MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017999	CTG	2	6	256832	256837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936124
5002	NC_017999	CGC	2	6	256889	256894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936124
5003	NC_017999	CGT	2	6	257124	257129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936125
5004	NC_017999	CGA	2	6	257217	257222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936125
5005	NC_017999	CGC	2	6	257238	257243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936125
5006	NC_017999	TCCA	2	8	257259	257266	25 %	25 %	0 %	50 %	390936125
5007	NC_017999	GCC	2	6	257377	257382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936125
5008	NC_017999	ATCGG	2	10	257450	257459	20 %	20 %	40 %	20 %	390936125
5009	NC_017999	GT	3	6	257488	257493	0 %	50 %	50 %	0 %	390936125
5010	NC_017999	CGT	2	6	257523	257528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936125
5011	NC_017999	ATA	2	6	257533	257538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390936125
5012	NC_017999	CGG	2	6	257578	257583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936125
5013	NC_017999	AGA	2	6	257595	257600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936125
5014	NC_017999	CTT	2	6	258146	258151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936126
5015	NC_017999	GGT	2	6	258158	258163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
5016	NC_017999	GAC	2	6	258173	258178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
5017	NC_017999	CG	3	6	258225	258230	0 %	0 %	50 %	50 %	390936126
5018	NC_017999	GGCT	2	8	258273	258280	0 %	25 %	50 %	25 %	390936126
5019	NC_017999	TGG	2	6	258283	258288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
5020	NC_017999	CGA	2	6	258334	258339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
5021	NC_017999	CGT	2	6	258406	258411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936126
5022	NC_017999	GGC	2	6	258440	258445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936126
5023	NC_017999	TGA	2	6	258604	258609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
5024	NC_017999	TGA	2	6	258634	258639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
5025	NC_017999	CCG	2	6	258660	258665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936126
5026	NC_017999	T	6	6	258760	258765	0 %	100 %	0 %	0 %	390936126
5027	NC_017999	CAG	2	6	258785	258790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
5028	NC_017999	CCCG	2	8	258853	258860	0 %	0 %	25 %	75 %	390936126
5029	NC_017999	GTGATG	2	12	258867	258878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390936126
5030	NC_017999	ATC	2	6	258918	258923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936126
5031	NC_017999	GTG	2	6	258984	258989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
5032	NC_017999	GA	3	6	258992	258997	50 %	0 %	50 %	0 %	390936126
5033	NC_017999	TCC	2	6	259014	259019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936126
5034	NC_017999	GC	3	6	259034	259039	0 %	0 %	50 %	50 %	390936126
5035	NC_017999	TGA	2	6	259072	259077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
5036	NC_017999	T	6	6	259136	259141	0 %	100 %	0 %	0 %	390936126
5037	NC_017999	CAT	2	6	259357	259362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936127
5038	NC_017999	TCGGAC	2	12	259409	259420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936127
5039	NC_017999	CGT	2	6	259455	259460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936127
5040	NC_017999	CAC	2	6	259464	259469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936127
5041	NC_017999	GGA	2	6	259659	259664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936128
5042	NC_017999	GC	3	6	259700	259705	0 %	0 %	50 %	50 %	390936128
5043	NC_017999	GCC	2	6	259722	259727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936128
5044	NC_017999	CAT	2	6	259751	259756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936128
5045	NC_017999	CG	3	6	259810	259815	0 %	0 %	50 %	50 %	390936128
5046	NC_017999	CAA	2	6	259856	259861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936128
5047	NC_017999	CGG	2	6	259889	259894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936128
5048	NC_017999	GAT	2	6	259962	259967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936128
5049	NC_017999	GCC	2	6	260085	260090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936128
5050	NC_017999	CAT	2	6	260173	260178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936129
5051	NC_017999	GTC	2	6	260201	260206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5052	NC_017999	CGG	2	6	260215	260220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936129
5053	NC_017999	AGG	2	6	260262	260267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936129
5054	NC_017999	CGA	2	6	260293	260298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5055	NC_017999	GCC	2	6	260303	260308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936129
5056	NC_017999	CGA	2	6	260380	260385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5057	NC_017999	TCG	2	6	260397	260402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5058	NC_017999	CAA	2	6	260443	260448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936129
5059	NC_017999	ACCTCG	2	12	260466	260477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390936129
5060	NC_017999	TCG	2	6	260586	260591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5061	NC_017999	CGC	2	6	260641	260646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936129
5062	NC_017999	ACG	2	6	260688	260693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5063	NC_017999	AAC	2	6	260723	260728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936129
5064	NC_017999	CCA	2	6	260745	260750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936129
5065	NC_017999	AAC	2	6	260804	260809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936129
5066	NC_017999	ACT	2	6	260811	260816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936129
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5068	NC_017999	TCG	2	6	260886	260891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936129
5069	NC_017999	CGG	2	6	260899	260904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936129
5070	NC_017999	CGGC	2	8	260916	260923	0 %	0 %	50 %	50 %	390936129
5071	NC_017999	CCT	2	6	260975	260980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936129
5072	NC_017999	CGA	2	6	261032	261037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936129
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5074	NC_017999	CGT	2	6	261099	261104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936130
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5079	NC_017999	CGC	2	6	261279	261284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936130
