MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017999	GCC	2	6	156044	156049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936048
3002	NC_017999	CCA	2	6	156066	156071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936048
3003	NC_017999	CGA	2	6	156116	156121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936048
3004	NC_017999	GCC	2	6	156137	156142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936048
3005	NC_017999	GCCGC	2	10	156147	156156	0 %	0 %	40 %	60 %	390936048
3006	NC_017999	CG	3	6	156197	156202	0 %	0 %	50 %	50 %	390936048
3007	NC_017999	CCCG	2	8	156208	156215	0 %	0 %	25 %	75 %	390936048
3008	NC_017999	GC	3	6	156453	156458	0 %	0 %	50 %	50 %	390936049
3009	NC_017999	CGG	2	6	156461	156466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3010	NC_017999	CGCTG	2	10	156512	156521	0 %	20 %	40 %	40 %	390936049
3011	NC_017999	TGCCGA	2	12	156530	156541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3012	NC_017999	CAT	2	6	156551	156556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936049
3013	NC_017999	GCG	2	6	156571	156576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3014	NC_017999	CA	3	6	156687	156692	50 %	0 %	0 %	50 %	390936049
3015	NC_017999	CTG	2	6	156735	156740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3016	NC_017999	GCT	2	6	156848	156853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3017	NC_017999	CGC	2	6	156866	156871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936049
3018	NC_017999	GC	3	6	156870	156875	0 %	0 %	50 %	50 %	390936049
3019	NC_017999	GAAATC	2	12	156885	156896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390936049
3020	NC_017999	CGG	2	6	156905	156910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3021	NC_017999	GCCG	2	8	156959	156966	0 %	0 %	50 %	50 %	390936049
3022	NC_017999	GGC	2	6	157109	157114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3023	NC_017999	GTG	2	6	157122	157127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936049
3024	NC_017999	CCG	3	9	157144	157152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936049
3025	NC_017999	CGG	2	6	157199	157204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3026	NC_017999	GCGGT	2	10	157236	157245	0 %	20 %	60 %	20 %	390936049
3027	NC_017999	CGT	2	6	157250	157255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3028	NC_017999	GAA	2	6	157364	157369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936049
3029	NC_017999	GGC	2	6	157415	157420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936049
3030	NC_017999	CGT	2	6	157424	157429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3031	NC_017999	AGC	2	6	157441	157446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936049
3032	NC_017999	CCG	2	6	157453	157458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936049
3033	NC_017999	CGA	2	6	157800	157805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3034	NC_017999	AGGCAA	2	12	157806	157817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390936050
3035	NC_017999	CGG	2	6	157866	157871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936050
3036	NC_017999	CAA	2	6	157872	157877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936050
3037	NC_017999	CTG	2	6	157924	157929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3038	NC_017999	CAT	2	6	157938	157943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936050
3039	NC_017999	CGT	3	9	157977	157985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3040	NC_017999	GAG	2	6	158005	158010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936050
3041	NC_017999	CTG	2	6	158050	158055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3042	NC_017999	GTGA	2	8	158056	158063	25 %	25 %	50 %	0 %	390936050
3043	NC_017999	CAC	2	6	158142	158147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936050
3044	NC_017999	CGGCC	2	10	158160	158169	0 %	0 %	40 %	60 %	390936050
3045	NC_017999	AGA	2	6	158261	158266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936050
3046	NC_017999	GACCA	2	10	158311	158320	40 %	0 %	20 %	40 %	390936050
3047	NC_017999	GCT	2	6	158328	158333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3048	NC_017999	CGA	2	6	158397	158402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3049	NC_017999	TCC	2	6	158479	158484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936050
3050	NC_017999	CCG	2	6	158492	158497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936050
3051	NC_017999	GCG	2	6	158498	158503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936050
3052	NC_017999	GCACCG	2	12	158507	158518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390936050
3053	NC_017999	CCA	2	6	158528	158533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936050
3054	NC_017999	CGA	2	6	158610	158615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3055	NC_017999	CAG	2	6	158635	158640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3056	NC_017999	ACC	2	6	158659	158664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936050
3057	NC_017999	CGC	2	6	158674	158679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936050
