MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p06

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018512	TTC	2	6	671	676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379817
2	NC_018512	TTG	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379817
3	NC_018512	ATG	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379817
4	NC_018512	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379817
5	NC_018512	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
6	NC_018512	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
7	NC_018512	TAA	2	6	2182	2187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
8	NC_018512	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379818
9	NC_018512	AAG	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379818
10	NC_018512	ACC	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379818
11	NC_018512	CAG	2	6	2349	2354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379818
12	NC_018512	TGG	3	9	2683	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
13	NC_018512	TGG	3	9	2722	2730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
14	NC_018512	GCC	2	6	2767	2772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434379818
15	NC_018512	TAA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
16	NC_018512	TGT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379818
17	NC_018512	ACT	3	9	3131	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379818
18	NC_018512	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379818
19	NC_018512	TAT	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379818
20	NC_018512	TAA	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
21	NC_018512	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379818
22	NC_018512	CAA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379819
23	NC_018512	TAG	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
24	NC_018512	TAA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379819
25	NC_018512	AGT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
26	NC_018512	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
27	NC_018512	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
28	NC_018512	CAA	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
29	NC_018512	TGT	2	6	4925	4930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
30	NC_018512	GTA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
31	NC_018512	AGA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
32	NC_018512	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
33	NC_018512	ACA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
34	NC_018512	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
35	NC_018512	ACA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
36	NC_018512	CAA	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
37	NC_018512	GAA	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
38	NC_018512	AAC	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
39	NC_018512	GAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
40	NC_018512	AGA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
41	NC_018512	ATA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
42	NC_018512	AGA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
43	NC_018512	AAT	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
44	NC_018512	AGA	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
45	NC_018512	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
46	NC_018512	AAG	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.