MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	ATCTT	2	10	303	312	20 %	60 %	0 %	20 %	403529934
2	NC_018533	TGATT	2	10	2007	2016	20 %	60 %	20 %	0 %	403529936
3	NC_018533	TTTGT	2	10	2070	2079	0 %	80 %	20 %	0 %	403529936
4	NC_018533	TGCTT	2	10	3351	3360	0 %	60 %	20 %	20 %	403529938
5	NC_018533	AAAAG	2	10	6650	6659	80 %	0 %	20 %	0 %	403529939
6	NC_018533	ATCAT	2	10	11474	11483	40 %	40 %	0 %	20 %	403529944
7	NC_018533	TGCTT	2	10	12328	12337	0 %	60 %	20 %	20 %	403529945
8	NC_018533	AGTGG	2	10	19541	19550	20 %	20 %	60 %	0 %	403529952
9	NC_018533	GTGAA	2	10	23566	23575	40 %	20 %	40 %	0 %	403529954
10	NC_018533	ACCAC	2	10	25348	25357	40 %	0 %	0 %	60 %	403529955
11	NC_018533	ATTTT	2	10	25766	25775	20 %	80 %	0 %	0 %	403529956
12	NC_018533	ATAAA	2	10	29283	29292	80 %	20 %	0 %	0 %	403529957
13	NC_018533	GTGCA	2	10	34162	34171	20 %	20 %	40 %	20 %	403529958
14	NC_018533	TTGAT	2	10	36694	36703	20 %	60 %	20 %	0 %	403529959
15	NC_018533	GTTGT	2	10	37116	37125	0 %	60 %	40 %	0 %	403529959
16	NC_018533	TGACA	2	10	38191	38200	40 %	20 %	20 %	20 %	403529960
17	NC_018533	TAAGA	2	10	38980	38989	60 %	20 %	20 %	0 %	403529960
18	NC_018533	TTCCT	2	10	39615	39624	0 %	60 %	0 %	40 %	403529961
19	NC_018533	TAGCA	2	10	39662	39671	40 %	20 %	20 %	20 %	403529961
20	NC_018533	TTTGT	2	10	40468	40477	0 %	80 %	20 %	0 %	403529962
21	NC_018533	AATCA	2	10	46365	46374	60 %	20 %	0 %	20 %	403529965
22	NC_018533	GAAAG	2	10	47065	47074	60 %	0 %	40 %	0 %	403529966
23	NC_018533	TCAAA	2	10	47636	47645	60 %	20 %	0 %	20 %	403529966
24	NC_018533	TCCAT	2	10	47693	47702	20 %	40 %	0 %	40 %	403529966
25	NC_018533	AGGAG	2	10	49636	49645	40 %	0 %	60 %	0 %	403529968
26	NC_018533	AATCA	2	10	49824	49833	60 %	20 %	0 %	20 %	403529968
27	NC_018533	CAGTT	2	10	54615	54624	20 %	40 %	20 %	20 %	403529970
28	NC_018533	TTTGA	2	10	59269	59278	20 %	60 %	20 %	0 %	403529972
29	NC_018533	GCACA	2	10	59924	59933	40 %	0 %	20 %	40 %	403529972
30	NC_018533	AACCA	2	10	63047	63056	60 %	0 %	0 %	40 %	403529973
31	NC_018533	TGCTT	2	10	63710	63719	0 %	60 %	20 %	20 %	403529973
32	NC_018533	TCTTA	2	10	65973	65982	20 %	60 %	0 %	20 %	403529976
33	NC_018533	ACGGT	2	10	67151	67160	20 %	20 %	40 %	20 %	403529977
34	NC_018533	TAAAT	2	10	68699	68708	60 %	40 %	0 %	0 %	403529978
35	NC_018533	ATGCA	2	10	69422	69431	40 %	20 %	20 %	20 %	403529979
36	NC_018533	TCAAG	2	10	70460	70469	40 %	20 %	20 %	20 %	403529980
37	NC_018533	CCATC	2	10	76925	76934	20 %	20 %	0 %	60 %	403529987
38	NC_018533	GCAAT	2	10	81679	81688	40 %	20 %	20 %	20 %	403529991
