MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 78024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018604	GTA	2	6	113407	113412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380884
3002	NC_018604	GAA	2	6	113424	113429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380884
3003	NC_018604	T	6	6	113451	113456	0 %	100 %	0 %	0 %	434380884
3004	NC_018604	AAG	2	6	113467	113472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380884
3005	NC_018604	ATG	2	6	113497	113502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380884
3006	NC_018604	ATT	2	6	113604	113609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380884
3007	NC_018604	ATT	2	6	113632	113637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380884
3008	NC_018604	TAT	2	6	113640	113645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380884
3009	NC_018604	AAC	2	6	113651	113656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380884
3010	NC_018604	AT	3	6	113666	113671	50 %	50 %	0 %	0 %	434380884
3011	NC_018604	A	6	6	113674	113679	100 %	0 %	0 %	0 %	434380884
3012	NC_018604	CTT	2	6	113680	113685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380884
3013	NC_018604	TTC	2	6	113690	113695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380884
3014	NC_018604	AGA	2	6	113709	113714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380884
3015	NC_018604	CCG	2	6	113745	113750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434380884
3016	NC_018604	GGA	2	6	113753	113758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434380884
3017	NC_018604	TAC	2	6	113862	113867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380884
3018	NC_018604	AGA	2	6	113893	113898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380884
3019	NC_018604	A	6	6	113898	113903	100 %	0 %	0 %	0 %	434380884
3020	NC_018604	TGAT	2	8	114088	114095	25 %	50 %	25 %	0 %	434380885
3021	NC_018604	TAA	2	6	114103	114108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3022	NC_018604	A	8	8	114114	114121	100 %	0 %	0 %	0 %	434380885
3023	NC_018604	GAT	2	6	114159	114164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3024	NC_018604	TAA	2	6	114167	114172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3025	NC_018604	AAT	2	6	114201	114206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3026	NC_018604	TTA	2	6	114211	114216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380885
3027	NC_018604	TGA	2	6	114233	114238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3028	NC_018604	TTAT	2	8	114355	114362	25 %	75 %	0 %	0 %	434380885
3029	NC_018604	ATGA	2	8	114420	114427	50 %	25 %	25 %	0 %	434380885
3030	NC_018604	TGA	2	6	114430	114435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3031	NC_018604	A	6	6	114456	114461	100 %	0 %	0 %	0 %	434380885
3032	NC_018604	TAT	2	6	114481	114486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380885
3033	NC_018604	AGA	2	6	114510	114515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380885
3034	NC_018604	ATA	2	6	114528	114533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3035	NC_018604	GA	3	6	114603	114608	50 %	0 %	50 %	0 %	434380885
3036	NC_018604	ACAG	2	8	114615	114622	50 %	0 %	25 %	25 %	434380885
3037	NC_018604	GAT	2	6	114624	114629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3038	NC_018604	TAA	2	6	114644	114649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3039	NC_018604	TGA	2	6	114722	114727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3040	NC_018604	ATG	2	6	114796	114801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3041	NC_018604	AGGCT	2	10	114838	114847	20 %	20 %	40 %	20 %	434380885
3042	NC_018604	TA	3	6	114861	114866	50 %	50 %	0 %	0 %	434380885
3043	NC_018604	TGA	2	6	114887	114892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3044	NC_018604	CTT	2	6	114933	114938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380885
3045	NC_018604	AT	3	6	114971	114976	50 %	50 %	0 %	0 %	434380885
3046	NC_018604	TAA	2	6	115010	115015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3047	NC_018604	A	6	6	115037	115042	100 %	0 %	0 %	0 %	434380885
3048	NC_018604	A	7	7	115044	115050	100 %	0 %	0 %	0 %	434380885
3049	NC_018604	TTAAT	2	10	115051	115060	40 %	60 %	0 %	0 %	434380885
3050	NC_018604	GAT	2	6	115068	115073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380885
3051	NC_018604	AAT	2	6	115086	115091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3052	NC_018604	AAAC	2	8	115122	115129	75 %	0 %	0 %	25 %	434380885
3053	NC_018604	AGAT	2	8	115172	115179	50 %	25 %	25 %	0 %	434380885
3054	NC_018604	AT	3	6	115178	115183	50 %	50 %	0 %	0 %	434380885
3055	NC_018604	ACT	2	6	115209	115214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380885
3056	NC_018604	GAA	2	6	115258	115263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380885
3057	NC_018604	ATT	2	6	115289	115294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380885
3058	NC_018604	CAT	2	6	115301	115306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380885
3059	NC_018604	ATT	2	6	115333	115338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380885
3060	NC_018604	TAA	2	6	115341	115346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380885
