MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 78024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018604	TTA	2	6	17156	17161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380794
502	NC_018604	TGC	2	6	17173	17178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380794
503	NC_018604	CGG	2	6	17185	17190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434380794
504	NC_018604	T	6	6	17257	17262	0 %	100 %	0 %	0 %	434380794
505	NC_018604	GTT	2	6	17298	17303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380794
506	NC_018604	AAAT	2	8	17476	17483	75 %	25 %	0 %	0 %	434380794
507	NC_018604	GCT	2	6	17495	17500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380794
508	NC_018604	TCT	2	6	17558	17563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380794
509	NC_018604	CTA	2	6	17589	17594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380794
510	NC_018604	TAA	2	6	17653	17658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
511	NC_018604	A	7	7	17657	17663	100 %	0 %	0 %	0 %	434380795
512	NC_018604	TAA	2	6	17676	17681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
513	NC_018604	TATTTT	2	12	17698	17709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380795
514	NC_018604	TGT	3	9	17734	17742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380795
515	NC_018604	GAT	2	6	17747	17752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380795
516	NC_018604	ATA	2	6	17753	17758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
517	NC_018604	AATAG	2	10	17765	17774	60 %	20 %	20 %	0 %	434380795
518	NC_018604	CTT	2	6	17784	17789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380795
519	NC_018604	ATAG	2	8	17822	17829	50 %	25 %	25 %	0 %	434380795
520	NC_018604	AT	3	6	17852	17857	50 %	50 %	0 %	0 %	434380795
521	NC_018604	TGT	2	6	17863	17868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380795
522	NC_018604	TAA	2	6	17910	17915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
523	NC_018604	AGA	2	6	17929	17934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380795
524	NC_018604	TA	3	6	17975	17980	50 %	50 %	0 %	0 %	434380795
525	NC_018604	GCT	2	6	17999	18004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380795
526	NC_018604	AAAT	2	8	18022	18029	75 %	25 %	0 %	0 %	434380795
527	NC_018604	GAT	3	9	18032	18040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380795
528	NC_018604	AT	3	6	18066	18071	50 %	50 %	0 %	0 %	434380795
529	NC_018604	TATG	2	8	18079	18086	25 %	50 %	25 %	0 %	434380795
530	NC_018604	AAT	2	6	18155	18160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
531	NC_018604	TTA	2	6	18190	18195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380795
532	NC_018604	TAT	2	6	18196	18201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380795
533	NC_018604	CTA	2	6	18219	18224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380795
534	NC_018604	TGT	2	6	18256	18261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380795
535	NC_018604	CAA	2	6	18269	18274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380795
536	NC_018604	TGA	2	6	18283	18288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380795
537	NC_018604	TA	3	6	18291	18296	50 %	50 %	0 %	0 %	434380795
538	NC_018604	A	6	6	18337	18342	100 %	0 %	0 %	0 %	434380795
539	NC_018604	GAA	2	6	18410	18415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380795
540	NC_018604	A	6	6	18421	18426	100 %	0 %	0 %	0 %	434380795
541	NC_018604	AAT	2	6	18438	18443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380795
542	NC_018604	TGA	2	6	18483	18488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380796
543	NC_018604	GATA	2	8	18538	18545	50 %	25 %	25 %	0 %	434380796
544	NC_018604	TAT	2	6	18546	18551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380796
545	NC_018604	ATG	2	6	18557	18562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380796
546	NC_018604	GAT	2	6	18609	18614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380796
547	NC_018604	TTA	2	6	18626	18631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380796
548	NC_018604	ATG	2	6	18641	18646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380796
549	NC_018604	GA	6	12	18679	18690	50 %	0 %	50 %	0 %	434380796
550	NC_018604	A	7	7	18690	18696	100 %	0 %	0 %	0 %	434380796
551	NC_018604	TAT	2	6	18702	18707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380796
552	NC_018604	ATT	2	6	18724	18729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380796
553	NC_018604	A	6	6	18812	18817	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
554	NC_018604	A	7	7	18827	18833	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
555	NC_018604	A	8	8	18842	18849	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
556	NC_018604	CTT	2	6	18928	18933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380797
557	NC_018604	A	7	7	19001	19007	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
558	NC_018604	AT	3	6	19030	19035	50 %	50 %	0 %	0 %	434380797
559	NC_018604	TTC	2	6	19166	19171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380797
