MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018533	GAA	2	6	217267	217272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530086
3502	NC_018533	TGA	2	6	217338	217343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530086
3503	NC_018533	GTT	2	6	217384	217389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530086
3504	NC_018533	ATT	2	6	217524	217529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530086
3505	NC_018533	GTT	3	9	217543	217551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530086
3506	NC_018533	TCC	2	6	217560	217565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530086
3507	NC_018533	A	6	6	217582	217587	100 %	0 %	0 %	0 %	403530086
3508	NC_018533	A	6	6	217637	217642	100 %	0 %	0 %	0 %	403530086
3509	NC_018533	AGC	2	6	217749	217754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530086
3510	NC_018533	TGG	2	6	217776	217781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530086
3511	NC_018533	GTG	2	6	217814	217819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530086
3512	NC_018533	CATG	2	8	217851	217858	25 %	25 %	25 %	25 %	403530086
3513	NC_018533	T	6	6	217905	217910	0 %	100 %	0 %	0 %	403530086
3514	NC_018533	T	6	6	218030	218035	0 %	100 %	0 %	0 %	403530086
3515	NC_018533	GAA	2	6	218038	218043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530086
3516	NC_018533	ATA	2	6	218078	218083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530086
3517	NC_018533	CGAAAA	2	12	218109	218120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403530086
3518	NC_018533	CGT	2	6	218161	218166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530086
3519	NC_018533	AAT	2	6	218178	218183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530086
3520	NC_018533	GTTG	2	8	218186	218193	0 %	50 %	50 %	0 %	403530086
3521	NC_018533	TTG	2	6	218375	218380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530087
3522	NC_018533	TGA	2	6	218412	218417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530087
3523	NC_018533	CTG	2	6	218516	218521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530087
3524	NC_018533	TGG	2	6	218571	218576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530087
3525	NC_018533	GAA	2	6	218620	218625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530087
3526	NC_018533	A	6	6	218637	218642	100 %	0 %	0 %	0 %	403530087
3527	NC_018533	GTT	2	6	218659	218664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530087
3528	NC_018533	GTT	2	6	218746	218751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530087
3529	NC_018533	TGC	2	6	218757	218762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530087
3530	NC_018533	TTG	2	6	218786	218791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530087
3531	NC_018533	CAT	3	9	218920	218928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530087
3532	NC_018533	ATT	2	6	218940	218945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530087
3533	NC_018533	AGT	2	6	219064	219069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530087
3534	NC_018533	ATG	2	6	219077	219082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530087
3535	NC_018533	A	7	7	219187	219193	100 %	0 %	0 %	0 %	403530087
3536	NC_018533	TTA	2	6	219209	219214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530087
3537	NC_018533	GCAA	2	8	219237	219244	50 %	0 %	25 %	25 %	403530087
3538	NC_018533	TGAT	2	8	219254	219261	25 %	50 %	25 %	0 %	403530087
3539	NC_018533	GTG	2	6	219263	219268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530087
3540	NC_018533	ACA	2	6	219310	219315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530087
3541	NC_018533	TTG	2	6	219320	219325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530087
3542	NC_018533	TGC	2	6	219363	219368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530087
3543	NC_018533	TGC	2	6	219462	219467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530087
3544	NC_018533	AGA	2	6	219495	219500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530087
3545	NC_018533	TGA	2	6	219618	219623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530087
3546	NC_018533	GCTG	2	8	219696	219703	0 %	25 %	50 %	25 %	403530087
3547	NC_018533	ATG	2	6	219815	219820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530087
3548	NC_018533	GGC	2	6	220710	220715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530088
3549	NC_018533	GCA	2	6	220816	220821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530088
3550	NC_018533	ATG	2	6	220838	220843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530088
3551	NC_018533	GAT	2	6	220885	220890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530088
3552	NC_018533	TTA	2	6	220915	220920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530088
3553	NC_018533	TTA	2	6	220987	220992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530088
3554	NC_018533	AGC	2	6	221000	221005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530088
3555	NC_018533	GGC	2	6	221021	221026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530088
3556	NC_018533	GCT	2	6	221122	221127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530088
3557	NC_018533	CTT	2	6	221144	221149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530088
3558	NC_018533	TTG	2	6	221351	221356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530088
3559	NC_018533	AAAG	2	8	221374	221381	75 %	0 %	25 %	0 %	403530088
3560	NC_018533	ATT	2	6	221396	221401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530088
3561	NC_018533	GTGCTG	2	12	221402	221413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403530088
3562	NC_018533	GAA	2	6	221445	221450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530088
3563	NC_018533	AGA	2	6	221556	221561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530088
3564	NC_018533	AGTC	2	8	221574	221581	25 %	25 %	25 %	25 %	403530088
