MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	ATCA	2	8	499	506	50 %	25 %	0 %	25 %	402558406
2	NC_018501	ATCT	2	8	608	615	25 %	50 %	0 %	25 %	402558406
3	NC_018501	CCAA	2	8	669	676	50 %	0 %	0 %	50 %	402558406
4	NC_018501	ATGA	2	8	840	847	50 %	25 %	25 %	0 %	402558406
5	NC_018501	AGAA	2	8	884	891	75 %	0 %	25 %	0 %	402558406
6	NC_018501	AATA	2	8	1789	1796	75 %	25 %	0 %	0 %	402558407
7	NC_018501	TCAT	2	8	2163	2170	25 %	50 %	0 %	25 %	402558407
8	NC_018501	ATTT	2	8	2395	2402	25 %	75 %	0 %	0 %	402558407
9	NC_018501	GAAA	2	8	3076	3083	75 %	0 %	25 %	0 %	402558408
10	NC_018501	TTCG	2	8	3653	3660	0 %	50 %	25 %	25 %	402558408
11	NC_018501	CATC	2	8	4595	4602	25 %	25 %	0 %	50 %	402558409
12	NC_018501	TTTA	2	8	6136	6143	25 %	75 %	0 %	0 %	402558411
13	NC_018501	AGAA	2	8	6498	6505	75 %	0 %	25 %	0 %	402558412
14	NC_018501	AAAG	2	8	7118	7125	75 %	0 %	25 %	0 %	402558412
15	NC_018501	AAGT	2	8	8448	8455	50 %	25 %	25 %	0 %	402558414
16	NC_018501	TGAT	2	8	8598	8605	25 %	50 %	25 %	0 %	402558414
17	NC_018501	TGAA	2	8	8929	8936	50 %	25 %	25 %	0 %	402558415
18	NC_018501	GCCA	2	8	9208	9215	25 %	0 %	25 %	50 %	402558415
19	NC_018501	TTGC	2	8	9285	9292	0 %	50 %	25 %	25 %	402558415
20	NC_018501	TATC	2	8	10336	10343	25 %	50 %	0 %	25 %	402558416
21	NC_018501	AACT	2	8	10699	10706	50 %	25 %	0 %	25 %	402558416
22	NC_018501	TCCT	2	8	10803	10810	0 %	50 %	0 %	50 %	402558417
23	NC_018501	CGAA	2	8	10863	10870	50 %	0 %	25 %	25 %	402558417
24	NC_018501	ATTT	2	8	11074	11081	25 %	75 %	0 %	0 %	402558417
25	NC_018501	TTGA	2	8	11499	11506	25 %	50 %	25 %	0 %	402558418
26	NC_018501	AGAT	2	8	12604	12611	50 %	25 %	25 %	0 %	402558419
27	NC_018501	ATCT	2	8	12757	12764	25 %	50 %	0 %	25 %	402558419
28	NC_018501	TTAC	2	8	12788	12795	25 %	50 %	0 %	25 %	402558419
29	NC_018501	TTTA	2	8	13355	13362	25 %	75 %	0 %	0 %	402558420
30	NC_018501	TGTA	2	8	13692	13699	25 %	50 %	25 %	0 %	402558420
31	NC_018501	CAAT	2	8	14698	14705	50 %	25 %	0 %	25 %	402558422
32	NC_018501	AAAT	2	8	15199	15206	75 %	25 %	0 %	0 %	402558422
33	NC_018501	AGGA	2	8	15524	15531	50 %	0 %	50 %	0 %	402558423
34	NC_018501	CATT	2	8	15562	15569	25 %	50 %	0 %	25 %	402558423
35	NC_018501	TAAA	2	8	16175	16182	75 %	25 %	0 %	0 %	402558424
36	NC_018501	ATTT	2	8	16292	16299	25 %	75 %	0 %	0 %	402558424
37	NC_018501	AGAA	2	8	16775	16782	75 %	0 %	25 %	0 %	402558425
38	NC_018501	AAAT	2	8	16893	16900	75 %	25 %	0 %	0 %	402558425
