MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018533	TTG	2	6	271480	271485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530130
4502	NC_018533	GTTGT	2	10	271489	271498	0 %	60 %	40 %	0 %	403530130
4503	NC_018533	GCT	2	6	271600	271605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4504	NC_018533	AGC	2	6	271631	271636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4505	NC_018533	TA	3	6	271700	271705	50 %	50 %	0 %	0 %	403530130
4506	NC_018533	TCG	2	6	271716	271721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4507	NC_018533	ATTG	2	8	271747	271754	25 %	50 %	25 %	0 %	403530130
4508	NC_018533	ACA	2	6	271770	271775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530130
4509	NC_018533	CTG	2	6	271786	271791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4510	NC_018533	T	6	6	271858	271863	0 %	100 %	0 %	0 %	403530130
4511	NC_018533	ATGG	2	8	272008	272015	25 %	25 %	50 %	0 %	403530131
4512	NC_018533	CTA	2	6	272046	272051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530131
4513	NC_018533	GTT	2	6	272126	272131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530131
4514	NC_018533	AAG	3	9	272170	272178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530131
4515	NC_018533	TCA	2	6	272216	272221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530131
4516	NC_018533	TTG	2	6	272235	272240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530131
4517	NC_018533	TAA	2	6	272304	272309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530131
4518	NC_018533	TTC	2	6	272320	272325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530131
4519	NC_018533	T	6	6	272403	272408	0 %	100 %	0 %	0 %	403530131
4520	NC_018533	AATG	2	8	272424	272431	50 %	25 %	25 %	0 %	403530131
4521	NC_018533	GAT	2	6	272607	272612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530131
4522	NC_018533	AGA	2	6	272615	272620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530131
4523	NC_018533	AGC	2	6	272684	272689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530131
4524	NC_018533	ACA	2	6	272783	272788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530131
4525	NC_018533	TAT	2	6	272865	272870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530131
4526	NC_018533	CAA	2	6	272916	272921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530131
4527	NC_018533	T	7	7	272922	272928	0 %	100 %	0 %	0 %	403530131
4528	NC_018533	GTTTG	2	10	272934	272943	0 %	60 %	40 %	0 %	403530131
4529	NC_018533	GAT	2	6	272964	272969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530131
4530	NC_018533	CCA	2	6	272994	272999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530131
4531	NC_018533	GCT	2	6	273134	273139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530131
4532	NC_018533	GAA	2	6	273165	273170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530131
4533	NC_018533	CATT	2	8	273252	273259	25 %	50 %	0 %	25 %	403530131
4534	NC_018533	TAA	2	6	273276	273281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530131
4535	NC_018533	AAC	2	6	273295	273300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530131
4536	NC_018533	T	6	6	273385	273390	0 %	100 %	0 %	0 %	403530132
4537	NC_018533	T	6	6	273417	273422	0 %	100 %	0 %	0 %	403530132
4538	NC_018533	GTA	2	6	273428	273433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530132
4539	NC_018533	T	6	6	273451	273456	0 %	100 %	0 %	0 %	403530132
4540	NC_018533	TCT	2	6	273501	273506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530132
4541	NC_018533	GC	3	6	273528	273533	0 %	0 %	50 %	50 %	403530132
4542	NC_018533	CGA	2	6	273588	273593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530132
4543	NC_018533	TGA	2	6	273616	273621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530132
4544	NC_018533	TCA	2	6	273630	273635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530132
4545	NC_018533	GA	3	6	273686	273691	50 %	0 %	50 %	0 %	403530132
4546	NC_018533	AAG	2	6	273723	273728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530132
4547	NC_018533	T	6	6	273831	273836	0 %	100 %	0 %	0 %	403530132
4548	NC_018533	ATT	2	6	273855	273860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530132
4549	NC_018533	T	7	7	273859	273865	0 %	100 %	0 %	0 %	403530133
4550	NC_018533	TGT	2	6	273887	273892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530133
4551	NC_018533	TAGA	2	8	273910	273917	50 %	25 %	25 %	0 %	403530133
4552	NC_018533	GTT	2	6	273939	273944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530133
4553	NC_018533	GCA	2	6	273950	273955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530133
4554	NC_018533	GCT	2	6	273980	273985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530133
4555	NC_018533	T	6	6	274012	274017	0 %	100 %	0 %	0 %	403530133
4556	NC_018533	TAT	2	6	274026	274031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530133
4557	NC_018533	GCT	2	6	274058	274063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530133
4558	NC_018533	TGC	2	6	274082	274087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530133
4559	NC_018533	TGA	2	6	274098	274103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530133
4560	NC_018533	TGA	2	6	274163	274168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530133
4561	NC_018533	GTA	2	6	274214	274219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530133
4562	NC_018533	TGCA	2	8	274231	274238	25 %	25 %	25 %	25 %	403530133
4563	NC_018533	TG	3	6	274406	274411	0 %	50 %	50 %	0 %	403530133
4564	NC_018533	TAA	2	6	274419	274424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530133
4565	NC_018533	ATA	2	6	274557	274562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530133
4566	NC_018533	CTG	2	6	274578	274583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530133
4567	NC_018533	T	6	6	274586	274591	0 %	100 %	0 %	0 %	403530133
4568	NC_018533	TTA	2	6	274602	274607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530133
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4570	NC_018533	ACA	2	6	274649	274654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530133
4571	NC_018533	T	9	9	274658	274666	0 %	100 %	0 %	0 %	403530133
