MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	TGAA	2	8	3617	3624	50 %	25 %	25 %	0 %	402558577
2	NC_018502	GAAA	2	8	3658	3665	75 %	0 %	25 %	0 %	402558577
3	NC_018502	CGCT	2	8	3948	3955	0 %	25 %	25 %	50 %	402558578
4	NC_018502	TGCT	2	8	4184	4191	0 %	50 %	25 %	25 %	402558578
5	NC_018502	TCTT	2	8	4256	4263	0 %	75 %	0 %	25 %	402558578
6	NC_018502	CGTC	2	8	4365	4372	0 %	25 %	25 %	50 %	402558578
7	NC_018502	TGTT	2	8	4737	4744	0 %	75 %	25 %	0 %	402558579
8	NC_018502	TACA	2	8	4976	4983	50 %	25 %	0 %	25 %	402558579
9	NC_018502	TCAT	2	8	5049	5056	25 %	50 %	0 %	25 %	402558579
10	NC_018502	TAAA	2	8	5466	5473	75 %	25 %	0 %	0 %	402558580
11	NC_018502	ATCT	2	8	5559	5566	25 %	50 %	0 %	25 %	402558581
12	NC_018502	CAAA	2	8	6148	6155	75 %	0 %	0 %	25 %	402558582
13	NC_018502	CTTT	2	8	6721	6728	0 %	75 %	0 %	25 %	402558582
14	NC_018502	TAAT	2	8	7193	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	402558583
15	NC_018502	TTAT	2	8	7997	8004	25 %	75 %	0 %	0 %	402558583
16	NC_018502	ATTG	2	8	8134	8141	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
17	NC_018502	TGCT	2	8	8248	8255	0 %	50 %	25 %	25 %	402558583
18	NC_018502	ATCA	2	8	8323	8330	50 %	25 %	0 %	25 %	402558583
19	NC_018502	TTGT	2	8	8392	8399	0 %	75 %	25 %	0 %	402558583
20	NC_018502	TAAT	2	8	9050	9057	50 %	50 %	0 %	0 %	402558583
21	NC_018502	TGTT	2	8	9110	9117	0 %	75 %	25 %	0 %	402558583
22	NC_018502	TTGA	2	8	9146	9153	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
23	NC_018502	TTTC	2	8	9579	9586	0 %	75 %	0 %	25 %	402558583
24	NC_018502	TTCT	2	8	9796	9803	0 %	75 %	0 %	25 %	402558583
25	NC_018502	ATTG	2	8	10103	10110	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
26	NC_018502	CTTC	2	8	10419	10426	0 %	50 %	0 %	50 %	402558583
27	NC_018502	GGAA	2	8	11383	11390	50 %	0 %	50 %	0 %	402558584
28	NC_018502	TCCA	2	8	11834	11841	25 %	25 %	0 %	50 %	402558584
29	NC_018502	TCCA	2	8	12060	12067	25 %	25 %	0 %	50 %	402558584
30	NC_018502	CAAA	2	8	12115	12122	75 %	0 %	0 %	25 %	402558584
31	NC_018502	AGTA	2	8	12123	12130	50 %	25 %	25 %	0 %	402558584
32	NC_018502	TAAC	2	8	16359	16366	50 %	25 %	0 %	25 %	402558586
33	NC_018502	TAAG	2	8	16593	16600	50 %	25 %	25 %	0 %	402558586
34	NC_018502	AAAT	2	8	16648	16655	75 %	25 %	0 %	0 %	402558586
35	NC_018502	CTTT	2	8	16992	16999	0 %	75 %	0 %	25 %	402558587
36	NC_018502	TTCT	2	8	17585	17592	0 %	75 %	0 %	25 %	402558588
37	NC_018502	TCAT	2	8	17720	17727	25 %	50 %	0 %	25 %	402558588
38	NC_018502	CATT	2	8	18180	18187	25 %	50 %	0 %	25 %	402558590
39	NC_018502	TTTC	2	8	18555	18562	0 %	75 %	0 %	25 %	402558591
40	NC_018502	GTAC	2	8	20266	20273	25 %	25 %	25 %	25 %	402558593
41	NC_018502	ACAA	2	8	20704	20711	75 %	0 %	0 %	25 %	402558594
42	NC_018502	TAAC	2	8	20831	20838	50 %	25 %	0 %	25 %	402558595
