MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018533	CAAATG	2	12	93101	93112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530000
1502	NC_018533	TGAAT	2	10	93190	93199	40 %	40 %	20 %	0 %	403530000
1503	NC_018533	GCG	2	6	93320	93325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530000
1504	NC_018533	AAT	2	6	93329	93334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530000
1505	NC_018533	GTT	2	6	93356	93361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530000
1506	NC_018533	ATT	2	6	93428	93433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530000
1507	NC_018533	TCAT	2	8	93504	93511	25 %	50 %	0 %	25 %	403530000
1508	NC_018533	CT	3	6	93529	93534	0 %	50 %	0 %	50 %	403530000
1509	NC_018533	ATGCG	2	10	93570	93579	20 %	20 %	40 %	20 %	403530000
1510	NC_018533	GCA	2	6	93581	93586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530000
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1512	NC_018533	CAA	2	6	93732	93737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530000
1513	NC_018533	ATT	2	6	93788	93793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530000
1514	NC_018533	TTG	2	6	93806	93811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530000
1515	NC_018533	CAT	2	6	93990	93995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530000
1516	NC_018533	ACATT	2	10	94094	94103	40 %	40 %	0 %	20 %	403530000
1517	NC_018533	TTG	2	6	94104	94109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530000
1518	NC_018533	T	8	8	94262	94269	0 %	100 %	0 %	0 %	403530001
1519	NC_018533	A	7	7	94282	94288	100 %	0 %	0 %	0 %	403530001
1520	NC_018533	CCT	2	6	94289	94294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530001
1521	NC_018533	AT	3	6	94295	94300	50 %	50 %	0 %	0 %	403530001
1522	NC_018533	T	7	7	94339	94345	0 %	100 %	0 %	0 %	403530001
1523	NC_018533	GCT	2	6	94361	94366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530001
1524	NC_018533	A	6	6	94367	94372	100 %	0 %	0 %	0 %	403530001
1525	NC_018533	TAT	2	6	94402	94407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530001
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1533	NC_018533	TTTA	2	8	94674	94681	25 %	75 %	0 %	0 %	403530001
1534	NC_018533	GCA	2	6	94733	94738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530001
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1542	NC_018533	ACGT	2	8	96656	96663	25 %	25 %	25 %	25 %	403530003
1543	NC_018533	GTTT	2	8	96718	96725	0 %	75 %	25 %	0 %	403530003
1544	NC_018533	ATGA	2	8	96729	96736	50 %	25 %	25 %	0 %	403530003
1545	NC_018533	ATT	2	6	96768	96773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530003
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1553	NC_018533	ATT	2	6	97274	97279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530004
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1564	NC_018533	A	6	6	98116	98121	100 %	0 %	0 %	0 %	403530005
1565	NC_018533	ATT	2	6	98132	98137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530005
1566	NC_018533	A	7	7	98230	98236	100 %	0 %	0 %	0 %	403530006
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1573	NC_018533	TTTG	2	8	98714	98721	0 %	75 %	25 %	0 %	403530007
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1592	NC_018533	CCAT	2	8	99463	99470	25 %	25 %	0 %	50 %	403530007
1593	NC_018533	T	7	7	99678	99684	0 %	100 %	0 %	0 %	403530007
1594	NC_018533	T	7	7	99741	99747	0 %	100 %	0 %	0 %	403530007
1595	NC_018533	TG	3	6	99762	99767	0 %	50 %	50 %	0 %	403530007
1596	NC_018533	TGAA	2	8	99852	99859	50 %	25 %	25 %	0 %	403530008
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1603	NC_018533	GCT	3	9	100337	100345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530008
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1606	NC_018533	CAT	2	6	100437	100442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530008
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1609	NC_018533	AATG	2	8	100540	100547	50 %	25 %	25 %	0 %	403530008
1610	NC_018533	GTC	2	6	100587	100592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530008
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1613	NC_018533	TAT	2	6	100750	100755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530008
1614	NC_018533	G	6	6	100756	100761	0 %	0 %	100 %	0 %	403530008
1615	NC_018533	GA	3	6	100763	100768	50 %	0 %	50 %	0 %	403530008
1616	NC_018533	TGA	2	6	100777	100782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530008
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1618	NC_018533	CGGGC	2	10	100842	100851	0 %	0 %	60 %	40 %	403530008
1619	NC_018533	CAAAGA	2	12	100971	100982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403530008
1620	NC_018533	TTG	2	6	100983	100988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530008
1621	NC_018533	CAG	2	6	100994	100999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530008
1622	NC_018533	TAG	2	6	101181	101186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530008
1623	NC_018533	AAG	2	6	101187	101192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530008
1624	NC_018533	TGA	2	6	101193	101198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530008
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1626	NC_018533	GA	3	6	101326	101331	50 %	0 %	50 %	0 %	403530008
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1751	NC_018533	ATC	2	6	108695	108700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530014
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1859	NC_018533	AG	3	6	113614	113619	50 %	0 %	50 %	0 %	403530014
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1872	NC_018533	GGC	2	6	114120	114125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530014
1873	NC_018533	ATA	2	6	114158	114163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530014
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1875	NC_018533	T	7	7	114196	114202	0 %	100 %	0 %	0 %	403530014
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1979	NC_018533	TTCA	2	8	119215	119222	25 %	50 %	0 %	25 %	403530016
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1992	NC_018533	T	6	6	119695	119700	0 %	100 %	0 %	0 %	403530016
1993	NC_018533	CAT	2	6	119701	119706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530016
1994	NC_018533	TGT	2	6	119721	119726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530016
1995	NC_018533	GCT	2	6	119826	119831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530016
1996	NC_018533	C	6	6	119872	119877	0 %	0 %	0 %	100 %	403530017
1997	NC_018533	GTT	2	6	119880	119885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530017
1998	NC_018533	ATC	2	6	119932	119937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530017
1999	NC_018533	TG	3	6	120005	120010	0 %	50 %	50 %	0 %	403530017
2000	NC_018533	CCA	2	6	120020	120025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530017

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