MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017999	GCC	2	6	50376	50381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1002	NC_017999	GCT	2	6	50405	50410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1003	NC_017999	GCA	2	6	50426	50431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1004	NC_017999	GCC	2	6	50478	50483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1005	NC_017999	GCG	3	9	50484	50492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935958
1006	NC_017999	GGC	2	6	50493	50498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935958
1007	NC_017999	CAG	2	6	50519	50524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1008	NC_017999	CGG	2	6	50566	50571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935958
1009	NC_017999	GCT	2	6	50576	50581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1010	NC_017999	CGG	3	9	50804	50812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935958
1011	NC_017999	TCG	2	6	50836	50841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1012	NC_017999	CGCC	2	8	50879	50886	0 %	0 %	25 %	75 %	390935958
1013	NC_017999	TTC	2	6	50898	50903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935958
1014	NC_017999	GGC	2	6	51051	51056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935958
1015	NC_017999	CAT	2	6	51116	51121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935958
1016	NC_017999	CGC	2	6	51277	51282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1017	NC_017999	CGC	2	6	51299	51304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1018	NC_017999	GCCG	2	8	51359	51366	0 %	0 %	50 %	50 %	390935958
1019	NC_017999	GC	3	6	51385	51390	0 %	0 %	50 %	50 %	390935958
1020	NC_017999	CCG	2	6	51424	51429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1021	NC_017999	CTG	2	6	51441	51446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935958
1022	NC_017999	CCG	2	6	51447	51452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935958
1023	NC_017999	TCA	2	6	51496	51501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935958
1024	NC_017999	CTGC	2	8	51602	51609	0 %	25 %	25 %	50 %	390935958
1025	NC_017999	CGC	2	6	51789	51794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935959
1026	NC_017999	TCC	2	6	51814	51819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935959
1027	NC_017999	CTG	2	6	51899	51904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935959
1028	NC_017999	GCC	2	6	51910	51915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935959
1029	NC_017999	GC	3	6	51924	51929	0 %	0 %	50 %	50 %	390935959
1030	NC_017999	GCG	2	6	52016	52021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935959
1031	NC_017999	TGA	2	6	52118	52123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935959
1032	NC_017999	CCG	2	6	52196	52201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935959
1033	NC_017999	GT	3	6	52239	52244	0 %	50 %	50 %	0 %	390935959
1034	NC_017999	CGC	3	9	52248	52256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935959
1035	NC_017999	ATGGC	2	10	52288	52297	20 %	20 %	40 %	20 %	390935959
1036	NC_017999	AT	3	6	52388	52393	50 %	50 %	0 %	0 %	390935959
1037	NC_017999	ATC	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935959
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1039	NC_017999	CGCC	2	8	52550	52557	0 %	0 %	25 %	75 %	390935959
1040	NC_017999	CG	3	6	52634	52639	0 %	0 %	50 %	50 %	390935959
1041	NC_017999	CGC	2	6	52650	52655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935959
1042	NC_017999	CGG	2	6	52663	52668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935959
1043	NC_017999	GCGG	2	8	52725	52732	0 %	0 %	75 %	25 %	390935959
1044	NC_017999	TCC	3	9	52768	52776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935959
1045	NC_017999	GCAGC	2	10	53479	53488	20 %	0 %	40 %	40 %	390935960
1046	NC_017999	GCC	2	6	53497	53502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935960
1047	NC_017999	GTC	2	6	53591	53596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1048	NC_017999	TCG	2	6	53622	53627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1049	NC_017999	GTC	2	6	53663	53668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1050	NC_017999	ATG	2	6	53765	53770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935960
1051	NC_017999	GAC	2	6	53794	53799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1052	NC_017999	GAG	2	6	53804	53809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935960
1053	NC_017999	GCC	2	6	53868	53873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935960
1054	NC_017999	GCGT	2	8	53908	53915	0 %	25 %	50 %	25 %	390935960
1055	NC_017999	AGG	2	6	53928	53933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935960
1056	NC_017999	TCG	2	6	53942	53947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1057	NC_017999	CGG	2	6	54131	54136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935960
1058	NC_017999	TGA	2	6	54193	54198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935960
1059	NC_017999	AGG	2	6	54243	54248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935960
1060	NC_017999	CTG	2	6	54356	54361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935960
1061	NC_017999	GCG	2	6	55021	55026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
1062	NC_017999	GC	3	6	55080	55085	0 %	0 %	50 %	50 %	390935961
1063	NC_017999	CGG	2	6	55107	55112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
1064	NC_017999	CGG	2	6	55146	55151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
1065	NC_017999	CAG	2	6	55156	55161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935961
1066	NC_017999	GCGG	2	8	55173	55180	0 %	0 %	75 %	25 %	390935961
1067	NC_017999	TCGG	2	8	55214	55221	0 %	25 %	50 %	25 %	390935961
1068	NC_017999	CTT	2	6	55225	55230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935961
1069	NC_017999	CGG	2	6	55251	55256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
1070	NC_017999	ATG	2	6	55268	55273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935961
1071	NC_017999	CGG	2	6	55344	55349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
1072	NC_017999	TTC	2	6	55367	55372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935961
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1079	NC_017999	CAT	2	6	55645	55650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935961
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1081	NC_017999	CGG	2	6	55671	55676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935961
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1088	NC_017999	CTT	2	6	55921	55926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935961
1089	NC_017999	TGC	2	6	55973	55978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935961
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1091	NC_017999	ACC	2	6	56196	56201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935962
1092	NC_017999	ATG	2	6	56299	56304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935962
1093	NC_017999	CGC	2	6	56309	56314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935962
1094	NC_017999	GCG	2	6	56385	56390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935962
1095	NC_017999	GCCG	2	8	56411	56418	0 %	0 %	50 %	50 %	390935962
1096	NC_017999	CCCATG	2	12	56475	56486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390935962
1097	NC_017999	AAG	2	6	56505	56510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935962
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1099	NC_017999	CTG	3	9	56746	56754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935963
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1101	NC_017999	GGCG	2	8	56808	56815	0 %	0 %	75 %	25 %	390935963
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1105	NC_017999	CG	3	6	57142	57147	0 %	0 %	50 %	50 %	390935963
1106	NC_017999	GCG	2	6	57162	57167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935963
1107	NC_017999	GTC	2	6	57186	57191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935963
1108	NC_017999	GAC	2	6	57210	57215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935963
1109	NC_017999	GCC	2	6	57216	57221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935963
1110	NC_017999	GGC	2	6	57471	57476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935964
1111	NC_017999	GCA	2	6	57561	57566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935964
1112	NC_017999	CCCATA	2	12	57612	57623	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390935964
1113	NC_017999	TGC	2	6	57659	57664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935964
1114	NC_017999	ACG	2	6	57702	57707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935964
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1118	NC_017999	ATC	2	6	57881	57886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935964
1119	NC_017999	GCGG	2	8	57893	57900	0 %	0 %	75 %	25 %	390935964
1120	NC_017999	CAC	2	6	57934	57939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935964
1121	NC_017999	CTG	2	6	57947	57952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935964
1122	NC_017999	TGA	2	6	57962	57967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935964
1123	NC_017999	CGG	2	6	58160	58165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935965
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