MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 3000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018518	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	408414083
2	NC_018518	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	408414085
3	NC_018518	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	408414086
4	NC_018518	GCTGG	2	10	8516	8525	0 %	20 %	60 %	20 %	408414089
5	NC_018518	TCGCC	2	10	9915	9924	0 %	20 %	20 %	60 %	408414092
6	NC_018518	TACCG	2	10	10058	10067	20 %	20 %	20 %	40 %	408414092
7	NC_018518	GACCA	2	10	13225	13234	40 %	0 %	20 %	40 %	408414095
8	NC_018518	TGCCT	2	10	13748	13757	0 %	40 %	20 %	40 %	408414095
9	NC_018518	CTGGG	2	10	15067	15076	0 %	20 %	60 %	20 %	408414095
10	NC_018518	TCGCC	2	10	15844	15853	0 %	20 %	20 %	60 %	408414096
11	NC_018518	AAGGC	2	10	17101	17110	40 %	0 %	40 %	20 %	408414096
12	NC_018518	CGGCC	2	10	19406	19415	0 %	0 %	40 %	60 %	408414096
13	NC_018518	CTGGC	2	10	19852	19861	0 %	20 %	40 %	40 %	408414096
14	NC_018518	GCGCC	2	10	20818	20827	0 %	0 %	40 %	60 %	408414098
15	NC_018518	CGGCG	2	10	24740	24749	0 %	0 %	60 %	40 %	408414099
16	NC_018518	GGGCT	2	10	25355	25364	0 %	20 %	60 %	20 %	408414099
17	NC_018518	GGCGC	2	10	26894	26903	0 %	0 %	60 %	40 %	408414101
18	NC_018518	GCGCC	2	10	30186	30195	0 %	0 %	40 %	60 %	408414105
19	NC_018518	CTGGA	2	10	39457	39466	20 %	20 %	40 %	20 %	408414111
20	NC_018518	GCCGC	2	10	39563	39572	0 %	0 %	40 %	60 %	408414111
21	NC_018518	GCGCC	2	10	39813	39822	0 %	0 %	40 %	60 %	408414111
22	NC_018518	GGCCA	2	10	39979	39988	20 %	0 %	40 %	40 %	408414111
23	NC_018518	GCGCC	2	10	42717	42726	0 %	0 %	40 %	60 %	408414114
24	NC_018518	GCCGA	2	10	43034	43043	20 %	0 %	40 %	40 %	408414114
25	NC_018518	GCGCC	2	10	48459	48468	0 %	0 %	40 %	60 %	408414120
26	NC_018518	AGGCA	2	10	48931	48940	40 %	0 %	40 %	20 %	408414121
27	NC_018518	GCCGT	2	10	49651	49660	0 %	20 %	40 %	40 %	408414122
28	NC_018518	GCGCT	2	10	49837	49846	0 %	20 %	40 %	40 %	408414122
29	NC_018518	TCCGG	2	10	50115	50124	0 %	20 %	40 %	40 %	408414123
30	NC_018518	TGCGC	2	10	52157	52166	0 %	20 %	40 %	40 %	408414125
31	NC_018518	CCGTT	2	10	52665	52674	0 %	40 %	20 %	40 %	408414126
32	NC_018518	GGCGC	2	10	57272	57281	0 %	0 %	60 %	40 %	408414128
33	NC_018518	GGCGG	2	10	58330	58339	0 %	0 %	80 %	20 %	408414128
34	NC_018518	CTGGG	2	10	58529	58538	0 %	20 %	60 %	20 %	408414128
35	NC_018518	GACCT	2	10	61051	61060	20 %	20 %	20 %	40 %	408414129
36	NC_018518	TGCGG	2	10	63370	63379	0 %	20 %	60 %	20 %	408414131
37	NC_018518	CTTCG	2	10	63412	63421	0 %	40 %	20 %	40 %	408414131
38	NC_018518	CCAGC	2	10	63801	63810	20 %	0 %	20 %	60 %	408414132
