MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017999	GTC	2	6	206429	206434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936090
4002	NC_017999	TCAG	2	8	206502	206509	25 %	25 %	25 %	25 %	390936090
4003	NC_017999	GCG	2	6	206582	206587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936091
4004	NC_017999	ACT	2	6	206642	206647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4005	NC_017999	TCA	3	9	206666	206674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4006	NC_017999	CGGC	2	8	206693	206700	0 %	0 %	50 %	50 %	390936091
4007	NC_017999	ATC	2	6	206713	206718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4008	NC_017999	TGA	2	6	206792	206797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4009	NC_017999	GCT	2	6	206835	206840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4010	NC_017999	GAT	2	6	206889	206894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4011	NC_017999	CAA	2	6	206952	206957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936091
4012	NC_017999	ACG	2	6	207017	207022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4013	NC_017999	GCTC	2	8	207059	207066	0 %	25 %	25 %	50 %	390936091
4014	NC_017999	GC	3	6	207092	207097	0 %	0 %	50 %	50 %	390936091
4015	NC_017999	ATG	2	6	207103	207108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4016	NC_017999	ACA	2	6	207113	207118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936091
4017	NC_017999	TCA	2	6	207122	207127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4018	NC_017999	TCA	3	9	207164	207172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4019	NC_017999	TCA	2	6	207179	207184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
4020	NC_017999	CGCC	2	8	207207	207214	0 %	0 %	25 %	75 %	390936091
4021	NC_017999	GAG	2	6	207250	207255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936091
4022	NC_017999	CCG	2	6	207309	207314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936091
4023	NC_017999	TGA	2	6	207377	207382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4024	NC_017999	TGA	2	6	207389	207394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4025	NC_017999	TCG	2	6	207398	207403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4026	NC_017999	GCG	2	6	207439	207444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936091
4027	NC_017999	TCG	2	6	207479	207484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4028	NC_017999	ATG	2	6	207490	207495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936091
4029	NC_017999	GCC	3	9	207565	207573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936091
4030	NC_017999	GATG	2	8	207606	207613	25 %	25 %	50 %	0 %	390936091
4031	NC_017999	GCACG	2	10	207659	207668	20 %	0 %	40 %	40 %	390936091
4032	NC_017999	CG	3	6	207703	207708	0 %	0 %	50 %	50 %	390936091
4033	NC_017999	CCG	2	6	207716	207721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936091
4034	NC_017999	GCT	2	6	207747	207752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4035	NC_017999	CGGC	2	8	207764	207771	0 %	0 %	50 %	50 %	390936091
4036	NC_017999	GCG	2	6	207788	207793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936091
4037	NC_017999	ATC	2	6	207841	207846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936091
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4039	NC_017999	TCG	2	6	207890	207895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4040	NC_017999	ACC	2	6	207916	207921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936091
4041	NC_017999	CTG	2	6	207931	207936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4042	NC_017999	CGG	2	6	207957	207962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936091
4043	NC_017999	CTCCAT	2	12	207963	207974	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390936091
4044	NC_017999	CGA	2	6	208104	208109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936091
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4046	NC_017999	GAC	2	6	208189	208194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936091
4047	NC_017999	GCT	2	6	208224	208229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936091
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4049	NC_017999	GAA	2	6	208309	208314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936091
4050	NC_017999	CCA	2	6	208382	208387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936091
4051	NC_017999	CGG	2	6	208463	208468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936091
4052	NC_017999	ACA	2	6	208490	208495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936091
4053	NC_017999	TGG	2	6	209388	209393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936092
4054	NC_017999	TGC	2	6	209415	209420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4055	NC_017999	ACG	2	6	209456	209461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4056	NC_017999	TCC	2	6	209486	209491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936092
4057	NC_017999	CTCC	2	8	209508	209515	0 %	25 %	0 %	75 %	390936092
4058	NC_017999	CGAG	2	8	209541	209548	25 %	0 %	50 %	25 %	390936092
4059	NC_017999	ACC	2	6	209648	209653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936092
4060	NC_017999	CTG	2	6	209669	209674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4061	NC_017999	CACCGA	2	12	209761	209772	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	390936092
4062	NC_017999	ACC	2	6	209798	209803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936092
4063	NC_017999	GCG	2	6	209829	209834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936092
4064	NC_017999	CTC	2	6	209881	209886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936092
4065	NC_017999	TCG	2	6	209889	209894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4066	NC_017999	GTACG	2	10	209914	209923	20 %	20 %	40 %	20 %	390936092
4067	NC_017999	AAG	2	6	209969	209974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936092
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4069	NC_017999	AAG	2	6	210023	210028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936092
4070	NC_017999	TCA	2	6	210030	210035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936092
4071	NC_017999	AAG	2	6	210056	210061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936092
4072	NC_017999	ACG	2	6	210092	210097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4077	NC_017999	GC	3	6	210243	210248	0 %	0 %	50 %	50 %	390936092
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4093	NC_017999	GAC	2	6	211124	211129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4099	NC_017999	ACC	2	6	211223	211228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936092