3058	NC_017999	GCCA	2	8	158713	158720	25 %	0 %	25 %	50 %	390936050
3059	NC_017999	GACC	2	8	158733	158740	25 %	0 %	25 %	50 %	390936050
3060	NC_017999	ACG	2	6	158822	158827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3061	NC_017999	GCC	2	6	158845	158850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936050
3062	NC_017999	CTG	2	6	158855	158860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3063	NC_017999	CGA	2	6	158922	158927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936050
3064	NC_017999	CGC	2	6	158934	158939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936050
3065	NC_017999	CAT	2	6	159021	159026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936050
3066	NC_017999	CTC	2	6	159152	159157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936051
3067	NC_017999	GGC	2	6	159174	159179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936051
3068	NC_017999	CGC	2	6	159182	159187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936051
3069	NC_017999	GACTC	2	10	159249	159258	20 %	20 %	20 %	40 %	390936051
3070	NC_017999	CGC	2	6	159278	159283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936051
3071	NC_017999	CAC	2	6	159373	159378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936051
3072	NC_017999	TTCCA	2	10	159380	159389	20 %	40 %	0 %	40 %	390936051
3073	NC_017999	TGG	2	6	159451	159456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936051
3074	NC_017999	TCG	2	6	159460	159465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936051
3075	NC_017999	TTC	2	6	159471	159476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936051
3076	NC_017999	CGATA	2	10	159484	159493	40 %	20 %	20 %	20 %	390936051
3077	NC_017999	GCT	2	6	159503	159508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936051
3078	NC_017999	CGC	2	6	159596	159601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936051
3079	NC_017999	GGC	2	6	159623	159628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936051
3080	NC_017999	GGCATG	2	12	159672	159683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390936051
3081	NC_017999	GCG	2	6	159685	159690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936051
3082	NC_017999	GAT	3	9	159710	159718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936051
3083	NC_017999	GC	3	6	159737	159742	0 %	0 %	50 %	50 %	390936051
3084	NC_017999	GCT	2	6	159773	159778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936051
3085	NC_017999	ATC	2	6	159798	159803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936051
3086	NC_017999	GC	3	6	159852	159857	0 %	0 %	50 %	50 %	390936051
3087	NC_017999	GTG	2	6	159858	159863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936051
3088	NC_017999	CG	3	6	159867	159872	0 %	0 %	50 %	50 %	390936051
3089	NC_017999	GCC	2	6	159888	159893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936051
3090	NC_017999	TCCG	2	8	159899	159906	0 %	25 %	25 %	50 %	390936051
3091	NC_017999	CGA	2	6	159980	159985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936051
3092	NC_017999	CGT	2	6	159997	160002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936051
3093	NC_017999	GCG	2	6	160094	160099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936052
3094	NC_017999	GGT	2	6	160145	160150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936052
3095	NC_017999	CG	3	6	160156	160161	0 %	0 %	50 %	50 %	390936052
3096	NC_017999	TCA	3	9	160178	160186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936052
3097	NC_017999	TTC	2	6	160201	160206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936052
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3099	NC_017999	TCG	2	6	160252	160257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936052
3100	NC_017999	CTG	2	6	160261	160266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936052
3101	NC_017999	TCGC	2	8	160327	160334	0 %	25 %	25 %	50 %	390936052
3102	NC_017999	CGC	2	6	160350	160355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936052
3103	NC_017999	GCC	2	6	160357	160362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936052
3104	NC_017999	ATG	2	6	160372	160377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936052
3105	NC_017999	GGT	2	6	160392	160397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936052
3106	NC_017999	GT	4	8	160396	160403	0 %	50 %	50 %	0 %	390936052
3107	NC_017999	TGG	2	6	160658	160663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936053
3108	NC_017999	TGCG	2	8	160718	160725	0 %	25 %	50 %	25 %	390936053
3109	NC_017999	CCA	2	6	160799	160804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936053
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3111	NC_017999	GGC	2	6	160830	160835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936053
3112	NC_017999	CCG	2	6	160932	160937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936053
3113	NC_017999	ATG	2	6	160942	160947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936053
3114	NC_017999	GGC	2	6	160962	160967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936053
3115	NC_017999	TCGG	2	8	161003	161010	0 %	25 %	50 %	25 %	390936053
