MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 1274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018488	GAT	2	6	24579	24584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558360
502	NC_018488	ATC	2	6	24590	24595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558360
503	NC_018488	TAA	2	6	24635	24640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558360
504	NC_018488	CTA	2	6	24667	24672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558360
505	NC_018488	GAA	2	6	24705	24710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558360
506	NC_018488	AAAG	2	8	24765	24772	75 %	0 %	25 %	0 %	402558360
507	NC_018488	TCT	2	6	25106	25111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
508	NC_018488	TTC	2	6	25135	25140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
509	NC_018488	AT	3	6	25154	25159	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
510	NC_018488	CA	3	6	25169	25174	50 %	0 %	0 %	50 %	402558361
511	NC_018488	TAA	2	6	25185	25190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558361
512	NC_018488	A	6	6	25261	25266	100 %	0 %	0 %	0 %	402558361
513	NC_018488	ATTG	2	8	25285	25292	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
514	NC_018488	TTTA	2	8	25300	25307	25 %	75 %	0 %	0 %	402558361
515	NC_018488	TTA	2	6	25337	25342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558361
516	NC_018488	TTA	2	6	25515	25520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558361
517	NC_018488	TTC	2	6	25567	25572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
518	NC_018488	CCA	2	6	25574	25579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558361
519	NC_018488	A	6	6	25587	25592	100 %	0 %	0 %	0 %	402558361
520	NC_018488	GAG	2	6	25620	25625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558361
521	NC_018488	CAA	2	6	25639	25644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558361
522	NC_018488	GT	3	6	25645	25650	0 %	50 %	50 %	0 %	402558361
523	NC_018488	TTC	2	6	25696	25701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
524	NC_018488	ATG	2	6	25720	25725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558361
525	NC_018488	AAG	2	6	25726	25731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558361
526	NC_018488	GTA	2	6	25766	25771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558361
527	NC_018488	AGA	3	9	25903	25911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558361
528	NC_018488	GAT	2	6	25934	25939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558361
529	NC_018488	CAT	3	9	25992	26000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558361
530	NC_018488	GATT	2	8	26138	26145	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
531	NC_018488	GAA	2	6	26238	26243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558361
532	NC_018488	CTT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
533	NC_018488	T	6	6	26342	26347	0 %	100 %	0 %	0 %	402558361
534	NC_018488	TA	3	6	26392	26397	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
535	NC_018488	TCA	2	6	26456	26461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558361
536	NC_018488	ATC	2	6	26476	26481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558361
537	NC_018488	ATG	2	6	26491	26496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558361
538	NC_018488	ATA	2	6	26566	26571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558361
539	NC_018488	TCA	3	9	26591	26599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558361
540	NC_018488	ATTCA	2	10	26674	26683	40 %	40 %	0 %	20 %	402558361
541	NC_018488	TCG	2	6	26724	26729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558361
542	NC_018488	TAA	2	6	26749	26754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558361
543	NC_018488	GTT	2	6	26832	26837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558361
544	NC_018488	CTT	2	6	26841	26846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
545	NC_018488	TAA	2	6	26946	26951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558361
546	NC_018488	TCT	2	6	26961	26966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
547	NC_018488	T	6	6	26974	26979	0 %	100 %	0 %	0 %	402558361
548	NC_018488	TGCT	2	8	26986	26993	0 %	50 %	25 %	25 %	402558361
549	NC_018488	T	6	6	27010	27015	0 %	100 %	0 %	0 %	402558361
550	NC_018488	TTTG	2	8	27020	27027	0 %	75 %	25 %	0 %	402558361
551	NC_018488	TCA	2	6	27033	27038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558361
552	NC_018488	T	6	6	27231	27236	0 %	100 %	0 %	0 %	402558361
553	NC_018488	GTA	2	6	27390	27395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558361
554	NC_018488	TTG	2	6	27418	27423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558361
555	NC_018488	CATA	2	8	27453	27460	50 %	25 %	0 %	25 %	402558361
556	NC_018488	GAA	2	6	27465	27470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558361
557	NC_018488	TAT	2	6	27522	27527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558361
558	NC_018488	TTG	2	6	27541	27546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558361
559	NC_018488	TAA	2	6	27559	27564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558361
560	NC_018488	AGA	2	6	27580	27585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558361
561	NC_018488	TTC	2	6	27667	27672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558361
562	NC_018488	CCAG	2	8	27745	27752	25 %	0 %	25 %	50 %	402558361
