MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018533	GAA	2	6	377387	377392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530211
6002	NC_018533	GTTC	2	8	377432	377439	0 %	50 %	25 %	25 %	403530211
6003	NC_018533	GAT	2	6	377516	377521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530211
6004	NC_018533	TTC	2	6	377530	377535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530211
6005	NC_018533	AAC	2	6	377571	377576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530211
6006	NC_018533	GCA	2	6	377657	377662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530211
6007	NC_018533	CTT	2	6	377789	377794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530211
6008	NC_018533	GA	3	6	377837	377842	50 %	0 %	50 %	0 %	403530211
6009	NC_018533	TATTGG	2	12	377863	377874	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	403530211
6010	NC_018533	TGAT	2	8	377979	377986	25 %	50 %	25 %	0 %	403530211
6011	NC_018533	CT	3	6	378024	378029	0 %	50 %	0 %	50 %	403530211
6012	NC_018533	T	6	6	379004	379009	0 %	100 %	0 %	0 %	403530212
6013	NC_018533	TAGC	2	8	379245	379252	25 %	25 %	25 %	25 %	403530212
6014	NC_018533	TAA	2	6	379255	379260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530212
6015	NC_018533	ACA	2	6	379293	379298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530212
6016	NC_018533	AAC	2	6	379304	379309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530212
6017	NC_018533	GAA	2	6	379326	379331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530212
6018	NC_018533	TCT	2	6	379414	379419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530212
6019	NC_018533	T	8	8	379465	379472	0 %	100 %	0 %	0 %	403530212
6020	NC_018533	ATG	2	6	379487	379492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530212
6021	NC_018533	T	7	7	379509	379515	0 %	100 %	0 %	0 %	403530212
6022	NC_018533	TCA	2	6	379588	379593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530212
6023	NC_018533	GATG	2	8	379617	379624	25 %	25 %	50 %	0 %	403530212
6024	NC_018533	GAT	2	6	379652	379657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530212
6025	NC_018533	A	6	6	379706	379711	100 %	0 %	0 %	0 %	403530212
6026	NC_018533	GTTG	2	8	379763	379770	0 %	50 %	50 %	0 %	403530212
6027	NC_018533	AGA	2	6	379774	379779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530212
6028	NC_018533	ATA	2	6	379800	379805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530212
6029	NC_018533	TCA	2	6	379806	379811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530212
6030	NC_018533	T	7	7	379855	379861	0 %	100 %	0 %	0 %	403530212
6031	NC_018533	AAG	2	6	379865	379870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530212
6032	NC_018533	CTGTTG	2	12	379900	379911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403530212
6033	NC_018533	ATAA	2	8	379958	379965	75 %	25 %	0 %	0 %	403530212
6034	NC_018533	AAAC	2	8	379974	379981	75 %	0 %	0 %	25 %	403530212
6035	NC_018533	GAAA	2	8	380077	380084	75 %	0 %	25 %	0 %	403530212
6036	NC_018533	GCA	2	6	380220	380225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530212
6037	NC_018533	TAA	2	6	380231	380236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530212
6038	NC_018533	AG	3	6	380307	380312	50 %	0 %	50 %	0 %	403530212
6039	NC_018533	T	6	6	380498	380503	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6040	NC_018533	ATTT	2	8	380532	380539	25 %	75 %	0 %	0 %	403530213
6041	NC_018533	T	6	6	380601	380606	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6042	NC_018533	T	6	6	380695	380700	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6043	NC_018533	CTT	2	6	380754	380759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530213
6044	NC_018533	A	6	6	380801	380806	100 %	0 %	0 %	0 %	403530213
6045	NC_018533	ACTT	2	8	380835	380842	25 %	50 %	0 %	25 %	403530213
6046	NC_018533	GA	3	6	380867	380872	50 %	0 %	50 %	0 %	403530213
6047	NC_018533	AGA	2	6	380900	380905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530213
6048	NC_018533	T	6	6	380956	380961	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6049	NC_018533	AAG	3	9	380982	380990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530213
6050	NC_018533	T	8	8	380997	381004	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6051	NC_018533	CAT	2	6	381005	381010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530213
6052	NC_018533	T	7	7	381089	381095	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6053	NC_018533	GA	4	8	381117	381124	50 %	0 %	50 %	0 %	403530213
6054	NC_018533	T	7	7	381132	381138	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6055	NC_018533	TTGAA	2	10	381166	381175	40 %	40 %	20 %	0 %	403530213
6056	NC_018533	AAT	2	6	381267	381272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530213
6057	NC_018533	CTT	2	6	381296	381301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530213
6058	NC_018533	AG	3	6	381402	381407	50 %	0 %	50 %	0 %	403530213
6059	NC_018533	TTC	2	6	381426	381431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530213
6060	NC_018533	TTGA	2	8	381486	381493	25 %	50 %	25 %	0 %	403530213
6061	NC_018533	ATA	2	6	381514	381519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530213
6062	NC_018533	TCG	2	6	381608	381613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530213
