MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018533	TTG	2	6	62461	62466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529973
1002	NC_018533	TCA	2	6	62469	62474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529973
1003	NC_018533	GTT	2	6	62524	62529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529973
1004	NC_018533	ATT	2	6	62555	62560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529973
1005	NC_018533	ATA	2	6	62595	62600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529973
1006	NC_018533	TGC	2	6	62624	62629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529973
1007	NC_018533	ATTA	2	8	62774	62781	50 %	50 %	0 %	0 %	403529973
1008	NC_018533	ATA	2	6	62814	62819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529973
1009	NC_018533	CCA	2	6	62857	62862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403529973
1010	NC_018533	GGT	2	6	63013	63018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529973
1011	NC_018533	AACCA	2	10	63047	63056	60 %	0 %	0 %	40 %	403529973
1012	NC_018533	ATA	2	6	63186	63191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529973
1013	NC_018533	GCAATG	2	12	63195	63206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403529973
1014	NC_018533	T	6	6	63302	63307	0 %	100 %	0 %	0 %	403529973
1015	NC_018533	TTC	2	6	63314	63319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529973
1016	NC_018533	TGA	2	6	63334	63339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529973
1017	NC_018533	A	6	6	63447	63452	100 %	0 %	0 %	0 %	403529973
1018	NC_018533	CTA	2	6	63463	63468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529973
1019	NC_018533	TGAA	2	8	63498	63505	50 %	25 %	25 %	0 %	403529973
1020	NC_018533	AG	3	6	63530	63535	50 %	0 %	50 %	0 %	403529973
1021	NC_018533	ATA	2	6	63558	63563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529973
1022	NC_018533	TGC	2	6	63581	63586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529973
1023	NC_018533	AAG	2	6	63611	63616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529973
1024	NC_018533	TAT	2	6	63628	63633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529973
1025	NC_018533	GTT	3	9	63682	63690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529973
1026	NC_018533	CAA	2	6	63694	63699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529973
1027	NC_018533	TTG	2	6	63702	63707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529973
1028	NC_018533	TGCTT	2	10	63710	63719	0 %	60 %	20 %	20 %	403529973
1029	NC_018533	AAC	2	6	63830	63835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529973
1030	NC_018533	AAT	2	6	63875	63880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529973
1031	NC_018533	A	6	6	63889	63894	100 %	0 %	0 %	0 %	403529973
1032	NC_018533	GAT	2	6	63947	63952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529973
1033	NC_018533	T	6	6	63980	63985	0 %	100 %	0 %	0 %	403529973
1034	NC_018533	ATT	2	6	64214	64219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529974
1035	NC_018533	CAT	3	9	64233	64241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529974
1036	NC_018533	GAA	2	6	64310	64315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529974
1037	NC_018533	T	8	8	64506	64513	0 %	100 %	0 %	0 %	403529974
1038	NC_018533	AC	3	6	64551	64556	50 %	0 %	0 %	50 %	403529974
1039	NC_018533	CTT	2	6	64622	64627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529974
1040	NC_018533	TCA	2	6	64657	64662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529974
1041	NC_018533	TAA	2	6	64664	64669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529974
1042	NC_018533	T	7	7	64954	64960	0 %	100 %	0 %	0 %	403529975
1043	NC_018533	T	7	7	65076	65082	0 %	100 %	0 %	0 %	403529975
1044	NC_018533	T	7	7	65148	65154	0 %	100 %	0 %	0 %	403529975
1045	NC_018533	TTC	2	6	65235	65240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529975
1046	NC_018533	G	7	7	65244	65250	0 %	0 %	100 %	0 %	403529975
1047	NC_018533	GGA	2	6	65370	65375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529975
1048	NC_018533	A	8	8	65390	65397	100 %	0 %	0 %	0 %	403529975
1049	NC_018533	AT	3	6	65400	65405	50 %	50 %	0 %	0 %	403529975
1050	NC_018533	GAG	2	6	65428	65433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529975
1051	NC_018533	ATTG	2	8	65454	65461	25 %	50 %	25 %	0 %	403529975
1052	NC_018533	GAA	2	6	65542	65547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529975
1053	NC_018533	ATG	2	6	65594	65599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529975
1054	NC_018533	ATC	2	6	65627	65632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529975
1055	NC_018533	ATTG	2	8	65682	65689	25 %	50 %	25 %	0 %	403529975
1056	NC_018533	AGG	2	6	65703	65708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529975
1057	NC_018533	TGA	3	9	65725	65733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529975
1058	NC_018533	T	6	6	65770	65775	0 %	100 %	0 %	0 %	403529976
1059	NC_018533	GC	3	6	65813	65818	0 %	0 %	50 %	50 %	403529976
1060	NC_018533	AAC	2	6	65867	65872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529976
1061	NC_018533	CCG	2	6	65874	65879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403529976
1062	NC_018533	TCTTA	2	10	65973	65982	20 %	60 %	0 %	20 %	403529976
1063	NC_018533	AAG	2	6	65983	65988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529976
1064	NC_018533	AAG	2	6	66034	66039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529976
1065	NC_018533	ATT	2	6	66090	66095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529976
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1067	NC_018533	TTA	2	6	66160	66165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529976
1068	NC_018533	TC	3	6	66272	66277	0 %	50 %	0 %	50 %	403529976
1069	NC_018533	TTG	2	6	66313	66318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529976
1070	NC_018533	TGT	2	6	66323	66328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529976
1071	NC_018533	A	6	6	66390	66395	100 %	0 %	0 %	0 %	403529976
1072	NC_018533	A	8	8	66490	66497	100 %	0 %	0 %	0 %	403529976
1073	NC_018533	CTA	2	6	66742	66747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529977
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1082	NC_018533	CAG	2	6	67202	67207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529977
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1093	NC_018533	TTG	2	6	67868	67873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529977
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1095	NC_018533	A	6	6	67886	67891	100 %	0 %	0 %	0 %	403529977
1096	NC_018533	TGA	2	6	68004	68009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529978
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1101	NC_018533	TG	3	6	68433	68438	0 %	50 %	50 %	0 %	403529978
1102	NC_018533	GAT	2	6	68517	68522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529978
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1105	NC_018533	TTCC	2	8	68592	68599	0 %	50 %	0 %	50 %	403529978
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1108	NC_018533	CAT	2	6	68769	68774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529978
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1110	NC_018533	ATC	2	6	68917	68922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529978
1111	NC_018533	CAA	2	6	68950	68955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529978
1112	NC_018533	TTCA	2	8	69178	69185	25 %	50 %	0 %	25 %	403529978
1113	NC_018533	GA	3	6	69236	69241	50 %	0 %	50 %	0 %	403529979
1114	NC_018533	A	7	7	69322	69328	100 %	0 %	0 %	0 %	403529979
1115	NC_018533	CAAAAC	2	12	69335	69346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529979
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1118	NC_018533	AAT	2	6	69398	69403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529979
1119	NC_018533	ATGCA	2	10	69422	69431	40 %	20 %	20 %	20 %	403529979
1120	NC_018533	T	6	6	69464	69469	0 %	100 %	0 %	0 %	403529979
1121	NC_018533	T	6	6	69482	69487	0 %	100 %	0 %	0 %	403529979
1122	NC_018533	TCT	2	6	69496	69501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529979
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1124	NC_018533	CAC	2	6	69578	69583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403529979
1125	NC_018533	ATC	2	6	69609	69614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529979
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