MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 78024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	T	6	6	482	487	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
2	NC_018604	T	6	6	503	508	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
3	NC_018604	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
4	NC_018604	TAA	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
5	NC_018604	AAAAT	2	10	561	570	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
6	NC_018604	TA	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	434380779
7	NC_018604	ATA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
8	NC_018604	TAT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
9	NC_018604	TAAA	2	8	760	767	75 %	25 %	0 %	0 %	434380779
10	NC_018604	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
11	NC_018604	TTTA	2	8	821	828	25 %	75 %	0 %	0 %	434380779
12	NC_018604	AAAAT	2	10	843	852	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
13	NC_018604	TAG	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
14	NC_018604	ATAAAA	2	12	892	903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380779
15	NC_018604	TTTA	2	8	933	940	25 %	75 %	0 %	0 %	434380779
16	NC_018604	TAA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
17	NC_018604	GA	3	6	1002	1007	50 %	0 %	50 %	0 %	434380779
18	NC_018604	T	6	6	1014	1019	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
19	NC_018604	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
20	NC_018604	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
21	NC_018604	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
22	NC_018604	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
23	NC_018604	TTA	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
24	NC_018604	TAT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
25	NC_018604	AATA	2	8	1244	1251	75 %	25 %	0 %	0 %	434380779
26	NC_018604	AGT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
27	NC_018604	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
28	NC_018604	TTA	2	6	1318	1323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
29	NC_018604	TATAT	2	10	1364	1373	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
30	NC_018604	AG	3	6	1377	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	434380780
31	NC_018604	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
32	NC_018604	ATA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
33	NC_018604	TTTA	2	8	1413	1420	25 %	75 %	0 %	0 %	434380780
34	NC_018604	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
35	NC_018604	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380780
36	NC_018604	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
37	NC_018604	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
38	NC_018604	AAAAT	2	10	1585	1594	80 %	20 %	0 %	0 %	434380780
39	NC_018604	TATTT	2	10	1634	1643	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
40	NC_018604	AT	6	12	1679	1690	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
41	NC_018604	TA	3	6	1708	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
42	NC_018604	TATTT	2	10	1718	1727	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
43	NC_018604	TAG	3	9	1730	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380780
44	NC_018604	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
45	NC_018604	TAA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
46	NC_018604	AATT	2	8	1838	1845	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
47	NC_018604	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380780
48	NC_018604	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380780
49	NC_018604	TAA	3	9	1968	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
50	NC_018604	ATA	3	9	2018	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
51	NC_018604	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
52	NC_018604	TTTAA	2	10	2059	2068	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
53	NC_018604	AG	3	6	2074	2079	50 %	0 %	50 %	0 %	434380780
54	NC_018604	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
55	NC_018604	AT	3	6	2141	2146	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
56	NC_018604	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
57	NC_018604	AT	4	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
58	NC_018604	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	434380780
59	NC_018604	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
60	NC_018604	ATTA	2	8	2237	2244	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
61	NC_018604	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380781
62	NC_018604	CTT	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
63	NC_018604	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	434380781
64	NC_018604	TCT	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
65	NC_018604	T	6	6	2483	2488	0 %	100 %	0 %	0 %	434380781
66	NC_018604	AT	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	434380781
67	NC_018604	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	434380781
68	NC_018604	ATA	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
69	NC_018604	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
70	NC_018604	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
71	NC_018604	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
72	NC_018604	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
73	NC_018604	A	7	7	2730	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	434380782
74	NC_018604	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
75	NC_018604	TCT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
76	NC_018604	ATGC	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	434380782
77	NC_018604	ATA	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
78	NC_018604	T	7	7	2890	2896	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
79	NC_018604	T	6	6	2923	2928	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
80	NC_018604	TTTG	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	434380782
81	NC_018604	ACAA	2	8	2959	2966	75 %	0 %	0 %	25 %	434380782
82	NC_018604	AGT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380782
83	NC_018604	AAT	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
84	NC_018604	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
85	NC_018604	ATA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
86	NC_018604	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
87	NC_018604	TCA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380782
88	NC_018604	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
89	NC_018604	TATGA	2	10	3182	3191	40 %	40 %	20 %	0 %	434380782
90	NC_018604	T	7	7	3200	3206	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
91	NC_018604	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
92	NC_018604	CCA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380782
93	NC_018604	AT	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	434380782
94	NC_018604	TATGTT	2	12	3354	3365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380782
95	NC_018604	AT	3	6	3388	3393	50 %	50 %	0 %	0 %	434380782
96	NC_018604	ATA	2	6	3681	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
97	NC_018604	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
98	NC_018604	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
99	NC_018604	GAA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
100	NC_018604	AGA	3	9	3832	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
101	NC_018604	AGT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380783
102	NC_018604	AGA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
103	NC_018604	AGA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
104	NC_018604	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380783
105	NC_018604	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380784
106	NC_018604	TTGT	2	8	3977	3984	0 %	75 %	25 %	0 %	434380784
107	NC_018604	GT	3	6	4021	4026	0 %	50 %	50 %	0 %	434380784
108	NC_018604	TAT	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
109	NC_018604	TA	3	6	4093	4098	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
110	NC_018604	TCA	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380784
111	NC_018604	ATA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
112	NC_018604	TC	6	12	4228	4239	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
113	NC_018604	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
114	NC_018604	ATA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
115	NC_018604	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
116	NC_018604	TA	3	6	4342	4347	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
117	NC_018604	AT	3	6	4427	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
118	NC_018604	TC	3	6	4440	4445	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
119	NC_018604	CTTCT	2	10	4453	4462	0 %	60 %	0 %	40 %	434380784
120	NC_018604	A	7	7	4474	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	434380784
121	NC_018604	AT	3	6	4515	4520	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
122	NC_018604	TC	3	6	4540	4545	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
123	NC_018604	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
124	NC_018604	T	6	6	4721	4726	0 %	100 %	0 %	0 %	434380784
125	NC_018604	TAA	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
126	NC_018604	TATCAG	2	12	4774	4785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380785
127	NC_018604	TCA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
128	NC_018604	T	6	6	4842	4847	0 %	100 %	0 %	0 %	434380785
129	NC_018604	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
130	NC_018604	AGC	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
131	NC_018604	CAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
132	NC_018604	TAA	2	6	4946	4951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
133	NC_018604	TATT	2	8	4954	4961	25 %	75 %	0 %	0 %	434380785
134	NC_018604	GTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380785
135	NC_018604	ATC	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
136	NC_018604	ATT	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
137	NC_018604	T	8	8	5041	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	434380785
138	NC_018604	GCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
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161	NC_018604	T	6	6	5865	5870	0 %	100 %	0 %	0 %	434380786
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167	NC_018604	T	6	6	5942	5947	0 %	100 %	0 %	0 %	434380786
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172	NC_018604	T	6	6	6089	6094	0 %	100 %	0 %	0 %	434380786
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