563	NC_018488	ATTTT	2	10	27968	27977	20 %	80 %	0 %	0 %	402558362
564	NC_018488	T	6	6	27974	27979	0 %	100 %	0 %	0 %	402558362
565	NC_018488	AGT	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558362
566	NC_018488	AGA	2	6	28089	28094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558362
567	NC_018488	TAA	2	6	28116	28121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558362
568	NC_018488	GAC	2	6	28150	28155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558362
569	NC_018488	TAA	2	6	28185	28190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558362
570	NC_018488	CTGTA	2	10	28212	28221	20 %	40 %	20 %	20 %	402558362
571	NC_018488	TCGA	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	402558362
572	NC_018488	GTT	2	6	28287	28292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558362
573	NC_018488	CCT	2	6	28295	28300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558362
574	NC_018488	AAT	2	6	28312	28317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558362
575	NC_018488	TCAT	2	8	28343	28350	25 %	50 %	0 %	25 %	402558362
576	NC_018488	GATA	2	8	28354	28361	50 %	25 %	25 %	0 %	402558362
577	NC_018488	TTA	2	6	28424	28429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558362
578	NC_018488	AC	3	6	28437	28442	50 %	0 %	0 %	50 %	402558362
579	NC_018488	T	6	6	28454	28459	0 %	100 %	0 %	0 %	402558362
580	NC_018488	CAA	2	6	28470	28475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558362
581	NC_018488	TTG	2	6	28540	28545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558362
582	NC_018488	CTA	2	6	28586	28591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558362
583	NC_018488	TAAGA	2	10	28776	28785	60 %	20 %	20 %	0 %	402558362
584	NC_018488	AAT	2	6	28980	28985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558363
585	NC_018488	AT	3	6	28987	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
586	NC_018488	T	6	6	29000	29005	0 %	100 %	0 %	0 %	402558363
587	NC_018488	T	7	7	29028	29034	0 %	100 %	0 %	0 %	402558363
588	NC_018488	TGTAAA	2	12	29073	29084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558363
589	NC_018488	GTA	2	6	29122	29127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558363
590	NC_018488	AGA	2	6	29183	29188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558363
591	NC_018488	A	7	7	29195	29201	100 %	0 %	0 %	0 %	402558363
592	NC_018488	A	7	7	29214	29220	100 %	0 %	0 %	0 %	402558363
593	NC_018488	TTAA	2	8	29226	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
594	NC_018488	GAAG	2	8	29283	29290	50 %	0 %	50 %	0 %	402558363
595	NC_018488	ATT	2	6	29413	29418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558363
596	NC_018488	ATTAA	2	10	29427	29436	60 %	40 %	0 %	0 %	402558363
597	NC_018488	A	7	7	29465	29471	100 %	0 %	0 %	0 %	402558363
598	NC_018488	A	6	6	29485	29490	100 %	0 %	0 %	0 %	402558363
599	NC_018488	GAT	2	6	29586	29591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558363
600	NC_018488	AAC	2	6	29639	29644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558363
601	NC_018488	TAA	2	6	29666	29671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558363
602	NC_018488	A	7	7	29732	29738	100 %	0 %	0 %	0 %	402558363
603	NC_018488	TTA	2	6	29739	29744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558363
604	NC_018488	TAA	2	6	29783	29788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558363
605	NC_018488	CAAA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	402558364
606	NC_018488	AGA	2	6	30001	30006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558364
607	NC_018488	TAA	2	6	30069	30074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558364
608	NC_018488	ATT	2	6	30083	30088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558364
609	NC_018488	GAT	2	6	30098	30103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558364
610	NC_018488	GATA	2	8	30107	30114	50 %	25 %	25 %	0 %	402558364
611	NC_018488	ATT	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558364
612	NC_018488	CAATA	2	10	30189	30198	60 %	20 %	0 %	20 %	402558364
613	NC_018488	TTA	2	6	30241	30246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558364
614	NC_018488	GAAT	2	8	30299	30306	50 %	25 %	25 %	0 %	402558365
615	NC_018488	AAT	3	9	30304	30312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558365
616	NC_018488	AGTC	2	8	30321	30328	25 %	25 %	25 %	25 %	402558365
617	NC_018488	AAG	2	6	30345	30350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558365
618	NC_018488	A	7	7	30383	30389	100 %	0 %	0 %	0 %	402558365
619	NC_018488	ATA	2	6	30407	30412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558365
620	NC_018488	TGA	2	6	30489	30494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558365
621	NC_018488	TA	4	8	30500	30507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
622	NC_018488	GCA	2	6	30513	30518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558365
623	NC_018488	ACT	2	6	30519	30524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558365
624	NC_018488	AAT	2	6	30535	30540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558365
625	NC_018488	AT	4	8	30546	30553	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
626	NC_018488	CAG	2	6	30562	30567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558365
627	NC_018488	GAAAA	2	10	30608	30617	80 %	0 %	20 %	0 %	402558365
628	NC_018488	A	6	6	30614	30619	100 %	0 %	0 %	0 %	402558365
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