MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017999	CGCGCC	2	12	25741	25752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
502	NC_017999	CGG	2	6	25779	25784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935939
503	NC_017999	GAT	2	6	25792	25797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
504	NC_017999	GTC	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
505	NC_017999	GCT	2	6	25831	25836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
506	NC_017999	GCC	2	6	25840	25845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
507	NC_017999	GTT	2	6	25846	25851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
508	NC_017999	GCCG	2	8	25867	25874	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
509	NC_017999	GGT	2	6	25918	25923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
510	NC_017999	GGCGTC	2	12	25936	25947	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390935939
511	NC_017999	GCT	2	6	25985	25990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
512	NC_017999	GCC	2	6	26000	26005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
513	NC_017999	T	6	6	26607	26612	0 %	100 %	0 %	0 %	390935940
514	NC_017999	TCG	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935940
515	NC_017999	TG	3	6	26641	26646	0 %	50 %	50 %	0 %	390935940
516	NC_017999	GAT	2	6	26874	26879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935941
517	NC_017999	GAT	2	6	26979	26984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935941
518	NC_017999	GCG	2	6	26991	26996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
519	NC_017999	TGG	2	6	27031	27036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935941
520	NC_017999	TCA	2	6	27106	27111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
521	NC_017999	CGT	2	6	27182	27187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
522	NC_017999	CGG	2	6	27188	27193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
523	NC_017999	ATC	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
524	NC_017999	GC	3	6	27250	27255	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
525	NC_017999	CTA	2	6	27308	27313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
526	NC_017999	CG	3	6	27325	27330	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
527	NC_017999	GTACAA	2	12	27383	27394	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390935941
528	NC_017999	CGA	2	6	27431	27436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935941
529	NC_017999	CAT	2	6	27482	27487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
530	NC_017999	CGA	2	6	27494	27499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935941
531	NC_017999	GC	3	6	27505	27510	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
532	NC_017999	CG	3	6	27574	27579	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
533	NC_017999	CAC	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935941
534	NC_017999	GCG	2	6	27748	27753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
535	NC_017999	CGC	2	6	27801	27806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
536	NC_017999	GCT	2	6	27944	27949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
537	NC_017999	TCG	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
538	NC_017999	CGG	2	6	28030	28035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
539	NC_017999	GCT	2	6	28052	28057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
540	NC_017999	CGA	2	6	28067	28072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935941
541	NC_017999	AAC	2	6	28080	28085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935941
542	NC_017999	CG	3	6	28097	28102	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
543	NC_017999	GC	3	6	28204	28209	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
544	NC_017999	GCG	2	6	28255	28260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
545	NC_017999	GAA	2	6	28266	28271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935941
546	NC_017999	CTG	2	6	28276	28281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
547	NC_017999	ATGCCG	2	12	28288	28299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390935941
548	NC_017999	CCG	3	9	28297	28305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
549	NC_017999	GCC	2	6	28326	28331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
550	NC_017999	CGA	2	6	28376	28381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935941
551	NC_017999	GC	3	6	28414	28419	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
552	NC_017999	CGGC	2	8	28420	28427	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
553	NC_017999	GGC	2	6	28491	28496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
554	NC_017999	GCC	2	6	28518	28523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
555	NC_017999	GACG	2	8	28581	28588	25 %	0 %	50 %	25 %	390935941
556	NC_017999	CGGG	2	8	28649	28656	0 %	0 %	75 %	25 %	390935941
557	NC_017999	CTG	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
558	NC_017999	TGA	2	6	28691	28696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935941
559	NC_017999	TGC	2	6	28711	28716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
560	NC_017999	CGC	2	6	28726	28731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
561	NC_017999	CG	3	6	28740	28745	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
562	NC_017999	GCT	2	6	28763	28768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
563	NC_017999	GCC	3	9	28791	28799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