39	NC_018501	GTGC	2	8	17552	17559	0 %	25 %	50 %	25 %	402558427
40	NC_018501	GACA	2	8	17799	17806	50 %	0 %	25 %	25 %	402558428
41	NC_018501	CGTT	2	8	18065	18072	0 %	50 %	25 %	25 %	402558428
42	NC_018501	GAAA	2	8	18210	18217	75 %	0 %	25 %	0 %	402558428
43	NC_018501	TAGA	2	8	18443	18450	50 %	25 %	25 %	0 %	402558428
44	NC_018501	GGAT	2	8	19316	19323	25 %	25 %	50 %	0 %	402558428
45	NC_018501	GATT	2	8	19941	19948	25 %	50 %	25 %	0 %	402558429
46	NC_018501	GATG	2	8	20055	20062	25 %	25 %	50 %	0 %	402558429
47	NC_018501	TCAG	2	8	20266	20273	25 %	25 %	25 %	25 %	402558430
48	NC_018501	TACG	2	8	20633	20640	25 %	25 %	25 %	25 %	402558431
49	NC_018501	AGAC	2	8	20757	20764	50 %	0 %	25 %	25 %	402558431
50	NC_018501	GTTT	2	8	20957	20964	0 %	75 %	25 %	0 %	402558431
51	NC_018501	TGAT	2	8	21010	21017	25 %	50 %	25 %	0 %	402558431
52	NC_018501	ACTA	2	8	21052	21059	50 %	25 %	0 %	25 %	402558431
53	NC_018501	TCAT	2	8	21338	21345	25 %	50 %	0 %	25 %	402558431
54	NC_018501	AGAA	3	12	21692	21703	75 %	0 %	25 %	0 %	402558432
55	NC_018501	CATT	2	8	22008	22015	25 %	50 %	0 %	25 %	402558432
56	NC_018501	AAAT	2	8	22686	22693	75 %	25 %	0 %	0 %	402558433
57	NC_018501	ATGA	2	8	24434	24441	50 %	25 %	25 %	0 %	402558434
58	NC_018501	AAAG	2	8	24878	24885	75 %	0 %	25 %	0 %	402558434
59	NC_018501	TCAT	2	8	24942	24949	25 %	50 %	0 %	25 %	402558434
60	NC_018501	TGAG	2	8	24954	24961	25 %	25 %	50 %	0 %	402558434
61	NC_018501	TTTA	2	8	25829	25836	25 %	75 %	0 %	0 %	402558435
62	NC_018501	AATT	2	8	26477	26484	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
63	NC_018501	GATA	2	8	26529	26536	50 %	25 %	25 %	0 %	402558436
64	NC_018501	ATTT	2	8	26671	26678	25 %	75 %	0 %	0 %	402558436
65	NC_018501	ATAG	2	8	27063	27070	50 %	25 %	25 %	0 %	402558436
66	NC_018501	TATG	2	8	27140	27147	25 %	50 %	25 %	0 %	402558436
67	NC_018501	TTTA	2	8	27544	27551	25 %	75 %	0 %	0 %	402558436
68	NC_018501	ATTA	2	8	27774	27781	50 %	50 %	0 %	0 %	402558437
69	NC_018501	TTGC	2	8	27931	27938	0 %	50 %	25 %	25 %	402558437
70	NC_018501	TATT	2	8	28651	28658	25 %	75 %	0 %	0 %	402558437
71	NC_018501	AAAT	2	8	29223	29230	75 %	25 %	0 %	0 %	402558437
72	NC_018501	ACTA	2	8	29879	29886	50 %	25 %	0 %	25 %	402558438
73	NC_018501	AATT	2	8	30479	30486	50 %	50 %	0 %	0 %	402558438
74	NC_018501	TTAA	2	8	30873	30880	50 %	50 %	0 %	0 %	402558439
75	NC_018501	TGCT	2	8	32044	32051	0 %	50 %	25 %	25 %	402558442