39	NC_018533	GGTTT	2	10	87930	87939	0 %	60 %	40 %	0 %	403529994
40	NC_018533	AATTT	2	10	87999	88008	40 %	60 %	0 %	0 %	403529994
41	NC_018533	TTGGC	2	10	90886	90895	0 %	40 %	40 %	20 %	403529997
42	NC_018533	GTATG	2	10	91304	91313	20 %	40 %	40 %	0 %	403529997
43	NC_018533	TGAAT	2	10	93190	93199	40 %	40 %	20 %	0 %	403530000
44	NC_018533	ATGCG	2	10	93570	93579	20 %	20 %	40 %	20 %	403530000
45	NC_018533	ACATT	2	10	94094	94103	40 %	40 %	0 %	20 %	403530000
46	NC_018533	CGGGC	2	10	100842	100851	0 %	0 %	60 %	40 %	403530008
47	NC_018533	ATCTT	2	10	102720	102729	20 %	60 %	0 %	20 %	403530009
48	NC_018533	GTTTG	2	10	105460	105469	0 %	60 %	40 %	0 %	403530012
49	NC_018533	CTTAT	2	10	105786	105795	20 %	60 %	0 %	20 %	403530012
50	NC_018533	TGCAT	2	10	107601	107610	20 %	40 %	20 %	20 %	403530013
51	NC_018533	CATAA	2	10	108947	108956	60 %	20 %	0 %	20 %	403530014
52	NC_018533	ATCTA	2	10	111476	111485	40 %	40 %	0 %	20 %	403530014
53	NC_018533	GGTGC	2	10	112618	112627	0 %	20 %	60 %	20 %	403530014
54	NC_018533	GAATA	2	10	114614	114623	60 %	20 %	20 %	0 %	403530014
55	NC_018533	GTTTT	2	10	117941	117950	0 %	80 %	20 %	0 %	403530015
56	NC_018533	GATTT	2	10	118483	118492	20 %	60 %	20 %	0 %	403530015
57	NC_018533	ATTGT	2	10	119068	119077	20 %	60 %	20 %	0 %	403530015
58	NC_018533	ATTCA	2	10	124818	124827	40 %	40 %	0 %	20 %	403530019
59	NC_018533	AGAGA	2	10	125912	125921	60 %	0 %	40 %	0 %	403530019
60	NC_018533	GATTG	2	10	128452	128461	20 %	40 %	40 %	0 %	403530020
61	NC_018533	AGAAT	2	10	133036	133045	60 %	20 %	20 %	0 %	403530025
62	NC_018533	AATAT	2	10	136356	136365	60 %	40 %	0 %	0 %	403530028
63	NC_018533	AAAAG	2	10	137338	137347	80 %	0 %	20 %	0 %	403530029
64	NC_018533	TTTCG	2	10	138116	138125	0 %	60 %	20 %	20 %	403530030
65	NC_018533	CCATT	2	10	143036	143045	20 %	40 %	0 %	40 %	403530033
66	NC_018533	TGTCG	2	10	143050	143059	0 %	40 %	40 %	20 %	403530033
67	NC_018533	TTGGT	2	10	144548	144557	0 %	60 %	40 %	0 %	403530035
68	NC_018533	TCTTT	2	10	147381	147390	0 %	80 %	0 %	20 %	403530037
69	NC_018533	GGTTT	2	10	148131	148140	0 %	60 %	40 %	0 %	403530037
70	NC_018533	TGGTA	2	10	151608	151617	20 %	40 %	40 %	0 %	403530040
71	NC_018533	GATTG	2	10	151904	151913	20 %	40 %	40 %	0 %	403530040
72	NC_018533	TGGAA	2	10	152374	152383	40 %	20 %	40 %	0 %	403530041
73	NC_018533	TTACG	2	10	155114	155123	20 %	40 %	20 %	20 %	403530044
74	NC_018533	TTGAT	2	10	158309	158318	20 %	60 %	20 %	0 %	403530047
75	NC_018533	TTTCA	2	10	159870	159879	20 %	60 %	0 %	20 %	403530049
76	NC_018533	GTGAT	2	10	163132	163141	20 %	40 %	40 %	0 %	403530052
