MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 3078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018501	TCG	2	6	160736	160741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558570
3002	NC_018501	TAA	2	6	160760	160765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558570
3003	NC_018501	CGA	2	6	160838	160843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558570
3004	NC_018501	AGA	2	6	160859	160864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558570
3005	NC_018501	A	6	6	160890	160895	100 %	0 %	0 %	0 %	402558570
3006	NC_018501	AATT	2	8	160912	160919	50 %	50 %	0 %	0 %	402558570
3007	NC_018501	CAAA	2	8	161012	161019	75 %	0 %	0 %	25 %	402558570
3008	NC_018501	A	6	6	161065	161070	100 %	0 %	0 %	0 %	402558570
3009	NC_018501	A	6	6	161105	161110	100 %	0 %	0 %	0 %	402558570
3010	NC_018501	A	6	6	161122	161127	100 %	0 %	0 %	0 %	402558570
3011	NC_018501	AGAA	2	8	161572	161579	75 %	0 %	25 %	0 %	402558571
3012	NC_018501	ATG	2	6	161586	161591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558571
3013	NC_018501	AT	3	6	161731	161736	50 %	50 %	0 %	0 %	402558571
3014	NC_018501	TGA	2	6	161737	161742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558571
3015	NC_018501	TAG	2	6	161796	161801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558571
3016	NC_018501	TTA	2	6	161866	161871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558572
3017	NC_018501	TAA	2	6	161964	161969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558572
3018	NC_018501	ACT	2	6	162010	162015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558572
3019	NC_018501	ATG	2	6	162055	162060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558572
3020	NC_018501	ATT	2	6	162073	162078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558572
3021	NC_018501	TGC	2	6	162114	162119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558572
3022	NC_018501	CTG	2	6	162128	162133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558572
3023	NC_018501	TGG	3	9	162273	162281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558572
3024	NC_018501	AATT	2	8	162314	162321	50 %	50 %	0 %	0 %	402558572
3025	NC_018501	TGA	2	6	162381	162386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558572
3026	NC_018501	TGA	2	6	162420	162425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558572
3027	NC_018501	GA	3	6	162432	162437	50 %	0 %	50 %	0 %	402558572
3028	NC_018501	ATT	2	6	162447	162452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558572
3029	NC_018501	ATA	2	6	162497	162502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558572
3030	NC_018501	AAG	2	6	162572	162577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558572
3031	NC_018501	TAA	2	6	162671	162676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558572
3032	NC_018501	TTC	2	6	162784	162789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558572
3033	NC_018501	CAA	2	6	162815	162820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558572
3034	NC_018501	TGG	2	6	162825	162830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558572
3035	NC_018501	CTT	2	6	162858	162863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558572
3036	NC_018501	TA	3	6	163015	163020	50 %	50 %	0 %	0 %	402558572
3037	NC_018501	GAA	2	6	163096	163101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558572
3038	NC_018501	AT	3	6	163109	163114	50 %	50 %	0 %	0 %	402558572
3039	NC_018501	A	7	7	163136	163142	100 %	0 %	0 %	0 %	402558572
3040	NC_018501	TAA	2	6	163158	163163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558572
3041	NC_018501	GTG	2	6	163196	163201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558572
3042	NC_018501	CTA	2	6	163238	163243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558572
3043	NC_018501	CAA	2	6	163255	163260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558572
3044	NC_018501	GAA	2	6	163261	163266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558572
3045	NC_018501	ATT	2	6	163273	163278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558572
3046	NC_018501	A	6	6	163306	163311	100 %	0 %	0 %	0 %	402558572
3047	NC_018501	A	6	6	163316	163321	100 %	0 %	0 %	0 %	402558572
3048	NC_018501	CA	3	6	163791	163796	50 %	0 %	0 %	50 %	402558573
3049	NC_018501	AT	3	6	163823	163828	50 %	50 %	0 %	0 %	402558573
3050	NC_018501	TAC	2	6	163863	163868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558573
3051	NC_018501	A	7	7	163975	163981	100 %	0 %	0 %	0 %	402558573
3052	NC_018501	GAT	2	6	163993	163998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558573
3053	NC_018501	TGAT	2	8	164039	164046	25 %	50 %	25 %	0 %	402558573
3054	NC_018501	CTG	2	6	164072	164077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558573
3055	NC_018501	TTC	3	9	164097	164105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558573
3056	NC_018501	TACA	2	8	164114	164121	50 %	25 %	0 %	25 %	402558573
3057	NC_018501	ATC	2	6	164216	164221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558573
3058	NC_018501	A	9	9	164228	164236	100 %	0 %	0 %	0 %	402558573
3059	NC_018501	TGA	2	6	164271	164276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558573
3060	NC_018501	A	7	7	164381	164387	100 %	0 %	0 %	0 %	402558573
3061	NC_018501	TGT	2	6	164403	164408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
3062	NC_018501	TATG	2	8	164415	164422	25 %	50 %	25 %	0 %	402558573
3063	NC_018501	AGA	2	6	164442	164447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558573
3064	NC_018501	ACC	2	6	164454	164459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558573
3065	NC_018501	TACG	2	8	164461	164468	25 %	25 %	25 %	25 %	402558573
3066	NC_018501	AAG	2	6	164555	164560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558573
3067	NC_018501	GAT	2	6	164596	164601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558573
3068	NC_018501	TTG	2	6	164678	164683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
3069	NC_018501	TGG	2	6	164715	164720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558573
3070	NC_018501	GA	3	6	164739	164744	50 %	0 %	50 %	0 %	402558573
3071	NC_018501	TCT	2	6	164765	164770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558573
3072	NC_018501	TGT	2	6	164820	164825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
3073	NC_018501	AAG	2	6	164832	164837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558573
3074	NC_018501	TGA	2	6	164844	164849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558573
3075	NC_018501	TTG	2	6	164861	164866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
3076	NC_018501	GTAC	2	8	164986	164993	25 %	25 %	25 %	25 %	402558573
3077	NC_018501	ACAT	2	8	165002	165009	50 %	25 %	0 %	25 %	402558573
3078	NC_018501	TTG	2	6	165026	165031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.