MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018492	TTCAA	2	10	6573	6582	40 %	40 %	0 %	20 %	402557999
2	NC_018492	TTATT	2	10	7209	7218	20 %	80 %	0 %	0 %	402557999
3	NC_018492	ATTTT	2	10	12438	12447	20 %	80 %	0 %	0 %	402558003
4	NC_018492	TTTTG	2	10	14139	14148	0 %	80 %	20 %	0 %	402558004
5	NC_018492	TCATT	2	10	17189	17198	20 %	60 %	0 %	20 %	402558007
6	NC_018492	ACTTT	2	10	17330	17339	20 %	60 %	0 %	20 %	402558007
7	NC_018492	GTTTT	2	10	17624	17633	0 %	80 %	20 %	0 %	402558007
8	NC_018492	CGTAT	2	10	18641	18650	20 %	40 %	20 %	20 %	402558008
9	NC_018492	AACAA	2	10	25466	25475	80 %	0 %	0 %	20 %	402558012
10	NC_018492	CAAAA	2	10	25741	25750	80 %	0 %	0 %	20 %	402558012
11	NC_018492	AAACA	2	10	26316	26325	80 %	0 %	0 %	20 %	402558013
12	NC_018492	CTTTT	2	10	28372	28381	0 %	80 %	0 %	20 %	402558016
13	NC_018492	ACCTA	2	10	28426	28435	40 %	20 %	0 %	40 %	402558016
14	NC_018492	GGTTT	2	10	30533	30542	0 %	60 %	40 %	0 %	402558017
15	NC_018492	ATTCC	2	10	30675	30684	20 %	40 %	0 %	40 %	402558017
16	NC_018492	GATTT	2	10	30747	30756	20 %	60 %	20 %	0 %	402558017
17	NC_018492	AGTTC	2	10	30926	30935	20 %	40 %	20 %	20 %	402558017
18	NC_018492	AAAGA	2	10	31014	31023	80 %	0 %	20 %	0 %	402558018
19	NC_018492	TCCAA	2	10	34099	34108	40 %	20 %	0 %	40 %	402558020
20	NC_018492	TTTTC	2	10	40367	40376	0 %	80 %	0 %	20 %	402558028
21	NC_018492	ACAGA	2	10	41146	41155	60 %	0 %	20 %	20 %	402558028
22	NC_018492	ATATA	2	10	41196	41205	60 %	40 %	0 %	0 %	402558028
23	NC_018492	CTGCT	2	10	42625	42634	0 %	40 %	20 %	40 %	402558029
24	NC_018492	TTGAA	2	10	44048	44057	40 %	40 %	20 %	0 %	402558030
25	NC_018492	CTAAC	2	10	46184	46193	40 %	20 %	0 %	40 %	402558031
26	NC_018492	TCGTA	2	10	46739	46748	20 %	40 %	20 %	20 %	402558032
27	NC_018492	CCATA	2	10	46773	46782	40 %	20 %	0 %	40 %	402558032
28	NC_018492	TGGTT	2	10	47235	47244	0 %	60 %	40 %	0 %	402558032
29	NC_018492	CTTTT	2	10	48100	48109	0 %	80 %	0 %	20 %	402558032
30	NC_018492	TGATT	2	10	57077	57086	20 %	60 %	20 %	0 %	402558042
31	NC_018492	GAAAA	2	10	57699	57708	80 %	0 %	20 %	0 %	402558042
32	NC_018492	CTCAT	2	10	58179	58188	20 %	40 %	0 %	40 %	402558043
33	NC_018492	ATTTA	2	10	58764	58773	40 %	60 %	0 %	0 %	402558044
34	NC_018492	TCAAA	2	10	58847	58856	60 %	20 %	0 %	20 %	402558044
35	NC_018492	TATTT	2	10	60259	60268	20 %	80 %	0 %	0 %	402558044
36	NC_018492	ACATT	2	10	61393	61402	40 %	40 %	0 %	20 %	402558045
37	NC_018492	AGTCA	2	10	63697	63706	40 %	20 %	20 %	20 %	402558047
38	NC_018492	AACAA	2	10	64149	64158	80 %	0 %	0 %	20 %	402558048
39	NC_018492	TTTTG	2	10	65906	65915	0 %	80 %	20 %	0 %	402558050
40	NC_018492	CATTT	2	10	67469	67478	20 %	60 %	0 %	20 %	402558052
41	NC_018492	ATCCA	2	10	68619	68628	40 %	20 %	0 %	40 %	402558054
42	NC_018492	AAACT	2	10	69155	69164	60 %	20 %	0 %	20 %	402558054
43	NC_018492	TTCTT	2	10	70894	70903	0 %	80 %	0 %	20 %	402558059
44	NC_018492	CATTT	2	10	70930	70939	20 %	60 %	0 %	20 %	402558059
45	NC_018492	AAAAT	2	10	72035	72044	80 %	20 %	0 %	0 %	402558061
46	NC_018492	AATCA	2	10	73203	73212	60 %	20 %	0 %	20 %	402558064
47	NC_018492	AGTCA	2	10	73359	73368	40 %	20 %	20 %	20 %	402558065
