MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_018533	ATA	2	6	1570038	1570043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531121
25003	NC_018533	TG	3	6	1570059	1570064	0 %	50 %	50 %	0 %	403531121
25004	NC_018533	TGA	2	6	1570114	1570119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531121
25005	NC_018533	CTC	2	6	1570142	1570147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531122
25006	NC_018533	CTG	2	6	1570151	1570156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25007	NC_018533	AGC	2	6	1570170	1570175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25008	NC_018533	AAC	2	6	1570263	1570268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531122
25009	NC_018533	TC	3	6	1570291	1570296	0 %	50 %	0 %	50 %	403531122
25010	NC_018533	CAG	2	6	1570298	1570303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25011	NC_018533	CAA	2	6	1570304	1570309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531122
25012	NC_018533	ATA	2	6	1570336	1570341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531122
25013	NC_018533	CCA	2	6	1570342	1570347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531122
25014	NC_018533	CAG	2	6	1570382	1570387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25015	NC_018533	TAA	2	6	1570388	1570393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531122
25016	NC_018533	AGC	2	6	1570401	1570406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25017	NC_018533	CCA	2	6	1570432	1570437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531122
25018	NC_018533	ATA	2	6	1570477	1570482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531122
25019	NC_018533	TTG	2	6	1570487	1570492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531122
25020	NC_018533	TCT	3	9	1570588	1570596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531122
25021	NC_018533	ATT	2	6	1570641	1570646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531122
25022	NC_018533	TCA	2	6	1570691	1570696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531122
25023	NC_018533	TCCG	2	8	1570781	1570788	0 %	25 %	25 %	50 %	403531122
25024	NC_018533	CAG	2	6	1570829	1570834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531122
25025	NC_018533	CTC	2	6	1570887	1570892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531122
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25027	NC_018533	GTTT	2	8	1571047	1571054	0 %	75 %	25 %	0 %	403531122
25028	NC_018533	CAA	2	6	1571093	1571098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531122
25029	NC_018533	CTT	2	6	1571099	1571104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531122
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25031	NC_018533	ATCAAG	2	12	1571139	1571150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403531122
25032	NC_018533	ACC	2	6	1571175	1571180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531122
25033	NC_018533	T	7	7	1571223	1571229	0 %	100 %	0 %	0 %	403531122
25034	NC_018533	ATTC	2	8	1571328	1571335	25 %	50 %	0 %	25 %	403531122
25035	NC_018533	T	7	7	1571471	1571477	0 %	100 %	0 %	0 %	403531123
25036	NC_018533	CTT	2	6	1571505	1571510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531123
25037	NC_018533	CGC	2	6	1571548	1571553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531123
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25040	NC_018533	CAC	2	6	1571734	1571739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531123
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25042	NC_018533	ACC	2	6	1571819	1571824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531123
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25044	NC_018533	AAAC	2	8	1571875	1571882	75 %	0 %	0 %	25 %	403531123
25045	NC_018533	ACT	2	6	1571967	1571972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531123
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25047	NC_018533	T	6	6	1572065	1572070	0 %	100 %	0 %	0 %	403531123
25048	NC_018533	ATC	2	6	1572119	1572124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531123
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25051	NC_018533	AAT	2	6	1572720	1572725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531124
25052	NC_018533	GTC	2	6	1572782	1572787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531124
25053	NC_018533	ATC	2	6	1572808	1572813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531124
25054	NC_018533	CTG	2	6	1572819	1572824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531124
25055	NC_018533	AATA	2	8	1572868	1572875	75 %	25 %	0 %	0 %	403531124
25056	NC_018533	AAAT	2	8	1572876	1572883	75 %	25 %	0 %	0 %	403531124
25057	NC_018533	GCT	2	6	1572974	1572979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531124
25058	NC_018533	CAAA	2	8	1572993	1573000	75 %	0 %	0 %	25 %	403531124
25059	NC_018533	TCA	2	6	1573073	1573078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531124
25060	NC_018533	GCA	2	6	1573098	1573103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531124
25061	NC_018533	TA	3	6	1573156	1573161	50 %	50 %	0 %	0 %	403531124
25062	NC_018533	CTG	2	6	1573165	1573170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531124
25063	NC_018533	T	6	6	1573180	1573185	0 %	100 %	0 %	0 %	403531124
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25071	NC_018533	ACA	2	6	1573670	1573675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531124
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25074	NC_018533	A	6	6	1573696	1573701	100 %	0 %	0 %	0 %	403531124
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25080	NC_018533	TTTG	2	8	1574146	1574153	0 %	75 %	25 %	0 %	403531125
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25086	NC_018533	A	6	6	1574372	1574377	100 %	0 %	0 %	0 %	403531125
25087	NC_018533	CAT	2	6	1574396	1574401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531125