77	NC_018533	TTGCA	2	10	163663	163672	20 %	40 %	20 %	20 %	403530052
78	NC_018533	TTGGG	2	10	164825	164834	0 %	40 %	60 %	0 %	403530053
79	NC_018533	TTTCT	2	10	165329	165338	0 %	80 %	0 %	20 %	403530053
80	NC_018533	GCAAC	2	10	166093	166102	40 %	0 %	20 %	40 %	403530053
81	NC_018533	CTTGG	2	10	171760	171769	0 %	40 %	40 %	20 %	403530057
82	NC_018533	TGATT	2	10	171809	171818	20 %	60 %	20 %	0 %	403530057
83	NC_018533	TGAAA	2	10	172199	172208	60 %	20 %	20 %	0 %	403530057
84	NC_018533	GAAGG	2	10	180409	180418	40 %	0 %	60 %	0 %	403530059
85	NC_018533	GCATT	2	10	181043	181052	20 %	40 %	20 %	20 %	403530059
86	NC_018533	CAATT	2	10	183124	183133	40 %	40 %	0 %	20 %	403530060
87	NC_018533	GCATT	2	10	184253	184262	20 %	40 %	20 %	20 %	403530060
88	NC_018533	GAAGG	2	10	186930	186939	40 %	0 %	60 %	0 %	403530061
89	NC_018533	GCATT	2	10	187522	187531	20 %	40 %	20 %	20 %	403530061
90	NC_018533	TAAAA	2	10	191626	191635	80 %	20 %	0 %	0 %	403530064
91	NC_018533	ATATC	2	10	195673	195682	40 %	40 %	0 %	20 %	403530068
92	NC_018533	CAATT	2	10	197534	197543	40 %	40 %	0 %	20 %	403530069
93	NC_018533	AGCAG	2	10	197585	197594	40 %	0 %	40 %	20 %	403530069
94	NC_018533	TTCAA	2	10	199278	199287	40 %	40 %	0 %	20 %	403530070
95	NC_018533	GTTTT	2	10	201252	201261	0 %	80 %	20 %	0 %	403530073
96	NC_018533	TATTT	2	10	209481	209490	20 %	80 %	0 %	0 %	403530080
97	NC_018533	GAGAA	2	10	210492	210501	60 %	0 %	40 %	0 %	403530081
98	NC_018533	AGGTT	2	10	210973	210982	20 %	40 %	40 %	0 %	403530081
99	NC_018533	ATTTT	2	10	212159	212168	20 %	80 %	0 %	0 %	403530082
100	NC_018533	TGATT	2	10	215016	215025	20 %	60 %	20 %	0 %	403530085
101	NC_018533	TGCAG	2	10	222614	222623	20 %	20 %	40 %	20 %	403530089
102	NC_018533	GTTAT	2	10	226756	226765	20 %	60 %	20 %	0 %	403530093
103	NC_018533	ACATA	2	10	226787	226796	60 %	20 %	0 %	20 %	403530093
104	NC_018533	TATTT	2	10	234235	234244	20 %	80 %	0 %	0 %	403530099
105	NC_018533	TTTTA	2	10	235790	235799	20 %	80 %	0 %	0 %	403530100
106	NC_018533	GAATC	2	10	240913	240922	40 %	20 %	20 %	20 %	403530104
107	NC_018533	TTTGG	2	10	244091	244100	0 %	60 %	40 %	0 %	403530106
108	NC_018533	CGAAA	2	10	248045	248054	60 %	0 %	20 %	20 %	403530110
109	NC_018533	TGTAT	2	10	250648	250657	20 %	60 %	20 %	0 %	403530113
110	NC_018533	TGTTT	2	10	252532	252541	0 %	80 %	20 %	0 %	403530114
111	NC_018533	CTTTT	2	10	253102	253111	0 %	80 %	0 %	20 %	403530115
112	NC_018533	CACGC	2	10	254010	254019	20 %	0 %	20 %	60 %	403530115
113	NC_018533	CTGGT	2	10	255082	255091	0 %	40 %	40 %	20 %	403530115