48	NC_018492	TGAAA	2	10	73933	73942	60 %	20 %	20 %	0 %	402558066
49	NC_018492	CCGAA	2	10	76128	76137	40 %	0 %	20 %	40 %	402558068
50	NC_018492	AAGAA	2	10	76948	76957	80 %	0 %	20 %	0 %	402558068
51	NC_018492	TAGTT	2	10	78984	78993	20 %	60 %	20 %	0 %	402558071
52	NC_018492	TAAAT	2	10	79300	79309	60 %	40 %	0 %	0 %	402558072
53	NC_018492	CTTTA	2	10	80923	80932	20 %	60 %	0 %	20 %	402558073
54	NC_018492	TATGG	2	10	81702	81711	20 %	40 %	40 %	0 %	402558074
55	NC_018492	TATTT	2	10	81832	81841	20 %	80 %	0 %	0 %	402558074
56	NC_018492	TTCAT	2	10	82121	82130	20 %	60 %	0 %	20 %	402558074
57	NC_018492	TTCGT	2	10	85462	85471	0 %	60 %	20 %	20 %	402558081
58	NC_018492	CCTTC	2	10	86074	86083	0 %	40 %	0 %	60 %	402558082
59	NC_018492	CTTCT	2	10	86595	86604	0 %	60 %	0 %	40 %	402558082
60	NC_018492	AAATC	2	10	86731	86740	60 %	20 %	0 %	20 %	402558082
61	NC_018492	ATTAC	2	10	89734	89743	40 %	40 %	0 %	20 %	402558088
62	NC_018492	GTTTG	2	10	90409	90418	0 %	60 %	40 %	0 %	402558088
63	NC_018492	TTAAT	2	10	95170	95179	40 %	60 %	0 %	0 %	402558089
64	NC_018492	ATCGC	2	10	97696	97705	20 %	20 %	20 %	40 %	402558090
65	NC_018492	TAAAT	2	10	98399	98408	60 %	40 %	0 %	0 %	402558091
66	NC_018492	ATTTC	2	10	99948	99957	20 %	60 %	0 %	20 %	402558094
67	NC_018492	TACCA	2	10	99982	99991	40 %	20 %	0 %	40 %	402558094
68	NC_018492	TTGCA	2	10	101735	101744	20 %	40 %	20 %	20 %	402558097
69	NC_018492	TTTTG	2	10	102059	102068	0 %	80 %	20 %	0 %	402558097
70	NC_018492	GGAAT	2	10	102430	102439	40 %	20 %	40 %	0 %	402558097
71	NC_018492	TTCAT	2	10	102489	102498	20 %	60 %	0 %	20 %	402558097
72	NC_018492	TCCAT	2	10	104320	104329	20 %	40 %	0 %	40 %	402558098
73	NC_018492	GTCTT	2	10	107454	107463	0 %	60 %	20 %	20 %	402558103
74	NC_018492	CTTCA	2	10	110126	110135	20 %	40 %	0 %	40 %	402558105
75	NC_018492	TTTTC	2	10	110136	110145	0 %	80 %	0 %	20 %	402558105
76	NC_018492	TCTGT	2	10	110501	110510	0 %	60 %	20 %	20 %	402558106
77	NC_018492	CTTTC	2	10	115382	115391	0 %	60 %	0 %	40 %	402558113
78	NC_018492	TTTTC	2	10	116799	116808	0 %	80 %	0 %	20 %	402558114
79	NC_018492	TTTCC	2	10	120423	120432	0 %	60 %	0 %	40 %	402558120
80	NC_018492	TCATT	2	10	120549	120558	20 %	60 %	0 %	20 %	402558120
81	NC_018492	TCCCA	2	10	120657	120666	20 %	20 %	0 %	60 %	402558120
82	NC_018492	TTTTC	2	10	121194	121203	0 %	80 %	0 %	20 %	402558120
83	NC_018492	ATTTT	2	10	121313	121322	20 %	80 %	0 %	0 %	402558120
84	NC_018492	ATGAC	2	10	122273	122282	40 %	20 %	20 %	20 %	402558120
85	NC_018492	ATACA	2	10	124822	124831	60 %	20 %	0 %	20 %	402558122
86	NC_018492	CTTTT	2	10	125437	125446	0 %	80 %	0 %	20 %	402558124
87	NC_018492	TTGGT	2	10	125457	125466	0 %	60 %	40 %	0 %	402558124
88	NC_018492	CATCA	2	10	126789	126798	40 %	20 %	0 %	40 %	402558124
89	NC_018492	TTTTG	2	10	132379	132388	0 %	80 %	20 %	0 %	402558129
90	NC_018492	ATCAA	2	10	134507	134516	60 %	20 %	0 %	20 %	402558131
91	NC_018492	ATGCA	2	10	136475	136484	40 %	20 %	20 %	20 %	402558132
92	NC_018492	TTCTT	2	10	137530	137539	0 %	80 %	0 %	20 %	402558134
93	NC_018492	TTTAC	2	10	139120	139129	20 %	60 %	0 %	20 %	402558134