5080	NC_017999	CGTC	2	8	261338	261345	0 %	25 %	25 %	50 %	390936130
5081	NC_017999	C	10	10	261347	261356	0 %	0 %	0 %	100 %	390936130
5082	NC_017999	CGA	2	6	261379	261384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936130
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5084	NC_017999	CGA	2	6	261405	261410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936130
5085	NC_017999	GAC	2	6	261797	261802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5086	NC_017999	CG	3	6	261851	261856	0 %	0 %	50 %	50 %	390936131
5087	NC_017999	CTG	2	6	261905	261910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5088	NC_017999	GAG	2	6	261971	261976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936131
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5090	NC_017999	CCGA	2	8	262052	262059	25 %	0 %	25 %	50 %	390936131
5091	NC_017999	CAT	2	6	262147	262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936131
5092	NC_017999	ACC	2	6	262176	262181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936131
5093	NC_017999	ACC	2	6	262230	262235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936131
5094	NC_017999	ACG	2	6	262313	262318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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5098	NC_017999	CG	3	6	262547	262552	0 %	0 %	50 %	50 %	390936131
5099	NC_017999	GAA	2	6	262558	262563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936131
5100	NC_017999	ATG	2	6	262601	262606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936131
5101	NC_017999	GTC	2	6	262676	262681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5102	NC_017999	CAC	2	6	262699	262704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936131
5103	NC_017999	CTT	2	6	262765	262770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936131
5104	NC_017999	CGT	2	6	262835	262840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5105	NC_017999	CGG	2	6	262876	262881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5106	NC_017999	GGC	2	6	262978	262983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5107	NC_017999	CTG	2	6	263014	263019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5108	NC_017999	CGTATT	2	12	263079	263090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390936131
5109	NC_017999	TCA	2	6	263136	263141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936131
5110	NC_017999	CGA	2	6	263173	263178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5111	NC_017999	GAG	2	6	263243	263248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936131
5112	NC_017999	GCG	2	6	263258	263263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5113	NC_017999	CGG	3	9	263284	263292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5114	NC_017999	CAG	2	6	263324	263329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5115	NC_017999	TTC	2	6	263342	263347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936131
5116	NC_017999	GAG	2	6	263375	263380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936131
5117	NC_017999	TCA	2	6	263436	263441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936131
5118	NC_017999	CCG	2	6	263442	263447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936131
5119	NC_017999	TGC	2	6	263469	263474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
5120	NC_017999	GCG	3	9	263517	263525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5121	NC_017999	GGC	2	6	263546	263551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5122	NC_017999	GCT	2	6	263605	263610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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5124	NC_017999	CGG	2	6	263620	263625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
5125	NC_017999	CTG	2	6	263711	263716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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5232	NC_017999	CG	3	6	268709	268714	0 %	0 %	50 %	50 %	390936136
5233	NC_017999	TGC	2	6	268741	268746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936136
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5236	NC_017999	GCCG	2	8	268829	268836	0 %	0 %	50 %	50 %	390936136
5237	NC_017999	CAG	2	6	268885	268890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936136
5238	NC_017999	ACG	2	6	268981	268986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936136
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5240	NC_017999	CGC	3	9	269042	269050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936136
5241	NC_017999	CGA	2	6	269111	269116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936136
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5361	NC_017999	CG	3	6	274635	274640	0 %	0 %	50 %	50 %	390936140
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5480	NC_017999	CGC	2	6	279925	279930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936145
5481	NC_017999	CGA	2	6	279958	279963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936145
5482	NC_017999	CAG	2	6	280048	280053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936146
5483	NC_017999	GCG	2	6	280055	280060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936146
5484	NC_017999	TCA	2	6	280095	280100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936146
5485	NC_017999	GCG	2	6	280142	280147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936146
5486	NC_017999	GCC	2	6	280178	280183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936146
5487	NC_017999	CAC	2	6	280186	280191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936146
5488	NC_017999	CGC	2	6	280209	280214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936146
5489	NC_017999	GAT	2	6	280249	280254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936146
5490	NC_017999	TTC	2	6	280268	280273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936146
5491	NC_017999	TACGGC	2	12	280276	280287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936146
5492	NC_017999	CTG	2	6	280312	280317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936146
5493	NC_017999	ATC	2	6	280361	280366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936146
5494	NC_017999	GCC	2	6	280462	280467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936146
5495	NC_017999	CAG	2	6	280480	280485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936146
5496	NC_017999	GCT	2	6	280500	280505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936146
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5498	NC_017999	CTG	2	6	280582	280587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936146
5499	NC_017999	TGT	2	6	280653	280658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936146
5500	NC_017999	GC	3	6	280683	280688	0 %	0 %	50 %	50 %	390936146

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