %	0 %	40 %	407702072
27	NC_018685	GGAAA	2	10	33297	33306	60 %	0 %	40 %	0 %	407702072
28	NC_018685	GTTAC	2	10	34168	34177	20 %	40 %	20 %	20 %	407702072
29	NC_018685	AAAAG	2	10	35737	35746	80 %	0 %	20 %	0 %	407702074
30	NC_018685	CAGGT	2	10	39204	39213	20 %	20 %	40 %	20 %	407702076
31	NC_018685	AGAAA	2	10	39421	39430	80 %	0 %	20 %	0 %	407702077
32	NC_018685	GAACA	2	10	39792	39801	60 %	0 %	20 %	20 %	407702077
33	NC_018685	ATGAT	2	10	42135	42144	40 %	40 %	20 %	0 %	407702082
34	NC_018685	ATTTT	2	10	43643	43652	20 %	80 %	0 %	0 %	407702084
35	NC_018685	TTATT	2	10	43744	43753	20 %	80 %	0 %	0 %	407702084
36	NC_018685	TTCCC	2	10	46096	46105	0 %	40 %	0 %	60 %	407702086
37	NC_018685	GTAGA	2	10	46806	46815	40 %	20 %	40 %	0 %	407702086
38	NC_018685	TAAGT	2	10	48352	48361	40 %	40 %	20 %	0 %	407702088
39	NC_018685	TAAAA	2	10	49432	49441	80 %	20 %	0 %	0 %	407702090
40	NC_018685	AAATC	2	10	52271	52280	60 %	20 %	0 %	20 %	407702095
41	NC_018685	TTTCA	2	10	60230	60239	20 %	60 %	0 %	20 %	407702102
42	NC_018685	AAAAG	2	10	61104	61113	80 %	0 %	20 %	0 %	407702102
43	NC_018685	TGGAT	2	10	63627	63636	20 %	40 %	40 %	0 %	407702103
44	NC_018685	TTTTC	2	10	63898	63907	0 %	80 %	0 %	20 %	407702103
45	NC_018685	TTGCT	2	10	63991	64000	0 %	60 %	20 %	20 %	407702103
46	NC_018685	AAAAG	2	10	68942	68951	80 %	0 %	20 %	0 %	407702106
47	NC_018685	TGGAA	2	10	69033	69042	40 %	20 %	40 %	0 %	407702106
48	NC_018685	ACAAA	2	10	69285	69294	80 %	0 %	0 %	20 %	407702107
49	NC_018685	CTTTT	2	10	69904	69913	0 %	80 %	0 %	20 %	407702108
50	NC_018685	AAAGA	2	10	70520	70529	80 %	0 %	20 %	0 %	407702108
51	NC_018685	AGTAC	2	10	70589	70598	40 %	20 %	20 %	20 %	407702108
52	NC_018685	GTATG	2	10	71927	71936	20 %	40 %	40 %	0 %	407702110
53	NC_018685	TTAAC	2	10	73017	73026	40 %	40 %	0 %	20 %	407702111
54	NC_018685	TTTTC	2	10	74814	74823	0 %	80 %	0 %	20 %	407702111
55	NC_018685	TTAAT	2	10	76435	76444	40 %	60 %	0 %	0 %	407702114
56	NC_018685	TTTCA	2	10	78120	78129	20 %	60 %	0 %	20 %	407702116
57	NC_018685	AACAA	2	10	79149	79158	80 %	0 %	0 %	20 %	407702117
58	NC_018685	AAAAC	2	10	80660	80669	80 %	0 %	0 %	20 %	407702118
59	NC_018685	GAAAA	2	10	80858	80867	80 %	0 %	20 %	0 %	407702118
60	NC_018685	AATTA	2	10	82249	82258	60 %	40 %	0 %	0 %	407702119
61	NC_018685	ATTTA	2	10	82429	82438	40 %	60 %	0 %	0 %	407702119
62	NC_018685	TTTCT	2	10	82441	82450	0 %	80 %	0 %	20 %	407702119
63	NC_018685	CTCAT	2	10	82721	82730	20 %	40 %	0 %	40 %	407702119
64	NC_018685	TAAAT	2	10	85561	85570	60 %	40 %	0 %	0 %	407702121
65	NC_018685	TTTAC	2	10	85792	85801	20 %	60 %	0 %	20 %	407702121
66	NC_018685	GAAAA	2	10	85957	85966	80 %	0 %	20 %	0 %	407702121
67	NC_018685	TATTT	2	10	87811	87820	20 %	80 %	0 %	0 %	407702124
68	NC_018685	ATTTA	2	10	90379	90388	40 %	60 %	0 %	0 %	407702128
69	NC_018685	AATTG	2	10	90598	90607	40 %	40 %	20 %	0 %	407702128
70	NC_018685	GAAAA	2	10	92713	92722	80 %	0 %	20 %	0 %	407702134
71	NC_018685	AACTT	2	10	93678	93687	40 %	40 %	0 %	20 %	407702135
72	NC_018685	TTCTA	2	10	93786	93795	20 %	60 %	0 %	20 %	407702135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.