MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018533	GTG	2	6	186085	186090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3002	NC_018533	TTG	2	6	186193	186198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3003	NC_018533	ATG	2	6	186306	186311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3004	NC_018533	TGC	2	6	186323	186328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530061
3005	NC_018533	TGG	2	6	186335	186340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3006	NC_018533	GAA	2	6	186422	186427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
3007	NC_018533	TGG	2	6	186452	186457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3008	NC_018533	TGG	2	6	186506	186511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3009	NC_018533	TTG	2	6	186562	186567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3010	NC_018533	GGAA	2	8	186581	186588	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
3011	NC_018533	AGA	2	6	186589	186594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
3012	NC_018533	ATG	2	6	186675	186680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3013	NC_018533	TGC	2	6	186692	186697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530061
3014	NC_018533	TGG	2	6	186704	186709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3015	NC_018533	GTT	2	6	186783	186788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3016	NC_018533	TGG	2	6	186821	186826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3017	NC_018533	AAT	2	6	186852	186857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530061
3018	NC_018533	TCT	2	6	186900	186905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530061
3019	NC_018533	GAAGG	2	10	186930	186939	40 %	0 %	60 %	0 %	403530061
3020	NC_018533	G	7	7	186938	186944	0 %	0 %	100 %	0 %	403530061
3021	NC_018533	ATG	2	6	186946	186951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3022	NC_018533	TGG	2	6	187031	187036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3023	NC_018533	TC	3	6	187061	187066	0 %	50 %	0 %	50 %	403530061
3024	NC_018533	GTT	2	6	187113	187118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3025	NC_018533	GTT	2	6	187125	187130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3026	NC_018533	GGT	2	6	187182	187187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3027	NC_018533	GATA	2	8	187208	187215	50 %	25 %	25 %	0 %	403530061
3028	NC_018533	AAG	2	6	187249	187254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
3029	NC_018533	TGG	2	6	187262	187267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3030	NC_018533	AAC	2	6	187288	187293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530061
3031	NC_018533	GTT	2	6	187302	187307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
3032	NC_018533	TGA	2	6	187310	187315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3033	NC_018533	A	6	6	187320	187325	100 %	0 %	0 %	0 %	403530061
3034	NC_018533	ATG	2	6	187369	187374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3035	NC_018533	AAG	2	6	187447	187452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
3036	NC_018533	AGC	2	6	187460	187465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530061
3037	NC_018533	GCATT	2	10	187522	187531	20 %	40 %	20 %	20 %	403530061
3038	NC_018533	ATG	2	6	187679	187684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
3039	NC_018533	ATT	3	9	187694	187702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530062
3040	NC_018533	T	7	7	187707	187713	0 %	100 %	0 %	0 %	403530062
3041	NC_018533	TTA	2	6	187727	187732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530062
3042	NC_018533	TGA	2	6	187753	187758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530062
3043	NC_018533	CCA	2	6	187784	187789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530062
3044	NC_018533	TAT	2	6	187847	187852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530062
3045	NC_018533	ATA	2	6	187932	187937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530062
3046	NC_018533	TGA	2	6	188083	188088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530062
3047	NC_018533	AAG	2	6	188151	188156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530062
3048	NC_018533	GCA	2	6	188225	188230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530062
3049	NC_018533	TTCT	2	8	188757	188764	0 %	75 %	0 %	25 %	403530063
3050	NC_018533	AGA	2	6	188797	188802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530063
3051	NC_018533	GCA	2	6	188861	188866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530063
3052	NC_018533	A	7	7	190911	190917	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
3053	NC_018533	AGA	2	6	190981	190986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530064
3054	NC_018533	TCA	2	6	191051	191056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530064
3055	NC_018533	ATGA	2	8	191106	191113	50 %	25 %	25 %	0 %	403530064
3056	NC_018533	A	6	6	191130	191135	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
3057	NC_018533	A	6	6	191140	191145	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
3058	NC_018533	AGC	2	6	191159	191164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530064
3059	NC_018533	G	6	6	191168	191173	0 %	0 %	100 %	0 %	403530064
3060	NC_018533	TGA	2	6	191210	191215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530064
3061	NC_018533	ATT	2	6	191239	191244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530064
3062	NC_018533	TGT	2	6	191249	191254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530064
3063	NC_018533	T	6	6	191288	191293	0 %	100 %	0 %	0 %	403530064
3064	NC_018533	ATTG	2	8	191315	191322	25 %	50 %	25 %	0 %	403530064
3065	NC_018533	CAA	2	6	191371	191376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530064
3066	NC_018533	CAGA	2	8	191388	191395	50 %	0 %	25 %	25 %	403530064
3067	NC_018533	ATTT	2	8	191409	191416	25 %	75 %	0 %	0 %	403530064
3068	NC_018533	GCT	2	6	191427	191432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530064
