MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 2626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	AAAAT	2	10	561	570	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
2	NC_018604	AAAAT	2	10	843	852	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
3	NC_018604	TATAT	2	10	1364	1373	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
4	NC_018604	AAAAT	2	10	1585	1594	80 %	20 %	0 %	0 %	434380780
5	NC_018604	TATTT	2	10	1634	1643	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
6	NC_018604	TATTT	2	10	1718	1727	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
7	NC_018604	TTTAA	2	10	2059	2068	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
8	NC_018604	TATGA	2	10	3182	3191	40 %	40 %	20 %	0 %	434380782
9	NC_018604	CTTCT	2	10	4453	4462	0 %	60 %	0 %	40 %	434380784
10	NC_018604	TATAA	2	10	5804	5813	60 %	40 %	0 %	0 %	434380786
11	NC_018604	TGTTT	2	10	5921	5930	0 %	80 %	20 %	0 %	434380786
12	NC_018604	TAATA	2	10	6807	6816	60 %	40 %	0 %	0 %	434380787
13	NC_018604	TTCTA	2	10	8455	8464	20 %	60 %	0 %	20 %	434380788
14	NC_018604	ATATT	2	10	9214	9223	40 %	60 %	0 %	0 %	434380789
15	NC_018604	TAAAA	2	10	11916	11925	80 %	20 %	0 %	0 %	434380790
16	NC_018604	ATTTA	2	10	12073	12082	40 %	60 %	0 %	0 %	434380790
17	NC_018604	TTTCT	2	10	13445	13454	0 %	80 %	0 %	20 %	434380792
18	NC_018604	TATTT	2	10	13679	13688	20 %	80 %	0 %	0 %	434380792
19	NC_018604	TAAAT	2	10	13850	13859	60 %	40 %	0 %	0 %	434380792
20	NC_018604	AAATA	2	10	16576	16585	80 %	20 %	0 %	0 %	434380793
21	NC_018604	AATAG	2	10	17765	17774	60 %	20 %	20 %	0 %	434380795
22	NC_018604	TGCAA	2	10	20283	20292	40 %	20 %	20 %	20 %	434380798
23	NC_018604	ATCTA	2	10	20511	20520	40 %	40 %	0 %	20 %	434380798
24	NC_018604	AATAC	2	10	20934	20943	60 %	20 %	0 %	20 %	434380799
25	NC_018604	ATATA	2	10	20968	20977	60 %	40 %	0 %	0 %	434380799
26	NC_018604	ATTTC	2	10	23806	23815	20 %	60 %	0 %	20 %	434380801
27	NC_018604	TATAA	2	10	29124	29133	60 %	40 %	0 %	0 %	434380806
28	NC_018604	ATAAA	2	10	30347	30356	80 %	20 %	0 %	0 %	434380807
29	NC_018604	GTTTT	2	10	30408	30417	0 %	80 %	20 %	0 %	434380807
30	NC_018604	ATTAC	2	10	30766	30775	40 %	40 %	0 %	20 %	434380808
31	NC_018604	TATCT	2	10	31419	31428	20 %	60 %	0 %	20 %	434380809
32	NC_018604	AGCAT	2	10	31461	31470	40 %	20 %	20 %	20 %	434380809
33	NC_018604	TTTTA	2	10	34774	34783	20 %	80 %	0 %	0 %	434380813
34	NC_018604	ACGTT	2	10	35252	35261	20 %	40 %	20 %	20 %	434380813
35	NC_018604	TGTTT	2	10	35325	35334	0 %	80 %	20 %	0 %	434380813
36	NC_018604	GTAAA	2	10	35870	35879	60 %	20 %	20 %	0 %	434380814
37	NC_018604	GAAAA	2	10	41054	41063	80 %	0 %	20 %	0 %	434380818
38	NC_018604	TTATT	2	10	43194	43203	20 %	80 %	0 %	0 %	434380820
39	NC_018604	ACATT	2	10	44046	44055	40 %	40 %	0 %	20 %	434380821
40	NC_018604	AGCAC	2	10	45586	45595	40 %	0 %	20 %	40 %	434380822
41	NC_018604	TATTT	2	10	47177	47186	20 %	80 %	0 %	0 %	434380823
42	NC_018604	GAAAA	2	10	48214	48223	80 %	0 %	20 %	0 %	434380824
43	NC_018604	CTTTT	2	10	49398	49407	0 %	80 %	0 %	20 %	434380825
44	NC_018604	ATTAA	2	10	49483	49492	60 %	40 %	0 %	0 %	434380825
