MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 48034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CAG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896524
2	NC_017912	ATA	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896524
3	NC_017912	CGA	2	6	774	779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
4	NC_017912	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
5	NC_017912	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
6	NC_017912	GCA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
7	NC_017912	GTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387896525
8	NC_017912	TCT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
9	NC_017912	TCA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896525
10	NC_017912	GAT	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
11	NC_017912	GAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
12	NC_017912	CCG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
13	NC_017912	CCG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
14	NC_017912	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896525
15	NC_017912	CAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
16	NC_017912	TTC	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
17	NC_017912	GAA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
18	NC_017912	GGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896525
19	NC_017912	CTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896525
20	NC_017912	TGA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
21	NC_017912	AGC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
22	NC_017912	CAG	3	9	1988	1996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
23	NC_017912	ATA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896525
24	NC_017912	TCG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
25	NC_017912	AGA	3	9	2387	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896526
26	NC_017912	TGC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
27	NC_017912	TTC	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
28	NC_017912	ATT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896526
29	NC_017912	TTC	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
30	NC_017912	GCT	2	6	2939	2944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
31	NC_017912	TCG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
32	NC_017912	CTT	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
33	NC_017912	AAC	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896526
34	NC_017912	CGG	2	6	3097	3102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896526
35	NC_017912	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896526
36	NC_017912	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896526
37	NC_017912	ATA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896527
38	NC_017912	CGG	2	6	3559	3564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896527
39	NC_017912	CAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896527
40	NC_017912	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896527
41	NC_017912	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896527
42	NC_017912	ATC	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896528
43	NC_017912	TGA	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
44	NC_017912	AGC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
45	NC_017912	GAG	3	9	4102	4110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387896528
46	NC_017912	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
47	NC_017912	GAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
48	NC_017912	ATT	2	6	4495	4500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896528
49	NC_017912	GAT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
50	NC_017912	CAG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
51	NC_017912	ACG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
52	NC_017912	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
53	NC_017912	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
54	NC_017912	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
55	NC_017912	CAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896528
56	NC_017912	GAC	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896529
57	NC_017912	TCG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896529
58	NC_017912	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
59	NC_017912	AGT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896529
60	NC_017912	GAA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
61	NC_017912	CAG	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
62	NC_017912	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
63	NC_017912	CAC	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896530
64	NC_017912	TCG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896530
65	NC_017912	ACA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
66	NC_017912	GCC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896530
67	NC_017912	TCA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
68	NC_017912	CGG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
69	NC_017912	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
70	NC_017912	AAC	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
71	NC_017912	AAG	2	6	5854	5859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
72	NC_017912	ATA	2	6	5968	5973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896530
73	NC_017912	AAG	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
74	NC_017912	GAT	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
75	NC_017912	ATT	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896530
76	NC_017912	TCT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
77	NC_017912	CTT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
78	NC_017912	TTC	2	6	6386	6391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
79	NC_017912	TCA	2	6	6634	6639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
80	NC_017912	TTA	2	6	6681	6686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896530
81	NC_017912	TTC	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
82	NC_017912	ATC	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
83	NC_017912	GCC	2	6	6746	6751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896530
84	NC_017912	GCA	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
85	NC_017912	AGC	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
86	NC_017912	TGA	2	6	6809	6814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
87	NC_017912	TCG	2	6	7485	7490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896531
88	NC_017912	ACC	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896531
89	NC_017912	TTG	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896531
90	NC_017912	TCC	2	6	7825	7830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387896531
91	NC_017912	CTG	2	6	7935	7940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896531
92	NC_017912	CAT	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896531
93	NC_017912	CCG	2	6	8197	8202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896531
94	NC_017912	CTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896531
95	NC_017912	TTG	2	6	8616	8621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896531
96	NC_017912	GAA	2	6	8657	8662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
97	NC_017912	ATC	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896531
98	NC_017912	ATG	2	6	8715	8720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896531
99	NC_017912	TCA	2	6	8796	8801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896531
100	NC_017912	TTC	2	6	8951	8956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896531
101	NC_017912	TAA	2	6	8959	8964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896531
102	NC_017912	ATT	2	6	9032	9037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896531
103	NC_017912	TAT	2	6	9076	9081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896531
104	NC_017912	TGA	2	6	9097	9102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896531
105	NC_017912	ATC	3	9	9257	9265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896531
106	NC_017912	GAA	2	6	9271	9276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
107	NC_017912	GAA	2	6	9299	9304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
108	NC_017912	GAT	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896531
109	NC_017912	GAA	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
110	NC_017912	CAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896531
111	NC_017912	ATT	2	6	9566	9571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896531
112	NC_017912	GCG	2	6	9579	9584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896531
113	NC_017912	GAA	2	6	9704	9709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
114	NC_017912	GAA	2	6	9716	9721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
115	NC_017912	GAA	2	6	9725	9730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896531
116	NC_017912	CGG	2	6	14966	14971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896532
117	NC_017912	ATC	2	6	14983	14988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896532
118	NC_017912	CAG	2	6	15004	15009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896532
119	NC_017912	ACC	2	6	15015	15020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896532
120	NC_017912	ATC	2	6	15041	15046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896532
121	NC_017912	AAT	2	6	15073	15078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896532
122	NC_017912	GAA	2	6	15364	15369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896532
123	NC_017912	TTC	2	6	15407	15412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896532
124	NC_017912	TCC	2	6	15425	15430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387896532
125	NC_017912	AGA	2	6	15599	15604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896532
126	NC_017912	ACA	2	6	15636	15641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896532
127	NC_017912	TTC	2	6	15751	15756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896532
128	NC_017912	AAG	2	6	15992	15997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896533
129	NC_017912	GAT	2	6	16009	16014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896533
130	NC_017912	TCA	2	6	16106	16111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896533
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499	NC_017912	AGC	2	6	50614	50619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896566
500	NC_017912	ATT	2	6	51105	51110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896567

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