MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018533	CTG	2	6	151261	151266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530040
2502	NC_018533	CCA	2	6	151307	151312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530040
2503	NC_018533	CA	3	6	151311	151316	50 %	0 %	0 %	50 %	403530040
2504	NC_018533	ATT	2	6	151317	151322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530040
2505	NC_018533	GCTT	2	8	151352	151359	0 %	50 %	25 %	25 %	403530040
2506	NC_018533	T	7	7	151448	151454	0 %	100 %	0 %	0 %	403530040
2507	NC_018533	CGT	2	6	151488	151493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530040
2508	NC_018533	TGC	2	6	151538	151543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530040
2509	NC_018533	TAT	2	6	151556	151561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530040
2510	NC_018533	CTTG	2	8	151562	151569	0 %	50 %	25 %	25 %	403530040
2511	NC_018533	TGGTA	2	10	151608	151617	20 %	40 %	40 %	0 %	403530040
2512	NC_018533	CCT	2	6	151701	151706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530040
2513	NC_018533	GAA	3	9	151763	151771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530040
2514	NC_018533	ATT	2	6	151836	151841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530040
2515	NC_018533	TGG	2	6	151890	151895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530040
2516	NC_018533	TTG	2	6	151897	151902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530040
2517	NC_018533	GATTG	2	10	151904	151913	20 %	40 %	40 %	0 %	403530040
2518	NC_018533	TCAT	2	8	151940	151947	25 %	50 %	0 %	25 %	403530040
2519	NC_018533	TAC	2	6	151968	151973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530040
2520	NC_018533	GAA	2	6	151983	151988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530040
2521	NC_018533	A	6	6	151993	151998	100 %	0 %	0 %	0 %	403530040
2522	NC_018533	TA	3	6	152129	152134	50 %	50 %	0 %	0 %	403530041
2523	NC_018533	T	6	6	152163	152168	0 %	100 %	0 %	0 %	403530041
2524	NC_018533	T	6	6	152181	152186	0 %	100 %	0 %	0 %	403530041
2525	NC_018533	CTT	2	6	152190	152195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530041
2526	NC_018533	TGG	2	6	152197	152202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530041
2527	NC_018533	TCA	2	6	152270	152275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530041
2528	NC_018533	GTG	2	6	152322	152327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530041
2529	NC_018533	TGGAA	2	10	152374	152383	40 %	20 %	40 %	0 %	403530041
2530	NC_018533	TGAA	2	8	152406	152413	50 %	25 %	25 %	0 %	403530041
2531	NC_018533	T	6	6	152510	152515	0 %	100 %	0 %	0 %	403530041
2532	NC_018533	TGGT	2	8	152520	152527	0 %	50 %	50 %	0 %	403530041
2533	NC_018533	TCT	2	6	152554	152559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530041
2534	NC_018533	GAT	2	6	152563	152568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530041
2535	NC_018533	T	6	6	152576	152581	0 %	100 %	0 %	0 %	403530041
2536	NC_018533	TCG	3	9	152587	152595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530041
2537	NC_018533	ATA	2	6	152610	152615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530041
2538	NC_018533	TG	3	6	152662	152667	0 %	50 %	50 %	0 %	403530041
2539	NC_018533	ATG	2	6	152819	152824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530042
2540	NC_018533	ATT	2	6	152873	152878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530042
2541	NC_018533	TTA	2	6	152979	152984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530042
2542	NC_018533	TGG	2	6	152996	153001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530042
2543	NC_018533	ATG	2	6	153026	153031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530042
2544	NC_018533	TGG	2	6	153207	153212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530042
2545	NC_018533	CAT	2	6	153728	153733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530043
2546	NC_018533	AT	3	6	153876	153881	50 %	50 %	0 %	0 %	403530043
2547	NC_018533	TCA	2	6	153907	153912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530043
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2549	NC_018533	AAG	2	6	154005	154010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530043
2550	NC_018533	AGC	2	6	154111	154116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530043
2551	NC_018533	GAA	2	6	154136	154141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530043
2552	NC_018533	TTA	2	6	154296	154301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530043
2553	NC_018533	CGT	2	6	154424	154429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530043
2554	NC_018533	AGA	2	6	154462	154467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530043
2555	NC_018533	TTG	2	6	154491	154496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530043
2556	NC_018533	AAG	2	6	154515	154520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530043
2557	NC_018533	ACG	2	6	154534	154539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530043
2558	NC_018533	ATT	2	6	154958	154963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530044
2559	NC_018533	CTT	2	6	154973	154978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530044
2560	NC_018533	TTC	2	6	154992	154997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530044
2561	NC_018533	ATA	2	6	155014	155019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530044