39	NC_018518	GCCGC	2	10	65076	65085	0 %	0 %	40 %	60 %	408414133
40	NC_018518	CGGCG	2	10	66737	66746	0 %	0 %	60 %	40 %	408414134
41	NC_018518	CTGGG	2	10	69826	69835	0 %	20 %	60 %	20 %	408414136
42	NC_018518	CCGCG	2	10	71569	71578	0 %	0 %	40 %	60 %	408414137
43	NC_018518	GCGCC	2	10	71848	71857	0 %	0 %	40 %	60 %	408414137
44	NC_018518	GCCGC	2	10	75267	75276	0 %	0 %	40 %	60 %	408414142
45	NC_018518	CTGGC	2	10	78276	78285	0 %	20 %	40 %	40 %	408414145
46	NC_018518	GGGCA	2	10	78772	78781	20 %	0 %	60 %	20 %	408414146
47	NC_018518	GGACG	2	10	79219	79228	20 %	0 %	60 %	20 %	408414147
48	NC_018518	GGTCG	2	10	79546	79555	0 %	20 %	60 %	20 %	408414147
49	NC_018518	CGTAC	2	10	81559	81568	20 %	20 %	20 %	40 %	408414148
50	NC_018518	TGCCG	2	10	81936	81945	0 %	20 %	40 %	40 %	408414148
51	NC_018518	GCGCG	2	10	84316	84325	0 %	0 %	60 %	40 %	408414150
52	NC_018518	CATGG	2	10	85321	85330	20 %	20 %	40 %	20 %	408414150
53	NC_018518	CGTTT	2	10	85461	85470	0 %	60 %	20 %	20 %	408414150
54	NC_018518	GCGCC	2	10	91379	91388	0 %	0 %	40 %	60 %	408414155
55	NC_018518	CCTGC	2	10	92072	92081	0 %	20 %	20 %	60 %	408414156
56	NC_018518	CGATC	2	10	92626	92635	20 %	20 %	20 %	40 %	408414157
57	NC_018518	CGGCC	2	10	94178	94187	0 %	0 %	40 %	60 %	408414158
58	NC_018518	GCCGC	2	10	94190	94199	0 %	0 %	40 %	60 %	408414158
59	NC_018518	CGAGC	2	10	94390	94399	20 %	0 %	40 %	40 %	408414158
60	NC_018518	CGGCC	3	15	95806	95820	0 %	0 %	40 %	60 %	408414159
61	NC_018518	TGGCC	2	10	96274	96283	0 %	20 %	40 %	40 %	408414159
62	NC_018518	GGGCC	2	10	100044	100053	0 %	0 %	60 %	40 %	408414163
63	NC_018518	GCGCG	2	10	104025	104034	0 %	0 %	60 %	40 %	408414168
64	NC_018518	ACGAC	2	10	104810	104819	40 %	0 %	20 %	40 %	408414168
65	NC_018518	CTGGG	2	10	105491	105500	0 %	20 %	60 %	20 %	408414168
66	NC_018518	CCGAT	2	10	105512	105521	20 %	20 %	20 %	40 %	408414168
67	NC_018518	GCCGC	2	10	106668	106677	0 %	0 %	40 %	60 %	408414169
68	NC_018518	CTGGG	2	10	106866	106875	0 %	20 %	60 %	20 %	408414169
69	NC_018518	GCGCC	2	10	107054	107063	0 %	0 %	40 %	60 %	408414169
70	NC_018518	GAACA	2	10	107145	107154	60 %	0 %	20 %	20 %	408414169
71	NC_018518	GTCGA	2	10	107247	107256	20 %	20 %	40 %	20 %	408414170
72	NC_018518	GCCGC	2	10	108662	108671	0 %	0 %	40 %	60 %	408414171
73	NC_018518	CGGCG	2	10	109752	109761	0 %	0 %	60 %	40 %	408414172
74	NC_018518	GCGGT	2	10	115324	115333	0 %	20 %	60 %	20 %	408414175
75	NC_018518	GCGCG	2	10	115972	115981	0 %	0 %	60 %	40 %	408414176
76	NC_018518	AGGCC	2	10	116290	116299	20 %	0 %	40 %	40 %	408414176
77	NC_018518	AAGGC	2	10	119631	119640	40 %	0 %	40 %	20 %	408414178
78	NC_018518	CGGCG	2	10	119986	119995	0 %	0 %	60 %	40 %	408414178