3061	NC_018604	CT	3	6	115388	115393	0 %	50 %	0 %	50 %	434380886
3062	NC_018604	T	6	6	115403	115408	0 %	100 %	0 %	0 %	434380886
3063	NC_018604	AT	4	8	115409	115416	50 %	50 %	0 %	0 %	434380886
3064	NC_018604	TA	5	10	115425	115434	50 %	50 %	0 %	0 %	434380886
3065	NC_018604	A	8	8	115446	115453	100 %	0 %	0 %	0 %	434380886
3066	NC_018604	TAA	2	6	115458	115463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380886
3067	NC_018604	TAA	2	6	115475	115480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380886
3068	NC_018604	T	8	8	115704	115711	0 %	100 %	0 %	0 %	434380887
3069	NC_018604	AGA	2	6	115716	115721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380887
3070	NC_018604	ATC	2	6	115722	115727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380887
3071	NC_018604	AGA	2	6	115743	115748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380887
3072	NC_018604	ATG	2	6	115762	115767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3073	NC_018604	T	6	6	115843	115848	0 %	100 %	0 %	0 %	434380887
3074	NC_018604	ATT	2	6	115943	115948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380887
3075	NC_018604	A	6	6	115971	115976	100 %	0 %	0 %	0 %	434380887
3076	NC_018604	AAAT	2	8	116073	116080	75 %	25 %	0 %	0 %	434380887
3077	NC_018604	TAA	2	6	116097	116102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3078	NC_018604	TTGCTA	2	12	116144	116155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380887
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3080	NC_018604	AAT	3	9	116200	116208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3081	NC_018604	TC	3	6	116252	116257	0 %	50 %	0 %	50 %	434380887
3082	NC_018604	AAAG	2	8	116287	116294	75 %	0 %	25 %	0 %	434380887
3083	NC_018604	ATA	2	6	116299	116304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
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3085	NC_018604	CAC	2	6	116343	116348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380887
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3088	NC_018604	AT	3	6	116473	116478	50 %	50 %	0 %	0 %	434380887
3089	NC_018604	CAT	2	6	116501	116506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380887
3090	NC_018604	AT	3	6	116513	116518	50 %	50 %	0 %	0 %	434380887
3091	NC_018604	ACA	2	6	116534	116539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380887
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3093	NC_018604	ACAAA	2	10	116642	116651	80 %	0 %	0 %	20 %	434380887
3094	NC_018604	AAT	2	6	116682	116687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3095	NC_018604	TGA	2	6	116709	116714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3096	NC_018604	ATAA	2	8	116716	116723	75 %	25 %	0 %	0 %	434380887
3097	NC_018604	TAA	2	6	116730	116735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3098	NC_018604	AAT	2	6	116775	116780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3099	NC_018604	AG	3	6	116808	116813	50 %	0 %	50 %	0 %	434380887
3100	NC_018604	GCTT	2	8	116814	116821	0 %	50 %	25 %	25 %	434380887
3101	NC_018604	TCT	2	6	116884	116889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380887
3102	NC_018604	TAA	2	6	116916	116921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3103	NC_018604	TGA	2	6	116925	116930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3104	NC_018604	ATT	2	6	116962	116967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380887
3105	NC_018604	GA	3	6	116980	116985	50 %	0 %	50 %	0 %	434380887
3106	NC_018604	AGA	2	6	116994	116999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380887
3107	NC_018604	TAA	2	6	117011	117016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3108	NC_018604	GAT	2	6	117037	117042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3109	NC_018604	ATG	2	6	117044	117049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3110	NC_018604	A	7	7	117057	117063	100 %	0 %	0 %	0 %	434380887
3111	NC_018604	GAAG	2	8	117082	117089	50 %	0 %	50 %	0 %	434380887
3112	NC_018604	ATCA	2	8	117123	117130	50 %	25 %	0 %	25 %	434380887
3113	NC_018604	TAA	2	6	117138	117143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3114	NC_018604	AAT	2	6	117160	117165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3115	NC_018604	TA	3	6	117178	117183	50 %	50 %	0 %	0 %	434380887
3116	NC_018604	TAG	2	6	117242	117247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380887
3117	NC_018604	GA	3	6	117253	117258	50 %	0 %	50 %	0 %	434380887
3118	NC_018604	ACA	2	6	117262	117267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380887
3119	NC_018604	A	6	6	117311	117316	100 %	0 %	0 %	0 %	434380887
3120	NC_018604	TAA	2	6	117354	117359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3121	NC_018604	TAA	2	6	117363	117368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
3122	NC_018604	ATA	2	6	117400	117405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380887
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3124	NC_018604	AGA	2	6	117447	117452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380887
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3499	NC_018604	TA	3	6	130639	130644	50 %	50 %	0 %	0 %	434380897
3500	NC_018604	A	6	6	130651	130656	100 %	0 %	0 %	0 %	434380897

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