MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	AT	3	6	196	201	50 %	50 %	0 %	0 %	402558330
2	NC_018488	TG	3	6	321	326	0 %	50 %	50 %	0 %	402558330
3	NC_018488	GA	3	6	360	365	50 %	0 %	50 %	0 %	402558330
4	NC_018488	TA	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
5	NC_018488	CT	3	6	3359	3364	0 %	50 %	0 %	50 %	402558332
6	NC_018488	TA	3	6	3824	3829	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
7	NC_018488	AT	4	8	4985	4992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
8	NC_018488	AG	3	6	5973	5978	50 %	0 %	50 %	0 %	402558334
9	NC_018488	AT	3	6	6502	6507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
10	NC_018488	AT	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
11	NC_018488	AT	3	6	7660	7665	50 %	50 %	0 %	0 %	402558336
12	NC_018488	TA	3	6	7944	7949	50 %	50 %	0 %	0 %	402558336
13	NC_018488	TA	3	6	8449	8454	50 %	50 %	0 %	0 %	402558337
14	NC_018488	AT	3	6	8982	8987	50 %	50 %	0 %	0 %	402558337
15	NC_018488	AT	3	6	9292	9297	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
16	NC_018488	AT	3	6	9354	9359	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
17	NC_018488	TA	3	6	9564	9569	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
18	NC_018488	TA	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
19	NC_018488	AT	3	6	10047	10052	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
20	NC_018488	TA	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	402558340
21	NC_018488	AT	3	6	12783	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	402558343
22	NC_018488	TC	4	8	13106	13113	0 %	50 %	0 %	50 %	402558344
23	NC_018488	TG	3	6	13324	13329	0 %	50 %	50 %	0 %	402558344
24	NC_018488	AT	3	6	13468	13473	50 %	50 %	0 %	0 %	402558344
25	NC_018488	TA	3	6	14024	14029	50 %	50 %	0 %	0 %	402558346
26	NC_018488	AT	3	6	14125	14130	50 %	50 %	0 %	0 %	402558346
27	NC_018488	AT	3	6	14232	14237	50 %	50 %	0 %	0 %	402558347
28	NC_018488	TG	3	6	15557	15562	0 %	50 %	50 %	0 %	402558349
29	NC_018488	GA	3	6	15636	15641	50 %	0 %	50 %	0 %	402558350
30	NC_018488	AG	3	6	16500	16505	50 %	0 %	50 %	0 %	402558352
31	NC_018488	TA	3	6	17130	17135	50 %	50 %	0 %	0 %	402558353
32	NC_018488	TA	3	6	18058	18063	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
33	NC_018488	AT	3	6	18073	18078	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
34	NC_018488	AG	3	6	18624	18629	50 %	0 %	50 %	0 %	402558355
35	NC_018488	TA	3	6	18806	18811	50 %	50 %	0 %	0 %	402558356
36	NC_018488	AT	4	8	19302	19309	50 %	50 %	0 %	0 %	402558357
37	NC_018488	TA	3	6	19921	19926	50 %	50 %	0 %	0 %	402558358
38	NC_018488	AG	3	6	19951	19956	50 %	0 %	50 %	0 %	402558358
39	NC_018488	TC	3	6	20570	20575	0 %	50 %	0 %	50 %	402558358
40	NC_018488	TA	3	6	22228	22233	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
41	NC_018488	TA	3	6	22616	22621	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
42	NC_018488	AT	3	6	22979	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
43	NC_018488	TC	3	6	23524	23529	0 %	50 %	0 %	50 %	402558360
44	NC_018488	AT	3	6	23628	23633	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
45	NC_018488	TA	3	6	23992	23997	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
46	NC_018488	AT	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
47	NC_018488	AT	3	6	25154	25159	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
48	NC_018488	CA	3	6	25169	25174	50 %	0 %	0 %	50 %	402558361
49	NC_018488	GT	3	6	25645	25650	0 %	50 %	50 %	0 %	402558361
50	NC_018488	TA	3	6	26392	26397	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
51	NC_018488	AC	3	6	28437	28442	50 %	0 %	0 %	50 %	402558362
52	NC_018488	AT	3	6	28987	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
53	NC_018488	TA	4	8	30500	30507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
54	NC_018488	AT	4	8	30546	30553	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
55	NC_018488	TA	3	6	31262	31267	50 %	50 %	0 %	0 %	402558366
56	NC_018488	AT	3	6	31973	31978	50 %	50 %	0 %	0 %	402558366
57	NC_018488	AT	3	6	33927	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	402558370
58	NC_018488	AG	3	6	34079	34084	50 %	0 %	50 %	0 %	402558370