79	NC_018518	CGGCC	2	10	121066	121075	0 %	0 %	40 %	60 %	408414179
80	NC_018518	TGGCG	2	10	121222	121231	0 %	20 %	60 %	20 %	408414179
81	NC_018518	GCCGC	2	10	121612	121621	0 %	0 %	40 %	60 %	408414180
82	NC_018518	GCGAG	2	10	127838	127847	20 %	0 %	60 %	20 %	408414184
83	NC_018518	CTCGC	2	10	134632	134641	0 %	20 %	20 %	60 %	408414187
84	NC_018518	TCGCC	2	10	136644	136653	0 %	20 %	20 %	60 %	408414189
85	NC_018518	CGTGC	2	10	136886	136895	0 %	20 %	40 %	40 %	408414189
86	NC_018518	CCTGC	2	10	137232	137241	0 %	20 %	20 %	60 %	408414189
87	NC_018518	GCCAG	2	10	138239	138248	20 %	0 %	40 %	40 %	408414190
88	NC_018518	GCCCT	2	10	139955	139964	0 %	20 %	20 %	60 %	408414192
89	NC_018518	GATCG	2	10	140286	140295	20 %	20 %	40 %	20 %	408414193
90	NC_018518	CTGGC	2	10	140727	140736	0 %	20 %	40 %	40 %	408414194
91	NC_018518	CGGAT	2	10	140979	140988	20 %	20 %	40 %	20 %	408414194
92	NC_018518	GTGCC	2	10	142253	142262	0 %	20 %	40 %	40 %	408414196
93	NC_018518	GCGCC	2	10	144026	144035	0 %	0 %	40 %	60 %	408414199
94	NC_018518	GGATC	2	10	147902	147911	20 %	20 %	40 %	20 %	408414204
95	NC_018518	CGGGC	2	10	149779	149788	0 %	0 %	60 %	40 %	408414206
96	NC_018518	CGACC	2	10	150932	150941	20 %	0 %	20 %	60 %	408414207
97	NC_018518	GCCGC	2	10	152105	152114	0 %	0 %	40 %	60 %	408414209
98	NC_018518	AGGTC	2	10	154723	154732	20 %	20 %	40 %	20 %	408414211
99	NC_018518	CCAGC	2	10	156910	156919	20 %	0 %	20 %	60 %	408414213
100	NC_018518	GGCAG	2	10	157562	157571	20 %	0 %	60 %	20 %	408414214
101	NC_018518	CGGCG	2	10	158539	158548	0 %	0 %	60 %	40 %	408414215
102	NC_018518	GGCCT	2	10	161056	161065	0 %	20 %	40 %	40 %	408414216
103	NC_018518	CGTGC	2	10	161179	161188	0 %	20 %	40 %	40 %	408414217
104	NC_018518	GACGG	2	10	164588	164597	20 %	0 %	60 %	20 %	408414219
105	NC_018518	GCGCG	2	10	169060	169069	0 %	0 %	60 %	40 %	408414222
106	NC_018518	CGATG	2	10	170198	170207	20 %	20 %	40 %	20 %	408414224
107	NC_018518	GGGCA	2	10	171332	171341	20 %	0 %	60 %	20 %	408414224
108	NC_018518	AGGGC	2	10	172137	172146	20 %	0 %	60 %	20 %	408414225
109	NC_018518	CTTCG	2	10	174550	174559	0 %	40 %	20 %	40 %	408414227
110	NC_018518	CAGCG	2	10	175853	175862	20 %	0 %	40 %	40 %	408414229
111	NC_018518	GGCCG	2	10	177173	177182	0 %	0 %	60 %	40 %	408414230
112	NC_018518	GGCCT	2	10	178548	178557	0 %	20 %	40 %	40 %	408414231
113	NC_018518	CAGCG	2	10	180756	180765	20 %	0 %	40 %	40 %	408414234
114	NC_018518	GCCGC	2	10	183873	183882	0 %	0 %	40 %	60 %	408414237
115	NC_018518	GCCCA	2	10	187872	187881	20 %	0 %	20 %	60 %	408414241
116	NC_018518	GCGCC	2	10	189090	189099	0 %	0 %	40 %	60 %	408414243
117	NC_018518	GCGCG	2	10	191920	191929	0 %	0 %	60 %	40 %	408414246
