MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 plasmid pKJ006

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017923	CGGC	2	8	376	383	0 %	0 %	50 %	50 %	387906745
2	NC_017923	CGGC	2	8	784	791	0 %	0 %	50 %	50 %	387906745
3	NC_017923	GCTC	2	8	909	916	0 %	25 %	25 %	50 %	387906745
4	NC_017923	CAGC	2	8	1192	1199	25 %	0 %	25 %	50 %	387906745
5	NC_017923	GTCG	2	8	1214	1221	0 %	25 %	50 %	25 %	387906745
6	NC_017923	TTCG	2	8	1388	1395	0 %	50 %	25 %	25 %	387906745
7	NC_017923	CGGC	2	8	1438	1445	0 %	0 %	50 %	50 %	387906745
8	NC_017923	GCCG	2	8	1668	1675	0 %	0 %	50 %	50 %	387906745
9	NC_017923	AAAG	2	8	3847	3854	75 %	0 %	25 %	0 %	387906749
10	NC_017923	TCGA	2	8	4436	4443	25 %	25 %	25 %	25 %	387906750
11	NC_017923	ATGT	2	8	4900	4907	25 %	50 %	25 %	0 %	387906751
12	NC_017923	GATG	2	8	7369	7376	25 %	25 %	50 %	0 %	387906754
13	NC_017923	GAGC	2	8	7528	7535	25 %	0 %	50 %	25 %	387906754
14	NC_017923	CGGC	2	8	7966	7973	0 %	0 %	50 %	50 %	387906755
15	NC_017923	GCTT	2	8	8829	8836	0 %	50 %	25 %	25 %	387906756
16	NC_017923	AGCG	3	12	9013	9024	25 %	0 %	50 %	25 %	387906756
17	NC_017923	GCCG	2	8	10423	10430	0 %	0 %	50 %	50 %	387906757
18	NC_017923	CGTG	2	8	10838	10845	0 %	25 %	50 %	25 %	387906757
19	NC_017923	GATC	2	8	10931	10938	25 %	25 %	25 %	25 %	387906757
20	NC_017923	TCGA	2	8	11065	11072	25 %	25 %	25 %	25 %	387906757
21	NC_017923	TTCC	2	8	11289	11296	0 %	50 %	0 %	50 %	387906757
22	NC_017923	GAGC	2	8	11519	11526	25 %	0 %	50 %	25 %	387906757
23	NC_017923	TCGC	2	8	12570	12577	0 %	25 %	25 %	50 %	387906757
24	NC_017923	CGGC	2	8	12974	12981	0 %	0 %	50 %	50 %	387906757
25	NC_017923	TTCC	2	8	13002	13009	0 %	50 %	0 %	50 %	387906757
26	NC_017923	TCGT	2	8	13570	13577	0 %	50 %	25 %	25 %	387906757
27	NC_017923	TGGC	2	8	15218	15225	0 %	25 %	50 %	25 %	387906759
28	NC_017923	AAGT	2	8	15512	15519	50 %	25 %	25 %	0 %	387906759
29	NC_017923	GATC	2	8	15977	15984	25 %	25 %	25 %	25 %	387906760
30	NC_017923	GCGA	2	8	16070	16077	25 %	0 %	50 %	25 %	387906760
31	NC_017923	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	387906764
32	NC_017923	CTGC	2	8	18843	18850	0 %	25 %	25 %	50 %	387906765
33	NC_017923	TTCG	2	8	20416	20423	0 %	50 %	25 %	25 %	387906767
34	NC_017923	GATC	2	8	21799	21806	25 %	25 %	25 %	25 %	387906768
35	NC_017923	GCCG	2	8	22210	22217	0 %	0 %	50 %	50 %	387906768
36	NC_017923	CGTC	2	8	24776	24783	0 %	25 %	25 %	50 %	387906769
37	NC_017923	AGGT	2	8	24830	24837	25 %	25 %	50 %	0 %	387906769
38	NC_017923	GCTT	2	8	25145	25152	0 %	50 %	25 %	25 %	387906769
39	NC_017923	GTGG	2	8	25226	25233	0 %	25 %	75 %	0 %	387906769
40	NC_017923	AAGC	2	8	25469	25476	50 %	0 %	25 %	25 %	387906769