4572	NC_018533	AGG	2	6	275263	275268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530134
4573	NC_018533	TCC	2	6	275297	275302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530134
4574	NC_018533	CAT	2	6	275426	275431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530134
4575	NC_018533	CAT	2	6	276314	276319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
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4577	NC_018533	TGT	2	6	276414	276419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530135
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4579	NC_018533	TCA	2	6	276508	276513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
4580	NC_018533	CAA	3	9	276614	276622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530135
4581	NC_018533	TTG	2	6	276626	276631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530135
4582	NC_018533	ATC	2	6	276633	276638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
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4584	NC_018533	GCT	2	6	276721	276726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530135
4585	NC_018533	GCT	2	6	276733	276738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530135
4586	NC_018533	T	7	7	276764	276770	0 %	100 %	0 %	0 %	403530135
4587	NC_018533	GCA	2	6	276784	276789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530135
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4589	NC_018533	T	6	6	276972	276977	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
4590	NC_018533	TTTTG	2	10	276997	277006	0 %	80 %	20 %	0 %	403530136
4591	NC_018533	TTC	2	6	277051	277056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530136
4592	NC_018533	AGT	2	6	277064	277069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530136
4593	NC_018533	CCG	2	6	277133	277138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530136
4594	NC_018533	TCT	2	6	277169	277174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530136
4595	NC_018533	TGC	2	6	277181	277186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530136
4596	NC_018533	T	6	6	277188	277193	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
4597	NC_018533	T	6	6	277210	277215	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
4598	NC_018533	CAT	2	6	277216	277221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530136
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4600	NC_018533	TCA	2	6	277258	277263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
4601	NC_018533	TTTA	2	8	277320	277327	25 %	75 %	0 %	0 %	403530137
4602	NC_018533	A	6	6	277403	277408	100 %	0 %	0 %	0 %	403530137
4603	NC_018533	TCT	2	6	277432	277437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530137
4604	NC_018533	TCC	3	9	277449	277457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530137
4605	NC_018533	T	8	8	277508	277515	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
4606	NC_018533	ATA	2	6	277561	277566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
4607	NC_018533	AAG	2	6	277608	277613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530137
4608	NC_018533	TAA	2	6	277649	277654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
4609	NC_018533	AAT	2	6	277671	277676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
4610	NC_018533	GCT	2	6	277936	277941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530137
4611	NC_018533	TGT	2	6	277947	277952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530137
4612	NC_018533	TGA	2	6	277975	277980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530137
4613	NC_018533	GAA	2	6	277981	277986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530137
4614	NC_018533	GA	3	6	278001	278006	50 %	0 %	50 %	0 %	403530137
4615	NC_018533	T	6	6	278009	278014	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
4616	NC_018533	T	6	6	278026	278031	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
4617	NC_018533	TCA	2	6	278038	278043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
4618	NC_018533	CAG	2	6	278090	278095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530137
4619	NC_018533	T	7	7	278181	278187	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
4620	NC_018533	GA	3	6	278227	278232	50 %	0 %	50 %	0 %	403530137
4621	NC_018533	AAACGT	2	12	278254	278265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530137
4622	NC_018533	CAT	2	6	278324	278329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
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4624	NC_018533	ATG	2	6	278374	278379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530137
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4653	NC_018533	T	6	6	282579	282584	0 %	100 %	0 %	0 %	403530139
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4739	NC_018533	TGGTT	2	10	290332	290341	0 %	60 %	40 %	0 %	403530146
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4987	NC_018533	GCT	2	6	304516	304521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530158
4988	NC_018533	TGGG	2	8	304535	304542	0 %	25 %	75 %	0 %	403530158
4989	NC_018533	ATG	2	6	304550	304555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530158
4990	NC_018533	GAT	2	6	304563	304568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530158
4991	NC_018533	GGTT	2	8	304569	304576	0 %	50 %	50 %	0 %	403530158
4992	NC_018533	GTG	3	9	304586	304594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530158
4993	NC_018533	TGC	2	6	304622	304627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530158
4994	NC_018533	ATA	2	6	304673	304678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530158
4995	NC_018533	TAA	2	6	305252	305257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530159
4996	NC_018533	GGC	2	6	305298	305303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530159
4997	NC_018533	TCAG	2	8	305322	305329	25 %	25 %	25 %	25 %	403530159
4998	NC_018533	CTT	2	6	305336	305341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530159
4999	NC_018533	TGG	2	6	305400	305405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530159
5000	NC_018533	TTG	2	6	305432	305437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530159

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