76	NC_018501	ATAC	2	8	32526	32533	50 %	25 %	0 %	25 %	402558442
77	NC_018501	AACA	2	8	33389	33396	75 %	0 %	0 %	25 %	402558444
78	NC_018501	GAAT	2	8	33867	33874	50 %	25 %	25 %	0 %	402558444
79	NC_018501	TCTA	2	8	33882	33889	25 %	50 %	0 %	25 %	402558444
80	NC_018501	ATAC	2	8	34115	34122	50 %	25 %	0 %	25 %	402558444
81	NC_018501	CAGG	2	8	34423	34430	25 %	0 %	50 %	25 %	402558444
82	NC_018501	CAAA	2	8	34497	34504	75 %	0 %	0 %	25 %	402558444
83	NC_018501	AGAA	2	8	34655	34662	75 %	0 %	25 %	0 %	402558444
84	NC_018501	AAAT	2	8	34806	34813	75 %	25 %	0 %	0 %	402558444
85	NC_018501	GCAA	2	8	34818	34825	50 %	0 %	25 %	25 %	402558444
86	NC_018501	TTAA	2	8	35377	35384	50 %	50 %	0 %	0 %	402558444
87	NC_018501	ACAA	2	8	36003	36010	75 %	0 %	0 %	25 %	402558444
88	NC_018501	TGGG	2	8	36322	36329	0 %	25 %	75 %	0 %	402558444
89	NC_018501	AAAG	2	8	36576	36583	75 %	0 %	25 %	0 %	402558444
90	NC_018501	ATTT	2	8	36626	36633	25 %	75 %	0 %	0 %	402558444
91	NC_018501	ATTA	2	8	37330	37337	50 %	50 %	0 %	0 %	402558445
92	NC_018501	GTAA	2	8	37794	37801	50 %	25 %	25 %	0 %	402558446
93	NC_018501	AAAG	2	8	38057	38064	75 %	0 %	25 %	0 %	402558446
94	NC_018501	GAAG	2	8	38198	38205	50 %	0 %	50 %	0 %	402558446
95	NC_018501	GGAA	2	8	38279	38286	50 %	0 %	50 %	0 %	402558446
96	NC_018501	GTAT	2	8	38556	38563	25 %	50 %	25 %	0 %	402558447
97	NC_018501	ATTA	2	8	38638	38645	50 %	50 %	0 %	0 %	402558447
98	NC_018501	TTCT	2	8	39038	39045	0 %	75 %	0 %	25 %	402558448
99	NC_018501	ACAA	2	8	39258	39265	75 %	0 %	0 %	25 %	402558448
100	NC_018501	ATGT	2	8	39977	39984	25 %	50 %	25 %	0 %	402558449
101	NC_018501	GGTT	2	8	40375	40382	0 %	50 %	50 %	0 %	402558450
102	NC_018501	CTAT	2	8	40409	40416	25 %	50 %	0 %	25 %	402558450
103	NC_018501	GGAT	2	8	40985	40992	25 %	25 %	50 %	0 %	402558451
104	NC_018501	AGAA	2	8	41036	41043	75 %	0 %	25 %	0 %	402558451
105	NC_018501	TAAA	2	8	41486	41493	75 %	25 %	0 %	0 %	402558452
106	NC_018501	AAAG	2	8	42117	42124	75 %	0 %	25 %	0 %	402558453
107	NC_018501	ACTT	2	8	42191	42198	25 %	50 %	0 %	25 %	402558453
108	NC_018501	ATTA	2	8	42401	42408	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
109	NC_018501	AAAT	2	8	42938	42945	75 %	25 %	0 %	0 %	402558453
110	NC_018501	TAGA	2	8	44228	44235	50 %	25 %	25 %	0 %	402558454
111	NC_018501	AAAT	2	8	44286	44293	75 %	25 %	0 %	0 %	402558454
112	NC_018501	GAAG	2	8	44325	44332	50 %	0 %	50 %	0 %	402558454