43	NC_018502	CCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	25 %	50 %	402558595
44	NC_018502	AATG	2	8	20890	20897	50 %	25 %	25 %	0 %	402558595
45	NC_018502	CTTT	2	8	21186	21193	0 %	75 %	0 %	25 %	402558595
46	NC_018502	ATAG	2	8	21263	21270	50 %	25 %	25 %	0 %	402558595
47	NC_018502	TTGA	2	8	21319	21326	25 %	50 %	25 %	0 %	402558595
48	NC_018502	TTCA	2	8	21580	21587	25 %	50 %	0 %	25 %	402558595
49	NC_018502	GTTT	2	8	22236	22243	0 %	75 %	25 %	0 %	402558596
50	NC_018502	TCTT	2	8	23217	23224	0 %	75 %	0 %	25 %	402558597
51	NC_018502	AAAC	2	8	23408	23415	75 %	0 %	0 %	25 %	402558597
52	NC_018502	GTTT	2	8	23416	23423	0 %	75 %	25 %	0 %	402558597
53	NC_018502	TGTT	2	8	23737	23744	0 %	75 %	25 %	0 %	402558597
54	NC_018502	CATT	2	8	24291	24298	25 %	50 %	0 %	25 %	402558597
55	NC_018502	TCTT	2	8	24702	24709	0 %	75 %	0 %	25 %	402558598
56	NC_018502	TAGT	2	8	24748	24755	25 %	50 %	25 %	0 %	402558598
57	NC_018502	CATC	2	8	24794	24801	25 %	25 %	0 %	50 %	402558598
58	NC_018502	CAAA	2	8	24963	24970	75 %	0 %	0 %	25 %	402558598
59	NC_018502	TTTC	2	8	25022	25029	0 %	75 %	0 %	25 %	402558598
60	NC_018502	CATT	2	8	25082	25089	25 %	50 %	0 %	25 %	402558598
61	NC_018502	TCTG	2	8	25215	25222	0 %	50 %	25 %	25 %	402558598
62	NC_018502	AATG	2	8	25557	25564	50 %	25 %	25 %	0 %	402558599
63	NC_018502	TTGA	2	8	25634	25641	25 %	50 %	25 %	0 %	402558600
64	NC_018502	TGTT	2	8	25867	25874	0 %	75 %	25 %	0 %	402558600
65	NC_018502	TTTC	2	8	25997	26004	0 %	75 %	0 %	25 %	402558601
66	NC_018502	GAAG	2	8	26067	26074	50 %	0 %	50 %	0 %	402558601
67	NC_018502	CCCG	2	8	26243	26250	0 %	0 %	25 %	75 %	402558601
68	NC_018502	TGCA	2	8	26275	26282	25 %	25 %	25 %	25 %	402558601
69	NC_018502	ATTA	2	8	26468	26475	50 %	50 %	0 %	0 %	402558602
70	NC_018502	GAAC	2	8	26534	26541	50 %	0 %	25 %	25 %	402558602
71	NC_018502	AAGC	2	8	27172	27179	50 %	0 %	25 %	25 %	402558603
72	NC_018502	TTAA	2	8	27424	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	402558604
73	NC_018502	ATTT	2	8	27670	27677	25 %	75 %	0 %	0 %	402558604
74	NC_018502	CAAT	2	8	29106	29113	50 %	25 %	0 %	25 %	402558605
75	NC_018502	TTGT	2	8	29774	29781	0 %	75 %	25 %	0 %	402558606
76	NC_018502	GGAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	50 %	0 %	402558606
77	NC_018502	TTTG	2	8	30085	30092	0 %	75 %	25 %	0 %	402558606
78	NC_018502	CTTT	2	8	30103	30110	0 %	75 %	0 %	25 %	402558606
79	NC_018502	TTTA	2	8	30157	30164	25 %	75 %	0 %	0 %	402558607
80	NC_018502	ATCA	2	8	30402	30409	50 %	25 %	0 %	25 %	402558608
81	NC_018502	AACC	2	8	30490	30497	50 %	0 %	0 %	50 %	402558608
82	NC_018502	CAAC	2	8	30870	30877	50 %	0 %	0 %	50 %	402558609
83	NC_018502	AACT	2	8	30963	30970	50 %	25 %	0 %	25 %	402558609
84	NC_018502	CAAT	2	8	31064	31071	50 %	25 %	0 %	25 %	402558609
85	NC_018502	TCAT	2	8	31073	31080	25 %	50 %	0 %	25 %	402558609
