MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 78024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018604	AAG	2	6	54744	54749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380827
1502	NC_018604	ACA	2	6	54774	54779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380827
1503	NC_018604	AAC	2	6	54788	54793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380827
1504	NC_018604	AT	3	6	54855	54860	50 %	50 %	0 %	0 %	434380827
1505	NC_018604	TTTA	2	8	54895	54902	25 %	75 %	0 %	0 %	434380828
1506	NC_018604	TAT	2	6	54922	54927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1507	NC_018604	TGT	2	6	54985	54990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380828
1508	NC_018604	ATT	3	9	54998	55006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1509	NC_018604	AGC	2	6	55016	55021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380828
1510	NC_018604	AGC	2	6	55094	55099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380828
1511	NC_018604	TAA	2	6	55115	55120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380828
1512	NC_018604	TGA	2	6	55121	55126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380828
1513	NC_018604	TTTG	2	8	55137	55144	0 %	75 %	25 %	0 %	434380828
1514	NC_018604	GTA	2	6	55149	55154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380828
1515	NC_018604	GTTT	2	8	55155	55162	0 %	75 %	25 %	0 %	434380828
1516	NC_018604	TAT	2	6	55168	55173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1517	NC_018604	TTTG	2	8	55206	55213	0 %	75 %	25 %	0 %	434380828
1518	NC_018604	TAT	2	6	55234	55239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1519	NC_018604	AT	3	6	55275	55280	50 %	50 %	0 %	0 %	434380828
1520	NC_018604	TCTAT	2	10	55302	55311	20 %	60 %	0 %	20 %	434380828
1521	NC_018604	TTA	2	6	55312	55317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1522	NC_018604	CT	3	6	55337	55342	0 %	50 %	0 %	50 %	434380828
1523	NC_018604	CTT	2	6	55357	55362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1524	NC_018604	CCG	2	6	55377	55382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434380828
1525	NC_018604	ATA	2	6	55411	55416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380828
1526	NC_018604	TA	3	6	55430	55435	50 %	50 %	0 %	0 %	434380828
1527	NC_018604	T	6	6	55445	55450	0 %	100 %	0 %	0 %	434380828
1528	NC_018604	AGG	2	6	55484	55489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434380828
1529	NC_018604	TCT	2	6	55503	55508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1530	NC_018604	ACA	2	6	55512	55517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380828
1531	NC_018604	T	6	6	55527	55532	0 %	100 %	0 %	0 %	434380828
1532	NC_018604	TCA	2	6	55539	55544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380828
1533	NC_018604	ATT	2	6	55577	55582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380828
1534	NC_018604	AAT	2	6	55629	55634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380828
1535	NC_018604	T	7	7	55700	55706	0 %	100 %	0 %	0 %	434380828
1536	NC_018604	CTT	2	6	55723	55728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1537	NC_018604	GAA	2	6	55737	55742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380828
1538	NC_018604	GCT	3	9	55854	55862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380828
1539	NC_018604	AT	3	6	55881	55886	50 %	50 %	0 %	0 %	434380828
1540	NC_018604	GTA	2	6	55887	55892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380828
1541	NC_018604	AGCATA	2	12	55925	55936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380828
1542	NC_018604	CTTC	2	8	55995	56002	0 %	50 %	0 %	50 %	434380828
1543	NC_018604	TGA	2	6	56039	56044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380828
1544	NC_018604	CTT	2	6	56053	56058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1545	NC_018604	TTC	2	6	56093	56098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1546	NC_018604	TGC	2	6	56117	56122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380828
1547	NC_018604	T	6	6	56147	56152	0 %	100 %	0 %	0 %	434380828
1548	NC_018604	T	6	6	56171	56176	0 %	100 %	0 %	0 %	434380828
1549	NC_018604	AAG	2	6	56179	56184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380828
1550	NC_018604	A	6	6	56186	56191	100 %	0 %	0 %	0 %	434380828
1551	NC_018604	GATA	2	8	56192	56199	50 %	25 %	25 %	0 %	434380828
1552	NC_018604	ATA	2	6	56202	56207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380828
1553	NC_018604	AAT	2	6	56208	56213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380828
1554	NC_018604	TTG	2	6	56215	56220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380828
1555	NC_018604	CTT	2	6	56223	56228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380828
1556	NC_018604	CAT	2	6	56231	56236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380828
1557	NC_018604	CAT	2	6	56345	56350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380829
1558	NC_018604	TAT	2	6	56501	56506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380829
1559	NC_018604	TTAAT	2	10	56546	56555	40 %	60 %	0 %	0 %	434380829
1560	NC_018604	CTG	2	6	56561	56566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380829
1561	NC_018604	TAT	3	9	56669	56677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380829
1562	NC_018604	GTA	2	6	56698	56703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380829