94	NC_018492	TCGTA	2	10	139362	139371	20 %	40 %	20 %	20 %	402558134
95	NC_018492	AGAAA	2	10	141382	141391	80 %	0 %	20 %	0 %	402558135
96	NC_018492	TTACT	2	10	143356	143365	20 %	60 %	0 %	20 %	402558138
97	NC_018492	AAGCA	2	10	143834	143843	60 %	0 %	20 %	20 %	402558138
98	NC_018492	CTTAT	2	10	144337	144346	20 %	60 %	0 %	20 %	402558139
99	NC_018492	CGAAG	2	10	146264	146273	40 %	0 %	40 %	20 %	402558142
100	NC_018492	CATTC	2	10	148028	148037	20 %	40 %	0 %	40 %	402558145
101	NC_018492	ATTTC	2	10	149663	149672	20 %	60 %	0 %	20 %	402558147
102	NC_018492	TTTTC	2	10	151601	151610	0 %	80 %	0 %	20 %	402558150
103	NC_018492	GGAAG	2	10	154171	154180	40 %	0 %	60 %	0 %	402558154
104	NC_018492	ATTAT	2	10	155741	155750	40 %	60 %	0 %	0 %	402558156
105	NC_018492	TGGCT	2	10	160976	160985	0 %	40 %	40 %	20 %	402558161
106	NC_018492	AGCTC	2	10	162761	162770	20 %	20 %	20 %	40 %	402558162
107	NC_018492	TAAAG	2	10	163133	163142	60 %	20 %	20 %	0 %	402558162
108	NC_018492	CCGAA	2	10	164993	165002	40 %	0 %	20 %	40 %	402558164
109	NC_018492	GCAAA	2	10	165560	165569	60 %	0 %	20 %	20 %	402558166
110	NC_018492	AGGAA	2	10	166430	166439	60 %	0 %	40 %	0 %	402558166
111	NC_018492	TTGGT	2	10	168987	168996	0 %	60 %	40 %	0 %	402558168
112	NC_018492	AATGC	2	10	169530	169539	40 %	20 %	20 %	20 %	402558168
113	NC_018492	GAAAT	2	10	171680	171689	60 %	20 %	20 %	0 %	402558170
114	NC_018492	GTATG	2	10	172978	172987	20 %	40 %	40 %	0 %	402558172
115	NC_018492	TTCTT	2	10	172996	173005	0 %	80 %	0 %	20 %	402558172
116	NC_018492	CCATA	2	10	173281	173290	40 %	20 %	0 %	40 %	402558173
117	NC_018492	TGGAT	2	10	173302	173311	20 %	40 %	40 %	0 %	402558173
118	NC_018492	TTCCG	2	10	173400	173409	0 %	40 %	20 %	40 %	402558173
119	NC_018492	AAATT	2	10	178038	178047	60 %	40 %	0 %	0 %	402558177
120	NC_018492	GTTTA	2	10	179395	179404	20 %	60 %	20 %	0 %	402558178
121	NC_018492	ATGAG	2	10	180918	180927	40 %	20 %	40 %	0 %	402558178
122	NC_018492	AGAAA	2	10	183324	183333	80 %	0 %	20 %	0 %	402558182
123	NC_018492	TGTAA	2	10	184215	184224	40 %	40 %	20 %	0 %	402558184
124	NC_018492	TTCTT	2	10	185672	185681	0 %	80 %	0 %	20 %	402558187
125	NC_018492	AATTA	2	10	185767	185776	60 %	40 %	0 %	0 %	402558187
126	NC_018492	CTTTG	2	10	185827	185836	0 %	60 %	20 %	20 %	402558187
127	NC_018492	AGCAA	2	10	189003	189012	60 %	0 %	20 %	20 %	402558191
128	NC_018492	TTTAT	2	10	189330	189339	20 %	80 %	0 %	0 %	402558191
129	NC_018492	TCTAC	2	10	189352	189361	20 %	40 %	0 %	40 %	402558191
130	NC_018492	TTTTC	2	10	190091	190100	0 %	80 %	0 %	20 %	402558191
131	NC_018492	GGGCT	2	10	191269	191278	0 %	20 %	60 %	20 %	402558192
132	NC_018492	TAGAA	2	10	191641	191650	60 %	20 %	20 %	0 %	402558192
133	NC_018492	AGTTA	2	10	191709	191718	40 %	40 %	20 %	0 %	402558192
134	NC_018492	GCTTC	2	10	194728	194737	0 %	40 %	20 %	40 %	402558196
135	NC_018492	CATTA	2	10	195235	195244	40 %	40 %	0 %	20 %	402558196
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149	NC_018492	GTCAA	2	10	214900	214909	40 %	20 %	20 %	20 %	402558205
150	NC_018492	TCAGC	2	10	217059	217068	20 %	20 %	20 %	40 %	402558205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.