MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 6368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018516	AGT	2	6	166306	166311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380118
3002	NC_018516	AGA	2	6	166343	166348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380118
3003	NC_018516	TAGTT	2	10	166357	166366	20 %	60 %	20 %	0 %	434380118
3004	NC_018516	TATC	2	8	166373	166380	25 %	50 %	0 %	25 %	434380118
3005	NC_018516	TAA	2	6	166469	166474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380119
3006	NC_018516	ATTAAG	2	12	166590	166601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380119
3007	NC_018516	ATTG	2	8	166603	166610	25 %	50 %	25 %	0 %	434380119
3008	NC_018516	TTA	2	6	166675	166680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380119
3009	NC_018516	ATATA	2	10	166683	166692	60 %	40 %	0 %	0 %	434380119
3010	NC_018516	ACT	2	6	166695	166700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380119
3011	NC_018516	TTTC	2	8	166748	166755	0 %	75 %	0 %	25 %	434380119
3012	NC_018516	GAA	2	6	166781	166786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380119
3013	NC_018516	TAT	2	6	166808	166813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380119
3014	NC_018516	AAT	2	6	166819	166824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380119
3015	NC_018516	AC	3	6	166828	166833	50 %	0 %	0 %	50 %	434380119
3016	NC_018516	TAC	2	6	166844	166849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380119
3017	NC_018516	TAA	2	6	166892	166897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380120
3018	NC_018516	AAAG	2	8	166944	166951	75 %	0 %	25 %	0 %	434380120
3019	NC_018516	TGTT	2	8	166999	167006	0 %	75 %	25 %	0 %	434380120
3020	NC_018516	GAA	2	6	167034	167039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380120
3021	NC_018516	AAG	2	6	167050	167055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380120
3022	NC_018516	CAT	2	6	167061	167066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380120
3023	NC_018516	GAA	2	6	167073	167078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380120
3024	NC_018516	TAAAA	2	10	167130	167139	80 %	20 %	0 %	0 %	434380120
3025	NC_018516	CT	3	6	167174	167179	0 %	50 %	0 %	50 %	434380120
3026	NC_018516	TCTT	2	8	167194	167201	0 %	75 %	0 %	25 %	434380120
3027	NC_018516	ACT	2	6	167214	167219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380120
3028	NC_018516	TAT	2	6	167268	167273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380120
3029	NC_018516	TA	3	6	167341	167346	50 %	50 %	0 %	0 %	434380121
3030	NC_018516	TA	3	6	167427	167432	50 %	50 %	0 %	0 %	434380121
3031	NC_018516	TCT	2	6	167467	167472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380121
3032	NC_018516	CAAATA	2	12	167588	167599	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434380121
3033	NC_018516	TAC	2	6	167700	167705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380121
3034	NC_018516	ATA	2	6	167951	167956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380122
3035	NC_018516	TAG	2	6	168033	168038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380122
3036	NC_018516	TTC	2	6	168142	168147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380122
3037	NC_018516	AC	3	6	168214	168219	50 %	0 %	0 %	50 %	434380122
3038	NC_018516	CCAT	2	8	168297	168304	25 %	25 %	0 %	50 %	434380123
3039	NC_018516	CTT	2	6	168361	168366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380123
3040	NC_018516	TAG	2	6	168413	168418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380123
3041	NC_018516	TCT	2	6	168420	168425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380123
3042	NC_018516	AT	3	6	168447	168452	50 %	50 %	0 %	0 %	434380123
3043	NC_018516	TTA	2	6	168463	168468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380123
3044	NC_018516	TAT	2	6	168472	168477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380123
3045	NC_018516	TA	3	6	168488	168493	50 %	50 %	0 %	0 %	434380123
3046	NC_018516	CTT	2	6	168500	168505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380123
3047	NC_018516	TTC	3	9	168554	168562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380123
3048	NC_018516	TATAA	2	10	168581	168590	60 %	40 %	0 %	0 %	434380123
3049	NC_018516	TGA	2	6	168599	168604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380123
3050	NC_018516	TAA	2	6	168623	168628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380123
3051	NC_018516	TA	3	6	168656	168661	50 %	50 %	0 %	0 %	434380123
3052	NC_018516	TAA	2	6	168677	168682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380123
3053	NC_018516	CCTT	2	8	168743	168750	0 %	50 %	0 %	50 %	434380123
3054	NC_018516	AC	3	6	168809	168814	50 %	0 %	0 %	50 %	434380123
3055	NC_018516	CCA	2	6	168848	168853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380124
3056	NC_018516	TCT	2	6	168867	168872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380124
3057	NC_018516	CTT	2	6	168978	168983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380124
3058	NC_018516	CTA	2	6	169005	169010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380124
3059	NC_018516	T	6	6	169030	169035	0 %	100 %	0 %	0 %	434380124
3060	NC_018516	AAT	2	6	169123	169128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380124
3061	NC_018516	TTAT	2	8	169355	169362	25 %	75 %	0 %	0 %	434380125
3062	NC_018516	GTAC	2	8	169380	169387	25 %	25 %	25 %	25 %	434380125
3063	NC_018516	GATA	2	8	169394	169401	50 %	25 %	25 %	0 %	434380125
3064	NC_018516	ATA	2	6	169404	169409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380125
3065	NC_018516	TA	3	6	169491	169496	50 %	50 %	0 %	0 %	434380125
3066	NC_018516	ATA	2	6	169528	169533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380125
3067	NC_018516	CTAC	2	8	169615	169622	25 %	25 %	0 %	50 %	434380125
3068	NC_018516	GTT	2	6	169627	169632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380125
3069	NC_018516	GTAT	2	8	169696	169703	25 %	50 %	25 %	0 %	434380125
3070	NC_018516	CCT	2	6	169732	169737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434380126
3071	NC_018516	CTT	2	6	169937	169942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380126
3072	NC_018516	TTG	2	6	170284	170289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380126
3073	NC_018516	TAC	2	6	170298	170303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380126
3074	NC_018516	TTC	2	6	170356	170361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380126
3075	NC_018516	CTA	2	6	170423	170428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380126
3076	NC_018516	TACTT	2	10	170502	170511	20 %	60 %	0 %	20 %	434380126