86	NC_018502	TGCT	2	8	31365	31372	0 %	50 %	25 %	25 %	402558610
87	NC_018502	TTGA	2	8	31763	31770	25 %	50 %	25 %	0 %	402558610
88	NC_018502	TATT	2	8	32178	32185	25 %	75 %	0 %	0 %	402558611
89	NC_018502	TTAG	2	8	32312	32319	25 %	50 %	25 %	0 %	402558612
90	NC_018502	ATAA	2	8	32544	32551	75 %	25 %	0 %	0 %	402558613
91	NC_018502	ATAG	2	8	32572	32579	50 %	25 %	25 %	0 %	402558613
92	NC_018502	TCAA	2	8	32715	32722	50 %	25 %	0 %	25 %	402558613
93	NC_018502	TCCA	2	8	33318	33325	25 %	25 %	0 %	50 %	402558615
94	NC_018502	AATT	2	8	33438	33445	50 %	50 %	0 %	0 %	402558615
95	NC_018502	TCGT	2	8	33572	33579	0 %	50 %	25 %	25 %	402558616
96	NC_018502	ATCT	2	8	33672	33679	25 %	50 %	0 %	25 %	402558616
97	NC_018502	TCTA	2	8	34167	34174	25 %	50 %	0 %	25 %	402558618
98	NC_018502	TACC	2	8	34548	34555	25 %	25 %	0 %	50 %	402558619
99	NC_018502	TTCG	2	8	34837	34844	0 %	50 %	25 %	25 %	402558620
100	NC_018502	TAAG	2	8	35720	35727	50 %	25 %	25 %	0 %	402558621
101	NC_018502	AACC	2	8	36388	36395	50 %	0 %	0 %	50 %	402558621
102	NC_018502	TTCA	2	8	36451	36458	25 %	50 %	0 %	25 %	402558621
103	NC_018502	GATT	2	8	36630	36637	25 %	50 %	25 %	0 %	402558622
104	NC_018502	GTTT	3	12	36665	36676	0 %	75 %	25 %	0 %	402558623
105	NC_018502	AACT	2	8	37252	37259	50 %	25 %	0 %	25 %	402558624
106	NC_018502	GATA	2	8	37601	37608	50 %	25 %	25 %	0 %	402558624
107	NC_018502	TCAT	2	8	37826	37833	25 %	50 %	0 %	25 %	402558625
108	NC_018502	TCTA	2	8	38126	38133	25 %	50 %	0 %	25 %	402558627
109	NC_018502	AAAC	2	8	38279	38286	75 %	0 %	0 %	25 %	402558628
110	NC_018502	ATTG	2	8	38404	38411	25 %	50 %	25 %	0 %	402558628
111	NC_018502	CTTG	2	8	38604	38611	0 %	50 %	25 %	25 %	402558628
112	NC_018502	TTGC	2	8	38766	38773	0 %	50 %	25 %	25 %	402558628
113	NC_018502	AGCT	2	8	38780	38787	25 %	25 %	25 %	25 %	402558628
114	NC_018502	ATTA	2	8	39529	39536	50 %	50 %	0 %	0 %	402558630
115	NC_018502	GAAA	2	8	39565	39572	75 %	0 %	25 %	0 %	402558630
116	NC_018502	ATGT	2	8	39848	39855	25 %	50 %	25 %	0 %	402558630
117	NC_018502	TGAT	2	8	39880	39887	25 %	50 %	25 %	0 %	402558630
118	NC_018502	AATA	2	8	40438	40445	75 %	25 %	0 %	0 %	402558632
119	NC_018502	AATT	2	8	40719	40726	50 %	50 %	0 %	0 %	402558632
120	NC_018502	ATTT	2	8	41450	41457	25 %	75 %	0 %	0 %	402558632
121	NC_018502	AGAA	2	8	42288	42295	75 %	0 %	25 %	0 %	402558633
122	NC_018502	AAGC	2	8	42875	42882	50 %	0 %	25 %	25 %	402558634
123	NC_018502	AAAT	2	8	42949	42956	75 %	25 %	0 %	0 %	402558634
124	NC_018502	AATC	2	8	43089	43096	50 %	25 %	0 %	25 %	402558634
125	NC_018502	TTCA	2	8	43166	43173	25 %	50 %	0 %	25 %	402558634
126	NC_018502	AATA	2	8	43484	43491	75 %	25 %	0 %	0 %	402558634
127	NC_018502	ATTT	2	8	44550	44557	25 %	75 %	0 %	0 %	402558635

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.