45	NC_018604	TGATG	2	10	49735	49744	20 %	40 %	40 %	0 %	434380825
46	NC_018604	AATTA	2	10	50854	50863	60 %	40 %	0 %	0 %	434380826
47	NC_018604	ATTAT	2	10	52803	52812	40 %	60 %	0 %	0 %	434380827
48	NC_018604	TTCTT	2	10	53135	53144	0 %	80 %	0 %	20 %	434380827
49	NC_018604	TCTAT	2	10	55302	55311	20 %	60 %	0 %	20 %	434380828
50	NC_018604	TTAAT	2	10	56546	56555	40 %	60 %	0 %	0 %	434380829
51	NC_018604	TTAAA	2	10	58508	58517	60 %	40 %	0 %	0 %	434380830
52	NC_018604	ATACA	2	10	61134	61143	60 %	20 %	0 %	20 %	434380834
53	NC_018604	AGCCA	2	10	61147	61156	40 %	0 %	20 %	40 %	434380834
54	NC_018604	ATAAA	2	10	61973	61982	80 %	20 %	0 %	0 %	434380835
55	NC_018604	TTTCA	2	10	63002	63011	20 %	60 %	0 %	20 %	434380836
56	NC_018604	TTTTC	2	10	63343	63352	0 %	80 %	0 %	20 %	434380836
57	NC_018604	AAAAC	2	10	65695	65704	80 %	0 %	0 %	20 %	434380838
58	NC_018604	TATTT	2	10	66385	66394	20 %	80 %	0 %	0 %	434380839
59	NC_018604	GCCAA	2	10	67102	67111	40 %	0 %	20 %	40 %	434380839
60	NC_018604	TATCA	2	10	67537	67546	40 %	40 %	0 %	20 %	434380839
61	NC_018604	AAACA	2	10	68495	68504	80 %	0 %	0 %	20 %	434380840
62	NC_018604	TATAT	2	10	68723	68732	40 %	60 %	0 %	0 %	434380840
63	NC_018604	GTAAT	2	10	69332	69341	40 %	40 %	20 %	0 %	434380841
64	NC_018604	GAAAA	2	10	71332	71341	80 %	0 %	20 %	0 %	434380841
65	NC_018604	TTATA	2	10	71528	71537	40 %	60 %	0 %	0 %	434380841
66	NC_018604	GTATA	2	10	71724	71733	40 %	40 %	20 %	0 %	434380841
67	NC_018604	CATTT	2	10	72012	72021	20 %	60 %	0 %	20 %	434380842
68	NC_018604	ATATA	2	10	74765	74774	60 %	40 %	0 %	0 %	434380844
69	NC_018604	TGCTT	2	10	76050	76059	0 %	60 %	20 %	20 %	434380845
70	NC_018604	AAAGA	2	10	77552	77561	80 %	0 %	20 %	0 %	434380847
71	NC_018604	CAATA	2	10	78691	78700	60 %	20 %	0 %	20 %	434380848
72	NC_018604	TAATT	2	10	78730	78739	40 %	60 %	0 %	0 %	434380848
73	NC_018604	ATATA	2	10	78985	78994	60 %	40 %	0 %	0 %	434380848
74	NC_018604	ATTTT	2	10	79017	79026	20 %	80 %	0 %	0 %	434380848
75	NC_018604	TACTT	2	10	79150	79159	20 %	60 %	0 %	20 %	434380848
76	NC_018604	TTACA	2	10	80100	80109	40 %	40 %	0 %	20 %	434380848
77	NC_018604	TAAAG	2	10	80329	80338	60 %	20 %	20 %	0 %	434380848
78	NC_018604	ATAAA	2	10	80614	80623	80 %	20 %	0 %	0 %	434380849
79	NC_018604	TAGAA	2	10	81537	81546	60 %	20 %	20 %	0 %	434380850
80	NC_018604	TTTAA	2	10	82051	82060	40 %	60 %	0 %	0 %	434380851
81	NC_018604	AACCA	2	10	82122	82131	60 %	0 %	0 %	40 %	434380851
82	NC_018604	TTTAA	2	10	83335	83344	40 %	60 %	0 %	0 %	434380852
83	NC_018604	ATGAT	2	10	84456	84465	40 %	40 %	20 %	0 %	434380853
84	NC_018604	GATGT	2	10	85129	85138	20 %	40 %	40 %	0 %	434380854
85	NC_018604	GTTGG	2	10	87182	87191	0 %	40 %	60 %	0 %	434380856
86	NC_018604	GTGAT	2	10	89068	89077	20 %	40 %	40 %	0 %	434380859
87	NC_018604	ATATT	2	10	89437	89446	40 %	60 %	0 %	0 %	434380860
88	NC_018604	ATGAT	2	10	89878	89887	40 %	40 %	20 %	0 %	434380860
89	NC_018604	ACTAA	2	10	93350	93359	60 %	20 %	0 %	20 %	434380864
90	NC_018604	CAAGA	2	10	95144	95153	60 %	0 %	20 %	20 %	434380866
91	NC_018604	AACAG	2	10	98348	98357	60 %	0 %	20 %	20 %	434380868
92	NC_018604	TTAAT	2	10	98870	98879	40 %	60 %	0 %	0 %	434380869