59	NC_018488	AT	4	8	34253	34260	50 %	50 %	0 %	0 %	402558371
60	NC_018488	TA	3	6	34605	34610	50 %	50 %	0 %	0 %	402558371
61	NC_018488	TA	4	8	34892	34899	50 %	50 %	0 %	0 %	402558372
62	NC_018488	TA	3	6	34935	34940	50 %	50 %	0 %	0 %	402558372
63	NC_018488	AG	3	6	35683	35688	50 %	0 %	50 %	0 %	402558373
64	NC_018488	AT	3	6	36071	36076	50 %	50 %	0 %	0 %	402558374
65	NC_018488	AT	3	6	37770	37775	50 %	50 %	0 %	0 %	402558376
66	NC_018488	TA	3	6	37933	37938	50 %	50 %	0 %	0 %	402558376
67	NC_018488	TG	3	6	39470	39475	0 %	50 %	50 %	0 %	402558378
68	NC_018488	AT	3	6	39837	39842	50 %	50 %	0 %	0 %	402558379
69	NC_018488	TA	3	6	41585	41590	50 %	50 %	0 %	0 %	402558380
70	NC_018488	AT	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
71	NC_018488	TA	3	6	42544	42549	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
72	NC_018488	TA	3	6	42646	42651	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
73	NC_018488	TA	3	6	42920	42925	50 %	50 %	0 %	0 %	402558383
74	NC_018488	GA	3	6	43343	43348	50 %	0 %	50 %	0 %	402558384
75	NC_018488	AT	3	6	43457	43462	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
76	NC_018488	CA	3	6	43654	43659	50 %	0 %	0 %	50 %	402558384
77	NC_018488	AC	3	6	44157	44162	50 %	0 %	0 %	50 %	402558385
78	NC_018488	AT	3	6	44344	44349	50 %	50 %	0 %	0 %	402558385
79	NC_018488	AG	3	6	45439	45444	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
80	NC_018488	AG	3	6	45465	45470	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
81	NC_018488	AC	3	6	45573	45578	50 %	0 %	0 %	50 %	402558386
82	NC_018488	CT	3	6	46517	46522	0 %	50 %	0 %	50 %	402558386
83	NC_018488	AT	3	6	46661	46666	50 %	50 %	0 %	0 %	402558386
84	NC_018488	TA	3	6	47936	47941	50 %	50 %	0 %	0 %	402558387
85	NC_018488	AG	3	6	48228	48233	50 %	0 %	50 %	0 %	402558388
86	NC_018488	TA	3	6	50090	50095	50 %	50 %	0 %	0 %	402558390
87	NC_018488	AG	3	6	51116	51121	50 %	0 %	50 %	0 %	402558391
88	NC_018488	AT	3	6	53163	53168	50 %	50 %	0 %	0 %	402558393
89	NC_018488	AG	3	6	53545	53550	50 %	0 %	50 %	0 %	402558394
90	NC_018488	AT	3	6	53839	53844	50 %	50 %	0 %	0 %	402558394
91	NC_018488	AC	3	6	53994	53999	50 %	0 %	0 %	50 %	402558394
92	NC_018488	AT	3	6	55641	55646	50 %	50 %	0 %	0 %	402558394
93	NC_018488	AG	4	8	55818	55825	50 %	0 %	50 %	0 %	402558394
94	NC_018488	TA	3	6	55894	55899	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
95	NC_018488	TA	3	6	55967	55972	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
96	NC_018488	AG	4	8	56162	56169	50 %	0 %	50 %	0 %	402558395
97	NC_018488	TA	4	8	56650	56657	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
98	NC_018488	GT	3	6	56698	56703	0 %	50 %	50 %	0 %	402558395
99	NC_018488	AT	3	6	56924	56929	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
100	NC_018488	TA	4	8	57034	57041	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
101	NC_018488	TA	3	6	58372	58377	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
102	NC_018488	TA	3	6	58382	58387	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
103	NC_018488	TA	3	6	58491	58496	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
104	NC_018488	AG	3	6	59056	59061	50 %	0 %	50 %	0 %	402558398
105	NC_018488	TG	3	6	59237	59242	0 %	50 %	50 %	0 %	402558398
106	NC_018488	GA	3	6	59367	59372	50 %	0 %	50 %	0 %	402558398
107	NC_018488	TA	3	6	61759	61764	50 %	50 %	0 %	0 %	402558400
108	NC_018488	TA	3	6	62225	62230	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
109	NC_018488	GT	3	6	62702	62707	0 %	50 %	50 %	0 %	402558401
110	NC_018488	GA	3	6	62883	62888	50 %	0 %	50 %	0 %	402558401
111	NC_018488	TA	3	6	62976	62981	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
112	NC_018488	TA	3	6	63207	63212	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
113	NC_018488	CA	3	6	63439	63444	50 %	0 %	0 %	50 %	402558401
114	NC_018488	AT	3	6	63655	63660	50 %	50 %	0 %	0 %	402558402
115	NC_018488	AG	3	6	64134	64139	50 %	0 %	50 %	0 %	402558403
116	NC_018488	TA	3	6	65022	65027	50 %	50 %	0 %	0 %	402558403
117	NC_018488	AT	3	6	65118	65123	50 %	50 %	0 %	0 %	402558403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.