41	NC_017923	CACG	2	8	25742	25749	25 %	0 %	25 %	50 %	387906769
42	NC_017923	CGGC	2	8	28353	28360	0 %	0 %	50 %	50 %	387906773
43	NC_017923	CTGC	2	8	29020	29027	0 %	25 %	25 %	50 %	387906773
44	NC_017923	GTTG	2	8	29293	29300	0 %	50 %	50 %	0 %	387906773
45	NC_017923	GGTG	2	8	29700	29707	0 %	25 %	75 %	0 %	387906773
46	NC_017923	GCTC	2	8	30002	30009	0 %	25 %	25 %	50 %	387906773
47	NC_017923	CCGG	2	8	30254	30261	0 %	0 %	50 %	50 %	387906773
48	NC_017923	CAGG	2	8	30396	30403	25 %	0 %	50 %	25 %	387906773
49	NC_017923	TCAG	2	8	30483	30490	25 %	25 %	25 %	25 %	387906773
50	NC_017923	AGCG	2	8	30725	30732	25 %	0 %	50 %	25 %	387906773
51	NC_017923	CATT	2	8	31937	31944	25 %	50 %	0 %	25 %	387906775
52	NC_017923	GCCG	2	8	32638	32645	0 %	0 %	50 %	50 %	387906776
53	NC_017923	AAGC	2	8	32684	32691	50 %	0 %	25 %	25 %	387906776
54	NC_017923	CGGG	2	8	33273	33280	0 %	0 %	75 %	25 %	387906776
55	NC_017923	ACGT	2	8	33715	33722	25 %	25 %	25 %	25 %	387906777
56	NC_017923	CCTG	2	8	33999	34006	0 %	25 %	25 %	50 %	387906777
57	NC_017923	GAAG	2	8	34376	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	387906778
58	NC_017923	GGCA	2	8	35038	35045	25 %	0 %	50 %	25 %	387906778
59	NC_017923	TGGT	2	8	35188	35195	0 %	50 %	50 %	0 %	387906778
60	NC_017923	TCGG	2	8	35232	35239	0 %	25 %	50 %	25 %	387906778
61	NC_017923	CGAA	2	8	35296	35303	50 %	0 %	25 %	25 %	387906778
62	NC_017923	TGGG	2	8	35593	35600	0 %	25 %	75 %	0 %	387906779
63	NC_017923	GCCG	2	8	35881	35888	0 %	0 %	50 %	50 %	387906779
64	NC_017923	TGGG	2	8	36539	36546	0 %	25 %	75 %	0 %	387906780
65	NC_017923	CGGC	2	8	37146	37153	0 %	0 %	50 %	50 %	387906781
66	NC_017923	AGCC	2	8	37446	37453	25 %	0 %	25 %	50 %	387906781
67	NC_017923	CATC	2	8	38785	38792	25 %	25 %	0 %	50 %	387906782
68	NC_017923	CGAG	2	8	38920	38927	25 %	0 %	50 %	25 %	387906782
69	NC_017923	CGCT	2	8	39012	39019	0 %	25 %	25 %	50 %	387906782
70	NC_017923	GGCG	2	8	39376	39383	0 %	0 %	75 %	25 %	387906783
71	NC_017923	GCCG	2	8	39676	39683	0 %	0 %	50 %	50 %	387906783
72	NC_017923	GAGG	2	8	39993	40000	25 %	0 %	75 %	0 %	387906783
73	NC_017923	TCGA	2	8	40553	40560	25 %	25 %	25 %	25 %	387906784
74	NC_017923	TCGA	2	8	40676	40683	25 %	25 %	25 %	25 %	387906784
75	NC_017923	CCGA	2	8	40700	40707	25 %	0 %	25 %	50 %	387906784
76	NC_017923	GAGC	2	8	40892	40899	25 %	0 %	50 %	25 %	387906785
77	NC_017923	TTCG	2	8	42471	42478	0 %	50 %	25 %	25 %	387906788
78	NC_017923	CTTG	2	8	42717	42724	0 %	50 %	25 %	25 %	387906788
79	NC_017923	CTAC	2	8	42950	42957	25 %	25 %	0 %	50 %	387906788
80	NC_017923	CGCA	2	8	44097	44104	25 %	0 %	25 %	50 %	387906789
81	NC_017923	GACA	2	8	44370	44377	50 %	0 %	25 %	25 %	387906789

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.