93	NC_018604	ATGAG	2	10	99927	99936	40 %	20 %	40 %	0 %	434380870
94	NC_018604	ATTTT	2	10	101018	101027	20 %	80 %	0 %	0 %	434380871
95	NC_018604	ATAAA	2	10	102924	102933	80 %	20 %	0 %	0 %	434380874
96	NC_018604	ATATT	2	10	103398	103407	40 %	60 %	0 %	0 %	434380874
97	NC_018604	TTTAG	2	10	103685	103694	20 %	60 %	20 %	0 %	434380874
98	NC_018604	TTTAA	2	10	103850	103859	40 %	60 %	0 %	0 %	434380874
99	NC_018604	ATGGA	2	10	104139	104148	40 %	20 %	40 %	0 %	434380875
100	NC_018604	TGTTT	2	10	104521	104530	0 %	80 %	20 %	0 %	434380876
101	NC_018604	TATAA	2	10	107296	107305	60 %	40 %	0 %	0 %	434380878
102	NC_018604	GAAGT	2	10	107482	107491	40 %	20 %	40 %	0 %	434380879
103	NC_018604	TATAA	2	10	108198	108207	60 %	40 %	0 %	0 %	434380879
104	NC_018604	ATATT	2	10	108211	108220	40 %	60 %	0 %	0 %	434380879
105	NC_018604	ATATT	2	10	109602	109611	40 %	60 %	0 %	0 %	434380880
106	NC_018604	ATATA	2	10	110086	110095	60 %	40 %	0 %	0 %	434380881
107	NC_018604	AAGTA	2	10	111472	111481	60 %	20 %	20 %	0 %	434380882
108	NC_018604	AGGCT	2	10	114838	114847	20 %	20 %	40 %	20 %	434380885
109	NC_018604	TTAAT	2	10	115051	115060	40 %	60 %	0 %	0 %	434380885
110	NC_018604	ACAAA	2	10	116642	116651	80 %	0 %	0 %	20 %	434380887
111	NC_018604	TTAAT	2	10	118343	118352	40 %	60 %	0 %	0 %	434380887
112	NC_018604	ATATT	2	10	118697	118706	40 %	60 %	0 %	0 %	434380888
113	NC_018604	TTTTG	2	10	118754	118763	0 %	80 %	20 %	0 %	434380888
114	NC_018604	ATATT	2	10	118834	118843	40 %	60 %	0 %	0 %	434380888
115	NC_018604	TATCA	2	10	119342	119351	40 %	40 %	0 %	20 %	434380889
116	NC_018604	TAAAT	2	10	121425	121434	60 %	40 %	0 %	0 %	434380891
117	NC_018604	AAAAG	2	10	123954	123963	80 %	0 %	20 %	0 %	434380893
118	NC_018604	CTTTT	2	10	124115	124124	0 %	80 %	0 %	20 %	434380894
119	NC_018604	ATATC	2	10	125589	125598	40 %	40 %	0 %	20 %	434380894
120	NC_018604	TCATT	2	10	125599	125608	20 %	60 %	0 %	20 %	434380894
121	NC_018604	ATATA	2	10	126441	126450	60 %	40 %	0 %	0 %	434380895
122	NC_018604	ATTAT	2	10	128605	128614	40 %	60 %	0 %	0 %	434380897
123	NC_018604	TAATA	2	10	129534	129543	60 %	40 %	0 %	0 %	434380897
124	NC_018604	TTTTA	2	10	130570	130579	20 %	80 %	0 %	0 %	434380897
125	NC_018604	AAAAT	2	10	130917	130926	80 %	20 %	0 %	0 %	434380898
126	NC_018604	GATTA	2	10	131597	131606	40 %	40 %	20 %	0 %	434380899
127	NC_018604	AAATA	2	10	131682	131691	80 %	20 %	0 %	0 %	434380899
128	NC_018604	AAAAT	2	10	131791	131800	80 %	20 %	0 %	0 %	434380900
129	NC_018604	CAAAA	2	10	132122	132131	80 %	0 %	0 %	20 %	434380900
130	NC_018604	AATAA	2	10	133916	133925	80 %	20 %	0 %	0 %	434380902
131	NC_018604	ATATT	2	10	138050	138059	40 %	60 %	0 %	0 %	434380906
132	NC_018604	GGTTT	2	10	139881	139890	0 %	60 %	40 %	0 %	434380907
133	NC_018604	AACAG	5	25	140149	140173	60 %	0 %	20 %	20 %	434380907
134	NC_018604	AAAAT	2	10	142407	142416	80 %	20 %	0 %	0 %	434380911
135	NC_018604	ATAAA	2	10	142783	142792	80 %	20 %	0 %	0 %	434380911
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137	NC_018604	AATTT	2	10	142965	142974	40 %	60 %	0 %	0 %	434380911
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