3069	NC_018533	T	6	6	191468	191473	0 %	100 %	0 %	0 %	403530064
3070	NC_018533	CTT	2	6	191508	191513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530064
3071	NC_018533	CAT	2	6	191544	191549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530064
3072	NC_018533	ACC	2	6	191555	191560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530064
3073	NC_018533	TCT	2	6	191591	191596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530064
3074	NC_018533	TAAAA	2	10	191626	191635	80 %	20 %	0 %	0 %	403530064
3075	NC_018533	GGA	2	6	191846	191851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530065
3076	NC_018533	TCG	2	6	191869	191874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530065
3077	NC_018533	G	7	7	191906	191912	0 %	0 %	100 %	0 %	403530065
3078	NC_018533	GGA	2	6	191915	191920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530065
3079	NC_018533	GTG	3	9	191922	191930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530065
3080	NC_018533	G	6	6	192008	192013	0 %	0 %	100 %	0 %	403530065
3081	NC_018533	TGA	2	6	192049	192054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530065
3082	NC_018533	TAT	2	6	192055	192060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530065
3083	NC_018533	GAA	2	6	192092	192097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530065
3084	NC_018533	ATA	2	6	192099	192104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530065
3085	NC_018533	AGG	2	6	192157	192162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530065
3086	NC_018533	TTGG	2	8	192233	192240	0 %	50 %	50 %	0 %	403530065
3087	NC_018533	AGA	2	6	192241	192246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530065
3088	NC_018533	GCA	2	6	192341	192346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530065
3089	NC_018533	TTGA	2	8	192446	192453	25 %	50 %	25 %	0 %	403530065
3090	NC_018533	GTT	2	6	192507	192512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530065
3091	NC_018533	AAG	3	9	192540	192548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530065
3092	NC_018533	AAT	2	6	192599	192604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530065
3093	NC_018533	AGAT	2	8	192639	192646	50 %	25 %	25 %	0 %	403530065
3094	NC_018533	GAA	2	6	192659	192664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530065
3095	NC_018533	ATG	2	6	192713	192718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530065
3096	NC_018533	GTG	2	6	192732	192737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530065
3097	NC_018533	AAG	2	6	192792	192797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530065
3098	NC_018533	ATG	2	6	192943	192948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530066
3099	NC_018533	TTA	2	6	192981	192986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530066
3100	NC_018533	GAA	2	6	193053	193058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530066
3101	NC_018533	TGC	2	6	193070	193075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3102	NC_018533	TTA	2	6	193240	193245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530066
3103	NC_018533	CAA	2	6	193264	193269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530066
3104	NC_018533	AGC	2	6	193301	193306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3105	NC_018533	CGA	2	6	193315	193320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3106	NC_018533	TTA	2	6	193414	193419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530066
3107	NC_018533	A	6	6	193441	193446	100 %	0 %	0 %	0 %	403530066
3108	NC_018533	TGC	2	6	193457	193462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3109	NC_018533	GGA	2	6	193479	193484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530066
3110	NC_018533	CTG	2	6	193522	193527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3111	NC_018533	TTA	2	6	193540	193545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530066
3112	NC_018533	T	7	7	193601	193607	0 %	100 %	0 %	0 %	403530066
3113	NC_018533	AGC	2	6	193694	193699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3114	NC_018533	TTA	2	6	193725	193730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530066
3115	NC_018533	TTG	2	6	193786	193791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530066
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3117	NC_018533	GCT	2	6	193942	193947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530066
3118	NC_018533	A	6	6	193963	193968	100 %	0 %	0 %	0 %	403530066
3119	NC_018533	AGA	2	6	194022	194027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530067
3120	NC_018533	TGC	3	9	194061	194069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530067
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3122	NC_018533	TCT	2	6	194086	194091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530067
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3490	NC_018533	TCA	2	6	216857	216862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530086
3491	NC_018533	AGC	2	6	216900	216905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530086
3492	NC_018533	TAT	2	6	216934	216939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530086
3493	NC_018533	ATG	2	6	216947	216952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530086
3494	NC_018533	TTA	3	9	216967	216975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530086
3495	NC_018533	GTG	2	6	217001	217006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530086
3496	NC_018533	CTT	2	6	217018	217023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530086
3497	NC_018533	GAT	2	6	217027	217032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530086
3498	NC_018533	GGT	2	6	217126	217131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530086
3499	NC_018533	ATA	2	6	217187	217192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530086
3500	NC_018533	AGG	2	6	217227	217232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530086

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