MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018533	ACA	2	6	346346	346351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530186
5502	NC_018533	TTC	2	6	346380	346385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530186
5503	NC_018533	T	6	6	346418	346423	0 %	100 %	0 %	0 %	403530186
5504	NC_018533	CGT	2	6	346435	346440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530186
5505	NC_018533	ATCG	2	8	346445	346452	25 %	25 %	25 %	25 %	403530186
5506	NC_018533	TGC	2	6	346479	346484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530186
5507	NC_018533	TGT	2	6	346485	346490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530186
5508	NC_018533	ATT	2	6	346510	346515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530186
5509	NC_018533	TATT	2	8	346518	346525	25 %	75 %	0 %	0 %	403530186
5510	NC_018533	GT	3	6	346538	346543	0 %	50 %	50 %	0 %	403530186
5511	NC_018533	ATC	2	6	346556	346561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530186
5512	NC_018533	GGA	2	6	346570	346575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530186
5513	NC_018533	CAG	2	6	346610	346615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530186
5514	NC_018533	AAAG	2	8	346619	346626	75 %	0 %	25 %	0 %	403530186
5515	NC_018533	TTA	2	6	346639	346644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530186
5516	NC_018533	TTC	2	6	346689	346694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530186
5517	NC_018533	GAA	2	6	346699	346704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530186
5518	NC_018533	GTT	2	6	346717	346722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530186
5519	NC_018533	AAC	2	6	346745	346750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530186
5520	NC_018533	ATG	2	6	346787	346792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530186
5521	NC_018533	G	8	8	346851	346858	0 %	0 %	100 %	0 %	403530186
5522	NC_018533	AGA	2	6	346860	346865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530186
5523	NC_018533	CGT	2	6	346927	346932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530186
5524	NC_018533	TAT	2	6	346962	346967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530186
5525	NC_018533	TTCT	2	8	346982	346989	0 %	75 %	0 %	25 %	403530186
5526	NC_018533	TCAGG	2	10	346999	347008	20 %	20 %	40 %	20 %	403530186
5527	NC_018533	GAT	2	6	347098	347103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530186
5528	NC_018533	T	7	7	347103	347109	0 %	100 %	0 %	0 %	403530186
5529	NC_018533	TTG	2	6	347111	347116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530186
5530	NC_018533	ATC	2	6	347129	347134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530186
5531	NC_018533	ATTGG	2	10	347169	347178	20 %	40 %	40 %	0 %	403530186
5532	NC_018533	ACTG	2	8	347190	347197	25 %	25 %	25 %	25 %	403530186
5533	NC_018533	AAAAT	2	10	347319	347328	80 %	20 %	0 %	0 %	403530186
5534	NC_018533	TTC	2	6	347585	347590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530187
5535	NC_018533	ACG	2	6	347615	347620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530187
5536	NC_018533	ACG	2	6	347681	347686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530187
5537	NC_018533	TTG	2	6	347727	347732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530187
5538	NC_018533	TCA	2	6	347736	347741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530187
5539	NC_018533	ACCA	2	8	347742	347749	50 %	0 %	0 %	50 %	403530187
5540	NC_018533	CTT	2	6	347773	347778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530187
5541	NC_018533	CAC	2	6	347809	347814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530187
5542	NC_018533	TCT	2	6	347844	347849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530187
5543	NC_018533	A	6	6	347945	347950	100 %	0 %	0 %	0 %	403530187
5544	NC_018533	CCA	2	6	348032	348037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530187
5545	NC_018533	CTT	2	6	348256	348261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530187
5546	NC_018533	CTT	2	6	348289	348294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530187
5547	NC_018533	TCC	2	6	348311	348316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530187
5548	NC_018533	TGT	2	6	348323	348328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530187
5549	NC_018533	GAA	2	6	348558	348563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530188
5550	NC_018533	TGG	2	6	348753	348758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530188
5551	NC_018533	GAC	2	6	348775	348780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530188
5552	NC_018533	GA	3	6	348836	348841	50 %	0 %	50 %	0 %	403530188
5553	NC_018533	GCTT	2	8	348891	348898	0 %	50 %	25 %	25 %	403530188
5554	NC_018533	ACC	2	6	349121	349126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530188
5555	NC_018533	AAC	2	6	349205	349210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530188
5556	NC_018533	TGA	2	6	349228	349233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530188
5557	NC_018533	ATC	2	6	349244	349249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530188
