MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	GAAAA	2	10	1414	1423	80 %	0 %	20 %	0 %	402558331
2	NC_018488	TAAAA	2	10	2147	2156	80 %	20 %	0 %	0 %	402558332
3	NC_018488	TTAAT	2	10	7380	7389	40 %	60 %	0 %	0 %	402558336
4	NC_018488	AGTAC	2	10	8056	8065	40 %	20 %	20 %	20 %	402558336
5	NC_018488	AAAAG	2	10	11251	11260	80 %	0 %	20 %	0 %	402558341
6	NC_018488	CAAAG	2	10	11332	11341	60 %	0 %	20 %	20 %	402558341
7	NC_018488	CCATA	2	10	16479	16488	40 %	20 %	0 %	40 %	402558352
8	NC_018488	TTTGG	2	10	16713	16722	0 %	60 %	40 %	0 %	402558352
9	NC_018488	AACTA	2	10	21947	21956	60 %	20 %	0 %	20 %	402558359
10	NC_018488	TTCAA	2	10	23352	23361	40 %	40 %	0 %	20 %	402558359
11	NC_018488	ATTCA	2	10	26674	26683	40 %	40 %	0 %	20 %	402558361
12	NC_018488	ATTTT	2	10	27968	27977	20 %	80 %	0 %	0 %	402558362
13	NC_018488	CTGTA	2	10	28212	28221	20 %	40 %	20 %	20 %	402558362
14	NC_018488	TAAGA	2	10	28776	28785	60 %	20 %	20 %	0 %	402558362
15	NC_018488	ATTAA	2	10	29427	29436	60 %	40 %	0 %	0 %	402558363
16	NC_018488	CAATA	2	10	30189	30198	60 %	20 %	0 %	20 %	402558364
17	NC_018488	GAAAA	2	10	30608	30617	80 %	0 %	20 %	0 %	402558365
18	NC_018488	TAAAT	2	10	31999	32008	60 %	40 %	0 %	0 %	402558366
19	NC_018488	TAATT	2	10	32089	32098	40 %	60 %	0 %	0 %	402558366
20	NC_018488	TTTCA	2	10	33309	33318	20 %	60 %	0 %	20 %	402558368
21	NC_018488	AATAA	2	10	35246	35255	80 %	20 %	0 %	0 %	402558372
22	NC_018488	GAACA	2	10	37330	37339	60 %	0 %	20 %	20 %	402558376
23	NC_018488	TTATT	2	10	38337	38346	20 %	80 %	0 %	0 %	402558377
24	NC_018488	TGTAA	2	10	42067	42076	40 %	40 %	20 %	0 %	402558381
25	NC_018488	AAGTC	2	10	42663	42672	40 %	20 %	20 %	20 %	402558382
26	NC_018488	CTTTA	2	10	45975	45984	20 %	60 %	0 %	20 %	402558386
27	NC_018488	AATGA	2	10	50173	50182	60 %	20 %	20 %	0 %	402558390
28	NC_018488	AAAAG	2	10	51351	51360	80 %	0 %	20 %	0 %	402558391
29	NC_018488	AGAGG	2	10	52919	52928	40 %	0 %	60 %	0 %	402558393
30	NC_018488	AGAAT	2	10	54217	54226	60 %	20 %	20 %	0 %	402558394
31	NC_018488	GAAAA	2	10	56967	56976	80 %	0 %	20 %	0 %	402558395
32	NC_018488	AGATA	2	10	58198	58207	60 %	20 %	20 %	0 %	402558397
33	NC_018488	AAAAG	2	10	60080	60089	80 %	0 %	20 %	0 %	402558400
34	NC_018488	AAAAG	2	10	61031	61040	80 %	0 %	20 %	0 %	402558400
35	NC_018488	AGAAA	2	10	61557	61566	80 %	0 %	20 %	0 %	402558400
36	NC_018488	CTTTT	2	10	62169	62178	0 %	80 %	0 %	20 %	402558401

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.