564	NC_017999	GCC	2	6	28851	28856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935941
565	NC_017999	GCG	2	6	28901	28906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
566	NC_017999	TCA	2	6	28915	28920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
567	NC_017999	CG	3	6	28944	28949	0 %	0 %	50 %	50 %	390935941
568	NC_017999	CGGAAT	2	12	29083	29094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390935941
569	NC_017999	TCG	3	9	29627	29635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
570	NC_017999	GCG	2	6	29697	29702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
571	NC_017999	TGC	2	6	29733	29738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
572	NC_017999	TGA	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935942
573	NC_017999	CGG	2	6	29788	29793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
574	NC_017999	CGA	2	6	29800	29805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935942
575	NC_017999	GCG	2	6	29808	29813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
576	NC_017999	GCC	2	6	29825	29830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935942
577	NC_017999	TGACCT	2	12	29853	29864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390935942
578	NC_017999	TCG	2	6	29921	29926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
579	NC_017999	CGT	2	6	29982	29987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
580	NC_017999	TCA	2	6	30039	30044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935942
581	NC_017999	CGG	2	6	30087	30092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
582	NC_017999	TCG	2	6	30185	30190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
583	NC_017999	GCG	2	6	30294	30299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
584	NC_017999	ACC	2	6	30305	30310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935942
585	NC_017999	CGG	2	6	30323	30328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
586	NC_017999	GTC	2	6	30367	30372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935942
587	NC_017999	CAG	3	9	30382	30390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935942
588	NC_017999	GTCG	2	8	30451	30458	0 %	25 %	50 %	25 %	390935942
589	NC_017999	ATG	2	6	30467	30472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935942
590	NC_017999	GGC	2	6	30511	30516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
591	NC_017999	CCG	2	6	30543	30548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935942
592	NC_017999	TGT	2	6	30570	30575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935942
593	NC_017999	GCG	2	6	30586	30591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
594	NC_017999	CG	3	6	30627	30632	0 %	0 %	50 %	50 %	390935942
595	NC_017999	GCG	2	6	30638	30643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935942
596	NC_017999	TGG	2	6	31102	31107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935943
597	NC_017999	CAC	2	6	31118	31123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935943
598	NC_017999	GAT	2	6	31142	31147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935943
599	NC_017999	TCGCGC	2	12	31195	31206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390935943
600	NC_017999	CCCG	2	8	31210	31217	0 %	0 %	25 %	75 %	390935943
601	NC_017999	CAA	2	6	31280	31285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935943
602	NC_017999	AAG	2	6	31386	31391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935943
603	NC_017999	ATGTCA	2	12	31666	31677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390935944
604	NC_017999	CCG	2	6	31738	31743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935944
605	NC_017999	CAC	3	9	31766	31774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935944
606	NC_017999	TCA	2	6	31786	31791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935944
607	NC_017999	CGA	2	6	31808	31813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935944
608	NC_017999	CAT	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935945
609	NC_017999	AGCGC	2	10	32016	32025	20 %	0 %	40 %	40 %	390935945
610	NC_017999	GGC	2	6	32053	32058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935945
611	NC_017999	CGT	2	6	32092	32097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935945
612	NC_017999	GC	3	6	32145	32150	0 %	0 %	50 %	50 %	390935945
613	NC_017999	CGT	2	6	32155	32160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935945
614	NC_017999	CCA	2	6	32163	32168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935945
615	NC_017999	TCA	2	6	32175	32180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935945
616	NC_017999	CCAG	2	8	32193	32200	25 %	0 %	25 %	50 %	390935945
617	NC_017999	CCT	2	6	32208	32213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935945
618	NC_017999	CAT	2	6	32221	32226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935945
619	NC_017999	TGC	3	9	32247	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935945
620	NC_017999	CG	3	6	32257	32262	0 %	0 %	50 %	50 %	390935945
621	NC_017999	CCA	2	6	32296	32301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935945
622	NC_017999	CCA	2	6	32316	32321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935945
623	NC_017999	GTG	2	6	32330	32335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935945
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625	NC_017999	GCT	2	6	32365	32370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935945
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