1563	NC_018604	CTT	2	6	56746	56751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380829
1564	NC_018604	TGT	2	6	56762	56767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380829
1565	NC_018604	TTA	2	6	56785	56790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380829
1566	NC_018604	TAT	2	6	56810	56815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380829
1567	NC_018604	AT	3	6	56882	56887	50 %	50 %	0 %	0 %	434380829
1568	NC_018604	CAT	2	6	56903	56908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380829
1569	NC_018604	TTG	2	6	56965	56970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380829
1570	NC_018604	CAA	2	6	56978	56983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380829
1571	NC_018604	TA	3	6	57060	57065	50 %	50 %	0 %	0 %	434380829
1572	NC_018604	GCT	3	9	57095	57103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380829
1573	NC_018604	ATA	2	6	57105	57110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380829
1574	NC_018604	TATT	2	8	57161	57168	25 %	75 %	0 %	0 %	434380829
1575	NC_018604	T	6	6	57175	57180	0 %	100 %	0 %	0 %	434380829
1576	NC_018604	TCA	2	6	57184	57189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380829
1577	NC_018604	TCA	2	6	57203	57208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380829
1578	NC_018604	TGT	2	6	57332	57337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380829
1579	NC_018604	AT	3	6	57359	57364	50 %	50 %	0 %	0 %	434380829
1580	NC_018604	CCG	2	6	57370	57375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434380829
1581	NC_018604	AAAT	2	8	57396	57403	75 %	25 %	0 %	0 %	434380829
1582	NC_018604	ATG	2	6	57410	57415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380829
1583	NC_018604	TTTGAG	2	12	57422	57433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380829
1584	NC_018604	CAT	2	6	57443	57448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380829
1585	NC_018604	A	6	6	58069	58074	100 %	0 %	0 %	0 %	434380830
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1587	NC_018604	TAT	2	6	58092	58097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380830
1588	NC_018604	TTA	2	6	58117	58122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380830
1589	NC_018604	ATA	3	9	58130	58138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380830
1590	NC_018604	CAG	2	6	58142	58147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380830
1591	NC_018604	ATATGG	2	12	58215	58226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380830
1592	NC_018604	ATC	2	6	58236	58241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380830
1593	NC_018604	TA	3	6	58300	58305	50 %	50 %	0 %	0 %	434380830
1594	NC_018604	GGA	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434380830
1595	NC_018604	CTA	2	6	58409	58414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380830
1596	NC_018604	TAA	2	6	58446	58451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380830
1597	NC_018604	TA	3	6	58497	58502	50 %	50 %	0 %	0 %	434380830
1598	NC_018604	TTAAA	2	10	58508	58517	60 %	40 %	0 %	0 %	434380830
1599	NC_018604	ATG	2	6	58522	58527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380830
1600	NC_018604	TA	3	6	58534	58539	50 %	50 %	0 %	0 %	434380830
1601	NC_018604	ATA	2	6	58541	58546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380830
1602	NC_018604	TGA	2	6	58572	58577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380830
1603	NC_018604	TAA	2	6	58579	58584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380830
1604	NC_018604	A	7	7	58618	58624	100 %	0 %	0 %	0 %	434380831
1605	NC_018604	TTA	2	6	58633	58638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380831
1606	NC_018604	TTC	2	6	58659	58664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380831
1607	NC_018604	TA	3	6	58684	58689	50 %	50 %	0 %	0 %	434380831
1608	NC_018604	ATG	2	6	58807	58812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380831
1609	NC_018604	TA	3	6	58819	58824	50 %	50 %	0 %	0 %	434380831
1610	NC_018604	TTA	2	6	58840	58845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380831
1611	NC_018604	GAC	2	6	58858	58863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380831
1612	NC_018604	A	7	7	58902	58908	100 %	0 %	0 %	0 %	434380832
1613	NC_018604	TTA	2	6	58917	58922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380832
1614	NC_018604	TTC	2	6	58943	58948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380832
1615	NC_018604	AAT	2	6	59085	59090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380832
1616	NC_018604	ATG	2	6	59091	59096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380832
1617	NC_018604	TA	3	6	59103	59108	50 %	50 %	0 %	0 %	434380832
1618	NC_018604	TTG	2	6	59124	59129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380832
1619	NC_018604	GAC	2	6	59142	59147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380832
1620	NC_018604	TAA	2	6	59148	59153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380832
1621	NC_018604	TAC	2	6	59389	59394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380833
1622	NC_018604	TA	3	6	59411	59416	50 %	50 %	0 %	0 %	434380833
1623	NC_018604	TCT	2	6	59489	59494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380833
1624	NC_018604	CTTT	2	8	59568	59575	0 %	75 %	0 %	25 %	434380833
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