6063	NC_018533	CTTATT	2	12	381705	381716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403530213
6064	NC_018533	GCA	2	6	381742	381747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530213
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6066	NC_018533	GATGT	2	10	381785	381794	20 %	40 %	40 %	0 %	403530213
6067	NC_018533	T	8	8	381808	381815	0 %	100 %	0 %	0 %	403530213
6068	NC_018533	ATT	2	6	381861	381866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530213
6069	NC_018533	AAAG	2	8	381910	381917	75 %	0 %	25 %	0 %	403530213
6070	NC_018533	GGA	2	6	381919	381924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530213
6071	NC_018533	CCG	2	6	382096	382101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530213
6072	NC_018533	AAT	2	6	382134	382139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530213
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6074	NC_018533	AAT	2	6	382577	382582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530214
6075	NC_018533	ATG	2	6	382605	382610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530214
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6080	NC_018533	TTA	2	6	382732	382737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530214
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6082	NC_018533	T	6	6	382847	382852	0 %	100 %	0 %	0 %	403530214
6083	NC_018533	TGTT	2	8	382879	382886	0 %	75 %	25 %	0 %	403530214
6084	NC_018533	TCG	2	6	382937	382942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530214
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6089	NC_018533	CTG	2	6	383119	383124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530214
6090	NC_018533	T	7	7	383142	383148	0 %	100 %	0 %	0 %	403530214
6091	NC_018533	TGA	2	6	383189	383194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530214
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6093	NC_018533	TTG	2	6	383266	383271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530214
6094	NC_018533	GGT	2	6	383289	383294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530214
6095	NC_018533	CAC	2	6	383338	383343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530214
6096	NC_018533	TGA	2	6	383413	383418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530214
6097	NC_018533	TGC	2	6	383420	383425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530214
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6099	NC_018533	CA	3	6	383504	383509	50 %	0 %	0 %	50 %	403530214
6100	NC_018533	TTGC	2	8	383574	383581	0 %	50 %	25 %	25 %	403530214
6101	NC_018533	GTC	2	6	383587	383592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530214
6102	NC_018533	GTGAT	2	10	383641	383650	20 %	40 %	40 %	0 %	403530214
6103	NC_018533	TATTT	2	10	383768	383777	20 %	80 %	0 %	0 %	403530214
6104	NC_018533	ATT	2	6	383784	383789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530214
6105	NC_018533	T	8	8	383825	383832	0 %	100 %	0 %	0 %	403530214
6106	NC_018533	CTG	2	6	383833	383838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530214
6107	NC_018533	TAT	2	6	383911	383916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530214
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6110	NC_018533	T	6	6	384003	384008	0 %	100 %	0 %	0 %	403530214
6111	NC_018533	GCA	2	6	384075	384080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530214
6112	NC_018533	TGA	2	6	384085	384090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530214
6113	NC_018533	CT	3	6	384122	384127	0 %	50 %	0 %	50 %	403530214
6114	NC_018533	AGG	2	6	384230	384235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530214
6115	NC_018533	TTG	2	6	384292	384297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530214
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6117	NC_018533	TTG	2	6	385069	385074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530215
6118	NC_018533	ATT	2	6	385080	385085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530215
6119	NC_018533	TGA	2	6	385093	385098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530215
6120	NC_018533	TCAT	2	8	385102	385109	25 %	50 %	0 %	25 %	403530215
6121	NC_018533	GAA	2	6	385133	385138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530215
6122	NC_018533	TGA	2	6	385199	385204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530215
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6124	NC_018533	GCT	2	6	385338	385343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530215
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6493	NC_018533	CAG	2	6	409900	409905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530240
6494	NC_018533	CTG	2	6	409975	409980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530240
6495	NC_018533	AGT	2	6	410005	410010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530240
6496	NC_018533	GA	3	6	410013	410018	50 %	0 %	50 %	0 %	403530240
6497	NC_018533	ATGG	2	8	410192	410199	25 %	25 %	50 %	0 %	403530240
6498	NC_018533	ACC	2	6	410291	410296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530240
6499	NC_018533	AGA	2	6	410311	410316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530240
6500	NC_018533	AGG	2	6	410345	410350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530240

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