2562	NC_018533	TTACG	2	10	155114	155123	20 %	40 %	20 %	20 %	403530044
2563	NC_018533	A	6	6	155153	155158	100 %	0 %	0 %	0 %	403530044
2564	NC_018533	AAC	2	6	155508	155513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530044
2565	NC_018533	T	6	6	155573	155578	0 %	100 %	0 %	0 %	403530044
2566	NC_018533	T	6	6	155612	155617	0 %	100 %	0 %	0 %	403530044
2567	NC_018533	ATA	2	6	155740	155745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530044
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2569	NC_018533	GTT	2	6	155900	155905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530045
2570	NC_018533	GAT	2	6	155906	155911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530045
2571	NC_018533	TCA	2	6	155996	156001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530045
2572	NC_018533	CTT	2	6	156020	156025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530045
2573	NC_018533	CTG	2	6	156032	156037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530045
2574	NC_018533	CGG	2	6	156109	156114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530045
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2579	NC_018533	ATC	2	6	156523	156528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530045
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2582	NC_018533	T	7	7	156679	156685	0 %	100 %	0 %	0 %	403530045
2583	NC_018533	CAG	2	6	156698	156703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530045
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2586	NC_018533	TTC	2	6	156873	156878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530045
2587	NC_018533	ACA	2	6	157030	157035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530045
2588	NC_018533	TCT	2	6	157112	157117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530046
2589	NC_018533	CATC	2	8	157178	157185	25 %	25 %	0 %	50 %	403530046
2590	NC_018533	AAG	2	6	157243	157248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530046
2591	NC_018533	A	7	7	157336	157342	100 %	0 %	0 %	0 %	403530046
2592	NC_018533	ATC	2	6	157508	157513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530046
2593	NC_018533	CGC	2	6	157560	157565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530046
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2595	NC_018533	T	6	6	158009	158014	0 %	100 %	0 %	0 %	403530047
2596	NC_018533	TGC	2	6	158034	158039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530047
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2599	NC_018533	GTT	2	6	158130	158135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530047
2600	NC_018533	ATT	2	6	158140	158145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530047
2601	NC_018533	TA	3	6	158203	158208	50 %	50 %	0 %	0 %	403530047
2602	NC_018533	GGA	2	6	158247	158252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530047
2603	NC_018533	ATT	2	6	158260	158265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530047
2604	NC_018533	CCG	2	6	158281	158286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530047
2605	NC_018533	TTGAT	2	10	158309	158318	20 %	60 %	20 %	0 %	403530047
2606	NC_018533	A	7	7	158334	158340	100 %	0 %	0 %	0 %	403530047
2607	NC_018533	TAA	2	6	158347	158352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530047
2608	NC_018533	T	6	6	158420	158425	0 %	100 %	0 %	0 %	403530048
2609	NC_018533	TGA	2	6	158455	158460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530048
2610	NC_018533	ATT	2	6	158475	158480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530048
2611	NC_018533	TGAT	2	8	158652	158659	25 %	50 %	25 %	0 %	403530048
2612	NC_018533	ACCC	2	8	158662	158669	25 %	0 %	0 %	75 %	403530048
2613	NC_018533	TCA	2	6	158671	158676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530048
2614	NC_018533	GAT	2	6	158718	158723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530048
2615	NC_018533	GAT	2	6	158757	158762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530048
2616	NC_018533	GGGT	2	8	158801	158808	0 %	25 %	75 %	0 %	403530048
2617	NC_018533	TTGA	2	8	158856	158863	25 %	50 %	25 %	0 %	403530048
2618	NC_018533	A	6	6	158878	158883	100 %	0 %	0 %	0 %	403530048
2619	NC_018533	ATA	2	6	159855	159860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530049
2620	NC_018533	TTTCA	2	10	159870	159879	20 %	60 %	0 %	20 %	403530049
2621	NC_018533	CG	3	6	159915	159920	0 %	0 %	50 %	50 %	403530049
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2991	NC_018533	GGTTCT	2	12	185517	185528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403530061
2992	NC_018533	GA	4	8	185540	185547	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
2993	NC_018533	ATA	2	6	185593	185598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530061
2994	NC_018533	GTG	2	6	185603	185608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
2995	NC_018533	GGC	2	6	185678	185683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530061
2996	NC_018533	CAAT	2	8	185704	185711	50 %	25 %	0 %	25 %	403530061
2997	NC_018533	AG	3	6	185733	185738	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
2998	NC_018533	GAA	2	6	185870	185875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
2999	NC_018533	GGT	3	9	186000	186008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
3000	NC_018533	ATT	2	6	186042	186047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530061

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