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3081	NC_018516	AT	3	6	170720	170725	50 %	50 %	0 %	0 %	434380127
3082	NC_018516	GTTT	2	8	170741	170748	0 %	75 %	25 %	0 %	434380127
3083	NC_018516	GTT	2	6	170829	170834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380128
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3090	NC_018516	TCTAAC	2	12	171150	171161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380129
3091	NC_018516	AAG	2	6	171250	171255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380129
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3094	NC_018516	TAAC	2	8	171355	171362	50 %	25 %	0 %	25 %	434380129
3095	NC_018516	CAA	2	6	171365	171370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380129
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3100	NC_018516	TAA	2	6	171473	171478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380130
3101	NC_018516	TCT	2	6	171505	171510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380130
3102	NC_018516	TGA	2	6	171563	171568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380130
3103	NC_018516	TG	3	6	171604	171609	0 %	50 %	50 %	0 %	434380130
3104	NC_018516	CGTT	2	8	171617	171624	0 %	50 %	25 %	25 %	434380130
3105	NC_018516	TGA	2	6	171672	171677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380131
3106	NC_018516	TGT	2	6	171702	171707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3107	NC_018516	TTG	2	6	171728	171733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3108	NC_018516	TGT	2	6	171744	171749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3109	NC_018516	TTG	3	9	171758	171766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3110	NC_018516	TTG	2	6	171773	171778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3111	NC_018516	TTG	2	6	171788	171793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
3112	NC_018516	CTG	2	6	171815	171820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380131
3113	NC_018516	TTTG	2	8	171861	171868	0 %	75 %	25 %	0 %	434380131
3114	NC_018516	TTG	2	6	171896	171901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380131
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3117	NC_018516	CTG	2	6	172096	172101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380131
3118	NC_018516	CTT	2	6	172171	172176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380131
3119	NC_018516	A	6	6	172353	172358	100 %	0 %	0 %	0 %	434380132
3120	NC_018516	AGA	2	6	172368	172373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380132
3121	NC_018516	AGT	2	6	172407	172412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380132
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3123	NC_018516	ACT	2	6	172443	172448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380132
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3247	NC_018516	CTAC	2	8	179249	179256	25 %	25 %	0 %	50 %	434380142
3248	NC_018516	CTT	2	6	179286	179291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380142
3249	NC_018516	CTGT	2	8	179318	179325	0 %	50 %	25 %	25 %	434380142
3250	NC_018516	ACTT	2	8	179353	179360	25 %	50 %	0 %	25 %	434380142
3251	NC_018516	TCA	2	6	179372	179377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380142
3252	NC_018516	TAA	2	6	179492	179497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380143
3253	NC_018516	TTG	2	6	179542	179547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380143
3254	NC_018516	GAA	2	6	179583	179588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380143
3255	NC_018516	GAAG	2	8	179607	179614	50 %	0 %	50 %	0 %	434380143
3256	NC_018516	TGT	2	6	179652	179657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380143
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3260	NC_018516	ACT	2	6	179875	179880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380143
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3268	NC_018516	CTT	2	6	180358	180363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380144
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3275	NC_018516	TAT	2	6	181176	181181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380145
3276	NC_018516	GTAC	2	8	181229	181236	25 %	25 %	25 %	25 %	434380145
3277	NC_018516	CTG	2	6	181242	181247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380145
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3302	NC_018516	TAA	2	6	182424	182429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380145
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3350	NC_018516	TCT	2	6	185572	185577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380147
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3354	NC_018516	CAA	2	6	186066	186071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380148
3355	NC_018516	CAG	2	6	186090	186095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380148
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3357	NC_018516	TAGTG	2	10	186136	186145	20 %	40 %	40 %	0 %	434380148
3358	NC_018516	AAT	2	6	186362	186367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380148
3359	NC_018516	AC	3	6	186369	186374	50 %	0 %	0 %	50 %	434380148
3360	NC_018516	ATA	2	6	186410	186415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380148
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3362	NC_018516	TCT	2	6	186512	186517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380148
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3365	NC_018516	T	6	6	186669	186674	0 %	100 %	0 %	0 %	434380148
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3490	NC_018516	ATA	2	6	193442	193447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380161
3491	NC_018516	TAC	2	6	193520	193525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380162
3492	NC_018516	TTCT	2	8	193561	193568	0 %	75 %	0 %	25 %	434380162
3493	NC_018516	CTA	2	6	193572	193577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380162
3494	NC_018516	TTA	2	6	193592	193597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380162
3495	NC_018516	AGT	2	6	193598	193603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380162
3496	NC_018516	TC	3	6	193616	193621	0 %	50 %	0 %	50 %	434380162
3497	NC_018516	TAC	2	6	193648	193653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380162
3498	NC_018516	ATA	3	9	193688	193696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380162
3499	NC_018516	ATCT	2	8	193707	193714	25 %	50 %	0 %	25 %	434380162
3500	NC_018516	TAAG	2	8	193735	193742	50 %	25 %	25 %	0 %	434380162

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