25088	NC_018533	AAC	2	6	1574423	1574428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531125
25089	NC_018533	TAC	2	6	1574451	1574456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531125
25090	NC_018533	GATG	2	8	1574740	1574747	25 %	25 %	50 %	0 %	403531126
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25093	NC_018533	AGC	2	6	1574824	1574829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531126
25094	NC_018533	CA	3	6	1574875	1574880	50 %	0 %	0 %	50 %	403531126
25095	NC_018533	AAG	2	6	1574883	1574888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531126
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25098	NC_018533	CTG	2	6	1575144	1575149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531126
25099	NC_018533	T	8	8	1575198	1575205	0 %	100 %	0 %	0 %	403531126
25100	NC_018533	ATA	2	6	1575213	1575218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531126
25101	NC_018533	CAA	2	6	1575221	1575226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531126
25102	NC_018533	GAG	2	6	1575345	1575350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403531126
25103	NC_018533	TGC	2	6	1575376	1575381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531126
25104	NC_018533	GGC	2	6	1575397	1575402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403531126
25105	NC_018533	G	6	6	1575449	1575454	0 %	0 %	100 %	0 %	403531126
25106	NC_018533	AGA	2	6	1575475	1575480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531126
25107	NC_018533	CCAA	2	8	1575503	1575510	50 %	0 %	0 %	50 %	403531126
25108	NC_018533	TGG	2	6	1575520	1575525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403531126
25109	NC_018533	T	6	6	1575526	1575531	0 %	100 %	0 %	0 %	403531126
25110	NC_018533	AAG	2	6	1575554	1575559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531126
25111	NC_018533	TGA	2	6	1575569	1575574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531126
25112	NC_018533	AAAG	2	8	1575634	1575641	75 %	0 %	25 %	0 %	403531127
25113	NC_018533	CTT	2	6	1575644	1575649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531127
25114	NC_018533	ATG	2	6	1575671	1575676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531127
25115	NC_018533	TAT	2	6	1575678	1575683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531127
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25235	NC_018533	ATT	2	6	1581229	1581234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531132
25236	NC_018533	CAT	2	6	1581240	1581245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531132
25237	NC_018533	CAAT	2	8	1581425	1581432	50 %	25 %	0 %	25 %	403531132
25238	NC_018533	T	6	6	1581448	1581453	0 %	100 %	0 %	0 %	403531132
25239	NC_018533	ATC	2	6	1581466	1581471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531132
25240	NC_018533	TGA	2	6	1581508	1581513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531132
25241	NC_018533	AG	3	6	1581562	1581567	50 %	0 %	50 %	0 %	403531132
25242	NC_018533	GCT	2	6	1581590	1581595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531132
25243	NC_018533	CAT	2	6	1581624	1581629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531132
25244	NC_018533	GCT	2	6	1581725	1581730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531132
25245	NC_018533	GTT	2	6	1581758	1581763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531132
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25247	NC_018533	AAGC	2	8	1582019	1582026	50 %	0 %	25 %	25 %	403531133
25248	NC_018533	T	7	7	1582054	1582060	0 %	100 %	0 %	0 %	403531133
25249	NC_018533	T	6	6	1582062	1582067	0 %	100 %	0 %	0 %	403531133
25250	NC_018533	TGA	2	6	1582091	1582096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531133
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25253	NC_018533	T	7	7	1582186	1582192	0 %	100 %	0 %	0 %	403531133
25254	NC_018533	TCC	3	9	1582228	1582236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531133
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25259	NC_018533	CGT	2	6	1582492	1582497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531134
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25263	NC_018533	T	6	6	1582586	1582591	0 %	100 %	0 %	0 %	403531134
25264	NC_018533	AGA	2	6	1582644	1582649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531134
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25266	NC_018533	AAG	2	6	1582821	1582826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531134
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25270	NC_018533	GCA	2	6	1583176	1583181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531134
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25330	NC_018533	GTTT	2	8	1585831	1585838	0 %	75 %	25 %	0 %	403531136
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25332	NC_018533	ACG	2	6	1585893	1585898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531136
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25335	NC_018533	AAT	2	6	1586100	1586105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531136
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25337	NC_018533	TGC	2	6	1586136	1586141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531136
25338	NC_018533	A	7	7	1586145	1586151	100 %	0 %	0 %	0 %	403531136
25339	NC_018533	CAC	2	6	1586183	1586188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531136
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25343	NC_018533	AAG	2	6	1586256	1586261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531136
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25348	NC_018533	TCA	2	6	1586416	1586421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531136
25349	NC_018533	GAT	2	6	1586450	1586455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531136
25350	NC_018533	GTA	2	6	1586458	1586463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531136
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