3565	NC_018533	GGC	3	9	221630	221638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530088
3566	NC_018533	AG	3	6	221696	221701	50 %	0 %	50 %	0 %	403530088
3567	NC_018533	CT	3	6	221763	221768	0 %	50 %	0 %	50 %	403530088
3568	NC_018533	T	8	8	221768	221775	0 %	100 %	0 %	0 %	403530088
3569	NC_018533	ACA	2	6	221811	221816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530088
3570	NC_018533	AATA	2	8	221832	221839	75 %	25 %	0 %	0 %	403530088
3571	NC_018533	ACTT	2	8	221904	221911	25 %	50 %	0 %	25 %	403530088
3572	NC_018533	CAA	3	9	221921	221929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530088
3573	NC_018533	A	8	8	221960	221967	100 %	0 %	0 %	0 %	403530088
3574	NC_018533	CGG	2	6	222174	222179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530089
3575	NC_018533	TGAT	2	8	222289	222296	25 %	50 %	25 %	0 %	403530089
3576	NC_018533	TG	3	6	222376	222381	0 %	50 %	50 %	0 %	403530089
3577	NC_018533	TGG	2	6	222389	222394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530089
3578	NC_018533	T	6	6	222434	222439	0 %	100 %	0 %	0 %	403530089
3579	NC_018533	TGC	2	6	222581	222586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530089
3580	NC_018533	TGA	2	6	222593	222598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530089
3581	NC_018533	A	6	6	222598	222603	100 %	0 %	0 %	0 %	403530089
3582	NC_018533	TGCAG	2	10	222614	222623	20 %	20 %	40 %	20 %	403530089
3583	NC_018533	GTT	2	6	222636	222641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530089
3584	NC_018533	CTT	2	6	222718	222723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530089
3585	NC_018533	GAA	2	6	222752	222757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530089
3586	NC_018533	GGT	2	6	222792	222797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530089
3587	NC_018533	TCA	2	6	222804	222809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530089
3588	NC_018533	GAA	2	6	222897	222902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530089
3589	NC_018533	ATT	2	6	222911	222916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530089
3590	NC_018533	TGC	2	6	222953	222958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530089
3591	NC_018533	GCC	2	6	223021	223026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530089
3592	NC_018533	GAA	3	9	223044	223052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530089
3593	NC_018533	A	7	7	223056	223062	100 %	0 %	0 %	0 %	403530089
3594	NC_018533	CAT	2	6	223155	223160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530089
3595	NC_018533	GTTC	2	8	223233	223240	0 %	50 %	25 %	25 %	403530089
3596	NC_018533	TGA	2	6	223379	223384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530089
3597	NC_018533	ATG	2	6	223405	223410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530089
3598	NC_018533	GGCA	2	8	223417	223424	25 %	0 %	50 %	25 %	403530089
3599	NC_018533	TGT	2	6	223427	223432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530089
3600	NC_018533	TCT	2	6	223433	223438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530089
3601	NC_018533	TTTG	2	8	223485	223492	0 %	75 %	25 %	0 %	403530089
3602	NC_018533	CG	3	6	223500	223505	0 %	0 %	50 %	50 %	403530089
3603	NC_018533	CAG	2	6	223570	223575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530089
3604	NC_018533	TAT	2	6	223580	223585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530089
3605	NC_018533	GTT	2	6	223611	223616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530089
3606	NC_018533	CCT	2	6	223635	223640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530089
3607	NC_018533	TTAAAA	2	12	223811	223822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530090
3608	NC_018533	A	7	7	223847	223853	100 %	0 %	0 %	0 %	403530090
3609	NC_018533	TTG	2	6	223854	223859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530090
3610	NC_018533	GTG	2	6	223866	223871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530090
3611	NC_018533	TGA	2	6	223933	223938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530090
3612	NC_018533	GTG	2	6	223968	223973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530090
3613	NC_018533	A	7	7	224017	224023	100 %	0 %	0 %	0 %	403530090
3614	NC_018533	AT	3	6	224026	224031	50 %	50 %	0 %	0 %	403530090
3615	NC_018533	CTC	2	6	224088	224093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530090
3616	NC_018533	AGA	2	6	224101	224106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530090
3617	NC_018533	A	6	6	224215	224220	100 %	0 %	0 %	0 %	403530090
3618	NC_018533	TTGA	2	8	224411	224418	25 %	50 %	25 %	0 %	403530090
3619	NC_018533	CAAT	2	8	224457	224464	50 %	25 %	0 %	25 %	403530090
3620	NC_018533	TTA	2	6	224704	224709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530091
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3622	NC_018533	T	6	6	224748	224753	0 %	100 %	0 %	0 %	403530091
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3990	NC_018533	CTGG	2	8	244525	244532	0 %	25 %	50 %	25 %	403530107
3991	NC_018533	TGG	2	6	244548	244553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530107
3992	NC_018533	CAT	2	6	244583	244588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530107
3993	NC_018533	AGA	3	9	244602	244610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530107
3994	NC_018533	AAT	2	6	244633	244638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530107
3995	NC_018533	TTA	2	6	244639	244644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530107
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3997	NC_018533	CTT	2	6	244834	244839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530107
3998	NC_018533	T	6	6	245394	245399	0 %	100 %	0 %	0 %	403530108
3999	NC_018533	CTT	2	6	245417	245422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530108
4000	NC_018533	GAT	2	6	245466	245471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530108

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