4100	NC_017999	CGGCAA	2	12	211237	211248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4101	NC_017999	CGG	2	6	211252	211257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936092
4102	NC_017999	GAG	2	6	211301	211306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936092
4103	NC_017999	CGG	2	6	211318	211323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936092
4104	NC_017999	CGG	2	6	211348	211353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936092
4105	NC_017999	CAA	2	6	211354	211359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936092
4106	NC_017999	GC	4	8	211390	211397	0 %	0 %	50 %	50 %	390936092
4107	NC_017999	CAA	2	6	211399	211404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936092
4108	NC_017999	CGG	2	6	211450	211455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936092
4109	NC_017999	ACGAC	2	10	211521	211530	40 %	0 %	20 %	40 %	390936092
4110	NC_017999	CCG	2	6	211543	211548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936092
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4112	NC_017999	GCAAGG	2	12	211563	211574	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390936092
4113	NC_017999	CG	3	6	211611	211616	0 %	0 %	50 %	50 %	390936092
4114	NC_017999	CGCC	2	8	211651	211658	0 %	0 %	25 %	75 %	390936092
4115	NC_017999	ACT	2	6	211716	211721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936092
4116	NC_017999	ACG	2	6	211739	211744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4118	NC_017999	CTG	2	6	211793	211798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4119	NC_017999	GTC	2	6	211817	211822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
4120	NC_017999	CGC	3	9	211909	211917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936092
4121	NC_017999	CCG	3	9	211962	211970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936092
4122	NC_017999	CGC	2	6	212005	212010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936092
4123	NC_017999	CAA	2	6	212011	212016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936092
4124	NC_017999	CCG	2	6	212025	212030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936092
4125	NC_017999	GCT	2	6	212134	212139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4129	NC_017999	GGTC	2	8	212277	212284	0 %	25 %	50 %	25 %	390936092
4130	NC_017999	GAC	2	6	212291	212296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4144	NC_017999	GCT	2	6	213204	213209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936092
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4220	NC_017999	GCCG	2	8	216456	216463	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
4221	NC_017999	CGG	2	6	216468	216473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936094
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4228	NC_017999	CGA	2	6	216666	216671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
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4240	NC_017999	CAT	2	6	217314	217319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936094
4241	NC_017999	CGC	2	6	217320	217325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
4242	NC_017999	CGC	2	6	217410	217415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
4243	NC_017999	CGA	2	6	217419	217424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
4244	NC_017999	CG	3	6	217431	217436	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
4245	NC_017999	CGA	2	6	217449	217454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
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4272	NC_017999	CGCT	2	8	218244	218251	0 %	25 %	25 %	50 %	390936095
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4361	NC_017999	TCA	2	6	222937	222942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936099
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4464	NC_017999	GGC	2	6	229704	229709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936104
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4466	NC_017999	GCT	2	6	229769	229774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
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4472	NC_017999	CGA	2	6	229952	229957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936104
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4477	NC_017999	GCG	2	6	230110	230115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936104
4478	NC_017999	CAA	2	6	230231	230236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936104
4479	NC_017999	ACC	2	6	230275	230280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936104
4480	NC_017999	ACT	2	6	230314	230319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936104
4481	NC_017999	GAT	2	6	230375	230380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936104
4482	NC_017999	TCGACA	2	12	230425	230436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390936104
4483	NC_017999	GACC	2	8	230555	230562	25 %	0 %	25 %	50 %	390936104
4484	NC_017999	GTC	2	6	230571	230576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
4485	NC_017999	CTCCG	2	10	230585	230594	0 %	20 %	20 %	60 %	390936104
4486	NC_017999	CG	3	6	230605	230610	0 %	0 %	50 %	50 %	390936104
4487	NC_017999	CTG	2	6	230616	230621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
4488	NC_017999	CTG	2	6	230649	230654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
4489	NC_017999	GAG	2	6	230661	230666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936104
4490	NC_017999	AGC	2	6	230695	230700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936104
4491	NC_017999	CCG	3	9	230710	230718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936104
4492	NC_017999	GCC	2	6	230730	230735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936104
4493	NC_017999	CGC	2	6	230738	230743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936104
4494	NC_017999	GGA	2	6	230813	230818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936104
4495	NC_017999	CGC	2	6	230887	230892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936104
4496	NC_017999	TCG	2	6	230911	230916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
4497	NC_017999	TGGT	2	8	231431	231438	0 %	50 %	50 %	0 %	390936105
4498	NC_017999	TTG	2	6	231474	231479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936105
4499	NC_017999	ATG	2	6	231504	231509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936105
4500	NC_017999	CAG	2	6	231545	231550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936105

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