114	NC_018533	TCTTT	2	10	261055	261064	0 %	80 %	0 %	20 %	403530120
115	NC_018533	TGTAT	2	10	262044	262053	20 %	60 %	20 %	0 %	403530121
116	NC_018533	ACGCC	2	10	262338	262347	20 %	0 %	20 %	60 %	403530121
117	NC_018533	CTGTT	2	10	263057	263066	0 %	60 %	20 %	20 %	403530122
118	NC_018533	TACCG	2	10	263654	263663	20 %	20 %	20 %	40 %	403530122
119	NC_018533	ATTTT	2	10	263679	263688	20 %	80 %	0 %	0 %	403530122
120	NC_018533	TAATT	2	10	263906	263915	40 %	60 %	0 %	0 %	403530122
121	NC_018533	GAGAT	2	10	264482	264491	40 %	20 %	40 %	0 %	403530123
122	NC_018533	GCCAT	2	10	265343	265352	20 %	20 %	20 %	40 %	403530124
123	NC_018533	TCATT	2	10	267914	267923	20 %	60 %	0 %	20 %	403530127
124	NC_018533	CAAAA	2	10	268743	268752	80 %	0 %	0 %	20 %	403530127
125	NC_018533	GTTTG	2	10	269718	269727	0 %	60 %	40 %	0 %	403530128
126	NC_018533	TTTGT	2	10	270806	270815	0 %	80 %	20 %	0 %	403530130
127	NC_018533	GTTGT	2	10	271489	271498	0 %	60 %	40 %	0 %	403530130
128	NC_018533	GTTTG	2	10	272934	272943	0 %	60 %	40 %	0 %	403530131
129	NC_018533	TTTTG	2	10	276997	277006	0 %	80 %	20 %	0 %	403530136
130	NC_018533	ATGCA	2	10	278346	278355	40 %	20 %	20 %	20 %	403530137
131	NC_018533	TTATT	2	10	280627	280636	20 %	80 %	0 %	0 %	403530138
132	NC_018533	TAAAG	2	10	280691	280700	60 %	20 %	20 %	0 %	403530138
133	NC_018533	TATTT	2	10	283068	283077	20 %	80 %	0 %	0 %	403530140
134	NC_018533	GCAAG	2	10	286675	286684	40 %	0 %	40 %	20 %	403530142
135	NC_018533	AAATT	2	10	289211	289220	60 %	40 %	0 %	0 %	403530145
136	NC_018533	TGGTT	2	10	290332	290341	0 %	60 %	40 %	0 %	403530146
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249	NC_018533	CATCT	2	10	527271	527280	20 %	40 %	0 %	40 %	403530331
250	NC_018533	GAACA	2	10	527566	527575	60 %	0 %	20 %	20 %	403530332
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252	NC_018533	AAAAT	2	10	530338	530347	80 %	20 %	0 %	0 %	403530335
253	NC_018533	TTTTA	2	10	530963	530972	20 %	80 %	0 %	0 %	403530336
254	NC_018533	TGCGT	2	10	535831	535840	0 %	40 %	40 %	20 %	403530341
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256	NC_018533	GATTA	2	10	537044	537053	40 %	40 %	20 %	0 %	403530341
257	NC_018533	TTGAT	2	10	538871	538880	20 %	60 %	20 %	0 %	403530343
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259	NC_018533	TTGCT	2	10	539203	539212	0 %	60 %	20 %	20 %	403530343
260	NC_018533	TGATT	2	10	540010	540019	20 %	60 %	20 %	0 %	403530344
261	NC_018533	AATGA	2	10	540450	540459	60 %	20 %	20 %	0 %	403530345
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