MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017999	GAAT	2	8	231561	231568	50 %	25 %	25 %	0 %	390936105
4502	NC_017999	GCC	2	6	231647	231652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936105
4503	NC_017999	CCT	2	6	231700	231705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936105
4504	NC_017999	GGC	2	6	231717	231722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936105
4505	NC_017999	GCC	2	6	231816	231821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936105
4506	NC_017999	TCGT	2	8	231822	231829	0 %	50 %	25 %	25 %	390936105
4507	NC_017999	CGC	2	6	233189	233194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4508	NC_017999	GC	3	6	233193	233198	0 %	0 %	50 %	50 %	390936106
4509	NC_017999	CGT	2	6	233204	233209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4510	NC_017999	ACG	3	9	233239	233247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4511	NC_017999	CGGCG	2	10	233284	233293	0 %	0 %	60 %	40 %	390936106
4512	NC_017999	GTGC	2	8	233322	233329	0 %	25 %	50 %	25 %	390936106
4513	NC_017999	ATG	2	6	233398	233403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936106
4514	NC_017999	CCG	2	6	233469	233474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4515	NC_017999	CCG	2	6	233491	233496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4516	NC_017999	TGG	2	6	233626	233631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936106
4517	NC_017999	GGC	2	6	233661	233666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936106
4518	NC_017999	GGCC	2	8	233670	233677	0 %	0 %	50 %	50 %	390936106
4519	NC_017999	CGC	2	6	233684	233689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4520	NC_017999	ACG	2	6	233704	233709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4521	NC_017999	TAT	2	6	233766	233771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390936106
4522	NC_017999	GAT	2	6	233853	233858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936106
4523	NC_017999	GGC	2	6	233874	233879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936106
4524	NC_017999	GCG	2	6	233917	233922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936106
4525	NC_017999	CGC	2	6	233927	233932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4526	NC_017999	ACGG	2	8	233943	233950	25 %	0 %	50 %	25 %	390936106
4527	NC_017999	AT	3	6	233951	233956	50 %	50 %	0 %	0 %	390936106
4528	NC_017999	TCG	2	6	233992	233997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4529	NC_017999	GCTC	2	8	233998	234005	0 %	25 %	25 %	50 %	390936106
4530	NC_017999	GAT	2	6	234011	234016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936106
4531	NC_017999	TGG	2	6	234019	234024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936106
4532	NC_017999	GTTCGA	2	12	234086	234097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390936106
4533	NC_017999	GCT	2	6	234128	234133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4534	NC_017999	CAA	2	6	234167	234172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936106
4535	NC_017999	CGC	2	6	234206	234211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4536	NC_017999	CTG	2	6	234225	234230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936106
4537	NC_017999	CGC	3	9	234257	234265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936106
4538	NC_017999	GAA	2	6	234269	234274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936106
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4540	NC_017999	GGAAAT	2	12	234535	234546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390936107
4541	NC_017999	TGACC	2	10	234555	234564	20 %	20 %	20 %	40 %	390936107
4542	NC_017999	CGG	2	6	234648	234653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936107
4543	NC_017999	CGG	2	6	234663	234668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936107
4544	NC_017999	TCC	2	6	234710	234715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936107
4545	NC_017999	GAATC	2	10	234774	234783	40 %	20 %	20 %	20 %	390936107
4546	NC_017999	CGG	2	6	234839	234844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936107
4547	NC_017999	CCGGT	2	10	234863	234872	0 %	20 %	40 %	40 %	390936107
4548	NC_017999	CGC	2	6	234898	234903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936107
4549	NC_017999	CAG	2	6	234907	234912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936107
4550	NC_017999	GCG	2	6	234929	234934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936107
4551	NC_017999	GCA	2	6	234984	234989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936107
4552	NC_017999	CGGT	2	8	235029	235036	0 %	25 %	50 %	25 %	390936107
4553	NC_017999	TC	3	6	235143	235148	0 %	50 %	0 %	50 %	390936107
4554	NC_017999	CGT	2	6	235200	235205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936107
4555	NC_017999	TCG	2	6	235214	235219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936107
4556	NC_017999	CATG	2	8	235648	235655	25 %	25 %	25 %	25 %	390936108
4557	NC_017999	GCG	2	6	235932	235937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936108
4558	NC_017999	CACG	2	8	235951	235958	25 %	0 %	25 %	50 %	390936108
4559	NC_017999	GC	3	6	235968	235973	0 %	0 %	50 %	50 %	390936108
4560	NC_017999	TCGGCA	2	12	235980	235991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936108
4561	NC_017999	CGG	2	6	236079	236084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936108
4562	NC_017999	ATT	2	6	236102	236107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390936108
4563	NC_017999	ATC	2	6	236114	236119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936108
4564	NC_017999	CGG	3	9	236134	236142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936108
4565	NC_017999	GGCGA	2	10	236168	236177	20 %	0 %	60 %	20 %	390936108
4566	NC_017999	GGCG	2	8	236230	236237	0 %	0 %	75 %	25 %	390936108
4567	NC_017999	GAC	2	6	236360	236365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936108
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4569	NC_017999	CCA	2	6	236493	236498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936108
4570	NC_017999	GC	3	6	236500	236505	0 %	0 %	50 %	50 %	390936108
4571	NC_017999	CGC	3	9	236503	236511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936108
