MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 78024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018604	AATAGC	2	12	165567	165578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380930
4502	NC_018604	TAG	2	6	165584	165589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380930
4503	NC_018604	AT	3	6	165622	165627	50 %	50 %	0 %	0 %	434380930
4504	NC_018604	ATTA	2	8	165675	165682	50 %	50 %	0 %	0 %	434380930
4505	NC_018604	TTGT	2	8	165715	165722	0 %	75 %	25 %	0 %	434380930
4506	NC_018604	TATT	2	8	165770	165777	25 %	75 %	0 %	0 %	434380930
4507	NC_018604	CTT	2	6	165783	165788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380930
4508	NC_018604	AT	3	6	165826	165831	50 %	50 %	0 %	0 %	434380930
4509	NC_018604	AAT	2	6	165851	165856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380930
4510	NC_018604	ATC	2	6	165927	165932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380931
4511	NC_018604	AGCA	2	8	165976	165983	50 %	0 %	25 %	25 %	434380931
4512	NC_018604	AGTT	2	8	165990	165997	25 %	50 %	25 %	0 %	434380931
4513	NC_018604	TCA	2	6	166178	166183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380931
4514	NC_018604	AGA	2	6	166216	166221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380931
4515	NC_018604	AGT	2	6	166231	166236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380931
4516	NC_018604	CAG	2	6	166242	166247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380931
4517	NC_018604	AGC	3	9	166264	166272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380931
4518	NC_018604	TA	3	6	166285	166290	50 %	50 %	0 %	0 %	434380931
4519	NC_018604	CTT	3	9	166295	166303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380931
4520	NC_018604	GCA	2	6	166340	166345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380931
4521	NC_018604	CAC	2	6	166350	166355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380931
4522	NC_018604	ATTGA	2	10	166399	166408	40 %	40 %	20 %	0 %	434380931
4523	NC_018604	CTA	2	6	166437	166442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380931
4524	NC_018604	TCA	3	9	166475	166483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380931
4525	NC_018604	TA	4	8	166485	166492	50 %	50 %	0 %	0 %	434380931
4526	NC_018604	CT	3	6	166544	166549	0 %	50 %	0 %	50 %	434380931
4527	NC_018604	AGT	2	6	166564	166569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380931
4528	NC_018604	TGAA	2	8	166571	166578	50 %	25 %	25 %	0 %	434380931
4529	NC_018604	TTTC	2	8	166598	166605	0 %	75 %	0 %	25 %	434380931
4530	NC_018604	T	6	6	166638	166643	0 %	100 %	0 %	0 %	434380931
4531	NC_018604	AAG	2	6	166704	166709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380931
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4533	NC_018604	GAT	2	6	166783	166788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380931
4534	NC_018604	A	6	6	167422	167427	100 %	0 %	0 %	0 %	434380932
4535	NC_018604	AAT	2	6	167485	167490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380932
4536	NC_018604	TAA	2	6	167538	167543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380932
4537	NC_018604	ATT	2	6	167551	167556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380932
4538	NC_018604	ACA	2	6	167557	167562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380932
4539	NC_018604	GATA	2	8	167903	167910	50 %	25 %	25 %	0 %	434380933
4540	NC_018604	CTT	2	6	167941	167946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380933
4541	NC_018604	T	7	7	168047	168053	0 %	100 %	0 %	0 %	434380933
4542	NC_018604	GAT	2	6	168066	168071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380933
4543	NC_018604	ATT	2	6	168076	168081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380933
4544	NC_018604	TATT	2	8	168121	168128	25 %	75 %	0 %	0 %	434380933
4545	NC_018604	ATA	2	6	168136	168141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380933
4546	NC_018604	TTTA	2	8	168174	168181	25 %	75 %	0 %	0 %	434380933
4547	NC_018604	TAA	3	9	168191	168199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380933
4548	NC_018604	AGA	2	6	168218	168223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380933
4549	NC_018604	A	7	7	168252	168258	100 %	0 %	0 %	0 %	434380933
4550	NC_018604	ACT	2	6	168261	168266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380933
4551	NC_018604	AAT	2	6	168298	168303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380933
4552	NC_018604	A	7	7	168422	168428	100 %	0 %	0 %	0 %	434380934
4553	NC_018604	ATA	2	6	168434	168439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380934
4554	NC_018604	TTA	2	6	168444	168449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380934
4555	NC_018604	TAA	2	6	168469	168474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380934
4556	NC_018604	GATATA	2	12	168533	168544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
4557	NC_018604	A	8	8	168544	168551	100 %	0 %	0 %	0 %	434380934
4558	NC_018604	TGA	2	6	168559	168564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380934
4559	NC_018604	AT	3	6	168595	168600	50 %	50 %	0 %	0 %	434380934
4560	NC_018604	CAAT	2	8	168664	168671	50 %	25 %	0 %	25 %	434380934
4561	NC_018604	AT	4	8	168688	168695	50 %	50 %	0 %	0 %	434380934
4562	NC_018604	ATG	2	6	168714	168719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380934
4563	NC_018604	GAT	2	6	168743	168748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380934
4564	NC_018604	ATGATA	2	12	168792	168803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
4565	NC_018604	ATA	2	6	168819	168824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380934
4566	NC_018604	CATAT	2	10	168859	168868	40 %	40 %	0 %	20 %	434380934
4567	NC_018604	TAA	2	6	168883	168888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380934
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4571	NC_018604	A	7	7	169078	169084	100 %	0 %	0 %	0 %	434380934
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4573	NC_018604	AG	3	6	169147	169152	50 %	0 %	50 %	0 %	434380934
4574	NC_018604	A	6	6	169168	169173	100 %	0 %	0 %	0 %	434380934
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4582	NC_018604	TA	3	6	169402	169407	50 %	50 %	0 %	0 %	434380934
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4592	NC_018604	AT	3	6	169637	169642	50 %	50 %	0 %	0 %	434380934
4593	NC_018604	A	6	6	169739	169744	100 %	0 %	0 %	0 %	434380935
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4606	NC_018604	TA	3	6	170116	170121	50 %	50 %	0 %	0 %	434380935
4607	NC_018604	CTTT	3	12	170132	170143	0 %	75 %	0 %	25 %	434380935
4608	NC_018604	ATA	2	6	170156	170161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380935
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4611	NC_018604	AT	3	6	170190	170195	50 %	50 %	0 %	0 %	434380935
4612	NC_018604	TTCTTT	2	12	170236	170247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380935
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