113	NC_018501	GGAT	2	8	44410	44417	25 %	25 %	50 %	0 %	402558454
114	NC_018501	AACA	2	8	44690	44697	75 %	0 %	0 %	25 %	402558454
115	NC_018501	TCAA	2	8	44847	44854	50 %	25 %	0 %	25 %	402558454
116	NC_018501	ATTA	2	8	45019	45026	50 %	50 %	0 %	0 %	402558454
117	NC_018501	TTAT	2	8	46154	46161	25 %	75 %	0 %	0 %	402558455
118	NC_018501	TCAC	2	8	46213	46220	25 %	25 %	0 %	50 %	402558455
119	NC_018501	TAAA	2	8	46530	46537	75 %	25 %	0 %	0 %	402558455
120	NC_018501	AAAT	2	8	46714	46721	75 %	25 %	0 %	0 %	402558455
121	NC_018501	AGTA	2	8	47165	47172	50 %	25 %	25 %	0 %	402558455
122	NC_018501	CAAA	2	8	47420	47427	75 %	0 %	0 %	25 %	402558455
123	NC_018501	GGAA	2	8	47839	47846	50 %	0 %	50 %	0 %	402558455
124	NC_018501	CAAA	2	8	47897	47904	75 %	0 %	0 %	25 %	402558455
125	NC_018501	TAGA	2	8	48030	48037	50 %	25 %	25 %	0 %	402558455
126	NC_018501	GGTA	2	8	48532	48539	25 %	25 %	50 %	0 %	402558455
127	NC_018501	CTAT	2	8	49002	49009	25 %	50 %	0 %	25 %	402558456
128	NC_018501	AAGT	2	8	49541	49548	50 %	25 %	25 %	0 %	402558457
129	NC_018501	GAAT	2	8	50219	50226	50 %	25 %	25 %	0 %	402558458
130	NC_018501	TATT	2	8	50270	50277	25 %	75 %	0 %	0 %	402558458
131	NC_018501	GTTT	2	8	50525	50532	0 %	75 %	25 %	0 %	402558459
132	NC_018501	TATG	2	8	50642	50649	25 %	50 %	25 %	0 %	402558459
133	NC_018501	TAAA	2	8	50949	50956	75 %	25 %	0 %	0 %	402558460
134	NC_018501	AGAA	2	8	51148	51155	75 %	0 %	25 %	0 %	402558460
135	NC_018501	ATCA	2	8	51476	51483	50 %	25 %	0 %	25 %	402558461
136	NC_018501	GAAT	2	8	52051	52058	50 %	25 %	25 %	0 %	402558461
137	NC_018501	CTTT	2	8	53051	53058	0 %	75 %	0 %	25 %	402558462
138	NC_018501	TTTA	2	8	53410	53417	25 %	75 %	0 %	0 %	402558462
139	NC_018501	ATAC	2	8	53509	53516	50 %	25 %	0 %	25 %	402558462
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412	NC_018501	AGAA	2	8	161572	161579	75 %	0 %	25 %	0 %	402558571
413	NC_018501	AATT	2	8	162314	162321	50 %	50 %	0 %	0 %	402558572
414	NC_018501	TGAT	2	8	164039	164046	25 %	50 %	25 %	0 %	402558573
415	NC_018501	TACA	2	8	164114	164121	50 %	25 %	0 %	25 %	402558573
416	NC_018501	TATG	2	8	164415	164422	25 %	50 %	25 %	0 %	402558573
417	NC_018501	TACG	2	8	164461	164468	25 %	25 %	25 %	25 %	402558573
418	NC_018501	GTAC	2	8	164986	164993	25 %	25 %	25 %	25 %	402558573
419	NC_018501	ACAT	2	8	165002	165009	50 %	25 %	0 %	25 %	402558573

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.