4572	NC_017999	CGA	2	6	236611	236616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936108
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4574	NC_017999	TCG	2	6	236679	236684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936108
4575	NC_017999	CG	3	6	236697	236702	0 %	0 %	50 %	50 %	390936108
4576	NC_017999	GAAG	2	8	236719	236726	50 %	0 %	50 %	0 %	390936108
4577	NC_017999	GCT	2	6	236775	236780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936108
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4579	NC_017999	CGCC	2	8	236895	236902	0 %	0 %	25 %	75 %	390936108
4580	NC_017999	CGC	3	9	236905	236913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936108
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4582	NC_017999	CCG	2	6	236943	236948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936108
4583	NC_017999	CAC	2	6	237115	237120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936109
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4587	NC_017999	GGCC	2	8	237304	237311	0 %	0 %	50 %	50 %	390936109
4588	NC_017999	CG	3	6	237333	237338	0 %	0 %	50 %	50 %	390936109
4589	NC_017999	GTG	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936109
4590	NC_017999	TCT	2	6	237405	237410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936109
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4592	NC_017999	CAT	2	6	237445	237450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936109
4593	NC_017999	GCT	2	6	237481	237486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936109
4594	NC_017999	GAG	2	6	237491	237496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936109
4595	NC_017999	GTC	2	6	237501	237506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936109
4596	NC_017999	AGC	2	6	237525	237530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936109
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4598	NC_017999	TGA	2	6	237594	237599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936109
4599	NC_017999	ACG	2	6	237606	237611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936109
4600	NC_017999	GCA	2	6	237628	237633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936109
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4602	NC_017999	CGC	2	6	237646	237651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936109
4603	NC_017999	GC	3	6	237664	237669	0 %	0 %	50 %	50 %	390936109
4604	NC_017999	CCGC	2	8	237735	237742	0 %	0 %	25 %	75 %	390936109
4605	NC_017999	AG	3	6	237751	237756	50 %	0 %	50 %	0 %	390936109
4606	NC_017999	GGGC	2	8	237762	237769	0 %	0 %	75 %	25 %	390936109
4607	NC_017999	CAT	2	6	237787	237792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936109
4608	NC_017999	GAC	2	6	238081	238086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936110
4609	NC_017999	GCCGC	2	10	238096	238105	0 %	0 %	40 %	60 %	390936110
4610	NC_017999	GCC	2	6	238107	238112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936110
4611	NC_017999	CGA	2	6	238119	238124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936110
4612	NC_017999	CGG	2	6	238143	238148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936110
4613	NC_017999	GC	3	6	238262	238267	0 %	0 %	50 %	50 %	390936110
4614	NC_017999	CCG	2	6	238334	238339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936110
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4616	NC_017999	CGA	2	6	238476	238481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936110
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4618	NC_017999	GCA	2	6	238581	238586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936110
4619	NC_017999	GAC	2	6	238588	238593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936110
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4621	NC_017999	CG	3	6	238784	238789	0 %	0 %	50 %	50 %	390936110
4622	NC_017999	GCT	2	6	238821	238826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936110
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4742	NC_017999	GAG	2	6	243949	243954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936112
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4744	NC_017999	CAA	2	6	244149	244154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936112
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4755	NC_017999	GAT	2	6	244410	244415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936112
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4850	NC_017999	CGCTGC	2	12	249023	249034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390936116
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4980	NC_017999	GCG	2	6	255883	255888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936123
4981	NC_017999	ATG	2	6	255926	255931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936124
4982	NC_017999	CAG	3	9	255935	255943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936124
4983	NC_017999	GCCG	2	8	256036	256043	0 %	0 %	50 %	50 %	390936124
4984	NC_017999	CTG	4	12	256118	256129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936124
4985	NC_017999	CCGA	2	8	256136	256143	25 %	0 %	25 %	50 %	390936124
4986	NC_017999	ATCG	2	8	256240	256247	25 %	25 %	25 %	25 %	390936124
4987	NC_017999	GCC	2	6	256299	256304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936124
4988	NC_017999	TTC	2	6	256314	256319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936124
4989	NC_017999	TCG	2	6	256353	256358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936124
4990	NC_017999	GACGGT	2	12	256445	256456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390936124
4991	NC_017999	GCG	2	6	256481	256486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936124
4992	NC_017999	GTG	2	6	256499	256504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936124
4993	NC_017999	GCG	2	6	256535	256540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936124
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4996	NC_017999	GC	3	6	256621	256626	0 %	0 %	50 %	50 %	390936124
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4999	NC_017999	CGG	2	6	256744	256749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936124
5000	NC_017999	CTG	2	6	256775	256780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936124

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