118	NC_018518	GGCCG	2	10	192254	192263	0 %	0 %	60 %	40 %	408414247
119	NC_018518	GCGCC	2	10	194749	194758	0 %	0 %	40 %	60 %	408414250
120	NC_018518	CGCGC	2	10	195084	195093	0 %	0 %	40 %	60 %	408414250
121	NC_018518	CCGGG	2	10	196070	196079	0 %	0 %	60 %	40 %	408414250
122	NC_018518	CTGGG	2	10	196504	196513	0 %	20 %	60 %	20 %	408414250
123	NC_018518	CCGCG	2	10	196533	196542	0 %	0 %	40 %	60 %	408414250
124	NC_018518	CGCGC	2	10	198322	198331	0 %	0 %	40 %	60 %	408414252
125	NC_018518	CGATG	2	10	200237	200246	20 %	20 %	40 %	20 %	408414255
126	NC_018518	GCGCC	2	10	201480	201489	0 %	0 %	40 %	60 %	408414256
127	NC_018518	GCAGC	2	10	203360	203369	20 %	0 %	40 %	40 %	408414259
128	NC_018518	CGTGG	2	10	206398	206407	0 %	20 %	60 %	20 %	408414262
129	NC_018518	CGGCC	2	10	209529	209538	0 %	0 %	40 %	60 %	408414264
130	NC_018518	TCGCC	2	10	211169	211178	0 %	20 %	20 %	60 %	408414264
131	NC_018518	CGCGG	2	10	211729	211738	0 %	0 %	60 %	40 %	408414265
132	NC_018518	GCCGA	2	10	213275	213284	20 %	0 %	40 %	40 %	408414267
133	NC_018518	GCACG	2	10	213601	213610	20 %	0 %	40 %	40 %	408414267
134	NC_018518	GGCCA	2	10	215237	215246	20 %	0 %	40 %	40 %	408414269
135	NC_018518	CGCGC	2	10	216243	216252	0 %	0 %	40 %	60 %	408414270
136	NC_018518	GGCCG	2	10	218055	218064	0 %	0 %	60 %	40 %	408414271
137	NC_018518	ACGCC	2	10	218078	218087	20 %	0 %	20 %	60 %	408414271
138	NC_018518	TGTGC	2	10	218503	218512	0 %	40 %	40 %	20 %	408414272
139	NC_018518	GCCGC	2	10	223816	223825	0 %	0 %	40 %	60 %	408414276
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142	NC_018518	CCAGG	2	10	224842	224851	20 %	0 %	40 %	40 %	408414277
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148	NC_018518	CTGGC	2	10	231067	231076	0 %	20 %	40 %	40 %	408414284
149	NC_018518	CGGCG	2	10	233590	233599	0 %	0 %	60 %	40 %	408414286
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152	NC_018518	TGCGC	2	10	237776	237785	0 %	20 %	40 %	40 %	408414291
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157	NC_018518	GCCTG	2	10	241796	241805	0 %	20 %	40 %	40 %	408414294
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262	NC_018518	TGGCC	2	10	381224	381233	0 %	20 %	40 %	40 %	408414422
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383	NC_018518	CTGGT	2	10	550997	551006	0 %	40 %	40 %	20 %	408414549
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387	NC_018518	GGCGC	2	10	557336	557345	0 %	0 %	60 %	40 %	408414555
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392	NC_018518	CGGCG	2	10	560135	560144	0 %	0 %	60 %	40 %	408414557
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