560	NC_018604	CTT	2	6	19197	19202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380797
561	NC_018604	A	6	6	19214	19219	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
562	NC_018604	AAT	2	6	19221	19226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380797
563	NC_018604	AT	3	6	19225	19230	50 %	50 %	0 %	0 %	434380797
564	NC_018604	TTAA	2	8	19290	19297	50 %	50 %	0 %	0 %	434380797
565	NC_018604	AGA	2	6	19304	19309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380797
566	NC_018604	ATA	2	6	19315	19320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380797
567	NC_018604	ATT	2	6	19348	19353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380797
568	NC_018604	T	6	6	19352	19357	0 %	100 %	0 %	0 %	434380797
569	NC_018604	AAG	2	6	19378	19383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380797
570	NC_018604	AT	4	8	19414	19421	50 %	50 %	0 %	0 %	434380797
571	NC_018604	A	6	6	19448	19453	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
572	NC_018604	AT	3	6	19458	19463	50 %	50 %	0 %	0 %	434380797
573	NC_018604	ATG	2	6	19468	19473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380797
574	NC_018604	GGAGAT	2	12	19496	19507	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434380797
575	NC_018604	A	8	8	19534	19541	100 %	0 %	0 %	0 %	434380797
576	NC_018604	ATG	2	6	19567	19572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380797
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578	NC_018604	TTA	2	6	19627	19632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380797
579	NC_018604	GGC	2	6	19656	19661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434380797
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583	NC_018604	CTTT	2	8	19737	19744	0 %	75 %	0 %	25 %	434380797
584	NC_018604	TA	3	6	20263	20268	50 %	50 %	0 %	0 %	434380798
585	NC_018604	TGCAA	2	10	20283	20292	40 %	20 %	20 %	20 %	434380798
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588	NC_018604	TAA	2	6	20383	20388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380798
589	NC_018604	AT	3	6	20396	20401	50 %	50 %	0 %	0 %	434380798
590	NC_018604	A	6	6	20466	20471	100 %	0 %	0 %	0 %	434380798
591	NC_018604	ATA	2	6	20476	20481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380798
592	NC_018604	AT	3	6	20489	20494	50 %	50 %	0 %	0 %	434380798
593	NC_018604	ATT	2	6	20499	20504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380798
594	NC_018604	ATCTA	2	10	20511	20520	40 %	40 %	0 %	20 %	434380798
595	NC_018604	AGC	2	6	20544	20549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380798
596	NC_018604	TCA	2	6	20594	20599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380798
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598	NC_018604	T	6	6	20638	20643	0 %	100 %	0 %	0 %	434380798
599	NC_018604	TAA	2	6	20748	20753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380799
600	NC_018604	GAT	2	6	20901	20906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380799
601	NC_018604	AATAC	2	10	20934	20943	60 %	20 %	0 %	20 %	434380799
602	NC_018604	AGCT	2	8	20950	20957	25 %	25 %	25 %	25 %	434380799
603	NC_018604	ATATA	2	10	20968	20977	60 %	40 %	0 %	0 %	434380799
604	NC_018604	ATA	2	6	20980	20985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380799
605	NC_018604	AGC	2	6	21020	21025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380799
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609	NC_018604	TAT	2	6	21101	21106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380799
610	NC_018604	AAT	2	6	21141	21146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380799
611	NC_018604	TCA	2	6	21174	21179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380799
612	NC_018604	CAT	2	6	21275	21280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380799
613	NC_018604	GTT	2	6	21288	21293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380799
614	NC_018604	ATTA	2	8	21332	21339	50 %	50 %	0 %	0 %	434380799
615	NC_018604	AAG	2	6	21415	21420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380799
616	NC_018604	ATCC	2	8	21461	21468	25 %	25 %	0 %	50 %	434380799
617	NC_018604	AT	3	6	21512	21517	50 %	50 %	0 %	0 %	434380799
618	NC_018604	AAG	2	6	21527	21532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380799
619	NC_018604	AGA	2	6	21548	21553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380799
620	NC_018604	ATAA	2	8	21588	21595	75 %	25 %	0 %	0 %	434380799
621	NC_018604	T	7	7	21646	21652	0 %	100 %	0 %	0 %	434380799
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624	NC_018604	TTC	2	6	21696	21701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380800
625	NC_018604	TA	3	6	21714	21719	50 %	50 %	0 %	0 %	434380800
626	NC_018604	AAT	2	6	21724	21729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380800
627	NC_018604	TCTA	2	8	21735	21742	25 %	50 %	0 %	25 %	434380800
628	NC_018604	T	7	7	21770	21776	0 %	100 %	0 %	0 %	434380800
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630	NC_018604	TAT	2	6	21930	21935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380800
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