MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
2	NC_018489	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558810
3	NC_018489	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
4	NC_018489	AAT	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558811
5	NC_018489	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558811
6	NC_018489	ACT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558812
7	NC_018489	ATG	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558812
8	NC_018489	GAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558812
9	NC_018489	AGA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
10	NC_018489	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
11	NC_018489	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558812
12	NC_018489	AGA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
13	NC_018489	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558812
14	NC_018489	AAG	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
15	NC_018489	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558812
16	NC_018489	TTA	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558812
17	NC_018489	GAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558813
18	NC_018489	ACA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
19	NC_018489	CTA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558813
20	NC_018489	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558813
21	NC_018489	ACA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
22	NC_018489	TGT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558813
23	NC_018489	TAA	2	6	4084	4089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558813
24	NC_018489	TCT	2	6	4200	4205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
25	NC_018489	TAG	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558814
26	NC_018489	CAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
27	NC_018489	TTG	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558814
28	NC_018489	ATA	2	6	4558	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558814
29	NC_018489	TAT	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
30	NC_018489	AGG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558814
31	NC_018489	AAC	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
32	NC_018489	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
33	NC_018489	GTC	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558814
34	NC_018489	TTA	2	6	4867	4872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
35	NC_018489	CTT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
36	NC_018489	ACT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558814
37	NC_018489	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
38	NC_018489	TCT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
39	NC_018489	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
40	NC_018489	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
41	NC_018489	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
42	NC_018489	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
43	NC_018489	ATG	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
44	NC_018489	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
45	NC_018489	GAA	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
46	NC_018489	AAC	2	6	6151	6156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
47	NC_018489	TTA	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
48	NC_018489	CGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558815
49	NC_018489	ATG	3	9	6388	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
50	NC_018489	TAT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
51	NC_018489	CAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
52	NC_018489	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
53	NC_018489	ATG	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
54	NC_018489	AGA	2	6	6719	6724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
55	NC_018489	CTT	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
56	NC_018489	ATG	3	9	6988	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
57	NC_018489	ATC	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
58	NC_018489	CTT	3	9	7075	7083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
59	NC_018489	TAC	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
60	NC_018489	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
61	NC_018489	CAT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
62	NC_018489	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
63	NC_018489	TTG	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558815
64	NC_018489	CTC	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558815
65	NC_018489	TGG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558815
66	NC_018489	AGA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
67	NC_018489	TAA	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
68	NC_018489	TAA	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
69	NC_018489	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
70	NC_018489	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
71	NC_018489	AGA	2	6	7877	7882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
72	NC_018489	ATA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
73	NC_018489	ATT	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558816
74	NC_018489	TAA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
75	NC_018489	TCG	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558816
76	NC_018489	TAA	2	6	8848	8853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
77	NC_018489	ATG	2	6	8898	8903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558816
78	NC_018489	GTT	2	6	9950	9955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558817
79	NC_018489	ATG	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558817
80	NC_018489	CAA	2	6	10243	10248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558817
81	NC_018489	AGA	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558818
82	NC_018489	GTT	2	6	10689	10694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
83	NC_018489	TGT	2	6	10808	10813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
84	NC_018489	GTT	2	6	10842	10847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
85	NC_018489	TTG	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
86	NC_018489	TTA	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558818
87	NC_018489	GTG	2	6	10995	11000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558818
88	NC_018489	GAT	2	6	11066	11071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558818
89	NC_018489	CTT	2	6	11091	11096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558818
90	NC_018489	GTT	2	6	11172	11177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
91	NC_018489	ATT	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558818
92	NC_018489	GAA	2	6	11756	11761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558819
93	NC_018489	CGG	2	6	11797	11802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558819
94	NC_018489	CCA	2	6	12050	12055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558819
95	NC_018489	AGA	2	6	12172	12177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558819
96	NC_018489	AGA	2	6	12456	12461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558820
97	NC_018489	AGG	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558820
98	NC_018489	AAT	2	6	12556	12561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558820
99	NC_018489	ATT	2	6	12625	12630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558821
100	NC_018489	AAG	2	6	12640	12645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558821
101	NC_018489	ACC	2	6	12829	12834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558821
102	NC_018489	TGA	2	6	13036	13041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558821
103	NC_018489	ACG	2	6	13358	13363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558822
104	NC_018489	TTA	2	6	13374	13379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558822
105	NC_018489	ACA	2	6	13423	13428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558823
106	NC_018489	TAA	2	6	13493	13498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558823
107	NC_018489	AGA	2	6	13513	13518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558823
108	NC_018489	AGA	2	6	13659	13664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558823
109	NC_018489	AGA	3	9	13701	13709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558823

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.