MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p05

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018511	TGA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379792
2	NC_018511	CCA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379792
3	NC_018511	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379792
4	NC_018511	TAT	2	6	538	543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
5	NC_018511	GGT	2	6	840	845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
6	NC_018511	TGG	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
7	NC_018511	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
8	NC_018511	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
9	NC_018511	CTG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
10	NC_018511	AGG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
11	NC_018511	CAG	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
12	NC_018511	CAG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
13	NC_018511	AGG	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
14	NC_018511	TTA	2	6	1548	1553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
15	NC_018511	ATT	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379793
16	NC_018511	ATG	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379793
17	NC_018511	CAG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
18	NC_018511	CAG	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
19	NC_018511	CTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
20	NC_018511	TCT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
21	NC_018511	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379794
22	NC_018511	AAC	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379795
23	NC_018511	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
24	NC_018511	CTT	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
25	NC_018511	TAC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379795
26	NC_018511	TAT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
27	NC_018511	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
28	NC_018511	CCA	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
29	NC_018511	TCT	3	9	3727	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
30	NC_018511	CCA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
31	NC_018511	CTT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
32	NC_018511	CTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
33	NC_018511	AAT	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379796
34	NC_018511	TTC	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
35	NC_018511	CTA	3	9	4534	4542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
36	NC_018511	CTT	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
37	NC_018511	TTG	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
38	NC_018511	TAC	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
39	NC_018511	CAA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379796
40	NC_018511	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
41	NC_018511	TCA	3	9	5118	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
42	NC_018511	CTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
43	NC_018511	GTC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379796
44	NC_018511	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
45	NC_018511	TAG	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
46	NC_018511	TCA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
47	NC_018511	CTT	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
48	NC_018511	TAT	3	9	5467	5475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379796
49	NC_018511	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
50	NC_018511	TGA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379797
51	NC_018511	TTG	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379797
52	NC_018511	CAT	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379797
53	NC_018511	TTA	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379797
54	NC_018511	ATA	2	6	6688	6693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
55	NC_018511	AAT	2	6	6781	6786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
56	NC_018511	TGA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379798
57	NC_018511	CAC	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379798
58	NC_018511	TGG	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379798
59	NC_018511	CAT	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379798
60	NC_018511	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
61	NC_018511	ATT	2	6	7000	7005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
62	NC_018511	CAA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379798
63	NC_018511	TAC	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379798
64	NC_018511	ATT	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
65	NC_018511	ACA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379798
66	NC_018511	TTC	2	6	7095	7100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379798
67	NC_018511	CTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379799
68	NC_018511	ATA	2	6	7328	7333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379799
69	NC_018511	TTG	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379799
70	NC_018511	AGG	3	9	7448	7456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.