5558	NC_018533	CAC	2	6	349279	349284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530188
5559	NC_018533	TTGG	2	8	349328	349335	0 %	50 %	50 %	0 %	403530188
5560	NC_018533	ACGTGA	2	12	349412	349423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403530188
5561	NC_018533	T	6	6	349535	349540	0 %	100 %	0 %	0 %	403530189
5562	NC_018533	TACCA	2	10	349668	349677	40 %	20 %	0 %	40 %	403530189
5563	NC_018533	ACG	2	6	349698	349703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530189
5564	NC_018533	TTG	2	6	349708	349713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530189
5565	NC_018533	TA	3	6	349728	349733	50 %	50 %	0 %	0 %	403530189
5566	NC_018533	GAA	2	6	349796	349801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530189
5567	NC_018533	TCT	2	6	349825	349830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530189
5568	NC_018533	ATA	2	6	349881	349886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530189
5569	NC_018533	TCA	2	6	349942	349947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530189
5570	NC_018533	TTG	2	6	349983	349988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530189
5571	NC_018533	AAC	2	6	349995	350000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530189
5572	NC_018533	T	6	6	350045	350050	0 %	100 %	0 %	0 %	403530189
5573	NC_018533	TAT	2	6	350138	350143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530189
5574	NC_018533	GAT	2	6	350196	350201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530189
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5576	NC_018533	TGC	2	6	350246	350251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530189
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5578	NC_018533	CTG	2	6	350378	350383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530189
5579	NC_018533	CAGC	2	8	350464	350471	25 %	0 %	25 %	50 %	403530189
5580	NC_018533	AG	3	6	350474	350479	50 %	0 %	50 %	0 %	403530189
5581	NC_018533	ACG	2	6	350539	350544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530189
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5583	NC_018533	CTA	2	6	350585	350590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530189
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5585	NC_018533	GTT	2	6	350788	350793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530189
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5589	NC_018533	ATC	2	6	350925	350930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530189
5590	NC_018533	TTA	2	6	350959	350964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530189
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5592	NC_018533	TGA	2	6	351463	351468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530190
5593	NC_018533	AGAA	2	8	351487	351494	75 %	0 %	25 %	0 %	403530190
5594	NC_018533	A	6	6	351542	351547	100 %	0 %	0 %	0 %	403530190
5595	NC_018533	CGT	2	6	351605	351610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530190
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5597	NC_018533	ACA	2	6	351707	351712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530190
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5599	NC_018533	CGC	2	6	351819	351824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530190
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5601	NC_018533	A	6	6	351873	351878	100 %	0 %	0 %	0 %	403530190
5602	NC_018533	T	6	6	351911	351916	0 %	100 %	0 %	0 %	403530190
5603	NC_018533	GCGA	2	8	351989	351996	25 %	0 %	50 %	25 %	403530190
5604	NC_018533	TGA	2	6	352027	352032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530190
5605	NC_018533	ATAC	2	8	352148	352155	50 %	25 %	0 %	25 %	403530190
5606	NC_018533	AG	3	6	352172	352177	50 %	0 %	50 %	0 %	403530190
5607	NC_018533	GAT	2	6	352232	352237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530190
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5611	NC_018533	AGA	2	6	352315	352320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530190
5612	NC_018533	ATG	2	6	352328	352333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530190
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5617	NC_018533	TGA	2	6	352651	352656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530190
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5619	NC_018533	TTTA	2	8	352755	352762	25 %	75 %	0 %	0 %	403530190
5620	NC_018533	AAC	2	6	352891	352896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530190
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5992	NC_018533	AG	3	6	376874	376879	50 %	0 %	50 %	0 %	403530211
5993	NC_018533	ATG	2	6	376992	376997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530211
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5995	NC_018533	CGG	2	6	377025	377030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530211
5996	NC_018533	GCAA	2	8	377050	377057	50 %	0 %	25 %	25 %	403530211
5997	NC_018533	TTGG	2	8	377082	377089	0 %	50 %	50 %	0 %	403530211
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6000	NC_018533	GTG	2	6	377244	377249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530211

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