MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018533	TAC	2	6	305453	305458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530159
5002	NC_018533	TTG	2	6	305470	305475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530159
5003	NC_018533	TAC	2	6	305675	305680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530159
5004	NC_018533	GAA	2	6	305732	305737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530159
5005	NC_018533	GCA	3	9	305752	305760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5006	NC_018533	CCAGCA	2	12	305761	305772	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403530159
5007	NC_018533	GCA	3	9	305776	305784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5008	NC_018533	GCACCA	2	12	305800	305811	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403530159
5009	NC_018533	GCA	3	9	305818	305826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5010	NC_018533	GCACCA	2	12	305842	305853	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403530159
5011	NC_018533	GCA	3	9	305860	305868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5012	NC_018533	AGA	2	6	305899	305904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530159
5013	NC_018533	GA	4	8	305903	305910	50 %	0 %	50 %	0 %	403530159
5014	NC_018533	CTG	2	6	305996	306001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5015	NC_018533	CAT	2	6	306034	306039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530159
5016	NC_018533	TAA	2	6	306072	306077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530159
5017	NC_018533	CA	3	6	306080	306085	50 %	0 %	0 %	50 %	403530159
5018	NC_018533	TGG	2	6	306096	306101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530159
5019	NC_018533	TGAA	2	8	306143	306150	50 %	25 %	25 %	0 %	403530159
5020	NC_018533	A	6	6	306149	306154	100 %	0 %	0 %	0 %	403530159
5021	NC_018533	AGA	2	6	306174	306179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530159
5022	NC_018533	GAA	2	6	306183	306188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530159
5023	NC_018533	CTT	2	6	306194	306199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530159
5024	NC_018533	AGG	2	6	306216	306221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530159
5025	NC_018533	TGC	2	6	306291	306296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530159
5026	NC_018533	TGG	2	6	306321	306326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530159
5027	NC_018533	TGT	2	6	306351	306356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530159
5028	NC_018533	TGG	3	9	306444	306452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530159
5029	NC_018533	TGAC	2	8	306467	306474	25 %	25 %	25 %	25 %	403530159
5030	NC_018533	ATT	2	6	306878	306883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5031	NC_018533	CAAA	2	8	306904	306911	75 %	0 %	0 %	25 %	403530160
5032	NC_018533	AGCA	2	8	306998	307005	50 %	0 %	25 %	25 %	403530160
5033	NC_018533	TTC	2	6	307025	307030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530160
5034	NC_018533	ATG	2	6	307031	307036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5035	NC_018533	CCT	2	6	307039	307044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530160
5036	NC_018533	CCATAT	2	12	307056	307067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530160
5037	NC_018533	ATT	2	6	307102	307107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5038	NC_018533	GAA	2	6	307189	307194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530160
5039	NC_018533	GAT	2	6	307222	307227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5040	NC_018533	GAA	2	6	307294	307299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530160
5041	NC_018533	GTC	2	6	307315	307320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530160
5042	NC_018533	TGA	2	6	307385	307390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5043	NC_018533	GTCAG	2	10	307401	307410	20 %	20 %	40 %	20 %	403530160
5044	NC_018533	TGT	2	6	307443	307448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530160
5045	NC_018533	TGT	2	6	307563	307568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530160
5046	NC_018533	TTC	2	6	307620	307625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530160
5047	NC_018533	ATT	2	6	307765	307770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5048	NC_018533	CTG	2	6	307772	307777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530160
5049	NC_018533	CTTTTT	2	12	307792	307803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403530160
5050	NC_018533	TGA	2	6	307998	308003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5051	NC_018533	G	7	7	308053	308059	0 %	0 %	100 %	0 %	403530160
5052	NC_018533	TGA	2	6	308073	308078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5053	NC_018533	TTA	2	6	308111	308116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5054	NC_018533	TTAA	2	8	308122	308129	50 %	50 %	0 %	0 %	403530160
5055	NC_018533	GTT	2	6	308139	308144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530160
5056	NC_018533	A	6	6	308191	308196	100 %	0 %	0 %	0 %	403530160
5057	NC_018533	CTT	2	6	308312	308317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530160
5058	NC_018533	TTCT	2	8	308366	308373	0 %	75 %	0 %	25 %	403530160
5059	NC_018533	GA	3	6	308440	308445	50 %	0 %	50 %	0 %	403530160
5060	NC_018533	T	6	6	308520	308525	0 %	100 %	0 %	0 %	403530160
5061	NC_018533	GTTTG	2	10	308575	308584	0 %	60 %	40 %	0 %	403530160
5062	NC_018533	GAGC	2	8	308591	308598	25 %	0 %	50 %	25 %	403530160
5063	NC_018533	GAT	2	6	308623	308628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5064	NC_018533	CTG	2	6	308639	308644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530160
5065	NC_018533	GTGG	2	8	308675	308682	0 %	25 %	75 %	0 %	403530160
