MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 113647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018500	A	6	6	47100	47105	100 %	0 %	0 %	0 %	402558869
1002	NC_018500	AAATGA	2	12	47198	47209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558869
1003	NC_018500	A	7	7	47209	47215	100 %	0 %	0 %	0 %	402558869
1004	NC_018500	GA	3	6	47278	47283	50 %	0 %	50 %	0 %	402558869
1005	NC_018500	TGG	2	6	47306	47311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558869
1006	NC_018500	TGA	2	6	47426	47431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1007	NC_018500	GAA	2	6	47433	47438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558869
1008	NC_018500	A	6	6	47442	47447	100 %	0 %	0 %	0 %	402558869
1009	NC_018500	GAA	2	6	47450	47455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558869
1010	NC_018500	GAA	2	6	47466	47471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558869
1011	NC_018500	GAT	2	6	47496	47501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1012	NC_018500	AGA	2	6	47570	47575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558869
1013	NC_018500	TACGT	2	10	47600	47609	20 %	40 %	20 %	20 %	402558869
1014	NC_018500	AT	3	6	47612	47617	50 %	50 %	0 %	0 %	402558869
1015	NC_018500	AC	3	6	47629	47634	50 %	0 %	0 %	50 %	402558869
1016	NC_018500	TGA	2	6	47669	47674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1017	NC_018500	AAC	2	6	47720	47725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558869
1018	NC_018500	GTA	2	6	47881	47886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1019	NC_018500	AAG	2	6	47905	47910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558869
1020	NC_018500	CTT	2	6	47956	47961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558869
1021	NC_018500	CAA	2	6	48006	48011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558869
1022	NC_018500	CTT	2	6	48177	48182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558869
1023	NC_018500	TGA	2	6	48200	48205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1024	NC_018500	ATT	2	6	48207	48212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558869
1025	NC_018500	TGA	2	6	48272	48277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558869
1026	NC_018500	TTA	2	6	48292	48297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558869
1027	NC_018500	GTAT	2	8	48465	48472	25 %	50 %	25 %	0 %	402558870
1028	NC_018500	A	6	6	48523	48528	100 %	0 %	0 %	0 %	402558870
1029	NC_018500	AAG	2	6	48634	48639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558870
1030	NC_018500	AAAG	2	8	48662	48669	75 %	0 %	25 %	0 %	402558870
1031	NC_018500	CTT	2	6	48684	48689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558870
1032	NC_018500	AGG	2	6	48922	48927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558871
1033	NC_018500	CTTT	2	8	48980	48987	0 %	75 %	0 %	25 %	402558871
1034	NC_018500	GCA	2	6	49025	49030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558871
1035	NC_018500	AAAG	2	8	49031	49038	75 %	0 %	25 %	0 %	402558871
1036	NC_018500	ATT	2	6	49073	49078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558871
1037	NC_018500	T	6	6	49122	49127	0 %	100 %	0 %	0 %	402558871
1038	NC_018500	TA	3	6	49186	49191	50 %	50 %	0 %	0 %	402558871
1039	NC_018500	CTA	2	6	49230	49235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558871
1040	NC_018500	ATT	2	6	49255	49260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558871
1041	NC_018500	TGA	2	6	49267	49272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558871
1042	NC_018500	ATG	2	6	49316	49321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558871
1043	NC_018500	ATG	2	6	49478	49483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558871
1044	NC_018500	AGAA	2	8	49512	49519	75 %	0 %	25 %	0 %	402558871
1045	NC_018500	TGAT	2	8	49608	49615	25 %	50 %	25 %	0 %	402558871
1046	NC_018500	A	6	6	49656	49661	100 %	0 %	0 %	0 %	402558871
1047	NC_018500	GAG	2	6	49662	49667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558871
1048	NC_018500	TTG	2	6	49701	49706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558871
1049	NC_018500	TTCT	2	8	49740	49747	0 %	75 %	0 %	25 %	402558871
1050	NC_018500	TTA	2	6	49751	49756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558871
1051	NC_018500	GCA	2	6	49757	49762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558871
1052	NC_018500	AGG	3	9	49776	49784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558871
1053	NC_018500	AATT	2	8	49874	49881	50 %	50 %	0 %	0 %	402558872
1054	NC_018500	GTT	2	6	49906	49911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558872
1055	NC_018500	TCAA	2	8	49923	49930	50 %	25 %	0 %	25 %	402558872
1056	NC_018500	GAA	2	6	49975	49980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558872
1057	NC_018500	AATT	2	8	49998	50005	50 %	50 %	0 %	0 %	402558872
1058	NC_018500	TTG	2	6	50009	50014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558872
1059	NC_018500	GCA	2	6	50128	50133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558872
1060	NC_018500	CGA	2	6	50177	50182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558872
1061	NC_018500	ATG	2	6	50183	50188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558872
1062	NC_018500	CAA	2	6	50228	50233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558872
1063	NC_018500	A	6	6	50232	50237	100 %	0 %	0 %	0 %	402558872
1064	NC_018500	A	6	6	50275	50280	100 %	0 %	0 %	0 %	402558872
1065	NC_018500	GCT	2	6	50307	50312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558872
1066	NC_018500	GGT	2	6	50358	50363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558872
1067	NC_018500	AT	3	6	50379	50384	50 %	50 %	0 %	0 %	402558872
1068	NC_018500	A	6	6	50390	50395	100 %	0 %	0 %	0 %	402558872
1069	NC_018500	A	6	6	50552	50557	100 %	0 %	0 %	0 %	402558873