3116	NC_017999	TCGG	2	8	161053	161060	0 %	25 %	50 %	25 %	390936053
3117	NC_017999	GGGC	2	8	161076	161083	0 %	0 %	75 %	25 %	390936053
3118	NC_017999	GGC	2	6	161137	161142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936053
3119	NC_017999	GCAG	2	8	161147	161154	25 %	0 %	50 %	25 %	390936053
3120	NC_017999	GCC	2	6	161395	161400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936053
3121	NC_017999	TGC	2	6	161401	161406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936053
3122	NC_017999	AGG	2	6	161411	161416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936053
3123	NC_017999	CGC	2	6	161422	161427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936053
3124	NC_017999	GTC	2	6	161455	161460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936053
3125	NC_017999	ATG	2	6	161465	161470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936053
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3127	NC_017999	ATG	2	6	161557	161562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936053
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3129	NC_017999	TGC	2	6	161730	161735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936054
3130	NC_017999	ACG	2	6	161757	161762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936054
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3132	NC_017999	GCC	3	9	161801	161809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936054
3133	NC_017999	CAT	2	6	161893	161898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936054
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3135	NC_017999	TAC	2	6	161978	161983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936054
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3137	NC_017999	GCC	2	6	162051	162056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936054
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3139	NC_017999	ACGCG	2	10	162098	162107	20 %	0 %	40 %	40 %	390936054
3140	NC_017999	GAT	2	6	162217	162222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936055
3141	NC_017999	CAG	2	6	162223	162228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936055
3142	NC_017999	CGAA	2	8	162233	162240	50 %	0 %	25 %	25 %	390936055
3143	NC_017999	GAT	2	6	162292	162297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936055
3144	NC_017999	CGG	2	6	162443	162448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936055
3145	NC_017999	CGG	2	6	162467	162472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936055
3146	NC_017999	GGT	2	6	162513	162518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936055
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3148	NC_017999	CG	3	6	162688	162693	0 %	0 %	50 %	50 %	390936055
3149	NC_017999	GGC	2	6	162706	162711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936055
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3151	NC_017999	GTT	2	6	162799	162804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936055
3152	NC_017999	CGT	3	9	162813	162821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936055
3153	NC_017999	CGT	2	6	162840	162845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936055
3154	NC_017999	CG	3	6	162866	162871	0 %	0 %	50 %	50 %	390936055
3155	NC_017999	ATC	2	6	162898	162903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936055
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3162	NC_017999	TCCG	2	8	163058	163065	0 %	25 %	25 %	50 %	390936055
3163	NC_017999	GC	4	8	163074	163081	0 %	0 %	50 %	50 %	390936055
3164	NC_017999	CGT	2	6	163137	163142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936055
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3193	NC_017999	CTG	2	6	164895	164900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936056
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3232	NC_017999	GTC	2	6	166550	166555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936057
3233	NC_017999	GC	3	6	166630	166635	0 %	0 %	50 %	50 %	390936057
3234	NC_017999	GAC	2	6	166648	166653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936057
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3237	NC_017999	ACC	2	6	166716	166721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936057
3238	NC_017999	GGT	2	6	166829	166834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936057
3239	NC_017999	TCA	2	6	166896	166901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936057
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3360	NC_017999	GTC	2	6	173254	173259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936061
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3481	NC_017999	CTCG	2	8	179072	179079	0 %	25 %	25 %	50 %	390936066
3482	NC_017999	TTC	2	6	179094	179099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936066
3483	NC_017999	CGAC	2	8	179161	179168	25 %	0 %	25 %	50 %	390936066
3484	NC_017999	CGA	2	6	179183	179188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936066
3485	NC_017999	AGC	2	6	179245	179250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936066
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