5066	NC_018533	CT	3	6	308691	308696	0 %	50 %	0 %	50 %	403530160
5067	NC_018533	CA	3	6	308745	308750	50 %	0 %	0 %	50 %	403530160
5068	NC_018533	GTT	2	6	308806	308811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530160
5069	NC_018533	ATT	2	6	308821	308826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5070	NC_018533	ATG	2	6	308863	308868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
5071	NC_018533	ATT	2	6	308873	308878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5072	NC_018533	CAAA	2	8	308898	308905	75 %	0 %	0 %	25 %	403530160
5073	NC_018533	TTC	2	6	308906	308911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530160
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5075	NC_018533	A	6	6	308990	308995	100 %	0 %	0 %	0 %	403530160
5076	NC_018533	ATG	2	6	309077	309082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530160
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5078	NC_018533	ATT	2	6	309111	309116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530160
5079	NC_018533	ATTTT	2	10	309144	309153	20 %	80 %	0 %	0 %	403530160
5080	NC_018533	TCA	2	6	309190	309195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530160
5081	NC_018533	A	6	6	309195	309200	100 %	0 %	0 %	0 %	403530160
5082	NC_018533	GAA	2	6	309283	309288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530160
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5088	NC_018533	CCTA	2	8	310050	310057	25 %	25 %	0 %	50 %	403530161
5089	NC_018533	T	6	6	310086	310091	0 %	100 %	0 %	0 %	403530161
5090	NC_018533	ACAA	2	8	310125	310132	75 %	0 %	0 %	25 %	403530161
5091	NC_018533	TGG	2	6	310271	310276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530161
5092	NC_018533	A	6	6	310302	310307	100 %	0 %	0 %	0 %	403530161
5093	NC_018533	ATC	2	6	310310	310315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530161
5094	NC_018533	GCAAC	2	10	310368	310377	40 %	0 %	20 %	40 %	403530161
5095	NC_018533	CGT	2	6	310392	310397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530161
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5097	NC_018533	GAAA	2	8	310524	310531	75 %	0 %	25 %	0 %	403530161
5098	NC_018533	A	7	7	310670	310676	100 %	0 %	0 %	0 %	403530162
5099	NC_018533	CTT	2	6	310696	310701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530162
5100	NC_018533	ATG	2	6	310733	310738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530162
5101	NC_018533	CTG	2	6	310748	310753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530162
5102	NC_018533	CCT	2	6	310782	310787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530162
5103	NC_018533	GTA	2	6	310805	310810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530162
5104	NC_018533	AAATG	2	10	310829	310838	60 %	20 %	20 %	0 %	403530162
5105	NC_018533	CA	3	6	310846	310851	50 %	0 %	0 %	50 %	403530162
5106	NC_018533	TA	3	6	310973	310978	50 %	50 %	0 %	0 %	403530162
5107	NC_018533	GTGC	2	8	310986	310993	0 %	25 %	50 %	25 %	403530162
5108	NC_018533	TGAT	2	8	310996	311003	25 %	50 %	25 %	0 %	403530162
5109	NC_018533	T	8	8	311042	311049	0 %	100 %	0 %	0 %	403530162
5110	NC_018533	ATGA	2	8	311359	311366	50 %	25 %	25 %	0 %	403530163
5111	NC_018533	ATG	2	6	311437	311442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530163
5112	NC_018533	TTG	2	6	311444	311449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530163
5113	NC_018533	TTA	2	6	311462	311467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530163
5114	NC_018533	ACA	2	6	311482	311487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530163
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5118	NC_018533	GGGT	2	8	311758	311765	0 %	25 %	75 %	0 %	403530163
5119	NC_018533	AT	3	6	311897	311902	50 %	50 %	0 %	0 %	403530163
5120	NC_018533	A	6	6	311928	311933	100 %	0 %	0 %	0 %	403530163
5121	NC_018533	A	6	6	311943	311948	100 %	0 %	0 %	0 %	403530163
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5123	NC_018533	AGA	2	6	312024	312029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530163
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5247	NC_018533	T	6	6	320776	320781	0 %	100 %	0 %	0 %	403530171
5248	NC_018533	TGG	2	6	320887	320892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530171
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5250	NC_018533	TGG	2	6	320977	320982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530171
5251	NC_018533	TTG	2	6	321072	321077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
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5264	NC_018533	TGT	2	6	321481	321486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
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5353	NC_018533	T	6	6	329320	329325	0 %	100 %	0 %	0 %	403530176
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5355	NC_018533	A	6	6	329347	329352	100 %	0 %	0 %	0 %	403530176
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5361	NC_018533	AT	4	8	329458	329465	50 %	50 %	0 %	0 %	403530177
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5493	NC_018533	CGAT	2	8	345929	345936	25 %	25 %	25 %	25 %	403530186
5494	NC_018533	GCA	2	6	346012	346017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530186
5495	NC_018533	CCA	2	6	346019	346024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530186
5496	NC_018533	A	7	7	346049	346055	100 %	0 %	0 %	0 %	403530186
5497	NC_018533	GAA	3	9	346084	346092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530186
5498	NC_018533	TTC	2	6	346119	346124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530186
5499	NC_018533	TGGA	2	8	346131	346138	25 %	25 %	50 %	0 %	403530186
5500	NC_018533	TCT	2	6	346276	346281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530186

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