1070	NC_018500	GAA	2	6	50701	50706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1071	NC_018500	TGG	2	6	50769	50774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558873
1072	NC_018500	AGC	2	6	50802	50807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558873
1073	NC_018500	TTG	3	9	50822	50830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558873
1074	NC_018500	ATA	2	6	50831	50836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558873
1075	NC_018500	TTG	2	6	50870	50875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558873
1076	NC_018500	AAATGA	2	12	50886	50897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558873
1077	NC_018500	ATT	2	6	50917	50922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558873
1078	NC_018500	GTA	2	6	50953	50958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558873
1079	NC_018500	GAA	2	6	51049	51054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1080	NC_018500	GAA	2	6	51088	51093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1081	NC_018500	TTC	2	6	51107	51112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558873
1082	NC_018500	AAG	2	6	51127	51132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1083	NC_018500	GAA	2	6	51199	51204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1084	NC_018500	AACGA	2	10	51217	51226	60 %	0 %	20 %	20 %	402558873
1085	NC_018500	A	7	7	51226	51232	100 %	0 %	0 %	0 %	402558873
1086	NC_018500	GT	3	6	51267	51272	0 %	50 %	50 %	0 %	402558873
1087	NC_018500	AAG	2	6	51326	51331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
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1089	NC_018500	AGA	2	6	51399	51404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1090	NC_018500	GAA	2	6	51458	51463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558873
1091	NC_018500	TTA	2	6	51520	51525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558873
1092	NC_018500	AAT	2	6	51617	51622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558874
1093	NC_018500	TGG	2	6	51635	51640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558874
1094	NC_018500	TGA	2	6	51653	51658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558874
1095	NC_018500	TCA	2	6	51680	51685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558874
1096	NC_018500	A	7	7	51689	51695	100 %	0 %	0 %	0 %	402558874
1097	NC_018500	GCT	2	6	51702	51707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558874
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1099	NC_018500	TTA	2	6	51774	51779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558874
1100	NC_018500	CTA	2	6	51802	51807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558874
1101	NC_018500	TAT	3	9	51829	51837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558874
1102	NC_018500	AGC	3	9	51899	51907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558874
1103	NC_018500	ATG	2	6	51940	51945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558874
1104	NC_018500	ATT	2	6	51963	51968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558874
1105	NC_018500	TCG	2	6	52018	52023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558874
1106	NC_018500	A	6	6	52047	52052	100 %	0 %	0 %	0 %	402558874
1107	NC_018500	ACA	2	6	52062	52067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558874
1108	NC_018500	CTTCAG	2	12	52090	52101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558874
1109	NC_018500	AT	3	6	52135	52140	50 %	50 %	0 %	0 %	402558874
1110	NC_018500	ATGC	2	8	52284	52291	25 %	25 %	25 %	25 %	402558874
1111	NC_018500	AGA	2	6	52382	52387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558874
1112	NC_018500	CAA	2	6	52467	52472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558874
1113	NC_018500	CGAA	2	8	52492	52499	50 %	0 %	25 %	25 %	402558874
1114	NC_018500	TAAT	2	8	52516	52523	50 %	50 %	0 %	0 %	402558874
1115	NC_018500	GTGA	2	8	52551	52558	25 %	25 %	50 %	0 %	402558874
1116	NC_018500	ATT	2	6	52583	52588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558874
1117	NC_018500	TATC	2	8	52636	52643	25 %	50 %	0 %	25 %	402558874
1118	NC_018500	ACA	2	6	52743	52748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558874
1119	NC_018500	AAAAG	2	10	52820	52829	80 %	0 %	20 %	0 %	402558874
1120	NC_018500	ATT	2	6	52947	52952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558875
1121	NC_018500	ACA	2	6	52967	52972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558875
1122	NC_018500	AGG	2	6	52984	52989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558875
1123	NC_018500	AGA	2	6	53020	53025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558875
1124	NC_018500	TGT	2	6	53056	53061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558875
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1126	NC_018500	TAG	2	6	53166	53171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558875
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1253	NC_018500	GCT	2	6	59855	59860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558879
1254	NC_018500	GTA	2	6	59891	59896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558879
1255	NC_018500	GTA	2	6	59910	59915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558879
1256	NC_018500	GA	3	6	59920	59925	50 %	0 %	50 %	0 %	402558879
1257	NC_018500	ATG	2	6	59937	59942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558879
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1259	NC_018500	A	7	7	59961	59967	100 %	0 %	0 %	0 %	402558879
1260	NC_018500	GTC	2	6	60520	60525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558880
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1269	NC_018500	TAC	2	6	60824	60829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558880
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